Plasmodium vivax circumsporozoite genotypes: a limited variation or new subspecies with major biological consequences?

Background: Plasmodium vivax circumsporozoite variants have been identified in several geographical areas. The real implication of the genetic variation in this region of the P. vivax genome has been questioned for a long time. Although previous studies have observed significant association between VK210 and the Duffy blood group, we present here that evidences of this variation are limited to the CSP central portion.Methods: The phylogenetic analyses were accomplished starting from the amplification of conserved domains of 18 SSU RNAr and Cyt B. The antibodies responses against the CSP peptides, MSP-1, AMA-1 and DBP were detected by ELISA, in plasma samples of individuals infected with two P. vivax CS genotypes: VK210 and P. vivax-like.Results: These analyses of the two markers demonstrate high similarity among the P. vivax CS genotypes and surprisingly showed diversity equal to zero between VK210 and P. vivax-like, positioning these CS genotypes in the same clade. A high frequency IgG antibody against the N- and C-terminal regions of the P. vivax CSP was found as compared to the immune response to the R- and V-repetitive regions (p = 0.0005, Fisher's Exact test). This difference was more pronounced when the P. vivax-like variant was present in the infection (p = 0.003, Fisher's Exact test). A high frequency of antibody response against MSP-1 and AMA-1 peptides was observed for all P. vivax CS genotypes in comparison to the same frequency for DBP.Conclusions: This results target that the differences among the P. vivax CS variants are restrict to the central repeated region of the protein, mostly nucleotide variation with important serological consequences.

STABLE PIECEWISE POLYNOMIAL VECTOR FIELDS

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Evolution of a collapsing and exploding Bose-Einstein condensate in different trap symmetries

Based on the time-dependent Gross-Pitaevskii equation we study the evolution of a collapsing and exploding Bose-Einstein condensate in different trap symmetries to see the effect of confinement on collapse and subsequent explosion, which can be verified in future experiments. We make a prediction for the evolution of the shape of the condensate and the number of atoms in it for different trap symmetries (cigar to pancake) as well as in the presence of an optical lattice potential. We also make a prediction for the jet formation in different cases when the collapse is suddenly terminated by changing the scattering length to zero via a Feshbach resonance. In addition to the usual global collapse to the center of the condensate, in the presence of an optical-lattice potential one could also have in certain cases independent collapse of parts of the condensate to local centers, which could be verified in experiments.

Vibrational-rotational analysis of the Hulthen potential using hydrogenic eigenfunction bases

Hulthen's potential admits analytical solutions for its energy eigenvalues and eigenfunctions corresponding to zero orbital angular momentum stales, but its non zero angular momentum states are not equally known. This work presents a vibrational-rotational analy sis of Hulthen's potential using hydrogenic eigenfunction bases, which may be of interest and useful to students of quantum mechanics at different stages.

Constraints on two-neutron separation energy in the Borromean C-22 nucleus

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Do tadpoles vanish in the light-front?

In covariant gauges (CG) regularized with dimensional regularization (DR) it is a standard procedure to set all tadpole Feynman integrals to zero, though; explicitly, they diverge quadratically as the space-time volume. on the other hand, in the notoriously subtle light-front gauge (LTG) some divergent tadpole integrals are said to be nonvanishing, i.e., cannot be set to zero as in the CC case. In this article we analyse the reasons behind this seemingly ambiguous results.

Effect of a frictional force on the Fermi-Ulam model

The dynamical properties of a classical particle bouncing between two rigid walls, in the presence of a drag force, are studied for the case where one wall is fixed and the other one moves periodically in time. The system is described in terms of a two-dimensional nonlinear map obtained by solution of the relevant differential equations. It is shown that the structure of the KAM curves and the chaotic sea is destroyed as the drag force is introduced. At high energy, the velocity of the particle decreases linearly with increasing iteration number, but with a small superimposed sinusoidal modulation. If the motion passes near enough to a fixed point, the particle approaches it exponentially as the iteration number evolves, with a speed of approach that depends on the strength of the drag force. For a simplified version of the model it is shown that, at low energies corresponding to the region of the chaotic sea in the non-dissipative model, the particle wanders in a chaotic transient that depends on the strength of the drag coefficient. However, the KAM islands survive in the presence of dissipation. It is confirmed that the fixed points and periodic orbits go over smoothly into the orbits of the well-known (non-dissipative) Fermi-Ulam model as the drag force goes to zero.

Scaling invariance for the escape of particles from a periodically corrugated waveguide

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Modelos de regressão aleatória com diferentes estruturas de variância residual para descrever o tamanho da leitegada

Objetivou-se comparar modelos de regressão aleatória com diferentes estruturas de variância residual, a fim de se buscar a melhor modelagem para a característica tamanho da leitegada ao nascer (TLN). Utilizaram-se 1.701 registros de TLN, que foram analisados por meio de modelo animal, unicaracterística, de regressão aleatória. As regressões fixa e aleatórias foram representadas por funções contínuas sobre a ordem de parto, ajustadas por polinômios ortogonais de Legendre de ordem 3. Para averiguar a melhor modelagem para a variância residual, considerou-se a heterogeneidade de variância por meio de 1 a 7 classes de variância residual. O modelo geral de análise incluiu grupo de contemporâneo como efeito fixo; os coeficientes de regressão fixa para modelar a trajetória média da população; os coeficientes de regressão aleatória do efeito genético aditivo-direto, do comum-de-leitegada e do de ambiente permanente de animal; e o efeito aleatório residual. O teste da razão de verossimilhança, o critério de informação de Akaike e o critério de informação bayesiano de Schwarz apontaram o modelo que considerou homogeneidade de variância como o que proporcionou melhor ajuste aos dados utilizados. As herdabilidades obtidas foram próximas a zero (0,002 a 0,006). O efeito de ambiente permanente foi crescente da 1ª (0,06) à 5ª (0,28) ordem, mas decrescente desse ponto até a 7ª ordem (0,18). O comum-de-leitegada apresentou valores baixos (0,01 a 0,02). A utilização de homogeneidade de variância residual foi mais adequada para modelar as variâncias associadas à característica tamanho da leitegada ao nascer nesse conjunto de dado.

Efeito da solarização e do brometo de metila sobre a comunidade de fungos do solo

A microbiota do solo é de grande importância no desenvolvimento de culturas. Os métodos de controle, químico (brometo de metila) e físico (solarização), alteram essa microbiota. O presente trabalho objetivou estudar o comportamento da comunidade de fungos em solo solarizado e fumigado (brometo de metila). O delineamento experimental foi de blocos ao acaso, com três tratamentos (solarização, brometo de metila e testemunha) e sete repetições. A comunidade de fungos do solo foi avaliada de forma quantitativa e qualitativa, em três momentos (antes, durante e após a solarização) com amostras coletadas de três profundidades (0-5; 10-15 e 20-25 cm). Durante a solarização ocorreu uma redução na comunidade de fungos do solo, em termos quantitativos, em todas as camadas amostradas. No entanto, essa diminuição foi mais significativa na camada superficial (0-5cm). em termos qualitativos, a solarização reduziu também o número de diferentes espécies de fungos do solo, mas na camada de 20-25 cm, essa diminuição foi a zero aos 56 dias de avaliação. A recolonização da microbiota do solo, em termos quantitativos, foi maior no tratamento com brometo de metila do que nos demais. Entretanto, esse aumento não foi o mesmo em termos qualitativos. Nos tratamentos solarizado e testemunha, o aumento na comunidade de fungos do solo foi acompanhado pela diversificação de espécies fúngicas.

Genetic trends in the expected progeny difference of the asymptotic weight of Nelore females

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Equação de predição da exigência de proteína bruta para aves reprodutoras pesadas na fase de produção

O objetivo do presente trabalho foi determinar as exigências de proteína para aves reprodutoras pesadas através do método fatorial. A exigência de proteína bruta para mantença (PBm) foi determinada por intermédio da técnica do balanço de nitrogênio por meio de ensaio de metabolismo com aves submetidas a quatro dietas com níveis decrescentes de proteína, proporcionando balanço positivo, próximo a zero e negativo. Para determinar a exigência de proteína bruta para o ganho de peso (PBg) dois experimentos foram conduzidos, sendo que em um, determinou-se as exigências líquidas de nitrogênio e no outro, a eficiência de utilização do nitrogênio para o ganho, por meio de abates semanais de aves no período de 26 a 33 semanas de idade. A exigência de proteína bruta para produção de ovos (PBo) foi determinada através de análises semanais de proteína bruta dos ovos coletados, no período de 31 a 37 semanas de idade, considerando a eficiência de deposição da proteína no ovo. A exigência e eficiência de utilização da proteína para mantença foram 2.282 mg PB/kg0,75/dia e 60,79%; respectivamente. As exigências de PBg e PBo determinadas foram: 356 mg PB/g e 262 mg PB/g, respectivamente, e as eficiências de utilização do nitrogênio, 40 e 46,80%, respectivamente. A equação de predição elaborada para aves reprodutoras pesadas na fase de produção foi: PB=2,282.P0,75+0,356.G+0,262.MO, onde PB é a exigência de proteína bruta (g/ave/dia), P o peso corporal (kg), G o ganho de peso (g/dia) e MO a massa de ovos (g/dia).

Avaliação do comportamento sexual em touros Nelore: comparação entre os testes da libido em curral e do comportamento sexual a campo

Objetivou-se determinar a eficiência do teste da libido realizado em curral em comparação ao teste realizado a campo e relacioná-los à taxa de gestação em estação de monta de 120 dias. Treze touros aptos à reprodução foram submetidos ao teste da libido em curral por 3 horas. Desses touros, nove foram submetidos à avaliação a campo na proporção touro:vaca de 1:33. A cada 21 dias, foi diagnosticada a gestação por meio de avaliações ultra-sonográficas. No teste em curral, observou-se que, quanto maior o tempo, maiores foram os escores de classificação e que nenhum touro efetuou serviço completo nos 10 minutos iniciais do teste. Com um touro classificado como muito bom obteve-se 84,80% de prenhez, porém touros questionáveis proporcionaram taxas de prenhez de 86,67 e 96,55% ao final da estação. As correlações entre características físicas e morfológicas do sêmen mantiveram-se próximas de zero ou foram nulas. Os principais sinais fisiológicos do comportamento sexual foram o ato de cheirar ou lamber o corpo da fêmea, cheirar ou lamber a vulva, seguidos ou não por reflexo de Flehmen. em animais da raça Nelore, o tempo de 30 minutos de observação mostrou-se mais eficiente para a realização do teste da libido em curral. O teste da libido realizado a campo no período diurno não foi eficaz em predizer a libido de todos os animais estudados, em decorrência, provavelmente, do comportamento sexual noturno de alguns reprodutores.

A SIMPLE NUMERICAL-METHOD FOR HYDROSTATIC INCOMPRESSIBLE MODELS WITH RIGID LIDS

A simple and easily implemented method is developed to keep the vertical velocity equal to zero at the bottom and top of hydrostatic incompressible numerical models. The pressure is computed at the top by correcting its value given in the previous time step so that the vertical integral of the horizontal divergence is zero at each column. Numerical experiments that exhibit small time variations of pressure at the top are able to simplify the algorithm and save computer time. Numerical simulations illustrate the method effectiveness for a horizontal deformation-induced frontogenesis.

NONLINEAR DIFFUSION PROCESS IN A BENARD SYSTEM AT THE CRITICAL-POINT FOR THE ONSET OF CONVECTION

The evolution equation governing surface perturbations of a shallow fluid heated from below at the critical Rayleigh number for the onset of convective motion, and with boundary conditions leading to zero critical wave number, is obtained. A solution for negative or cooling perturbations is explicitly exhibited, which shows that the system presents sharp propagating fronts.