Dental anomalies in Richieri-Costa-Pereira syndrome

Objective. The objective of this study was to investigate the prevalence of dental anomalies in individuals with Richieri-Costa-Pereira syndrome. Study Design. A total of 13 individuals with Richieri-Costa-Pereira syndrome who were older than 8 years with at least 1 available panoramic radiograph were assessed. Dental anomalies were evaluated clinically and radiographically and classified as hyperplastic, hypoplastic, or heterotopic and as alterations of shape, number, position, and structure. Enamel alterations were classified by the DDE index. Results. All individuals exhibited anomalies, with predominance of hypoplastic disorders, mainly agenesis of mandibular incisors and second premolars and demarcated creamy-white enamel opacities primarily affecting the maxillary premolars. Conclusions. Individuals with Richieri-Costa Pereira syndrome exhibit high prevalence of tooth agenesis, especially mandibular incisors and premolars, as well as high frequency of enamel opacities. These findings are compatible with the mandibular cleft observed in all individuals and also reflect the hypoplastic characteristic of the syndrome. (Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol 2012;114:99-106)

Prevalência de anomalias congênitas associadas às fissuras labiopalatinas

Objetivo: Verificar a prevalência de anomalias congênitas associadas às fissuras labiopalatinas em crianças de 0 a 3 anos de idade. Métodos: Estudo transversal, observacional, aprovado pelo Comitê de Ética em Pesquisa (Ofício nº 412/2011). Participaram do estudo 325 mulheres, mães biológicas de crianças com fissuras labiopalatinas de 0 a 3 anos de idade, associadas ou não a anomalias congênitas, matriculados no HRAC-USP. A média de idade das mães foi de 29 anos e mediana de 28 anos. O tamanho amostral foi segundo a “Fórmula para cálculo de tamanho de amostra - Populações infinitas”. Os resultados foram tabulados em planilha do programa computacional Microsoft® Excel, apresentados em tabelas apontando a média, mediana, frequência absoluta (fi), frequência absoluta acumulada (Fi), frequência relativa acumulada (Fr). Para a comparação entre a porcentagem do agravo na população e amostra, utilizou-se o teste estatístico “Teste Exato de Fisher”, adotando-se nível de significância de 5%. Resultado: Quanto à prevalência de anomalias congênitas associadas às fissuras labiopalatinas, 209(64,30%) crianças na faixa etária de 0 a 3 anos, apresentaram fissura labiopalatina isolada e 116(35,69%) apresentaram algum tipo de anomalia congênita associada a essas fissuras. A fissura mais prevalente foi a fissura pós-forame, apresentando-se isolada em 63 casos e associadas à anomalias em 42 casos, seguida da fissura trans-forame incisivo unilateral esquerda, sendo 17 casos isolada e 59 casos associada à anomalias. A anomalia congênita associada às fissuras mais encontrada foi a Sequencia de Pierre Robin, seguida das cardiopatias diversas e malformações de pés e mãos. Conclusão: a prevalência de anomalias congênitas associadas às fissuras labiopalatinas foi de 35,69%.

Dual Sequence Simulated Annealing with Round-Robin Approach for University Course Timetabling

The university course timetabling problem involves assigning a given number of events into a limited number of timeslots and rooms under a given set of constraints; the objective is to satisfy the hard constraints (essential requirements) and minimize the violation of soft constraints (desirable requirements). In this study we employed a Dual-sequence Simulated Annealing (DSA) algorithm as an improvement algorithm. The Round Robin (RR) algorithm is used to control the selection of neighbourhood structures within DSA. The performance of our approach is tested over eleven benchmark datasets. Experimental results show that our approach is able to generate competitive results when compared with other state-of-the-art techniques.

Permanent shift: the topology of Didier Vermeiren's Cariatide à la Pierre

Photographic documentation of sculpture produces significant consequences for the way in which sculptural space is conceived. When viewed as discrete mediums the interaction of the photograph and its sculptural subject is always framed by notions of loss. However, when taken as a composite system, the sculpture-photograph proposes a new ontology of space. In place of the fixity of medium, we can observe a topology at play: a theory drawn from mathematics in which space is understood not as a static field but in terms of properties of connectedness, movement and differentiation. Refracted through the photographic medium, sculpture becomes not a field of fixed points in space, but rather as a fluid set of relations - a continuous sequence of multiple ‘surfaces’, a network of shifting views. This paper will develop a topological account of studio practice through an examination of the work of the contemporary Belgian sculptor Didier Vermeiren (b. 1951). Since the 1980s, Vermeiren has made extensive use of photography in his sculptural practice. By analysing a series of iterations of his work Cariatide à la Pierre (1997-1998), this paper proposes that Vermeiren’s use of photography reveals patterns of connection that expand and complicate the language of sculpture, while also emphasising the broader topology of the artist’s practice as a network of ‘backward glances’ to previous works from the artist’s oeuvre and the art-historical canon. In this context, photography is not simply a method of documentation, but rather a means of revealing the intrinsic condition of sculpture as medium shaped by dynamic patterns of connection and change. In Vermeiren’s work the sculpture-photograph, has a composite identity that exceeds straightforward categories of medium. In their place, we can observe a practice based upon the complex interactions of objects whose ontology is always underpinned by a certain contingency. It is in this fundamental mobility, that the topology of Vermeiren’s practice can be said to rest.

Une tradition technologique régionale de l’industrie de pierre polie dans la vallée de l’Outaouais au cours de l’Archaïque supérieur

La séquence culturelle régionale de l’Archaïque supérieur et terminal de la vallée de l’Outaouais n’est pas complétée, mais les variations stylistiques, technologiques et fonctionnelles des artéfacts sur le plan régional et local facilitent le découpage culturel. La reconstruction de la chaîne opératoire des haches, des herminettes et des gouges en pierre polie des sites Muldoon et Lamoureux, deux sites du sud-est ontarien, pourrait permettre de déceler une tradition technologique régionale à cheval entre l’Archaïque laurentien, l’Archaïque post-laurentien et d’autres courants des Grands Lacs. L’analyse des haches, des herminettes et des gouges des sites Muldoon et Lamoureux démontre l’utilisation massive de l’amphibolite. La moitié distale de ces outils est surtout polie et finement abrasée et la moitié proximale souvent éclatée, mais parfois abrasée. Ces éléments technologiques et l’industrie de pierre taillée démontrent des ressemblances et des différences avec les sites laurentiens de la région, et certains sites post-laurentiens du Québec et de l’Ontario méridional. Le matériel en pierre polie des sites Muldoon et Lamoureux démontre des liens technologiques vers l’Ouest tout en gardant un contact avec la sphère d’interaction postlaurentienne. La vallée de l’Outaouais semble alors prendre une place indépendante dans l’Archaïque supérieur, certaines continuités technologiques s’observent entre l’Archaïque laurentien et l’Archaïque post-laurentien.

Navigating the labyrinth: a guide to sequence-based, community ecology of arbuscular mycorrhizal fungi

Data generated from next generation sequencing (NGS) will soon comprise the majority of information about arbuscular mycorrhizal fungal (AMF) communities. Although these approaches give deeper insight, analysing NGS data involves decisions that can significantly affect results and conclusions. This is particularly true for AMF community studies, because much remains to be known about their basic biology and genetics. During a workshop in 2013, representatives from seven research groups using NGS for AMF community ecology gathered to discuss common challenges and directions for future research. Our goal was to improve the quality and accessibility of NGS data for the AMF research community. Discussions spanned sampling design, sample preservation, sequencing, bioinformatics and data archiving. With concrete examples we demonstrated how different approaches can significantly alter analysis outcomes. Failure to consider the consequences of these decisions may compound bias introduced at each step along the workflow. The products of these discussions have been summarized in this paper in order to serve as a guide for any researcher undertaking NGS sequencing of AMF communities.

Differential expression analysis for sequence count data via mixtures of negative binomials

The recent advent of Next-generation sequencing technologies has revolutionized the way of analyzing the genome. This innovation allows to get deeper information at a lower cost and in less time, and provides data that are discrete measurements. One of the most important applications with these data is the differential analysis, that is investigating if one gene exhibit a different expression level in correspondence of two (or more) biological conditions (such as disease states, treatments received and so on). As for the statistical analysis, the final aim will be statistical testing and for modeling these data the Negative Binomial distribution is considered the most adequate one especially because it allows for "over dispersion". However, the estimation of the dispersion parameter is a very delicate issue because few information are usually available for estimating it. Many strategies have been proposed, but they often result in procedures based on plug-in estimates, and in this thesis we show that this discrepancy between the estimation and the testing framework can lead to uncontrolled first-type errors. We propose a mixture model that allows each gene to share information with other genes that exhibit similar variability. Afterwards, three consistent statistical tests are developed for differential expression analysis. We show that the proposed method improves the sensitivity of detecting differentially expressed genes with respect to the common procedures, since it is the best one in reaching the nominal value for the first-type error, while keeping elevate power. The method is finally illustrated on prostate cancer RNA-seq data.

Plus ça change...Le renouvellement de la tradition chez Régine Robin, Dany Laferrière et Ying Chen

Cette thèse analyse la manifestation de la tradition dans certains textes des écrivains migrants au Québec, nommément La Québécoite et L’Immense fatigue des pierres de Régine Robin, Comment faire l’amour avec un nègre sans se fatiguer, Cette grenade dans la main du jeune nègre est-elle une arme ou un fruit ?, Pays sans chapeau et L’Énigme du retour de Dany Laferrière et, enfin L’Ingratitude et Immobile de Ying Chen. Les références à des récits, à des croyances et à des pratiques collectives qui se trouvent dans ces textes signalent une transformation de la transmission de l’héritage culturel d’une génération à l’autre. Afin de parvenir à une meilleure compréhension des liens entre la mémoire collective et la communauté culturelle se définissant dans le présent, je me sers du travail de folkloristes comme Alan Dundes, Simon Bronner et Richard Handler de même que des théories sur la faculté de la tradition proposées par Paul Ricœur, Walter Benjamin et Pierre Nora. Dans la première partie de la thèse, j’étudie l’imaginaire populaire du XIXe siècle et son incorporation dans la littérature canadienne-française de l’époque. Ensuite, j’analyse la remise en question de la tradition – de même que le rôle sous-jacent qu’elle continue de jouer, lors de la Révolution tranquille. Par rapport à ces deux périodes précédentes, l’usage du folklore chez les auteurs migrants laisse présager une nouvelle opération de la tradition dans un contexte où plusieurs groupes culturels se rencontrent. Dans un contexte pluraliste, l’idée de la communauté culturelle est fabriquée en fonction de notre appartenance à plusieurs groupes. Je m’intéresse à comment les gens qui habitent ensemble formulent des liens au passé même dans une situation dans laquelle ils ne partagent pas les mêmes rapports à la mémoire collective. Explorant le renouvellement, qui peut sembler paradoxal, de la tradition, je forme l’hypothèse qu’il est possible pour un groupe de se définir en fonction de valeurs culturelles puisées dans un passé collectif qui s’adaptent constamment à la réalité actuelle.

Plus ça change...Le renouvellement de la tradition chez Régine Robin, Dany Laferrière et Ying Chen

Cette thèse analyse la manifestation de la tradition dans certains textes des écrivains migrants au Québec, nommément La Québécoite et L’Immense fatigue des pierres de Régine Robin, Comment faire l’amour avec un nègre sans se fatiguer, Cette grenade dans la main du jeune nègre est-elle une arme ou un fruit ?, Pays sans chapeau et L’Énigme du retour de Dany Laferrière et, enfin L’Ingratitude et Immobile de Ying Chen. Les références à des récits, à des croyances et à des pratiques collectives qui se trouvent dans ces textes signalent une transformation de la transmission de l’héritage culturel d’une génération à l’autre. Afin de parvenir à une meilleure compréhension des liens entre la mémoire collective et la communauté culturelle se définissant dans le présent, je me sers du travail de folkloristes comme Alan Dundes, Simon Bronner et Richard Handler de même que des théories sur la faculté de la tradition proposées par Paul Ricœur, Walter Benjamin et Pierre Nora. Dans la première partie de la thèse, j’étudie l’imaginaire populaire du XIXe siècle et son incorporation dans la littérature canadienne-française de l’époque. Ensuite, j’analyse la remise en question de la tradition – de même que le rôle sous-jacent qu’elle continue de jouer, lors de la Révolution tranquille. Par rapport à ces deux périodes précédentes, l’usage du folklore chez les auteurs migrants laisse présager une nouvelle opération de la tradition dans un contexte où plusieurs groupes culturels se rencontrent. Dans un contexte pluraliste, l’idée de la communauté culturelle est fabriquée en fonction de notre appartenance à plusieurs groupes. Je m’intéresse à comment les gens qui habitent ensemble formulent des liens au passé même dans une situation dans laquelle ils ne partagent pas les mêmes rapports à la mémoire collective. Explorant le renouvellement, qui peut sembler paradoxal, de la tradition, je forme l’hypothèse qu’il est possible pour un groupe de se définir en fonction de valeurs culturelles puisées dans un passé collectif qui s’adaptent constamment à la réalité actuelle.