Characterization of a new clinical yeast species, Candida tunisiensis sp. nov., isolated from a strain collection from Tunisian hospitals.

From a collection of yeast isolates isolated from patients in Tunisian hospitals between September 2006 and July 2010, the yeast strain JEY63 (CBS 12513), isolated from a 50-year-old male that suffered from oral thrush, could not be identified to the species level using conventional methods used in clinical laboratories. These methods include matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS), germ tube formation, and the use of CHROMagar Candida and metabolic galleries. Sequence analysis of the nuclear rRNA (18S rRNA, 5.8S rRNA, and 26S rRNA) and internal transcribed spacer regions (ITS1 and ITS2) indicated that the ribosomal DNA sequences of this species were not yet reported. Multiple gene phylogenic analyses suggested that this isolate clustered at the base of the Dipodascaceae (Saccharomycetales, Saccharomycetes, and Ascomycota). JEY63 was named Candida tunisiensis sp. nov. according to several phenotypic criteria and its geographical origin. C. tunisiensis was able to grow at 42°C and does not form chlamydospores and hyphae but could grow as yeast and pseudohyphal forms. C. tunisiensis exhibited most probably a haploid genome with an estimated size of 10 Mb on at least three chromosomes. Using European Committee for Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) and Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) Candida albicans susceptibility breakpoints as a reference, C. tunisiensis was resistant to fluconazole (MIC = 8 μg/ml), voriconazole (MIC = 0.5 μg/ml), itraconazole (MIC = 16 μg/ml), and amphotericin B (MIC = 4 μg/ml) but still susceptible to posaconazole (MIC = 0.008 μg/ml) and caspofungin (MIC = 0.5 μg/ml). In conclusion, MALDI-TOF MS permitted the early selection of an unusual isolate, which was still unreported in molecular databases but could not be unambiguously classified based on phylogenetic approaches.

Relationships of Scincid Lizards (Mabuya spp; Reptilia: Scincidae) from the Cape Verde Islands Based on Mitochondrial and Nuclear DNA Sequences

Partial DNA sequences from two mitochondrial (mt) and one nuclear gene (cytochrome b, 12S rRNA, and C-mos) were used to estimate the phylogenetic relationships among the six extant species of skinks endemic to the Cape Verde Archipelago. The species form a monophyletic unit, indicating a single colonization of the islands, probably from West Africa. Mabuya vaillanti and M. delalandii are sister taxa, as indicated by morphological characters. Mabuya fogoensis and M. stangeri are closely related, but the former is probably paraphyletic. Mabuya spinalis and M. salensis are also probably paraphyletic. Within species, samples from separate islands always form monophyletic groups. Some colonization events can be hypothesized, which are in line with the age of the islands. C-mos variation is concordant with the topology derived from mtDNA.

Algunas características biológicas de la merluza peruana durante el crucero de otoño de 1997

Presenta los principales resultados del análisis de algunas características biológicas de la merluza (Merluccius gayi peruanus) en base a datos de un crucero de evaluación desarrollado en otoño de 1997. La merluza presentó dos gradientes latitudinales, al norte y al sur de los 6°S, cada grupo con su propia característica reproductiva. El grupo del sur presentó características de maduración sexual más avanzada. El rango de tamaños fue amplio, encontrándose ejemplares longevos que eran escasos en años anteriores. La proporción sexual total fue de 1:1. Los parámetros de la relación longitud-peso fueron: a = 0,005744; b = 3,0618 para machos; y a = 0,004807; b = 3,1273 para hembras.

Abundancia relativa y distribución de aves marinas frente a la costa peruana y su relación con la anchoveta. Crucero BIC Humboldt 9803-05 de Tumbes a Tacna

Se analizan avistamientos de aves marinas llevados a cabo frente a la costa peruana a bordo del Crucero BIC Humboldt 9803-05. En 2.516 millas náuticas observadas se registró un total de 84.845 aves marinas clasificadas en 17 familias y 53 especies. El grupo más numeroso fue el de las pardelas con 54,11% del total de aves registradas, seguido por las aves guaneras (incluyendo camanay) con 17,98%. Como consecuencia del evento El Niño, se observa una disminución en el rango de distribución de especies propias de la Corriente Peruana y un incremento de los rangos de distribución de especies tropicales como camanay y albatros de Galápagos. Así mismo, se reporta por primera vez Sula leucogaster a los 6°S, constituyéndose éste en el registro más austral de esta especie de piquero pantropical. Las asociaciones entre presencia de anchoveta y presencia de guanay, piquero peruano y pardelas, sugieren que estas aves se congregan en áreas donde se presenta dicho recurso. Las correlaciones encontradas entre la abundancia de guanay y piquero peruano respecto a la abundancia de anchoveta, sugieren que estas aves serían potencialmente buenos indicadores de la abundancia relativa y distribución de este recurso; sin embargo, debe tomarse en cuenta que en la actualidad las poblaciones de estas aves son reducidas, siendo necesario repetir el presente trabajo durante años normales.

Estructura del subsistema demersal durante el crucero de evaluación del recurso Merluza, BIC Humboldt 9705-06, Callao a Puerto Pizarro

Presenta la estructura especiológica, distribución, espacio temporal y captura de peces e invertebrados accesibles a redes tipo Granton 130/400 y Engel 998/400, empleadas durante el Crucero de Evaluación del recurso merluza BIC Humboldt 9705-06. Así como el análisis de comunidades de peces del fondo de la fauna acompañante. Se capturó 134 especies: 99 fueron peces, 19 crustáceos, 12 moluscos, 2 equinodermos, 1 cnidario, 1 sipuncúlido y un cordado. En comparación con los dos últimos cruceros BIC SNP-1 9505-06 y 9607-08, la diversidad íctica se incrementó hasta 43%, aún sin haberse constatado presencia de la típica diversidad íctica tropical costera y estuarina. Al sur de los 6°S se encontró distribuida más del 50% de la riqueza íctica. La captura total fue 45.368,59 kg, de los cuales 40.106,04 se obtuvo en 63 lances de fondo y 5.262,55 kg con 20 lances de media agua. El falso volador Prionotus stephanophrys y la merluza Merluccius gayi peruanus fueron las especies más frecuentes y abundantes con 21.259,21 kg y 14.190,51 kg de captura total, respectivamente.

Effects of prior repeated-sprints with different recovery duration on oxygen uptake kinetics during subsequent heavy-exercise

Introduction: Prior repeated-sprints (6) has become an interesting method to resolve the debate surrounding the principal factors that limits the oxygen uptake (V'O2) kinetics at the onset of exercise [i.e., muscle O2 delivery (5) or metabolic inertia (3)]. The aim of this study was to compare the effects of two repeated-sprints sets of 6x6s separated by different recovery duration between the sprints on V'O2 and muscular de-oxygenation [HHb] kinetics during a subsequent heavy-intensity exercise. Methods: 10 male subjects performed a 6-min constant-load cycling test (T50) at intensity corresponding to half of the difference between V'O2max and the ventilatory threshold. Then, they performed two repeated-sprints sets of 6x6s all-out separated by different recovery duration between the sprints (S1:30s and S2:3min) followed, after 7-min-recovery, by the T50 (S1T50 and S2T50, respectively). V'O2, [HHb] of the vastus lateralis (VL) and surface electromyography activity [i.e., root-mean-square (RMS) and the median frequency of the power density spectrum (MDF)] from VL and vastus medialis (VM) were recorded throughout T50. Models using a bi-exponential function for the overall T50 and a mono-exponential for the first 90s of T50 were used to define V'O2 and [HHb] kinetics respectively. Results: V'O2 mean value was higher in S1 (2.9±0.3l.min-1) than in S2 (1.2±0.3l.min-1); (p<0.001). The peripheral blood flow was increased after sprints as attested by a higher basal heart rate (HRbaseline) (S1T50: +22%; S2T50: +17%; p≤0.008). Time delay [HHb] was shorter for S1T50 and S2T50 than for T50 (-22% for both; p≤0.007) whereas the mean response time of V'O2 was accelerated only after S1 (S1T50: 32.3±2.5s; S2T50: 34.4±2.6s; T50: 35.7±5.4s; p=0.031). There were no significant differences in RMS between the three conditions (p>0.05). MDF of VM was higher during the first 3-min in S1T50 than in T50 (+6%; p≤0.05). Conclusion: The study show that V'O2 kinetics was speeded by prior repeated-sprints with a short (30s) but not a long (3min) inter-sprints-recovery even though the [HHb] kinetics was accelerated and the peripheral blood flow was enhanced after both sprints. S1, inducing a greater PCr depletion (1) and change in the pattern of the fibres recruitment (increase in MDF) compared with S2, may decrease metabolic inertia (2), stimulate the oxidative phosphorylation activation (4) and accelerate V'O2 kinetics at the beginning of the subsequent high-intensity exercise.

Estudio del macrozoobentos durante durante el crucero de evaluación de recursos demersales BIC José Olaya Balandra 9806-07 de Puerto Pizarro a Huarmey

Estudia las muestras obtenidas en cuatro lances ubicados en el sublitoral peruano de fondo blando al norte de los 8°S frente a Puerto Pizarro, Paita, Sechura y Pimentel durante los meses de junio y julio de 1998. Los resultados obtenidos reflejan una relación directa entre las comunidades macrozoobentónicas y el recurso demersal. Se observa que las distribuciones de densidades, biomasas y diversidad son mayores en la subáreas al norte de los 6°S, teniendo como grupo más representativo a los anélidos Polychaeta.

Características biológicas de la merluza Merluccius gayi peruanus. Crucero BIC Jose Olaya Balandra 9901

El crucero se realizó entre el 7 y 26 de enero 1999, entre Huarmey (10°5 'S) y Puerto Pizarro (3° 29 'S). La merluza estuvo concentrada al norte de los 6°S, en un área reducida no habitual, desplazada en tres grados latitudinales, pero mantuvo la conocida estratificación latitudinal de tallas. Los cambios de las condiciones oceanográficas determinaron esta distribución, la estructura de tallas y otros aspectos biológicos de la especie.

Distribución y biomasa de los principales recursos pelágicos del mar peruano. Verano 2006

El crucero de evaluación hidroacústica de recursos pelágicos BIC Olaya y SNP2 0602-04 se realizó entre Tumbes e Ilo, del 20 febrero al 4 abril 2006. Se aplicó el método establecido por el IMARPE. La anchoveta, desde Talara a Mollendo (8.014.877 t), fue predominante en el ecosistema costero, con mayor concentración en los 6°S (Punta La Negra-Pimentel) y 10°S (Huarmey-Supe), pero su área fue menor, comparada con los veranos 2005 y 2004

Climatología de la salinidad superficial del mar frente a la costa peruana 1960-2008

Análisis de la información recopilada por el Instituto del Mar del Perú (IMARPE), durante el período 1960 - 2008, en el área del Pacífico sudeste comprendida entre los 3 y 18°S y desde la costa hasta los 86°W, con datos filtrados y procesados. Se obtuvo promedios por cuadrados Marsden de un grado; se elaboraron tablas y mapas patrón mensuales, estacionales y anuales, una serie de tiempo de medias mensuales para la banda costera dentro de las 60 mn, referida a tres periodos: a) 1960-1975, b) 1976-1992 y c) 1993-2008, además de una serie de promedios mensuales por cuadrados Marsden de un grado de la salinidad superficial del mar (SSM), para las zonas norte (Tumbes y Paita), central (Chimbote, Callao y Pisco), y sur (San Juan e Ilo). La SSM frente al Perú presentó promedios mensuales entre 29,47 y 35,94 ups, que varían de acuerdo a la estación del año, situación geográfica, topografía, factores meteorológicos, descargas de los ríos, etc. Los promedios mensuales patrón (multianuales) tuvieron rango de 32,92 a 35,62 ups; en verano (enero, febrero y marzo) 33,30 a 35,62 ups y en invierno (julio, agosto y setiembre) 33,96 a 35,44 ups; se registraron valores de transición en otoño (abril, mayo, junio) y primavera (octubre, noviembre y diciembre). La salinidad <34,00 ups corresponde a masas de agua de la región tropical, principalmente del golfo de Panamá (alta precipitación), en la zona costera al norte de 4°30'S. Aguas con salinidades de 34,00 - 34,80 ups se extienden por el lado costero hasta 6°S en verano, y se repliegan en invierno. Alta salinidad superficial corresponde a las aguas de la región subtropical (alta evaporación), que se presentan principalmente al sur de los 6°S con valores de 35,1 hasta 35,60 ups. Estas aguas tienen mayor aproximación a la costa durante el verano austral. En toda el área de estudio, el rango de la fluctuación anual de los promedios patrón de la SSM fue de 32,92 a 35,62 ups (± 2,70 ups en el año); con variación mensual de -0,1 a 0,1 ups al sur de 6°S; y de -0,3 a 0,3 ups al norte de 6°S, la mayor variación se da en la zona norte (Tumbes y Paita). La serie de tiempo mensual (1960 - 2008) en la franja costera (0 - 60 mn), entre los 3°S y 18°S, mostró importantes fluctuaciones decadales, destacando salinidad relativamente baja en los años 60 y después de El Niño (EN) 1997 - 98 hasta la actualidad.

Aspectos oceanográficos en verano 2004: Crucero pelágico BIC Olaya y SNP2 0402-03

El crucero 0402-03 se efectuó en forma simultánea en los BIC Olaya y SNP2, del 6 febrero al 25 marzo 2004, cubriendo el área entre los 3°30’ y 18°20’S y hasta una distancia máxima de 100 mn de la costa. Las principales observaciones fueron: (1) Diversas alteraciones del ambiente marino como la presencia de: (a) una lengua cálida de 26 °C frente a Casma y Chicama, fuera de las 60 mn, que originó anomalías de hasta +2,5 °C; (b) altas concentraciones de aguas subtropicales superficiales (ASS) (de hasta 35,5 ups) con gran aproximación a la costa, desde Huarmey a Pucusana y desde Atico a Mollendo; (c) altas concentraciones de oxígeno disuelto cerca de la costa, por efecto de alta actividad fotosintética o presencia de aguaje o marea roja. (2) Aguas tropicales superficiales (ATS) (<34,0 ups) se registraron al norte de Punta Sal. (3) Aguas ecuatoriales superficiales (AES) (34,0 – 34,8 ups) presentaron una proyección dentro de lo normal hasta los 6°S. (4) Aguas costeras frías (ACF) (34,9 – 35,0 ups) se concentraron al sur de Cerro Azul, asociadas al afloramiento costero; hacia el norte fueron más frecuentes en mezcla con las ASS. (5) Entre Caleta La Cruz y Chimbote se presentó una fuerte termoclina sobre los 40 m de profundidad. (6) La Extensión Sur de la Corriente de Cromwell (ESCC) se registró hasta la altura de Chimbote.

Condiciones oceanográficas y ondas Kelvin en primavera 2004: crucero BIC Olaya 0409-10

Este crucero oceanográfico 0409-10, se realizó entre el 24 setiembre y 7 octubre 2004; abarcó el área entre Punta Caballas (15°S) y Paita (5°S), hasta 190 mn de la costa. El objetivo era conocer las características del ambiente marino y establecer sus relaciones con un probable evento cálido. Las observaciones más importantes fueron: (1) ondas Kelvin, ya registradas en el invierno, motivaron proyección de aguas ecuatoriales superficiales hacia el sur y suroeste, entre los 5-7,5°S, provocando condiciones ligeramente cálidas en la zona oceánica, con un pequeño núcleo de anomalía térmica de +2,3 °C en la zona costera de Paita; (2) al sur de los 6°S (Punta La Negra) dentro de las 100 mn hubo anomalías térmicas próximas a lo normal; (3) el afloramiento costero se desarrolló moderadamente en el área de estudio en una franja de 10 a 25 mn de la costa, excepto en la zona frente a Paita; (4) las aguas subtropicales superficiales (ASS) se ubicaron fuera de las 50 mn entre 9-12°S, por fuera de las 160 mn al norte de esa latitud y a 25 mn de Pucusana, alcanzando 90 m de profundidad frente a Chimbote; (5) la isoterma de 15 °C se registró entre 11 a 100 m, con mayor profundidad frente a Chimbote, por fuera de 100 mn, mostrando que los flujos predominantes provinieron del sur; (6) la Extensión Sur de la Corriente de Cromwell (ESCC) mostró profundización de la isoterma de 14 °C y no con la de 15 °C como es normal; (7) vientos predominantes del SE con 4 a 7 m/s fueron característicos durante el crucero, excepto frente a Paita, Chicama y de regreso al Callao donde se registraron velocidades entre 7 a 11 m/s.

Condiciones oceanográficas en verano 2005: Crucero demersal BIC Olaya 0501- 02

El crucero de verano BIC Olaya 0501-02 se desarrolló del 18 de enero al 16 de febrero entre Punta Lobos (9º50'S) y el dominio marítimo norte del litoral peruano (3º25'S) hasta las 70 mn de la costa. Se realizaron dos perfiles oceanográficos de 150 mn (Paita y Punta Falsa) y de 100 mn (Chicama) a fin de conocer las características superficiales y subsuperficia, relacionar las variables ambientales con el compor tamiento de los recursos demersales. Las condiciones marinas fueron algo frías al norte de los 6ºS y cálidas al frente de Chicama (7º30'S), debido a la incursión de las Aguas Subtropicales Superficiales (ASS). Se observó la presencia de tres masas de agua: (a) aguas ecuatoriales superficiales (AES) al norte de Punta Sal; (b) aguas sub- tropicales superficiales (ASS) con anomalías positivas de +2ºC al frente de Mórrope y Chicama hasta las 40 mn de la costa; (c) predominancia de las aguas costeras frías (ACF) entre Paita y Casma, hasta las 30 mn de la costa. Ligeros procesos de mezcla (ASS y ACF) entre Punta La Negra y Mórrope, restringieron el afloramiento costero.

Aspectos oceanográficos en otoño 2005: Crucero demersal BIC Olaya 0506

El Crucero BIC Olaya 0506 se efectuó del 5 al 23 de junio 2005, entre Puerto Pizarro y Chicama. Los resultados más importantes fueron: (1) en el área de estudio predominaron las aguas costeras frías (ACF) asociadas al afloramiento, debido a los fuertes vientos del SE registrados las semanas anteriores y durante el rastreo acústico; (2) sólo al norte de los 4°S se observó aguas tropicales superficiales (ATS), mostrando una tendencia hacia su ubicación normal para la época; (3) en la zona norte, los vientos continuaron de moderados a fuertes, favoreciendo el desarrollo del afloramiento costero en esta zona; (4) al sur de los 6°S se mantuvieron las características de las ACF a pesar que el afloramiento mostró debilitamiento; (5) en general, el afloramiento costero se desarrolló en toda el área de estudio, pero la Extensión Sur de la Corriente de Cromwell (ESCC) mostró una tendencia hacia sus áreas habituales, después de haberse proyectado hasta el Callao.

Aspectos oceanográfcos durante el verano 2006: Crucero demersal BIC Olaya 0601-02

El crucero se desarrolló del 21 enero al 14 febrero 2006, desde Chicama hasta Puerto Pizarro a bordo del BIC Olaya. Las características oceanográficas de la columna de agua en la zona norte del área de estudio, presentó marcadas alteraciones debido a que las condiciones frías imperantes fueron alteradas por la proyección de Aguas Tropicales Superficiales (ATS) hasta los 4º30'S y Aguas Ecuatoriales Superficiales (AES) hasta los 6ºS procedentes de la zona tropical (Golfo de Panamá). El afloramiento costero se registró principal- mente entre Chicama a Chérrepe y frente a Paita. Las AES mostraron un espesor de 35 m frente a Paita, mientras que ATS se presentaron hasta 40 m de profundidad frente a Puerto Pizarro. Las concentraciones de oxígeno en el fondo fueron las más bajas de los últimos años, relacionado con las condiciones frías del último semestre del 2005. Por otro lado, la Extensión Sur de la Corriente de Cromwell (ESCC) se presentó muy debilitada con signos de recuperación, este escenario propició un repliegue del stock de merluza adulta hacia el norte. Al sur de los 7ºS se registraron condiciones superficiales próximas a lo normal.