Developing molecular diagnostics for the detection of strawberry viruses

Developing molecular diagnostics for the detection of strawberry viruses.

Soil nitrogen—crop response calibration relationships and criteria for winter cereal crops grown in Australia

More than 1200 wheat and 120 barley experiments conducted in Australia to examine yield responses to applied nitrogen (N) fertiliser are contained in a national database of field crops nutrient research (BFDC National Database). The yield responses are accompanied by various pre-plant soil test data to quantify plant-available N and other indicators of soil fertility status or mineralisable N. A web application (BFDC Interrogator), developed to access the database, enables construction of calibrations between relative crop yield ((Y0/Ymax) × 100) and N soil test value. In this paper we report the critical soil test values for 90% RY (CV90) and the associated critical ranges (CR90, defined as the 70% confidence interval around that CV90) derived from analysis of various subsets of these winter cereal experiments. Experimental programs were conducted throughout Australia’s main grain-production regions in different eras, starting from the 1960s in Queensland through to Victoria during 2000s. Improved management practices adopted during the period were reflected in increasing potential yields with research era, increasing from an average Ymax of 2.2 t/ha in Queensland in the 1960s and 1970s, to 3.4 t/ha in South Australia (SA) in the 1980s, to 4.3 t/ha in New South Wales (NSW) in the 1990s, and 4.2 t/ha in Victoria in the 2000s. Various sampling depths (0.1–1.2 m) and methods of quantifying available N (nitrate-N or mineral-N) from pre-planting soil samples were used and provided useful guides to the need for supplementary N. The most regionally consistent relationships were established using nitrate-N (kg/ha) in the top 0.6 m of the soil profile, with regional and seasonal variation in CV90 largely accounted for through impacts on experimental Ymax. The CV90 for nitrate-N within the top 0.6 m of the soil profile for wheat crops increased from 36 to 110 kg nitrate-N/ha as Ymax increased over the range 1 to >5 t/ha. Apparent variation in CV90 with seasonal moisture availability was entirely consistent with impacts on experimental Ymax. Further analyses of wheat trials with available grain protein (~45% of all experiments) established that grain yield and not grain N content was the major driver of crop N demand and CV90. Subsets of data explored the impact of crop management practices such as crop rotation or fallow length on both pre-planting profile mineral-N and CV90. Analyses showed that while management practices influenced profile mineral-N at planting and the likelihood and size of yield response to applied N fertiliser, they had no significant impact on CV90. A level of risk is involved with the use of pre-plant testing to determine the need for supplementary N application in all Australian dryland systems. In southern and western regions, where crop performance is based almost entirely on in-crop rainfall, this risk is offset by the management opportunity to split N applications during crop growth in response to changing crop yield potential. In northern cropping systems, where stored soil moisture at sowing is indicative of minimum yield potential, erratic winter rainfall increases uncertainty about actual yield potential as well as reducing the opportunity for effective in-season applications.

First complete genome sequence of a capsicum chlorosis tospovirus isolate from Australia with an unusually large S RNA intergenic region

The first complete genome sequence of capsicum chlorosis virus (CaCV) from Australia was determined using a combination of Illumina HiSeq RNA and Sanger sequencing technologies. Australian CaCV had a tripartite genome structure like other CaCV isolates. The large (L) RNA was 8913 nucleotides (nt) in length and contained a single open reading frame (ORF) of 8634 nt encoding a predicted RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) in the viral-complementary (vc) sense. The medium (M) and small (S) RNA segments were 4846 and 3944 nt in length, respectively, each containing two non-overlapping ORFs in ambisense orientation, separated by intergenic regions (IGR). The M segment contained ORFs encoding the predicted non-structural movement protein (NSm; 927 nt) and precursor of glycoproteins (GP; 3366 nt) in the viral sense (v) and vc strand, respectively, separated by a 449-nt IGR. The S segment coded for the predicted nucleocapsid (N) protein (828 nt) and non-structural suppressor of silencing protein (NSs; 1320 nt) in the vc and v strand, respectively. The S RNA contained an IGR of 1663 nt, being the largest IGR of all CaCV isolates sequenced so far. Comparison of the Australian CaCV genome with complete CaCV genome sequences from other geographic regions showed highest sequence identity with a Taiwanese isolate. Genome sequence comparisons and phylogeny of all available CaCV isolates provided evidence for at least two highly diverged groups of CaCV isolates that may warrant re-classification of AIT-Thailand and CP-China isolates as unique tospoviruses, separate from CaCV.

National media regulations in an age of convergent media: Beyond globalisation, neo-liberalism and internet freedom theories

There is a widely held view that the nation-state has become less central to media and communications policy over the last two decades. As Jan van Cuilenberg and Denis McQuail (2003, p. 181) observed in their overview of trends in communications policy-making, 'the old normative media policies have been challenged and policy-makers are searching for a new communications policy paradigm'. There are characteristically five factors put forward as to why the nation-state has become less central to media in the twenty-first century

Understanding the civic impact of journalism

The importance of journalism to civil society is constantly proclaimed, but empirical evidence on journalism's impact, and how this operates, is surprisingly thin. Indeed, there is confusion even about what is meant by the term “impact”. Meanwhile, the issue of the role of journalism is becoming increasingly urgent as a consequence of the rapid changes engulfing the news media, brought about by technological change and the flow-on effect to the traditional advertising-supported business model. Assessing the impact of journalism has recently been the topic of debate among practitioners and scholars particularly in the United States, where philanthropists have responded to the perceived crisis in investigative journalism by funding not-for-profit newsrooms, with resulting new pressures being placed on journalists and editors to quantify their impact on society. These recent attempts have so far failed to achieve clarity or a satisfactory conclusion, which is not surprising given the complex web of causation within which journalism operates. In this paper, the authors propose a stratified definition of journalistic impact and function. They propose a methodology for studying impact drawing on realistic evaluation—a theory-based approach developed primarily to assess large social programmes occurring in open systems. The authors argue this could allow a conceptual and methodological advance on the question of media impacts, leading to research capable of usefully informing responses at a time of worrying change.

A rare P2X7 variant Arg307Gln with absent pore formation function protects against neuroinflammation in multiple sclerosis

Multiple sclerosis (MS) is a chronic relapsing-remitting inflammatory disease of the central nervous system characterized by oligodendrocyte damage, demyelination and neuronal death. Genetic association studies have shown a 2-fold or greater prevalence of the HLA-DRB1*1501 allele in the MS population compared with normal Caucasians. In discovery cohorts of Australasian patients with MS (total 2941 patients and 3008 controls), we examined the associations of 12 functional polymorphisms of P2X7, a microglial/macrophage receptor with proinflammatory effects when activated by extracellular adenosine triphosphate (ATP). In discovery cohorts, rs28360457, coding for Arg307Gln was associated with MS and combined analysis showed a 2-fold lower minor allele frequency compared with controls (1.11% for MS and 2.15% for controls, P = 0.0000071). Replication analysis of four independent European MS case–control cohorts (total 2140 cases and 2634 controls) confirmed this association [odds ratio (OR) = 0.69, P = 0.026]. A meta-analysis of all Australasian and European cohorts indicated that Arg307Gln confers a 1.8-fold protective effect on MS risk (OR = 0.57, P = 0.0000024). Fresh human monocytes heterozygous for Arg307Gln have >85% loss of ‘pore’ function of the P2X7 receptor measured by ATP-induced ethidium uptake. Analysis shows Arg307Gln always occurred with 270His suggesting a single 307Gln–270His haplotype that confers dominant negative effects on P2X7 function and protection against MS. Modeling based on the homologous zP2X4 receptor showed Arg307 is located in a region rich in basic residues located only 12 Å from the ligand binding site. Our data show the protective effect against MS of a rare genetic variant of P2RX7 with heterozygotes showing near absent proinflammatory ‘pore’ function.

Expected Performance of the ATLAS Experiment - Detector, Trigger and Physics

A detailed study is presented of the expected performance of the ATLAS detector. The reconstruction of tracks, leptons, photons, missing energy and jets is investigated, together with the performance of b-tagging and the trigger. The physics potential for a variety of interesting physics processes, within the Standard Model and beyond, is examined. The study comprises a series of notes based on simulations of the detector and physics processes, with particular emphasis given to the data expected from the first years of operation of the LHC at CERN.

Incidencia de fasciola hepática en bovinos sacrificados en la Empresa Nuevo Carnic de Nicaragua

En este trabajo, se analizó la situación existente con respecto a la incidencia de fasciola hepática, en la Empresa Nuevo Carnic, ubicada en el Km 11 carretera Norte, departamento de Managua; esta empresa cubre el 33% de la matanza industrial en Nicaragua. Con los datos recabados se evaluaron: Niveles de infestación de los años 1989, 1990, 1991 y 1992; se determinó el departamento de mayor incidencia; y las pérdidas económicas. Para el análisis estadístico, el método utilizado fue el de Chi-cuadrado, usando el procedimiento CATMOD del paquete Statistical Analisis System. Los resultados obtenidos en el análisis de vari1anza, demuestran que existen diferentes significativas entre años, con un nivel de significancia de P<0.05 obteniéndose 0.55% de infestación global para los cuatro años. León resultó ser el departamento con el mayor número de animales parasitados seguido de Jinotega, Matagalpa y Managua. Las pérdidas económicas revelan cifras aproximadas de C$ 25, 271. 20 (Veinticinco mil doscientos setenta y un Córdobas con veinte centavos) para el matadero, adicionando a esto las pérdidas no visibles, como mala conversión alimenticia abortos, animales que murieron debido a esta enfermedad.

Estudio epidemiológico de la prevalencia de brucelosis equina en el municipio de San Pedro de Lóvago, departamento de Chontales

El presente trabajo se realizó con el objetivo del Estudio epidemiológico de la Prevalencia de brucelosis equina en el Municipio de San Pedro de Lóvago Departamento de Chontales. El municipio de San Pedro de Lóvago está limitado al norte con los municipios de La Libertad y Santo Domingo, al sur con los Municipios de Sto. Tomas y Acoyapa, al Este con el Municipio de Sto. Tomas y al Oeste con el Municipio de Juigalpa. La Zona donde se encuentra ubicado posee un clima semihumedo conocido como de Sabana Tropical, predominando la producción pecuaria con carácter ganadero y donde la tenencia de la tierra está orientada hacia haciendas de ganadería extensiva. El trabajo experimental cubrió 19 comarcas, durante los meses de Abril y Octubre del 2005, donde se tomaron muestras serológicas de todos los equinos en edad reproductiva que se encontraron en las fincas pertenecientes a las cooperativas San Pedro y Manantial. Se usaron como variables de estudio la edad, sexo, comarcas y categorías. Los resultados que se obtuvieron, indicaron que en el municipio existe una Prevalencia del 0% de brucelosis equina, de un total de 511 animales muestreados por lo tanto no existe diferencia significativa entre las variables estudiadas, considerándose al Municipio de San Pedro de Lóvago libre de brucelosis equina durante el periodo estudiado.

Efecto de diferentes densidades de siembra y alturas de corte sobre la producción de biomasa y composición quimica de Cratylia argentea

El presente estudio se realizó en la finca Santa Rosa, propiedad de la Universidad Nacional Agraria (UNA), De partamento de Managua, localizada geográficamente a 12º08 ́15 ̈ latitud Norte y a 86º09 ́36 ̈ longitud Este, en el período Julio 2005-Julio 2006. Se evaluó el efecto de tres densidades de siembras (40 000, 20000 y 10 000 plantas/ha) y tres alturas de corte (20, 40 y 60 cm.) sobre la producción de biomasa y composición química de Cratylia argentea. Se utilizó un diseño experimental de Bloque Completamente al Azar con 4 repeticiones con arreglo de Parcelas Divididas, a las parcelas principales se les asignó la densidad de plantas y a las subparcelas las alturas de corte. Los resultados del análisis de vari anza (p<0.05) mostraron que la densidad de siembra de 40 000 plantas/ha presentó estadísticamente (P<0.05) diferencias altamente significativas dando los ma yores rendimientos para Materia Fresca Total (58.9 t/ha/año), Materia Seca Total (17.6 t/ha/año) y Altura de Planta (97.5 cm). No se encontró diferencias significativas entre densidades de siembra en contenido de MS,FDN, FDA y DIVMS, sin embargo, la densidad de siembra de 20 000 plantas/ha, presentó el mayor (P<0.05) contenido de PB (21.1%).La altura de corte de 60 cm mostró significativamente (P<0.05) los mejores resultados para MFT (57.5 t/ha/año), MST (18.1 t/ha/año) y Altura de Plantas ( 115.6 cm). No se encontró diferencias estadísticas entre alturas de corte para contenido de MS y hemicelulosa, no obstante la altura de corte de 20 cm mostró el mayor (P<0.05) contenido de PB (22.6%) y DIVMS (60.8%). La altura de corte de 60 cm presentó los mayores (P<0.05) contenidos de FDN (51.6%) y FDA (37.7%). No se encontró interacción entre densidades de siembra y alturas de corte.

Efecto del momento de fertilización, posición de la yema y sustratos en tres clones de quequisque (Xanthosoma sagittifolium (L) Schott) propagados a través de la técnica de reproducción acelerada de semillas

El presente estudio se realizó con el objetivo de determinar el efecto que ejercen la posición de la yema, el momento de fertilización y sustrato sobre la velocidad de brotación y el crecimiento de las plantas de los genotipos de quequisque (Xanthosoma sagittifolium (L.) Schott): Blanco (Bco), Masaya (My) y Nueva Guinea (NG) propagados a través de la técnica de reproducción acelerada de semillas - CRAS, además se pretendió contribuir en la definición de una metodología para la propagación rápida y masiva de plantas a través de esta técnica. Los estudios se llevaron a cabo en canteros con dimensiones de 4.75 m de largo por 1.3 m de ancho, con una capa de 5 cm de hormigón rojo y otra de 15 crn de arena y en bolsas de polietileno para vivero (0.91 kg). Se establecieron tres ensayos bifactoriales siguiendo el arreglo de diseños completos al azar (DCA): posición de la yema (hacia abajo y hacia arriba); momento de fertilización (sin fertilización -testigo-; con fertilizaciones a los 15 dds, 30 dds y 45 dds; a los 30 y 45 dds; y a los O, 15, 30 y 45 dds); y sustratos (arena, humus, suelo; 1:1 humus-suelo; 1:1:2 arena-humus-suelo). Se evaluaron las variables altura de planta (cm), grosor del pseudotallo (cm), número de hojas y área foliar (cm2 . A los datos numéricos de las variables se les realizó un análisis de varianza (ANDEVA). Las yemas colocadas hacia abajo registraron una velocidad de brotación estadísticamente superior (8.15 cm) a la registrada por las yemas colocadas hacia arriba (5.92 cm), independientemente del genotipo. El quequisque Bco, sin importar la posición de la yema, brotó más rápido (8.36 cm) que los otros genotipos; el genotipo My lo hizo más lentamente (5.16 cm). Los genotipos donde se fertilizó a los 30 y 45 dds obtuvieron resultados estadísticamente superiores en todas las variables (Bco 23.21, My 15.23 y NG 22.86 cm de altura). El testigo (sin fertilización) obtuvo los resultados más discretos (Bco 8.71, My 13.83 y NG 14.25 cm de altura). Ningún genotipo prevaleció en todas las variables evaluadas, sin embargo, el genotipo NG registró los resultados más sobresalientes. Las combinaciones más destacadas en las interacciones genotipo - fertilización fueron el clon Bco y NG fertilizadas a los 30 y 45 dds (23.21 y 22.86 cm de altura respectivamente); el testigo y la fertilización aplicada a los O, 15, 30 y 45 dds en combinación con los tres genotipos reportaron los resultados más bajos. Las plantas de los genotipos Bco (27.98 cm de altura) y My (25.65 cm de altura) desarrolladas en humus registraron valores estadísticamente superiores. En los sustratos arena (Bco 9.82 y My 11.59 cm de altura) y suelo (Bco 16.29 y My 3.20 cm de altura) se obtuvieron plantas con los valores más bajos en las variables evaluadas. En las interacciones, el genotipo Blanco reportó los mayores valores (altura 19.5 cm, grosor 1.13 cm y área foliar 122 cm 2 coincidiendo con los dos ensayos anteriores

Evaluación de los factores de la ecuación universal de perdida de suelo: Municipio San José de los Remates

El área experimental está ubicada en el departamento de Boaco, municipio de San José de los Remate, finca La Primavera cuya ubicación es latitud norte 12°36'43" y longitud oeste 85°44'07". El objetivo del presente estudio es determinar los factores de la E.U.P.S durante la estación lluviosa del 2006, bajo diferentes estrategias de cubierta vegetal (Grama natural y Bosque nativo). Se estableció un experimento en bloques, con tres repeticiones y dos tratamientos. Cada parcela tiene una dimensión de 50 metros de largo y 15 metros de ancho para un área útil de 750 m2 con un área total por tratamiento de 2,250 m2. El estudio demuestra que las mayores pérdidas de suelo se dieron en las parcelas de Bosque nativo con un valor promedio de 0.068 ton/ha y en las parcelas de Grama natural resultaron con perdidas menores con 0.0264 ton/ha. Además las pérdidas de suelos en todos los eventos fueron relativamente bajo en comparación a los niveles de tolerancia propuestos por Mennering (1981) y Schertz (1983). Se utilizo la Ecuación Universal de Pérdida de Suelo (E.U.P.S) el cual está compuesta por un total de 6 parámetro como R = 285.13 MJmm/hah,K = 0.017-0.019 ton ha h /ha MJ mm, S = 1.6, L = 4.27 a 8.89, C = Grama natura l0.01 y Bosque nativo 0.001, P = no se asumió por no existir práctica. Para el análisis de la información; se utilizó como método estadística T student con un grado de significancia del 95 % los efectos de las diferentes variables relacionada a los procesos de erosión del suelo y del escurrimiento superficial resultando no significativos para dichos cálculos establecidos. El uso de relación entre algunas variables no fue sensible a su relación como la erosividad vs. Intensidad de la lluvia o erosividad vs. Pérdida de suelo debido a los pocos eventos de lluvia que fueron analizados en este período de estudio. Recomendando que estos estudios deberán de ser proyectado a mediano y largo plazo para reconocer los procesos de erosión de suelo y el efecto del escurrimiento superficial en tierras escarpadas bajo la aplicación de modelos de predicción de erosión.

La precarite de l’emploi et ses multiples impacts a la lumière du genre

Résumé: A l’heure où l’on évoque une “génération précaire” il est intéressant de s’interroger sur l’accroissement de la précarité de l’emploi en France et d’étudier ses éventuels effets sur les salariés. L’objectif de la présente recherche était d’observer les impacts causés par la précarité de l’emploi sur une population de référence et voir si ces effets différaient selon le sexe du salarié soumis à la précarité. Pour ce faire, nous avons soumis un questionnaire à deux groupes de travailleurs. Ce dernier portait sur la précarité de l’emploi et ses impacts en termes de stress, consommation de substances et impacts sur la sphère privée. Les résultats font apparaître des effets significatifs et des tendances qui existent sur certaines des dimensions interrogées (stress et consommation) entre le groupe de travailleurs précaires et non précaires. De plus, des effets entre hommes et femmes ont également été relevés. Par contre, nous n’avons pas d’effets observés sur la sphère privée de l’individu. Suite à l’absence d’effet constaté nous interrogeons la spécificité de la population. Aussi, nous envisageons de prolonger cette étude sur la recherche d’indicateurs concernant la précarité enseignante. Mots clés: précarité professionnelle, précarité du travail, précarité de l’emploi, travailleurs précaires, inégalités hommes femmes, stress, substances addictives, impact vie hors travail

Efecto de diferentes densidades de siembra y alturas de corte sobre la producción de biomasa y composición química de Cratylia argentea

Con el objetivo de evaluar el efecto de tres densidades de siembras (10000, 20000 y 40000 plantas ha -1 ) y tres alturas de corte (20, 40 y 60 cm) sobre la producción de biomasa y composición química de Cratylia argentea , se estableció un experimento en Bloques Completamente al Azar con arreglo en Parcelas Divididas, en el período comprendido entre Julio 2005 y Julio 2006. El estudio se realizó en la finca Santa Rosa de la Universidad Nacional Agraria, Departamento de Managua, localizada geográficamente a 12º08 ́15 ̈ latitud Norte y a 86º09 ́36 ̈ longitud Este. Los resultados muestran que la producción de materia seca total (PMST) aumenta (p<0.05) desde 11.8 hasta 17.6 ton ha -1 y desde 8.2 hasta 18.1 ton ha -1 en la medida que la densidad de siembra se incrementó de 10000 a 40000 plantas ha -1 y la altura de corte se incrementó de 20 a 60 cm, respectivamente. Las densidades de siembra no tuvieron efecto significativo sobre el contenido de MS, Fibra Detergente Neutro (FDN), Fibra Detergente Acido (FDA) y Digestibilidad In Vitro de la MS (DIVMS), sin embargo, la densidad de siembra de 20000 plantas ha -1 presentó el mayor (P<0.05) contenido de PB (21.1%). No se encontró efecto significativo de las alturas de corte sobre el contenido de MS. No obstante la altura de corte de 20 cm mostró el mayor (P<0.05) contenido de PB (22.6%) y DIVMS (60.8%). La altura de corte de 60 cm presentó los mayores (P<0.05) contenidos de FDN (51.6%) y FDA (37.7%). No se encontró interacción entre densidades de siembra y alturas de corte.