Evolutionary dynamics of retrotransposable elements Rex1, Rex3 and Rex6 in neotropical cichlid genomes

Background: Transposable elements (TEs) have the potential to produce broad changes in the genomes of their hosts, acting as a type of evolutionary toolbox and generating a collection of new regulatory and coding sequences. Several TE classes have been studied in Neotropical cichlids; however, the information gained from these studies is restricted to the physical chromosome mapping, whereas the genetic diversity of the TEs remains unknown. Therefore, the genomic organization of the non-LTR retrotransposons Rex1, Rex3, and Rex6 in five Amazonian cichlid species was evaluated using physical chromosome mapping and DNA sequencing to provide information about the role of TEs in the evolution of cichlid genomes. Results: Physical mapping revealed abundant TE clusters dispersed throughout the chromosomes. Furthermore, several species showed conspicuous clusters accumulation in the centromeric and terminal portions of the chromosomes. These TE chromosomal sites are associated with both heterochromatic and euchromatic regions. A higher number of Rex1 clusters were observed among the derived species. The Rex1 and Rex3 nucleotide sequences were more conserved in the basal species than in the derived species; however, this pattern was not observed in Rex6. In addition, it was possible to observe conserved blocks corresponding to the reverse transcriptase fragment of the Rex1 and Rex3 clones and to the endonuclease of Rex6. Conclusion: Our data showed no congruence between the Bayesian trees generated for Rex1, Rex3 and Rex6 of cichlid species and phylogenetic hypothesis described for the group. Rex1 and Rex3 nucleotide sequences were more conserved in the basal species whereas Rex6 exhibited high substitution rates in both basal and derived species. The distribution of Rex elements in cichlid genomes suggests that such elements are under the action of evolutionary mechanisms that lead to their accumulation in particular chromosome regions, mostly in heterochromatins. © 2013 Schneider et al.; licensee BioMed Central Ltd.

Isolamento e caracterização de elementos transponíveis em espécies do gênero Brycon (Characidae, Bryconinae)

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Phoenissae de Sêneca: estudo introdutório, tradução e notas

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

A criança com psoríase e as relações vinculares com a mãe e a família

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Diálogos entre feminilidade e maternidade: um estudo sob o olhar da mitologia e da psicanálise

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Citogenética molecular e caracterização cromossômica no gênero Eigenmannia (Teleostei, Gymnotiformes, Sternopygidae)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Mapeamento cromossômico comparativo em peixes ciclícos utilizando sequências repetitivas de DNA

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Molecular phylogeny of the genus Saguinus (Platyrrhini, Primates) based on the ND1 mitochondrial gene and implications for conservation

The systematics of the subfamily Callitrichinae (Platyrrhini, Primates), a group of small monkeys from South America and Panama, remains an area of considerable discussion despite many investigations, there being continuing controversy over subgeneric taxonomic classifications based on morphological characters. The purpose of our research was to help elucidate the phylogenetic relationships within the monkey genus Saguinus (Callitrichinae) using a molecular approach to discover whether or not the two different sections containing hairy-faced and bare-faced species are monophyletic, whether Saguinus midas midas and Saguinus bicolor are more closely related than are S. midas midas and Saguinus midas niger, and if Saguinus fuscicollis melanoleucus and Saguinus fuscicollis weddelli really are different species. We sequenced the 957 bp ND1 mitochondrial gene of 21 Saguinus monkeys (belonging to six species and nine morphotypes) and one Cebus monkey (the outgroup) and constructed phylogenetic trees using maximum parsimony, neighbor joining, and maximum likelihood methods. The phylogenetic trees obtained divided the genus Saguinus into two groups, one containing the small-bodied species S. fuscicollis and the other, the large-bodied species S. mystax, S. leucopus, S. oedipus, S. midas, S. bicolor. The most derived taxa, S. midas and S. bicolor, grouped together, while S. fuscicollis melanoleucus and S. f. weddelli showed divergence values that did not support the division of these morphotypes into subspecies. On the other hand, S. midas individuals showed divergence compatible with the existence of three subspecies, two of them with the same morphotype as the subspecies S. midas niger. The results of our study suggest that there is at least one Saguinus subspecies that has not yet been described and that the conservation status of Saguinus species and subspecies should be carefully revised using modern molecular approaches.

Diversidade morfológica e molecular do gênero Oecomys thomas, 1906 (Rodentia: Cricetidae) na Amazônia oriental brasileira

Os roedores arborícolas do gênero Oecomys possuem distribuição reconhecida para áreas de floresta tropical e subtropical da América Central e do Sul, e compreendem 17 espécies atualmente reconhecidas, além de duas descritas, mas não nomeadas, reconhecidas em estudos prévios. Destas, apenas seis têm ocorrência esperada para a Amazônia oriental brasileira. A delimitação das espécies com base apenas em caracteres morfológicos é complicada, de forma que diversos táxons nominais já foram associados ao gênero e diversos arranjos taxonômicos foram propostos. Na única revisão taxonômica para o gênero, realizada há 50 anos, foram reconhecidas apenas duas espécies politípicas. Desde então, vários trabalhos envolvendo análises morfológicas, moleculares e cariotípicas têm demonstrado que há uma maior diversidade de espécies em Oecomys, resultando em descrições de espécies novas e revalidações de espécies anteriormente sinonimizadas. Este trabalho buscou caracterizar a variação morfológica e a diversidade molecular das espécies com ocorrência na Amazônia oriental brasileira. Para isto, empregamos análises filogenéticas com base no gene mitocondrial citocromo-b a fim de definir clados que representassem espécies, para as quais descrevemos a morfologia externa e craniana. Como resultado, reconhecemos 11 espécies com ocorrência para o leste da Amazônia brasileira, das quais cinco são esperadas para a região (Oecomys auyantepui, O. bicolor, O. paricola, O. rex e O. rutilus), duas são registradas pela primeira vez para o bioma Amazônia (Oecomys catherinae e O. cleberi) e quatro espécies são novas ou não reconhecidas como válidas atualmente, aqui denominadas Oecomys sp. A, Oecomys sp. B, Oecomys sp. C e Oecomys sp. D. Além disso, corroboramos estudos moleculares prévios em que Oecomys bicolor é um complexo de espécies, com base na alta taxa de divergência nucleotídica apresentada (7,5 %). Observamos dimorfismo sexual e variação ontogenética na morfometria craniana da espécie Oecomys paricola, e para efeito de comparação extrapolamos estas variações para as demais espécies tratadas aqui. Sugerimos também uma hipótese filogenética entre as espécies do gênero a partir de 653 pb do gene citocromo-b, sendo esta a filogenia mais abrangente para Oecomys publicada até o momento, devido ao elevado número de espécies incluídas (11 das 16 espécies atualmente reconhecidas e sete prováveis novas espécies) e a amplitude geográfica das amostras aqui utilizadas.

A identificação na filiação por adoção: um estudo na clínica psicanalítica

O presente trabalho nasceu das inquietações oriundas da escuta na clínica psicanalítica e consiste em um estudo sobre a identificação da criança com seus pais na filiação por adoção. Com o intuito de compreendê-la, realizou um percurso teórico investigando a identificação e a filiação na obra freudiana. Assim, chegou a Narciso e Édipo enquanto importantes mitos tomados pela psicanálise freudiana como fundadores do “Eu”. E, em função de que estes revelam que o ego se constrói através do vínculo afetivo inicial entre a criança e seus pais, adentrou também nas relações entre alteridade, cultura e identificação. A análise destas relações levou à constatação de que a cultura castra, põe limites à pulsão. Portanto, que o humano, tal qual Freud nos apresentou, é condenado a carregar consigo a angústia da incompletude e do desconhecimento de si. Deste modo, este estudo chegou à clínica psicanalítica, partindo de seu aspecto crucial, a saber, a transferência, tendo sempre como fio condutor o conceito de identificação. Então, apresentou esta mesma clínica no que se refere à análise de crianças de um modo geral e a de crianças perfilhadas em adoção mais especificamente, utilizando como método de pesquisa o Estudo de Caso Clínico. Para a análise da questão da identificação na construção do eu da criança na filiação por adoção, expôs fragmentos do atendimento clínico de uma criança perfilhada por um casal que não a gerou biologicamente. Esses fragmentos foram interpretados à luz dos aportes teóricos aqui descritos. As considerações finais deste estudo de caso indicaram que, se o percurso identificatório pelo qual o ego se constrói é absolutamente singular por um lado, por outro há aspectos peculiares às questões da identificação na filiação por adoção. Sobretudo os que se referem à herança genética e à existência de outros pais com os quais também a criança se identifica e precisa elaborar sua filiação.

O pai, a psicanálise e a mitologia: um estudo sobre a função paterna e suas configurações no mundo contemporâneo

Pós-graduação em Psicologia - FCLAS

O mito de édipo - uma análise antropológica

O artigo aborda o mito de Édipo procurando inicialmente desvendar o código calêndrico — astronômico do mito. Uma segunda leitura realça o tipo psicológico de Édipo no retrato que dele faz Sófocles, retrato que parece corresponder ao espirito da nascente filosófica grega. Finalmente, retomando análises de Luc de Heusch, R. Cohen e Yamagushi, procura desvendar um código político, tentando acompanhar as transformações da organização política dentro do contexto histórico do surgimento da polis, seguindo a mesma linha de investigação de Jean-Pierre Vernant.

De Hollywood a Aracaju: a Segunda Guerra Mundial por intermédio dos cinemas (1939-1945)

Pós-graduação em História - FCLAS

Noção de feminilidade em Melanie Klein: subjetivações para além de um registro fálico

Pós-graduação em Psicologia - FCLAS

Confluências entre mito, literatura e direito em Édipo Rei, de Sófocles

Pós-graduação em Letras - IBILCE