Data compilation on the biological response to ocean acidification: environmental and experimental context of data sets and related literature

The exponential growth of studies on the biological response to ocean acidification over the last few decades has generated a large amount of data. To facilitate data comparison, a data compilation hosted at the data publisher PANGAEA was initiated in 2008 and is updated on a regular basis (doi:10.1594/PANGAEA.149999). By January 2015, a total of 581 data sets (over 4 000 000 data points) from 539 papers had been archived. Here we present the developments of this data compilation five years since its first description by Nisumaa et al. (2010). Most of study sites from which data archived are still in the Northern Hemisphere and the number of archived data from studies from the Southern Hemisphere and polar oceans are still relatively low. Data from 60 studies that investigated the response of a mix of organisms or natural communities were all added after 2010, indicating a welcomed shift from the study of individual organisms to communities and ecosystems. The initial imbalance of considerably more data archived on calcification and primary production than on other processes has improved. There is also a clear tendency towards more data archived from multifactorial studies after 2010. For easier and more effective access to ocean acidification data, the ocean acidification community is strongly encouraged to contribute to the data archiving effort, and help develop standard vocabularies describing the variables and define best practices for archiving ocean acidification data.

Distribution of diatoms, coccolithophores and planktic foraminifera in the Arabian Sea

The distribution of diatoms, coccolithophores and planktic foraminifers mirrored the hydrographic and trophic conditions of the surface ocean (0-100 m) across the upwelling area off the Oman coast to the central Arabian Sea during May/June 1997 and July/August 1995. The number of diatoms was increased in waters with local temperature minimum and enhanced nutrient concentration (nitrate, phosphate, silicate) caused by upwelling. Vegetative cells of Chaetoceros dominated the diatom assemblage in the coastal upwelling area. Towards the more nutrient depleted and stratified surface waters to the southeast, the number of diatoms decreased, coccolithophore and planktic foraminiferal numbers increased, and floral and faunal composition changed. In particular, the transition between the eutrophic upwelling region off Oman and the oligotrophic central Arabian Sea was marked by moderate nutrient concentration, and high coccolithophore and foraminifer numbers. Florisphaera profunda, previously often referred as a 'lower-photic-zone-species', was frequent in water depths as shallow as 20 m, and at high nutrient concentration up to 14 µmol NO3/l and 1.2 µmol PO4/. To the oligotrophic southeast of the divergence, cell densities of coccolithophores declined and Umbellosphaera irregularis prevailed throughout the water column down to 100 m depth. In general, total coccolithophore numbers were limited by nutrient threshold concentration, with low numbers (<10*10**3 cells/l) at high [NO3] and [PO4], and high numbers (>70*10**3 cells/l) at low [NO3] and [PO4]. The components of the complex microplankton succession, diatoms, coccoliths and planktic foraminifers (and possibly others), should ideally be used as a combined paleoceanographic proxy. Consequently, models on plankton ecology should be resolved at least for the seasonality, to account for the bias of paleoceanographic transfer calculations.

Ausonius’ Caesares

Ausonio de Burdigala (Burdeos) escribe entre los años 379-383 su obra poética titulada Caesares. Esta colección es una biografía de la vida de los emperadores en verso (hexámetro y dístico elegíaco). Caesares no está completa; la obra acaba de repente en el cuarteto dedicado a Heliogábalo. En este trabajo abordamos el género de la colección, examinamos el estilo de Ausonio en varias partes (monósticos y tetrásticos) y destacamos las fuentes (Suetonio, Tácito, Kaisergeschichte, Mario Máximo). Asimismo valoramos las diferentes opiniones que los estudiosos de Ausonio han expresado sobre la parte perdida de esta colección.

Profesionales de la educación en la Hispania romana

La epigrafía latina nos ha legado el recuerdo de doce docentes y un grupo de maestros de escuela en Hispania. Los diferentes textos, la mayoría de carácter funerario y procedente del ámbito urbano, nos aportan información acerca de las funciones que estos profesionales desempeñaron en la sociedad hispana, así como del contexto socio-jurídico del que provenían. En este sentido, la pieza más valiosa es la inscripción dedicada a un gramático llamado L. Memmius Probus en la antigua Tritium Magallum, gracias a la cual conocemos las circunstancias concretas en las que trabajó este educador.

Stable isotope ratios in bentho-demersal biota along a depth gradient in the bay of biscay: A multitrophic study

Although stable isotope ratios are increasingly used to investigate the trophic ecology of marine organisms, their spatial variations are still poorly understood in the coastal environment. In this study, we measured the stable isotope composition (δ13C, δ15N) of suspended particulate organic matter (SPOM) (primary producer), a suspension feeder, the great scallop Pecten maximus (primary consumer), megabenthic decapods and benthic fishes (secondary consumers) along a depth gradient (from 5m to 155m depth) across the continental shelf of the Bay of Biscay. Although the three trophic levels exhibited similar δ13C patterns along the gradient, the δ15N patterns varied between SPOM, scallops and carnivores. The δ15N difference between SPOM and scallops decreased with increasing depth, suggesting that non trophic factors may affect the stable isotope composition of scallops at deepest sampling stations. An opposed trend was found between scallops and carnivores, suggesting that the trophic level of these carnivores increased at higher depth, possibly as an adaptation to lower prey abundances. Although our results suggest that primary consumers are suitable to establish isotopic baselines in coastal environments, we stress the need for further studies aiming at characterizing the variability of stable isotopes in coastal biota, and the respective effects of baseline, trophic and metabolic factors in their isotopic composition.

Bilan 2015 du dispositif national de surveillance de la santé des mollusques marins

Depuis 1992, la surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français est assurée par le réseau de Pathologie des Mollusques (Repamo). Ses activités s’inscrivent dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Depuis son évaluation par la plateforme nationale d’épidémiosurveillance en santé animale en 2012, l’objectif de surveillance est la détection précoce des infections dues à des organismes pathogènes exotiques et émergents affectant les mollusques marins sauvages et d’élevage. L’année 2015 est la première année de transition pour laquelle un début d’évolution des modalités de surveillance de la santé des mollusques marins animées par l’Ifremer a été amorcé. Un dispositif hybride de surveillance a été mis en place, s’appuyant sur l’existant et intégrant des débuts d’évolution. La surveillance événementielle a constitué l’activité principale du dispositif en 2015 et s’est appuyée sur des réseaux existants : (1) la surveillance des mortalités observées sur des animaux sentinelles déployés sur les sites ateliers des réseaux Ifremer RESCO 2 (12 sites) pour l’huître creuse Crassostrea gigas et MYTILOBS 2 (8 sites) pour la moule bleue Mytilus edulis. Pour l’huître creuse Crassostrea gigas, la mortalité cumulée moyenne était de 50,3% (écart-type 10,9%) pour le naissain standardisé Ifremer (NSI), de 11,0% (écart-type 9,1%) pour les huîtres de 18 mois et de 7,3% (écart-type 5,6%) pour les huîtres de 30 mois. Les mortalités ont été observées principalement entre le début du mois de mai et la mi-juillet. Lors de ces épisodes de mortalité, des prélèvements d’animaux ont été réalisés en vue d’analyses diagnostiques : 7 prélèvements pour le NSI, 2 pour les huîtres de 18 mois et 1 pour les huîtres de 30 mois. Aucun agent réglementé n’a été détecté dans les échantillons d’huîtres creuses prélevés et analysés. Le virus OsHV-1 a été détecté dans les 7 échantillons analysés de NSI, dans 2 échantillons analysés d’huîtres de 18 mois et dans 1 échantillon analysé d’huîtres de 30 mois. La bactérie Vibrio aestuarianus a été détectée dans 5 échantillons analysés de NSI, dans 1 échantillon d’huîtres de 18 mois et dans 1’échantillon d’huîtres de 30 mois. Pour la moule bleue Mytilus edulis, des mortalités cumulées variant de 9% sur le site du Vivier à 51% sur le site des filières du Pertuis Breton ont été estimées. Les mortalités ont été observées au printemps sur des moules âgées d’une année et en automne sur des moules plus jeunes. Lors de ces épisodes de mortalités, des prélèvements d’animaux ont été réalisés en vue d’analyses diagnostiques : 2 prélèvements pour les moules d’une année et 1 pour les jeunes moules. Ces prélèvements ont eu lieu dans le Pertuis Breton. Aucun agent réglementé n’a été détecté dans les échantillons de moules prélevés et analysés. Des bactéries du groupe Splendidus ont été détectées dans les 3 échantillons de moules analysés. (2) la surveillance s’appuyant sur les déclarations de mortalités de mollusques par les conchyliculteurs et pêcheurs à pied professionnels auprès des Directions départementales des territoires et de la mer (DDTM). Cette modalité s’applique aux huîtres creuses et aux moules bleues lorsqu’il n’existe pas de site atelier RESCO 2 ou MYTILOBS 2 dans la zone où des mortalités sont déclarées par les conchyliculteurs ou pêcheurs à pied. Le réseau REPAMO 2 a réalisé 22 interventions, dont 15 pour les moules Mytilus edulis, 4 pour les coques Cerastoderma edule, 2 pour les palourdes Ruditapes sp. et 1pour les coquilles saint Jacques Pecten maximus. La recherche d’agents infectieux dans ces espèces de mollusques prélevés lors de hausse de mortalité a permis de mettre en évidence les parasites réglementés Perkinsus olseni dans 1 lot de palourdes, et Marteilia refringens dans 4 lots de moules, ainsi que le virus OsHV-1 dans 1 lot de palourdes et 1 lot de coques, la bactérie Vibrio aestuarianus dans 3 lots de coques, et des bactéries du groupe Splendidus dans 3 lots de coques et dans 13 lots de moules. L’année 2015 a également permis la démonstration sur un site atelier d’un exercice de surveillance programmée, ciblée et fondée sur les risques d’introduction et d’installation d’un organisme pathogène exotique. Elle a concerné le parasite Mikrocytos mackini de l’huître creuse Crassostrea gigas, sur un site atelier de la Charente-Maritime, suivi par le réseau RESCO 2. Le parasite Mikrocytos mackini n’a pas été détecté. En revanche, le parasite Marteilia refringens a été détecté dans ¾ des prélèvements d’huîtres réalisés. Dans le cadre du soutien scientifique et technique de l’évolution de la surveillance événementielle, l’année 2015 a également permis de poursuivre la démarche relative aux développements méthodologiques en lien avec la surveillance événementielle des mortalités de mollusques marins. Une étude de faisabilité de la recherche prospective de regroupements spatio-temporels d’événements de mortalités d’huîtres creuses a été préparée en collaboration avec tous les acteurs de la santé des mollusques marins en Normandie. Un outil de collecte et d’analyse des données de signalements des mortalités, automatisé, simple d’utilisation et flexible, a été élaboré.

Evaluation du stock de coquilles Saint-Jacques de la Baie de Seine et du Proche Extérieur. COMOR 32 (8-23 juillet 2002)

Scientific scallop surveys called COMOR are carried out in the bay of Seine since 1976. Results are used by fishermen’ associations and by fishing administration to lead management measures. In this report, the scientific results of the survey COMOR 32 realised in July 2002 are described. Abundance and growth indices for scallop, by age and area, are presented. During these surveys, data about most abundant benthic species are also collected since 1998. A first assessment with five years data is made here. A global descriptive analysis is undertaken about all the species present on scallops grounds. A special zoom is applied on both species whitch could be exploited (whelk Buccinum undatum and queen scallop Aequipecten opercularis) and three competitive species (starfish Asterias rubens, American slipper-limpet Crepidula fornicata and brittle star Ophiothrix fragilis)

Programme de recherche pour la mise au point d'une méthode d'élevage de coquilles Saint-Jacques en Méditerranée. Rapport d'avancement des travaux, résultats obtenus en écloserie en 1989 et au cours du premier semestre 1990

Au cours de la période considérée, il a été effectué 4 cycles d'élevage larvaire complets et 5 cycles d'élevage post-larvaire matérialisant une importante évolution quantitative par rapport aux deux années antérieures du programme. Le protocole, décrit dans le rapport d'avancement des travaux 1988, n'a pas subi d'aménagements majeurs saufen matière de conditionnement des géniteurs. Malgré les progrès réalisés dans la production de larves "D" et en survie larvaire, il n'a pas été possible d'obtenir un nombre de post-larves significatif de Pecten jacobaeus pour cause de mortalité à la fixation. En revanche, un essai mené en parallèle à partir de pédivéligères de Pecten maximus, originaires d'Argenton, s'est soldé par l'obtention de près de 30.000 naissains dans des conditions de rendement satisfaisants. Enfin, le suivi mensuel de l'indice gonadique de la population naturelle de Pecten jacobaeus, associé à un examen histologique des gonades pendant une année, a permis de préciser pour la première fois en Méditerranée française le cycle de reproduction, ainsi que la période optimale de réponse à un stimuli de déclenchement de ponte.

A tradução de textos económico-financeiros de português para inglês: potencialidades da Plataforma ISTRION

Este Trabalho de Projeto tem como objetivo primordial analisar a tradução, de português para inglês, de textos económico-financeiros, utilizando a plataforma de Tradução Automática (TA) ISTRION. A tradução de conteúdos selecionados da Newsletter Económico-Financeira Maximus Report é efetuada com base na referida plataforma, complementada com outras ferramentas de apoio ao processamento linguístico que sejam consideradas relevantes. Visa-se igualmente com este Trabalho de Projeto analisar as potencialidades desta plataforma, bem como medir os resultados da tradução. Por último pretende-se enquadrar, testar, estudar e medir quais os critérios em que se poderá tornar mais eficiente a tradução destes textos.

Efeito do encurtamento muscular dos flexores da anca na actividade muscular dos extensores da anca, durante uma tarefa de agachamento, em jovens jogadores de futebol

Projeto de Graduação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Licenciado em Fisioterapia

Avaliação da atividade muscular do vasto medial oblíquo em diferentes exercícios

Projeto de Graduação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Licenciado em Fisioterapia

The taxonomy, zoogeography and ecology of amphibians and reptiles of Hin Nam No National Protected Area (Laos) in comparison with data from Phong Nha – Ke Bang National Park (Vietnam).

In this thesis the mostly unknown herpetofauna in Hin Nam No National Protected Area Laos in the northern Truong Son Range was for the first time intensively investigated, and its diversity was compared to the bordering, and well-investigated Phong Nha - Ke Bang National Park in Vietnam. Twelve new vertebrate species were described comprising 11 geckonids (Cyrtodactylus bansocensis, C. calamei, C. hinnamnoensis, C. jaegeri, C. rufford, C. sommerladi, C. soudthichaki, Gekko boehmei, G. bonkowskii, G. sengchanthavongi, G. thakhekensis, Lycodon banksi and one colubrid snake (Lycodon banksi). Seven species were discovered for the first time in Laos including three frogs (Gracixalus quyeti, G. supercornutus, Rhacophorus maximus), two geckos (Cyrtodactylus cryptus, C. pseudoquadrivirgatus) and two snakes (Lycodon futsingensis, L. ruhstrati abditus). The main hypothesis that the Truong Son Range acted as a biogeographic barrier for the distribution of amphibians and reptiles could be confirmed at least for karst adapted gekkonids. Compared to other herpetofaunal groups the number of gekkonids in karst formations was particularly high (seven bent-toed geckos, four true geckos). By comparing the relative amounts of shared species in Hin Nam No and Phong Nha - Ke Bang, it is interesting to note that fewer reptile species (38%) than amphibian species (66%) were shared between both regions. This might indicate that the Truong Son Range acts as a stronger biogeographical barrier for reptiles than for amphibians. Two pairs of karst-adapted cryptic gecko species (i.e. species with distinct genetic differences, but a similar phenotype) occurred on both sides of the Truong Son Range. Only in one case these were sibling species (Crytodactylus sommerladi in Laos versus C. roesleri in Vietnam), but not in the other (C. hinnamnoensis in Laos versus C. phongnhakebangensis in Vietnam). On the Laotian side, nine gecko species (Cyrtodactylus bansocensis, C. calamei, C. darevskii, C. hinnamnoensis, C. khammouanensis, C. multiporus, C. sommerladi, G. boehmei, G. sengchanthavongi) currently have to be regarded as endemic to the Hin Nam No region. On the Vietnamese side, seven species including two bent-toed geckos (Cyrtodactylus phongnhakebangensis and C. roesleri), three skinks (Lygosoma boehmei, Sphenomorphus tetradactylus and Tropidophorus noggei), and two snakes (Hebius andreae and Boiga bourreti) are currently only known from Phong Nha - Ke Bang and adjacent regions. These high numbers of potential endemic species together with the cryptic species complex in Cyrtodactylus provide strong evidence that the karst formations in the northern Truong Son Range represent a hot spot of reptile diversity and of speciation in Crytodactylus in particular. Correct species identification is a fundamental requirement for conservation measures. The discovery of cryptic species complexes poses a challenge for alpha taxonomy and species conservation, because the true distribution ranges of the species are in fact much smaller than previously assumed. Species conservation in this area of Laos is facing a number of further problems. New and potentially endemic species were discovered in highly populated and disturbed areas. Conversion of the Ho Chi Minh Trail into a highway provided easy access for farmers and still continues to accelerate the destruction of remote forest areas. Southern Hin Nam No with its high diversity of endemic species was identified as the first priority area for conservation. Also Ban Soc, an area isolated from Hin Nam No, should be among the conservation priorities because this region houses a so far overlooked population of the critically endangered Siamese crocodile. Efforts to establish a legal conservation status for this habitat are in progress.

A água na paisagem natural e antrópica

O crescimento da população gerou a ocupação de grandes áreas da superfície terrestre que provocaram alterações nas paisagens naturais. A apropriação desordenada do território, tendo em conta os espaços urbanos e rurais, trouxe vários impactos negativos ao meio ambiente. As linhas de água são os ecossistemas mais utilizados pelo homem ao longo da história, pela água, pesca, transporte, … e que simultaneamente vai modelando a paisagem pelas alterações do estado físico e modificações nas superfícies por onde corre. O sistema ribeirinho é constituído por vários ecossistemas, relacionados entre si e que são identificados transversalmente. Ao longo do ano é possível identificar, numa linha de água, três níveis: o de cheia durante o escoamento máximo anual no período das chuvas, o médio ao longo do ano e o de estiagem com o escoamento mínimo no pico do verão. Nas margens, a zonagem das espécies ripárias, está relacionada com a altitude, a unidade bioclimática, a distância do “eixo de humidade”, a geomorfologia, o tipo de solos e a matéria orgânica, entre outros fatores. Nas galerias ripícolas do Alentejo são frequentes cinco comunidades vegetais com grande diversidade de espécies, cujas presenças estão relacionadas com os níveis de água ao longo do ano e o tipo de solo: a) Choupais (Populus nigra), em solos sujeitos a prolongados encharcamentos. b) Salgueirais de borrazeiras pretas (Salix atrocinerea), em ribeiras com regime torrencial. c) Amiais (Alnus glutinosa), em solos com toalha freática à superfície. d) Freixiais (Fraxinus angustifolia) em solos húmidos, a comunidade mais comum no Alentejo. A vegetação marginal constitui um sistema elástico importante na proteção mecânica das margens contra o desgaste normal das águas, porque as mantêm seguras, protege o leito, favorece a riqueza piscícola e purifica as águas. Na proteção com sistemas rígidos e impermeáveis, verifica-se um elevado custo e estabilidade ameaçada nos pontos de contacto com as margens naturais, impede a comunicação natural entre a água que corre no leito do rio e a que se desloca em toda a largura do vale, provocando alterações no lençol freático. São vários, os valores associados à paisagem ribeirinha e, a titulo de exemplo, destacam-se: a) Simbólico: o Taj Mahal nas margens do rio Yamuna em Agra – Índia, classificado como Património da Humanidade pela UNESCO (1980) e a ponte Hintze Ribeiro destinada a unir as margens de Entre-os-Rios, em Penafiel e Castelo de Paiva, sobre o rio Douro e que colapsou em 4 de março de 2001, num acidente que provou 59 mortes. b) Histórico: a ponte medieval de San Martín (séc. XIV.) em Toledo – Espanha; o açude e termas romanas do séc. I a IV a.C., na Herdade de Almagrassa (Pisões) – Portugal e a villa romana da Tourega (séc. I a IV) que pertenceu ao senador Julius Maximus (Ivlivs Maximvs), como consta da lapide funerária encontrada na N. Sra. da Tourega (Évora) – Portugal. c) Mítico: a ponte romana em Cangas de Onís com a Cruz de la Victoria no principado de Astúrias – Espanha. d) Cultural: a atividade diária nas margens do rio Kottayam no distrito de Kerala – Índia; um fim de semana na margem do rio Danúbio na cidade de Viena – Aústria; as várzeas de rios goeses: Loutulim (Rio Zuari), Benaulim (represa de Komollam Tollem) e Betul (rio Sal) (Goa) – Índia e várzeas de rios cingaleses (região de Kandy) – Sri Lanka. e) Turístico: o palácio real de verão mandado construir pelo marajá Jagat Singh II (1734-1751) na ilha de Jag Niwas (1,5 ha) no lago Pichola. No fim da década de 60, tornou-se num dos mais famosos hotéis românticos do mundo, o Lake Palace Hotel – Índia e a queda de água de Karpuzkaldiran próximo da cidade de Antalya, cujo acesso é feito por escadas ou de barco – Turquia.

ANÁLISE AMBIENTAL DAS ILHAS DO APARA E ITAÇUCÊ, MUNICÍPIO DE SÃO SEBASTIÃO, SÃO PAULO, BRASIL

Muitos sítios de reprodução de aves marinhas insulares na costa do Estado de São Paulo, apesar de serem pontos críticos para a conservação ambiental, não são protegidos integralmente, estando expostos a ameaças que incluem desde o furto de ovos das aves e incêndios criminosos a maus tratos à fauna e flora local.O presente trabalho realizou a análise ambiental de duas ilhas costeiras recentemente protegidas pela legislação ambiental que constituem colônias de aves marinhas ameaçadas de extinção no litoral paulista (Itaçucê e Apara, no município de São Sebastião), e comparou-as com outra abrangida por unidade de conservação da natureza desde 1977 (Ilha da Prainha, no Parque Estadual da Ilhabela).A partir dos levantamentos e observações em campo e da pesquisa bibliográfica, verificou-se que as ilhas que não são protegidas sofrem grandes perturbações na flora e nas colônias de aves marinhas (Sterna hirundinacea, Thalasseus sandvicensis eurygnatha e Thalasseus maximus, sendo que T. maximus procria exclusivamente no Estado de São Paulo e também é considerada ameaçada segundo a lista federal). Observou-se que após a criação de uma unidade de conservação é necessário o desenvolvimento da gestão e do manejo e uma fiscalização rigorosa e efetiva.