Adaptive evolution of a novel avian-origin influenza A/H7N9 virus

In China, the recent outbreak of novel influenza A/H7N9 virus has been assumed to be severe, and it may possibly turn brutal in the near future. In order to develop highly protective vaccines and drugs for the A/H7N9 virus, it is critical to find out the selection pressure of each amino acid site. In the present study, six different statistical methods consisting of four independent codon-based maximum likelihood (CML) methods, one hierarchical Bayesian (HB) method and one branch-site (BS) method, were employed to determine if each amino acid site of A/H7N9 virus is under natural selection pressure. Functions for both positively and negatively selected sites were inferred by annotating these sites with experimentally verified amino acid sites. Comprehensively, the single amino acid site 627 of PB2 protein was inferred as positively selected and it function was identified as a T-cell epitope (TCE). Among the 26 negatively selected amino acid sites of PB2, PB1, PA, HA, NP, NA, M1 and NS2 proteins, only 16 amino acid sites were identified to be involved in TCEs. In addition, 7 amino acid sites including, 608 and 609 of PA, 480 of NP, and 24, 25, 109 and 205 of M1, were identified to be involved in both B-cell epitopes (BCEs) and TCEs. Conversely, the function of positions 62 of PA, and, 43 and 113 of HA was unknown. In conclusion, the seven amino acid sites engaged in both BCEs and TCEs were identified as highly suitable targets, as these sites will be predicted to play a principal role in inducing strong humoral and cellular immune responses against A/H7N9 virus. (C) 2014 Elsevier Inc. All rights reserved.

Vaccination for pregnant women: Need to address

Pregnancy is a critically important state for any women in her life time. Administration of a vaccine to a pregnant woman is not a routine event and it is generally preferred to administer vaccines either prior to conception or in the postpartum period. Currently vaccination with inactivated vaccines are recommended due to potential risk to mother and fetus with live vaccines. Multiple factors determine the administration of the vaccines for example age, life style, medical conditions (e.g., asthma, diabetes etc.), type and location of travel and status of previous vaccination. If pregnant woman is exposed to these vaccines or if pregnancy occurs soon after vaccination, the women should be counselled regarding the risks to the fetus and vaccination should not be a reason to consider termination of pregnancy. Further research in vaccination among pregnancy is warranted for the safety of the pregnant women and their newborn for a healthy living and better life.

Hemagglutinin sequence conservation guided stem immunogen design from influenza A H3 subtype

Seasonal epidemics caused by influenza A (H1 and H3 subtypes) and B viruses are a major global health threat. The traditional, trivalent influenza vaccines have limited efficacy because of rapid antigenic evolution of the circulating viruses. This antigenic variability mediates viral escape from the host immune responses, necessitating annual vaccine updates. Influenza vaccines elicit a protective antibody response, primarily targeting the viral surface glycoprotein hemagglutinin (HA). However, the predominant humoral response is against the hypervariable head domain of HA, thereby restricting the breadth of protection. In contrast, the conserved, subdominant stem domain of HA is a potential ``universal'' vaccine candidate. We designed an HA stem-fragment immunogen from the 1968 pandemic H3N2 strain (A/Hong Kong/1/68) guided by a comprehensive H3 HA sequence conservation analysis. The biophysical properties of the designed immunogen were further improved by C-terminal fusion of a trimerization motif, ``isoleucine-zipper'', or ``foldon''. These immunogens elicited cross-reactive, antiviral antibodies and conferred partial protection against a lethal, homologous HK68 virus challenge in vivo. Furthermore, bacterial expression of these immunogens is economical and facilitates rapid scale-up.

A Multiantigenic DNA Vaccine That Induces Broad Hepatitis C Virus-Specific T-Cell Responses in Mice

There are 3 to 4 million new hepatitis C virus (HCV) infections annually around the world, but no vaccine is available. Robust T-cell mediated responses are necessary for effective clearance of the virus, and DNA vaccines result in a cell-mediated bias. Adjuvants are often required for effective vaccination, but during natural lytic viral infections damage-associated molecular patterns (DAMPs) are released, which act as natural adjuvants. Hence, a vaccine that induces cell necrosis and releases DAMPs will result in cell-mediated immunity (CMI), similar to that resulting from natural lytic viral infection. We have generated a DNA vaccine with the ability to elicit strong CMI against the HCV nonstructural (NS) proteins (3, 4A, 4B, and 5B) by encoding a cytolytic protein, perforin (PRF), and the antigens on a single plasmid. We examined the efficacy of the vaccines in C57BL/6 mice, as determined by gamma interferon enzyme-linked immunosorbent spot assay, cell proliferation studies, and intracellular cytokine production. Initially, we showed that encoding the NS4A protein in a vaccine which encoded only NS3 reduced the immunogenicity of NS3, whereas including PRF increased NS3 immunogenicity. In contrast, the inclusion of NS4A increased the immunogenicity of the NS3, NS4B, andNS5B proteins, when encoded in a DNA vaccine that also encoded PRF. Finally, vaccines that also encoded PRF elicited similar levels of CMI against each protein after vaccination with DNA encoding NS3, NS4A, NS4B, and NS5B compared to mice vaccinated with DNA encoding only NS3 or NS4B/5B. Thus, we have developed a promising ``multiantigen'' vaccine that elicits robust CMI. IMPORTANCE Since their development, vaccines have reduced the global burden of disease. One strategy for vaccine development is to use commercially viable DNA technology, which has the potential to generate robust immune responses. Hepatitis C virus causes chronic liver infection and is a leading cause of liver cancer. To date, no vaccine is currently available, and treatment is costly and often results in side effects, limiting the number of patients who are treated. Despite recent advances in treatment, prevention remains the key to efficient control and elimination of this virus. Here, we describe a novel DNA vaccine against hepatitis C virus that is capable of inducing robust cell-mediated immune responses in mice and is a promising vaccine candidate for humans.

Haloarchaeal gas vesicle nanoparticles displaying Salmonella antigens as a novel approach to vaccine development

A safe, effective, and inexpensive vaccine against typhoid and other Salmonella diseases is urgently needed. In order to address this need, we are developing a novel vaccine platform employing buoyant, self-adjuvanting gas vesicle nanoparticles (GVNPs) from the halophilic archaeon Halobacterium sp. NRC-1, bioengineered to display highly conserved Salmonella enterica antigens. As the initial antigen for testing, we selected SopB, a secreted inosine phosphate effector protein injected by pathogenic S. enterica bacteria during infection into the host cells. Two highly conserved sopB gene segments near the 3'- region, named sopB4 and sopB5, were each fused to the grIpC gene, and resulting SopB-GVNPs were purified by centrifugally accelerated flotation. Display of SopB4 and SopB5 antigenic epitopes on GVNPs was established by Western blotting analysis using antisera raised against short synthetic peptides of SopB. Immunostimulatory activities of the SopB4 and B5 nanoparticles were tested by intraperitoneal administration of SopB-GVNPs to BALB/c mice which had been immunized with S. enterica serovar Typhimurium 14028 ApmrG-H111-D (DV-STM-07), a live attenuated vaccine strain. Proinflammatory cytokines IFN-y, IL-2, and IL-9 were significantly induced in mice boosted with SopB5-GVNPs, consistent with a robust Thl response. After challenge with virulent S. enterica serovar Typhimurium 14028, bacterial burden was found to be diminished in spleen of mice boosted with SopB4-GVNPs and absent or significantly diminished in liver, mesenteric lymph node, and spleen of mice boosted with SopB5GVNPs, indicating that the C-terminal portions of SopB displayed on GVNPs elicit a protective response to Salmonella infection in mice. SopB antigen-GVNPs were also found to be stable at elevated temperatures for extended periods without refrigeration. The results show that bioengineered GVNPs are likely to represent a valuable platform for antigen delivery and development of improved vaccines against Salmonella and other diseases.

Spread of Salmonella enterica in the body during systemic infection: unravelling host and pathogen determinants.

Salmonella enterica causes a range of life-threatening diseases in humans and animals worldwide. Current treatments for S. enterica infections are not sufficiently effective, and there is a need to develop new vaccines and therapeutics. An understanding of how S. enterica spreads in tissues has very important implications for targeting bacteria with vaccine-induced immune responses and antimicrobial drugs. Development of new control strategies would benefit from a more sophisticated evaluation of bacterial location, spatiotemporal patterns of spread and distribution in the tissues, and sites of microbial persistence. We review here recent studies of S. enterica serovar Typhimurium (S. Typhimurium) infections in mice, an established model of systemic typhoid fever in humans, which suggest that continuous bacterial spread to new infection foci and host phagocytes is an essential trait in the virulence of S. enterica during systemic infections. We further highlight how infections within host tissues are truly heterogeneous processes despite the fact that they are caused by the expansion of a genetically homogeneous microbial population. We conclude by discussing how understanding the within-host quantitative, spatial and temporal dynamics of S. enterica infections might aid the development of novel targeted preventative measures and drug regimens.

Dynamics of Streptococcus pneumoniae Serotypes Causing Acute Otitis Media Isolated from Children with Spontaneous Middle-Ear Drainage over a 12-Year Period (1999–2010) in a Region of Northern Spain

10 p.

Vacunas profilácticas frente al VPH

Actualmente sólo existen dos vacunas disponibles para la prevención primaria frente al virus del papiloma humano, Gardasil® y Cervarix®. Ambas vacunas ofrecen una alta protección contra los genotipos 16 y 18 del papillomavirus, que son los responsables de más del 70% de los cánceres de cérvix, segunda causa de mortalidad por cáncer a nivel mundial en mujeres. Además, Gardasil®, ofrece una protección del 99% para las mujeres y del 89,4% para los hombre, frente a los genotipos 6 y 11 del virus, responsables del 90% de las verrugas genitales. Uno de los principales obstáculos para su uso generalizado es su elevado coste, por ello, los ensayos clínicos se dirigen a conseguir una inmunogenicidad eficaz con el menor número de dosis. Cervarix® se comercializa en Europa con una pauta de dos dosis en niñas de 9 a 14 años, con una inmunogenicidad de 48 meses. Gardasil® ha sido autorizada para su comercialización para una pauta de dos dosis en niñas/os de 9 a 13 años, con una imunogenicidad de 36 meses. Ambas vacunas han despertado una gran controversia en los últimos tiempos, por este motivo se están realizando continuos estudios de control que, hasta la fecha, avalan su seguridad. La falta de información sobre las vacunas, los escasos programas de sensibilización y las dudas sobre su seguridad han dificultado su aceptación. El papel de la enfermera es clave en este aspecto para fomentar la vacunación, a través de actividades dirigidas hacía la promoción y prevención frente al virus del papiloma humano.

Avaliações econômicas do uso da vacina contra o Papilomavírus Humano (HPV) em meninas adolescentes: uma revisão sistemática

O câncer de colo do útero persiste como um importante problema de saúde em todo o mundo, em particular nos países em desenvolvimento. Duas vacinas contra o papilomavirus humano (HPV) encontram-se atualmente disponíveis e aprovadas para uso em meninas adolescentes, antes do início da vida sexual: uma bivalente, contra os sorotipos 16 e 18 e outra quadrivalente, contra os sorotipos 6, 11, 16 e 18. Estes imunobiológicos têm por objetivo induzir uma imunidade contra o papilomavírus e, desta forma, atuar na prevenção primária do câncer do colo de útero. As avaliações econômicas podem ser um elemento que auxiliem nos processos de tomada de decisão sobre a incorporação da vacina em programas de imunização nacionais. Estas avaliações foram o objeto central deste trabalho, que teve como objetivo sintetizar as evidências procedentes de uma revisão sistemática da literatura de estudos de avaliação econômica da utilização da vacina contra o HPV em meninas adolescentes e pré-adolescentes. Foi realizada uma busca na literatura nas bases MEDLINE (via Pubmed), LILACS (via Bireme) e National Health Service Economic Evaluation Database (NHS EED) ate junho de 2010. Dois avaliadores, de forma independente, selecionaram estudos de avaliação econômica completa, que tivessem como foco a imunização para HPV em mulheres com as vacinas comercialmente disponíveis direcionada à população adolescente. Após a busca, 188 títulos foram identificados; destes, 39 estudos preencheram os critérios de elegibilidade e foram incluídos na revisão. Por tratar-se de uma revisão de avaliações econômicas, não foi realizada uma medida de síntese dos valores de relação incremental entre custos e efetividade. Os 39 artigos incluídos envolveram 51 avaliações econômicas em 26 países. Predominaram estudos de custo-utilidade (51%). Do ponto de vista da perspectiva da análise, predominou o dos sistemas de saúde (76,4%). A maioria dos trabalhos (94,9%) elegeu meninas, com idade entre 9 e 12 anos, como sua população alvo e desenvolveu simulações considerando imunidade para toda a vida (84,6%). Os modelos utilizados nos estudos foram do tipo Markov em 25 análises, de transmissão dinâmica em 11 e híbridos em 3. As análises de sensibilidade revelaram um conjunto de elementos de incerteza, uma parte significativa dos quais relacionados a aspectos vacinais: custos da vacina, duração da imunidade, necessidade de doses de reforço, eficácia vacinal e cobertura do programa. Estes elementos configuram uma área de especial atenção para futuros modelos que venham a ser desenvolvidos no Brasil para análises econômicas da vacinação contra o HPV.

El VIH: el origen, la patología y el tratamiento

The HIV (Human Immunodeficiency Virus) is a very important disease in the world, with approximately 35 million people infected. In this study we have tried to expose the main characters of the virus, explaining the disease and the illness associated to the HIV. Besides, we have explained the antiretroviral treatments that are the most important weapon against the HIV. However, any of these treatments do not eliminate the HIV in the human body. For this reason, we have been looking for the new treatments and researches that have been development in the last years, including vaccines and genetic resistance. In addition, we have described the situation of the SIV (Simian Immunodeficiency Virus) in Africa, because it is the origin of the disease. The prevalence of the virus in primates population is something that have being studied for the last years, because it could be a new threat to the human population. Finally, we have proposed the researches lines that seems to be more effective and the ones that, in a future, could eliminate the virus in the human body.

Ensaios clínicos com vcinas anti-HIV/AIDS:a rotina de incorporação de uma prática científica

O estudo acompanha a rotina de um ensaio clínico de vacinas experimentais anti-HIV/AIDS desenvolvido no Projeto Praça Onze, da UFRJ, em colaboração com a rede mundial de pesquisas de vacinas anti-HIV/AIDS, HVTN (HIV Vaccine Trials Network) e apoio financeiro dos NIH (National Institutes of Health), dos EUA. Focaliza os processos de recrutamento, seleção e seguimento dos voluntários, articulando os aspectos mais gerais às particularidades e demandas locais deste estudo realizado no Rio de Janeiro, Brasil. Do ponto de vista teórico-conceitual utiliza recursos oriundos das ciências sociais - história, sociologia da ciência e da corrente interacionista da sociologia. O estudo mostra que, como todo ensaio clínico, o experimento do Projeto Praça Onze é uma atividade coletiva, sustentada sobre múltiplos atores e instâncias, com diversas racionalidades, o que gera uma permanente tensão. Estuda a tensão que se coloca, principalmente entre a expectativa dos profissionais envolvidos (aconselhadores, recrutadores, médicos, enfermeiros, farmacêuticos, gerentes e coordenadores de estudos) e a experiência vivenciada pelos voluntários, assim como as possíveis negociações propostas durante o desenvolvimento do protocolo, a partir do contexto sociopolítico onde o mesmo está inserido. Os profissionais, apesar de suas especificidades, articulam-se para incorporar do universo dos colegas suas linguagens e seus modos de agir, num processo de hibridização dos conhecimentos e práticas. Os voluntários do ensaio, por sua vez, submetem-se, por um lado a uma rotina de disciplina e compromisso, que implica na entrega de seu corpo à medicina, implícita nesse papel. Por outro, apropriam-se da lógica do ensaio clínico para, em sua ótica, transformar-se em um coadjuvante no descobrimento de uma nova biotecnologia, que neste caso, se coloca como uma questão de vida ou morte, para ele e para uma ampla comunidade de infectados pelo HIV. Para o voluntário a entrega do corpo à ciência faz parte da construção de uma bioidentidade e de uma biopolítica contemporânea, onde não se pode desconsiderar a constante inter-relação entre ciência, sociedade, técnica e política.

The role of probiotics in aquaculture in Nigeria - a review

Aquaculture is beset by many problems especially diseases caused by bacteria as the major deteriorating factors. The use of vaccines and antimicrobial agents have been centered on disease control, but are associated with problems The development of antibiotic resistance among the microorganisms have become a global concern as a result of indiscriminate use of antibiotics. Several alternative suggestions for disease prevention have been on probiotics for its efficacy, low cost, less side effects and accessible to farmers. Probiotics is gaining a high priority in the developed countries with the aim of replacing conventional drugs. The principal bacterial groups tested as probiotic bacteria in culture of shrimps, crabs, oysters, fish and humans are Vibrio, Pseudomonas, Bacillus, Bifidobacteria and several Lactobacilli. Experiments have mainly been conducted with fish larvae, adult fish, crustaceans and animals where significant reduction in mortalities has been obtained. The purpose of this review is to create awareness of the role of probiotics in disease control in aquaculture as alternative to antibiotics.

Avaliação de Potencialidade de Implantação de Sistema de Gestão Ambiental Dirigido às Empresas do Setor Farmacêutico Localizadas no Estado do Rio de Janeiro

A indústria farmacêutica, de um modo geral, manipula substâncias tóxicas, desenvolve atividades utilizando como matéria-prima um dos maiores bens da natureza, que é a água. Enfim, para produzir o medicamento em benefício do homem deixa como conseqüências, impactos ambientais consideráveis. Pretende-se mostrar que o segmento em questão, apesar de buscar se adequar às normas legais, como as da vigilância sanitária, ele é muito centrado na qualidade do produto, em detrimento dos aspectos ambientais, ainda que tendo disponível uma importante ferramenta para tal: A certificação de Boas Práticas de Fabricação (BPF) dos produtos farmacêuticos. A escolha do local da pesquisa foi o estado do Rio de Janeiro, por ser este, entre outros aspectos, um sítio onde historicamente se localizam empresas deste setor. O Rio de Janeiro e São Paulo são estados que congregam o maior número de fabricantes de medicamentos do país. Identificadas as indústrias foi realizado um levantamento para selecionar um grupo de empresas com características semelhantes. Como as grandes empresas deste segmento são dotadas de estrutura adequada à implantação de sistema de gestão ambiental, elas ficaram fora deste escopo. Também ficou fora da pesquisa o grupo formado por empresas que importam, embalam, comercializam, mas não fabricam os medicamentos e os produtores de fitoterápicos e veterinários. O resultado da pesquisa foi que as empresas privadas com número de empregados entre 50 e 500 e todas as públicas têm deficiência para atender aos requisitos ambientais legais, em outras palavras, as questões ambientais ficam restritas a Agência Nacional de Vigilância Sanitária (ANVISA / RDC-306) e aos processos de obtenção de licenças junto a Fundação Estadual de Engenharia do Meio Ambiente (FEEMA). Apenas uma dentre às vinte e oito pesquisadas tem Sistema de Gestão Ambiental SGA implantado. Como todos os fabricantes de medicamentos têm que cumprir as exigências da RDC-210, para obterem o Certificado de BPF e os registros dos medicamentos, assim eles já possuem a cultura, parte dos requisitos e a ferramenta necessária à implantação de um SGA de acordo com padrões voluntários como a NBR ISO 14001 (2004). Para comprovar tal evidência, o estudo apresentou o caso de uma empresa pública dotada de características inovadoras e cultura diferenciada, porque agrega colaboradores advindos de laboratórios privados. Tal empresa fabrica exclusivamente vacinas, biofármacos e reativos, sendo uma grande exportadora, sujeita à fiscalização internacional, como por exemplo, a da Organização Mundial da Saúde (OMS). Conclui-se que as empresas priorizam as questões da ANVISA e as ambientais precisam ser monitoradas e mitigadas. Um Plano de Ação para melhorias ambientais, visando à implantação de um SGA e a obtenção de um diferencial competitivo pode ser adotado, através da estrutura existente por força das exigências da ANVISA a qualquer empresa do setor farmacêutico

Long-Term Epidemiology of Streptococcus pneumoniae Serogroup 6 in a Region of Southern Europe with Special Reference to Serotype 6E

Streptococcus pneumoniae serotype 6E has recently been described, but its long-term epidemiology is not well known. From 1981-2013, 704 serogroup 6 clinical isolates were obtained in Gipuzkoa, Basque Country, Spain. All invasive and one in four non-invasive isolates were included. Overall, 75, 97, 51 and 45 serotypes 6A, 6B, 6C and 6E isolates, respectively, were detected. No serotype 6D isolates were identified. The prevalence of serotypes 6E and 6B, but not that of serotypes 6A and 6C, declined after the introduction of pneumococcal conjugate vaccines. Serotype 6E isolates showed the highest resistance rate. Most serotype 6E isolates were ST90.

Validação de métodos analíticos - estudos de casos relevantes de atividades dos laboratórios de controle de qualidade de vacinas

A validação dos métodos de análises em situações fora da rotina, em P&D pesquisa e desenvolvimento, pode tornar-se um processo de difícil solução, em oposição àquelas de rotina, onde as concentrações são conhecidas. Nesta última situação, o método analítico é validado e aprovado com simplicidade. Apesar dos elementos de qualidade básicos para análises em P&D serem os mesmos adotados nas análises de rotina, fatores como o comportamento imprevisível da amostra, a composição desconhecida da matriz e interdependência com o analito, mesmo a incerteza a respeito da escolha do método instrumental, requer uma atenção renovada nos elementos de qualidade existentes. A razão pode ser atribuída à imprevisibilidade do procedimento analítico e a extensão do esforço adicional dos elementos de qualidade. As incertezas das análises em P&D requerem uma cuidadosa consideração do problema, assim como a disponibilidade de técnicas analíticas. Ao mesmo tempo, devem-se observar o planejamento e organização do trabalho, a supervisão do desenvolvimento analítico e a adequação dos aspectos técnico e organizacional - no trabalho de P&D, a definição de responsabilidades e a competência do corpo técnico. A garantia da qualidade nas indústrias farmacêuticas é estabelecida pelo desenvolvimento de especificações apropriadas para matérias-primas, produtos intermediários e produtos finais. A importância de especificações adequadas foi estabelecida e exemplos foram dados no desenvolvimento de especificação típica para produtos farmacêuticos, tais como a vacina e matéria prima. Isto incluiu uma discussão dos tipos de parâmetros que precisam ser controlados e uma indicação dos valores numéricos ou faixas esperadas para muitos materiais utilizados. A metrologia analítica que necessita ser aplicada para demonstrar a observância com as especificações foi discutida, com as implicações de desempenho do método para diferenciar variações na qualidade do produto e a simples variabilidade analítica. Esse trabalho foi escrito para laboratórios, com a finalidade de dar um suporte na implementação da validação de métodos analíticos e introduzir o conceito de incerteza da medida nas análises de rotina. O objetivo foi fornecer de uma maneira compreensível e prática a metodologia dos cálculos das medidas de incerteza baseados principalmente em dados de controle de qualidade e de validação já existentes. Exemplos práticos retirados diretamente do Laboratório de Metrologia e Validação, FIOCRUZ / Bio-Manguinhos, foram apresentados. Entretanto, o tratamento usado neste trabalho é genérico e pode ser aplicável a outros laboratórios químicos