Measuring genome evolution

The determination of complete genome sequences provides us with an opportunity to describe and analyze evolution at the comprehensive level of genomes. Here we compare nine genomes with respect to their protein coding genes at two levels: (i) we compare genomes as “bags of genes” and measure the fraction of orthologs shared between genomes and (ii) we quantify correlations between genes with respect to their relative positions in genomes. Distances between the genomes are related to their divergence times, measured as the number of amino acid substitutions per site in a set of 34 orthologous genes that are shared among all the genomes compared. We establish a hierarchy of rates at which genomes have changed during evolution. Protein sequence identity is the most conserved, followed by the complement of genes within the genome. Next is the degree of conservation of the order of genes, whereas gene regulation appears to evolve at the highest rate. Finally, we show that some genomes are more highly organized than others: they show a higher degree of the clustering of genes that have orthologs in other genomes.

Análise de confiabilidade de estruturas com paredes portantes de concreto pré-moldado

O método construtivo com painéis portantes de concreto é economicamente viável, porém relativamente novo no cenário nacional, sobretudo no caso dos pré-moldados. As incertezas referentes às peculiaridades desse método, bem como a nova norma brasileira de painéis pré-moldados, ainda em elaboração, vem a motivar uma análise probabilística dos critérios de projeto disponíveis. Utilizando-se a técnica da confiabilidade estrutural, é possível propagar as incertezas referentes às variáveis a uma resposta final no índice de confiabilidade, sendo um cálculo totalmente probabilístico. Neste trabalho, emprega-se tal técnica com informações estatísticas referentes a lajes de concreto moldadas in loco para verificar, de maneira mais verossímil, a segurança dos critérios de projeto impostos pelo Precast Concrete Institute Design Handbook - Precast and Prestressed Concrete - 7th Edition (2010) às fases transitórias (desforma, transporte e içamento) e pela Norma Brasileira ABNT NBR 6118: 2014 - Projeto de estruturas de concreto, à fase em uso. Prossegue-se a uma análise crítica dos resultados bem como sugestões para diminuir a variação dos resultados, sobretudo pela calibração de novos coeficientes parciais de segurança, processo para o qual este trabalho pode servir de base.

Obtenção e caracterização de PLA reforçado com nanocelulose.

A celulose é o polímero natural renovável disponível em maior abundância atualmente. Por possuir estrutura semicristalina, é possível extrair seus domínios cristalinos através de procedimentos que ataquem sua fase amorfa, como a hidrólise ácida, obtendo-se assim partículas cristalinas chamadas nanopartículas de celulose (NCs). Estas nanopartículas têm atraído enorme interesse científico, uma vez que possuem propriedades mecânicas, como módulo de elasticidade e resistência à tração, semelhantes a várias cargas inorgânicas utilizadas na fabricação de compósitos. Além disso, possuem dimensões nanométricas, o que contribui para menor adição de carga à matriz polimérica, já que possuem maior área de superfície, quando comparadas às cargas micrométricas. Nanocompósitos formados pela adição destas cargas em matrizes poliméricas podem apresentar propriedades comerciais atraentes, como barreira a gases, melhores propriedades térmicas e baixa densidade, quando comparados aos compósitos tradicionais. Como se trata de uma carga com dimensões nanométricas, obtida de fontes renováveis, uma das principais áreas de interesse para aplicação deste reforço é em biopolímeros biodegradáveis. O poli(ácido lático) (PLA), é um exemplo de biopolímero com propriedades mecânicas, térmicas e de processamento superiores a de outros biopolímeros comerciais. No presente trabalho foram obtidas nanopartículas de celulose (NCs), por meio de hidrólise ácida, utilizando-se três métodos distintos, com o objetivo de estudar o método mais eficiente para a obtenção de NCs adequadas à aplicação em compósitos de PLA. Os Métodos I e II empregam extração das NCs por meio do H2SO4, diferenciando-se apenas pela neutralização, a qual envolve diálise ou neutralização com NaHCO3, respectivamente. No Método III a extração das NCs foi realizada com H3PO4. As NCs foram caracterizadas por diferentes técnicas, como difração de raios X (DRX), análise termogravimétrica (TG), espectroscopia vibracional de absorção no infravermelho (FTIR), microscopia eletrônica de transmissão (MET) e microscopia de força atômica (MFA). Os resultados de caracterização das NCs indicaram que, a partir de todos os métodos utilizados, há formação de nanocristais de celulose (NCCs), entretanto, apenas os NCCs obtidos pelos Métodos II e III apresentaram estabilidade térmica suficiente para serem empregados em compósitos preparados por adição da carga no polímero em estado fundido. A incorporação das NCs em matriz de PLA foi realizada em câmara de mistura, com posterior moldagem por prensagem a quente. Compósitos obtidos por adição de NCs obtidas pelo Método II foram caracterizados por calorimetria exploratória diferencial (DSC), análise termogravimétrica, microscopia óptica, análises reológicas e microscopia eletrônica de varredura (MEV). A adição de NCs, extraídas pelo Método II, em matriz de PLA afetou o processo de cristalização do polímero, o qual apresentou maior grau de cristalinidade. Além disso, a adição de 3% em massa de NCs no PLA foi suficiente para alterar seu comportamento reológico. Os resultados reológicos indicaram que a morfologia do compósito é, predominantemente, composta por uma dispersão homogênea e fina da carga na fase matriz. Micrografias obtidas por MEV corroboram os resultados reológicos, mostrando, predominantemente a presença de partículas de NC em escala nanométrica. Compósitos de PLA com NCs obtidas pelo Método III apresentaram aglomerados de partículas de NC em escala micro e milimétrica, ao longo da fase matriz, e não foram extensivamente caracterizados.

Gender inequalities in occupational health related to the unequal distribution of working and employment conditions: a systematic review

Introduction: Gender inequalities exist in work life, but little is known about their presence in relation to factors examined in occupation health settings. The aim of this study was to identify and summarize the working and employment conditions described as determinants of gender inequalities in occupational health in studies related to occupational health published between 1999 and 2010. Methods: A systematic literature review was undertaken of studies available in MEDLINE, EMBASE, Sociological Abstracts, LILACS, EconLit and CINAHL between 1999 and 2010. Epidemiologic studies were selected by applying a set of inclusion criteria to the title, abstract, and complete text. The quality of the studies was also assessed. Selected studies were qualitatively analysed, resulting in a compilation of all differences between women and men in the prevalence of exposure to working and employment conditions and work-related health problems as outcomes. Results: Most of the 30 studies included were conducted in Europe (n=19) and had a cross-sectional design (n=24). The most common topic analysed was related to the exposure to work-related psychosocial hazards (n=8). Employed women had more job insecurity, lower control, worse contractual working conditions and poorer self-perceived physical and mental health than men did. Conversely, employed men had a higher degree of physically demanding work, lower support, higher levels of effort-reward imbalance, higher job status, were more exposed to noise and worked longer hours than women did. Conclusions: This systematic review has identified a set of working and employment conditions as determinants of gender inequalities in occupational health from the occupational health literature. These results may be useful to policy makers seeking to reduce gender inequalities in occupational health, and to researchers wishing to analyse these determinants in greater depth.

Production of nanoTiC–graphite composites using Ti-doped self-sintering carbon mesophase powder

This work reports the synthesis of nanoTiC–graphite composites using mesophase pitch containing titanium as TiC or TiO2 nanoparticles. NanoTiC–graphite composites have been prepared using Ti-doped self-sintering mesophase powders as starting materials without using any binders or a metal carbide-carbon mixing stage. The effect of manufacture variables on the graphite compacts properties was studied. Graphites were characterised using XRD and Raman spectroscopy, SEM and TEM, as well as by their mechanical, electrical and thermal properties. The presence of TiC promotes graphitisation producing materials with larger crystal sizes. The kind of titanium source and mesophase content of the starting pitch affects to the final properties. Mesophase pitch with higher amount of mesophase content produces graphites with higher degree of graphitisation. The incorporation of TiC nanoparticles to the graphites composites improved thermal conductivity more than four times, and mechanical properties are not significantly modified by the presence of TiC.

Auto perceção do estado de saúde, aptidão física e motivação para a prática de hidroginástica por parte de idosos

Dissertação apresentada à Escola Superior de Educação do Instituto Politécnico de Castelo Branco para o cumprimento dos requisitos necessários à obtenção do grau de Mestre em Atividade Física na especialização de Gerontomotricidade.

Rinite alérgica e suas principais comorbilidades : asma, conjuntivite alérgica e sinusite

Trabalho Final do Curso de Mestrado Integrado em Medicina, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 2014

Perceções dos enfermeiros sobre os erros de medicação no pré-hospitalar

Quase metade da totalidade de eventos adversos evitáveis é consequência de erros de medicação (EM), contudo, não sendo possível evitá-los completamente, estes podem ser minorados. Esta problemática em contexto pré-hospitalar (PH) tem sido pouco estudada a nível internacional e nunca foi abordada em Portugal. O objetivo deste estudo é relacionar as variáveis sociodemográficas, socioprofissionais, formação, conhecimentos e experiências com EM com a perceção dos enfermeiros que exercem no PH relativamente à frequência da ocorrência dos tipos e causas de EM, dos obstáculos ao relato de EM, dos fatores facilitadores do relato de EM e com o grau de concordância sobre divulgação de EM. Métodos: Trata-se de um estudo analítico, descritivo, transversal e correlacional. A amostra é composta por 107 enfermeiros do PH (método snowball), dos quais 56.1% são do sexo masculino. Foi aplicado um questionário eletrónico constituído por uma componente sociodemográfica, escala de conhecimentos, perceções e experiência com erros de medicação (Raimundo, 2011; Maurer, 2010; Bohomol & Ramos, 2006; Mayo & Duncan, 2004; Osborne, Blais & Hayes, 1999; Gladstone, 1995). Resultados: Dos inquiridos 60.7% apresentam fracos a razoáveis conhecimentos sobre EM; mais de 54% perceciona a sua formação académica/contínua sobre EM como sendo inexistente/insuficiente e 52.3% não recebe formação sobre farmacologia há pelo menos 6 anos; 45.8% diz ter experienciado no PH um ou mais EM sem dano para o doente e apenas 14.9% relatou um ou mais EM sem dano para o doente. Os tipos e as causas de EM identificadas ocorrem com uma frequência elevada para mais de 39% dos inquiridos. A maioria dos inquiridos (47.7%) considera que no PH existem grandes obstáculos ao relato de EM e os fatores facilitadores do relato de EM apresentados são considerados por 49.5% dos enfermeiros como altamente prováveis de facilitar o relato. 52,3% dos enfermeiros do PH discordam de uma forma global com a divulgação de EM. O sexo feminino apresenta uma perceção mais elevada da ocorrência das causas primárias de EM (MF=2.68, Dp= 0.60 vs MM=2.36, Dp=0.66) e uma perceção mais elevada dos fatores facilitadores ao relato dos EM (MF=4.40, Dp= 0.64 vs MM=4.12, Dp=0.74). Os enfermeiros que exercem exclusivamente no PH possuem uma melhor perceção da frequência de ocorrência das causas primárias de EM. Quanto maior o conhecimento dos enfermeiros sobre EM, maior é a perceção destes relativamente aos tipos de erros e maior o grau de concordância com a divulgação dos EM. Existe evidência estatisticamente significativa (p<0.05) de que os enfermeiros que experienciaram a ocorrência de pelo menos 1 erro com dano para o doente possuem melhor perceção dos tipos, causas primárias e obstáculos ao relato dos EM, assim como apresenta um maior grau de concordância com a divulgação de EM. Conclusão: A perceção dos enfermeiros sobre a frequência dos tipos e das causas de EM, assim como dos obstáculos e dos fatores facilitadores do relato de EM por parte dos enfermeiros no PH não tem, de uma forma geral, relação com as características sociodemográficas e socioprofissionais, o que demonstra a transversalidade desta problemática. Tão ou mais importante do que avaliar a dimensão e caracterizar a tipologia, causas, obstáculos e fatores facilitadores ao relato dos EM será, com base no conhecimento obtido, definir e implementar ações de gestão de risco que permitam a sua redução ou mesmo a sua supressão. PALAVRAS-CHAVE: Erros de Medicação, Perceção dos Enfermeiros, Pré- Hospitalar.

Self-evaluation guide for collegiate schools of nursing.

Cover title.

Indefinite determiner introducing definite referent: a special use of 'yi 'one' + classifier' in Chinese

The indefinite determiner yi 'one'+ classifier' is the most approximate to an indefinite article, like the English a, in Chinese. It serves all the functions characteristic of representative stages of grammaticalization from a numeral to a generalized indefinite determiner as elaborated in the literature. It is established in this paper that the Chinese indefinite determiner has developed a special use with definite expressions, serving as a backgrounding device marking entities as of low thematic importance and unlikely to receive subsequent mentions in ensuing discourse. 'yi+ classifier' in the special use with definite expressions displays striking similarities in terms of semantic bleaching and phonological reduction with the same determiner at the advanced stage of grammaticalization characterized by uses with generics, nonspecifics and nonreferentials. An explanation is offered in terms of an implicational relation between nonreferentiality and low thematic importance which characterize the two uses of the indefinite determiner. While providing another piece of evidence in support of the claim that semantically nonreferentials and entities of low thematic importance tend to be encoded in terms of same linguistic devices in language, findings in this paper have shown how an indefinite determiner can undergo a higher degree of grammaticalization than has been reported in the literature-it expands its scope to mark not only indefinite but also definite expressions as semantically nonreferential and/or thematically unimportant. (C) 2003 Elsevier B.V. All rights reserved.

Equity market linkage and multinational trade accords: The case of NAFTA

This paper examines the impact of multinational trade accords on the degree of stock market linkage using NAFTA as a case study. Besides liberalizing trade among the U.S., Canada and Mexico, NAFTA has also sought to strengthen linkage among stock markets of these countries. If successful, this could lessen the appeal of asset diversification across the North American region and promote a higher degree of market efficiency. We assess the possible impact of NAFTA on market linkage using cross-correlations, multivariate price cointegrating systems, speed of convergence, and generalized variance decompositions of unexpected stock returns. The evidence proves robust and consistently indicates intensified equity market linkage since the NAFTA accord. The results also suggest that interdependent goods markets in the region are a primary reason behind the stronger equity market linkage observed in the post-NAFTA period. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Integrated Pb- and S-isotope investigation of sulphide minerals from the early Archaean of southwest Greenland

We present high-spatial resolution secondary ion mass spectrometry (SIMS) measurements of Pb and S isotopes in sulphides from early Archaean samples at two localities in southwest Greenland. Secondary pyrite from a 3.71 Ga sample of magnetite-quartz banded iron formation in the Isua Greenstone Belt, which has previously yielded unradiogenic Pb consistent with its ancient origin, contains sulphur with a mass independently fractionated (MIF) isotope signature (Delta(33)S =+3.3 parts per thousand). This reflects the secondary mineralization of remobilized sedimentary S carrying a component modified by photochemical reactions in the early Archaean atmosphere. It further represents one of the most extreme positive excursions so far known from the early Archaean rock record. Sulphides from a quartz-pyroxene rock and an ultramafic boudin from the island of Akilia, in the Godth (a) over circle bsfjord, have heterogeneous and generally radiogenic Pb isotopic compositions that we interpret to represent partial re-equilibration of Pb between the sulphides and whole rocks during tectonothermal events at 3.6, 2.7 and 1.6 Ga. Both these samples have Delta(33)S=0 (within analytical error) and therefore show no evidence for MIF sulphur. These data are consistent with previous interpretations that the rock cannot be proven to have a sedimentary origin. Our study illustrates that SIMS S-isotope measurements in ancient rocks can be used to elucidate early atmospheric parameters because of the ability to obtain combined S and Pb-isotope data, but caution must be applied when using such data to infer protolith. When information from geological context, petrography and chronology (i.e. by Pb isotopes) is combined and fully evaluated, Delta(33)S signatures from sulphides and their geological significance can be interpreted with a higher degree of confidence. (c) 2005 Elsevier B.V All rights reserved.

Influence of nanowire density on the shape and optical properties of ternary InGaAs nanowires

We have synthesized ternary InGaAs nanowires on (111)B GaAs surfaces by metal-organic chemical vapor deposition. Au colloidal nanoparticles were employed to catalyze nanowire growth. We observed the strong influence of nanowire density on nanowire height, tapering, and base shape specific to the nanowires with high In composition. This dependency was attributed to the large difference of diffusion length on (111)B surfaces between In and Ga reaction species, with In being the more mobile species. Energy dispersive X-ray spectroscopy analysis together with high-resolution electron microscopy study of individual InGaAs nanowires shows large In/Ga compositional variation along the nanowire supporting the present diffusion model. Photoluminescence spectra exhibit a red shift with decreasing nanowire density due to the higher degree of In incorporation in more sparsely distributed InGaAs nanowires.

A dynamic model for the activated sludge treatment of coke oven effluents

This is an Inter-Disciplinary Higher Degree (IHD) thesis about Water Pollution Control in the Iron and Steel Industry. After examining the compositions, and various treatment methods, for the major effluent streams from a typical Integrated Iron and Steel works, it was decided to concentrate investigative work on the activated-sludge treatment of coke-oven effluents. A mathematical model of this process was developed in an attempt to provide a tool for plant management that would enable improved performance, and enhanced control of Works Units. The model differs from conventional models in that allowance is made for the presence of two genera of microorganisms, each of which utilises a particular type of substrate as its energy source. Allowance is also made for the inhibitive effect of phenol on thiocyanate biodegradation, and for the self-toxicity of the bacteria when present in a high substrate concentration environment. The enumeration of the kinetic characteristics of the two groups of micro-organisms was shown to be of major importance. Laboratory experiments were instigated in an attempt to determine accurate values of these coefficients. The use of the Suspended Solids concentration was found to be too insensitive a measure of viable active mass. Other measures were investigated, and Adenosine Triphosphate concentration was chosen as the most effective measure of bacterial populations. Using this measure, a model was developed for phenol biodegradation from experimental results which implicated the possibility of storage of substate prior to metabolism. A model for thiocyanate biodegradation was also developed, although the experimental results indicate that much work is still required in this area.

Analysis of nocturnal oxygen saturation recordings using kernel entropy to assist in sleep apnea-hypopnea diagnosis

In this study, a new entropy measure known as kernel entropy (KerEnt), which quantifies the irregularity in a series, was applied to nocturnal oxygen saturation (SaO 2) recordings. A total of 96 subjects suspected of suffering from sleep apnea-hypopnea syndrome (SAHS) took part in the study: 32 SAHS-negative and 64 SAHS-positive subjects. Their SaO 2 signals were separately processed by means of KerEnt. Our results show that a higher degree of irregularity is associated to SAHS-positive subjects. Statistical analysis revealed significant differences between the KerEnt values of SAHS-negative and SAHS-positive groups. The diagnostic utility of this parameter was studied by means of receiver operating characteristic (ROC) analysis. A classification accuracy of 81.25% (81.25% sensitivity and 81.25% specificity) was achieved. Repeated apneas during sleep increase irregularity in SaO 2 data. This effect can be measured by KerEnt in order to detect SAHS. This non-linear measure can provide useful information for the development of alternative diagnostic techniques in order to reduce the demand for conventional polysomnography (PSG). © 2011 IEEE.