An��lise da estrutura de um edif��cio em bet��o armado usando um m��todo dos elementos finitos: aplica����o do m��todo dos elementos finitos a problemas tridimensionais de elasticidade linear usando o freeFEM++

Pretende-se, utilizando o Modelo da Elasticidade Linear em freeFEM++, determinar os esfor��os e deslocamentos de um edif��cio alto submetido apenas �� ac����o do peso pr��prio da estrutura e, efectuar estudos comparativos dos resultados obtidos com o SAP2000. O trabalho inicia-se com a introdu����o da teoria da elasticidade linear, onde s��o feitas as dedu����es das Equa����es de Compatibilidade, Equil��brio e as Leis Constitutivas, de modo a resolver numericamente o problema de Elasticidade Linear mencionado. O m��todo de elementos finitos ser�� implementado em freeFEM++ com aux��lio do GMSH que �� uma poderosa ferramenta com capacidade de gerar automaticamente malhas tridimensionais de elementos finitos e com relativa facilidade de pr�� e p��s-processamento.

PHYLOViZ: phylogenetic inference and data visualization for sequence based typing methods

Background: With the decrease of DNA sequencing costs, sequence-based typing methods are rapidly becoming the gold standard for epidemiological surveillance. These methods provide reproducible and comparable results needed for a global scale bacterial population analysis, while retaining their usefulness for local epidemiological surveys. Online databases that collect the generated allelic profiles and associated epidemiological data are available but this wealth of data remains underused and are frequently poorly annotated since no user-friendly tool exists to analyze and explore it. Results: PHYLOViZ is platform independent Java software that allows the integrated analysis of sequence-based typing methods, including SNP data generated from whole genome sequence approaches, and associated epidemiological data. goeBURST and its Minimum Spanning Tree expansion are used for visualizing the possible evolutionary relationships between isolates. The results can be displayed as an annotated graph overlaying the query results of any other epidemiological data available. Conclusions: PHYLOViZ is a user-friendly software that allows the combined analysis of multiple data sources for microbial epidemiological and population studies. It is freely available at http://www.phyloviz.net.

Soleus activity in post-stroke subjects: movement sequence from standing to sitting

O documento em anexo encontra-se na vers��o post-print (vers��o corrigida pelo editor).

Spatio-temporal alignment of pedobarographic image sequences

O documento em anexo encontra-se na vers��o post-print (vers��o corrigida pelo editor).

Modela����o em regime el��stico-linear de pavimentos rodovi��rios

Neste trabalho apresenta-se o desenvolvimento de um programa de elementos finitos tridimensionais denominado AE3D1.0, concebido especificamente para a an��lise de pavimentos rodovi��rios, partindo do pressuposto de que todos os materiais incorporados possuem comportamento el��stico-linear. Por compara����o dos resultados do programa AE3D1.0 com as solu����es anal��ticas da teoria da elasticidade para o semi-espa��o homog��neo e multiestratificado, confirma-se que �� poss��vel estabelecer uma analogia pr��xima entre ambas as abordagens. Tirando partindo das potencialidades do m��todo dos elementos finitos, e da capacidade do programa de registar os resultados de c��lculo em ficheiros digitais que possibilitam a posterior aprecia����o visual e tratamento dos dados obtidos, comparam-se pavimentos r��gidos expostos a carregamentos de canto e de bordo, e �� evidenciado o efeito prejudicial que a eros��o da estrutura de apoio subjacente �� laje de bet��o tem na longevidade e integridade estrutural do pavimento. S��o tamb��m aplicadas for��as de frenagem a pavimentos r��gidos em sec����es confinadas e n��o confinadas. Elege-se um modelo de pneu para ve��culos pesados representativo das caracter��sticas do eixo padr��o de 130 kN, e analisa-se o efeito que a correspondente impress��o ovalizada e distribui����o de press��es verticais n��o uniforme tem na estrutura de um pavimento semi-r��gido. Adapta-se e �� aplicada uma malha de elementos finitos ao estudo da avalia����o da capacidade de carga de pavimentos atrav��s de ensaios com o deflet��metro de impacto.

Unified min-max and interlacing theorems for linear operators

There exist striking analogies in the behaviour of eigenvalues of Hermitian compact operators, singular values of compact operators and invariant factors of homomorphisms of modules over principal ideal domains, namely diagonalization theorems, interlacing inequalities and Courant-Fischer type formulae. Carlson and Sa [D. Carlson and E.M. Sa, Generalized minimax and interlacing inequalities, Linear Multilinear Algebra 15 (1984) pp. 77-103.] introduced an abstract structure, the s-space, where they proved unified versions of these theorems in the finite-dimensional case. We show that this unification can be done using modular lattices with Goldie dimension, which have a natural structure of s-space in the finite-dimensional case, and extend the unification to the countable-dimensional case.

Optimal scheduling of a renewable micro-grid in an isolated load area using mixed-integer linear programming

In the energy management of the isolated operation of small power system, the economic scheduling of the generation units is a crucial problem. Applying right timing can maximize the performance of the supply. The optimal operation of a wind turbine, a solar unit, a fuel cell and a storage battery is searched by a mixed-integer linear programming implemented in General Algebraic Modeling Systems (GAMS). A Virtual Power Producer (VPP) can optimal operate the generation units, assured the good functioning of equipment, including the maintenance, operation cost and the generation measurement and control. A central control at system allows a VPP to manage the optimal generation and their load control. The application of methodology to a real case study in Budapest Tech, demonstrates the effectiveness of this method to solve the optimal isolated dispatch of the DC micro-grid renewable energy park. The problem has been converged in 0.09 s and 30 iterations.

Can power laws help us understand gene and proteome information?

Proteins are biochemical entities consisting of one or more blocks typically folded in a 3D pattern. Each block (a polypeptide) is a single linear sequence of amino acids that are biochemically bonded together. The amino acid sequence in a protein is defined by the sequence of a gene or several genes encoded in the DNA-based genetic code. This genetic code typically uses twenty amino acids, but in certain organisms the genetic code can also include two other amino acids. After linking the amino acids during protein synthesis, each amino acid becomes a residue in a protein, which is then chemically modified, ultimately changing and defining the protein function. In this study, the authors analyze the amino acid sequence using alignment-free methods, aiming to identify structural patterns in sets of proteins and in the proteome, without any other previous assumptions. The paper starts by analyzing amino acid sequence data by means of histograms using fixed length amino acid words (tuples). After creating the initial relative frequency histograms, they are transformed and processed in order to generate quantitative results for information extraction and graphical visualization. Selected samples from two reference datasets are used, and results reveal that the proposed method is able to generate relevant outputs in accordance with current scientific knowledge in domains like protein sequence/proteome analysis.

Ancillary services dispatch using linear programming and genetic algorithm approaches

Electricity market players operating in a liberalized environment requires access to an adequate decision support tool, allowing them to consider all the business opportunities and take strategic decisions. Ancillary services represent a good negotiation opportunity that must be considered by market players. For this, decision support tools must include ancillary market simulation. This paper proposes two different methods (Linear Programming and Genetic Algorithm approaches) for ancillary services dispatch. The methodologies are implemented in MASCEM, a multi-agent based electricity market simulator. A test case concerning the dispatch of Regulation Down, Regulation Up, Spinning Reserve and Non-Spinning Reserve services is included in this paper.

Les��es da subst��ncia branca por resson��ncia magn��tica: uma avalia����o entre as pondera����es DWI e T2 FLAIR

RESUMO: Objetivos ��� Determinar a sensibilidade e especificidade das pondera����es Difus��o (DWI) e T2 Fluid-Attenuated Inversion Recovery (FLAIR) na avalia����o de les��es da subst��ncia branca (SB) e verificar em que medida se complementam, por forma a criar um conjunto de boas pr��ticas na RM cranioencef��lica de rotina. Metodologia ��� Recorrendo-se a uma metodologia quantitativa, efetuou-se uma an��lise retrospetiva da qual foram selecionados 30 pacientes, 10 sem patologia e 20 com patologia (2 com EM, 7 com Leucoencefalopatia, 6 com doen��a microangiop��tica e 5 com patologia da subst��ncia branca indefinida). Obteve-se uma amostra de 60 imagens, nomeadamente: 30 imagens ponderadas em DWI e 30 em T2 FLAIR. Recorrendo ao programa Viewdex��, tr��s observadores avaliaram um conjunto de imagens segundo sete crit��rios: visibilidade, dete����o, homogeneidade, localiza����o, margens e dimens��es da les��o e capacidade de diagn��stico. Com os resultados obtidos recorreu-se ao c��lculo de sensibilidade e especificidade pelas Curvas ROC, bem como �� an��lise estat��stica, nomeadamente, Teste-T, ��ndice de Concord��ncia Kappa e coeficiente de correla����o de Pearson entre as vari��veis em estudo. Resultados ��� Os resultados de sensibilidade e de especificidade obtidos para a pondera����o T2 FLAIR foram superiores (0,915 e 0,038, respetivamente) aos da pondera����o DWI (0,08 e 0,100, respetivamente). N��o se verificaram vari��ncias populacionais significativas. Obteve-se uma elevada correla����o linear entre as vari��veis com um valor r situado entre 0,8 e 0,99. Verificou-se tamb��m uma variabilidade consider��vel entre os observadores. Conclus��es ��� Dados os baixos valores de sensibilidade e especificidade obtidos para a DWI, sugere-se que esta deva ser inclu��da no protocolo de rotina de cr��nio como auxiliar no diagn��stico diferencial com outras patologias.

Compara����o de diferentes t��cnicas de irradia����o de mama em radioterapia com recurso a acelerador linear em modo de fot��es

RESUMO: Introdu����o ��� A Radioterapia (RT) �� uma abordagem terap��utica para tratamento de neoplasia de mama. Contudo, diferentes t��cnicas de irradia����o (TI) podem ser usadas. Objetivos ��� Comparar 4 TI, considerando a irradia����o dos volumes alvo (PTV) e dos ��rg��os de risco (OAR). Metodologia ��� Selecionaram-se 7 pacientes com indica����o para RT de mama esquerda. Sobre tomografia computorizada foram feitos os contornos do PTV e dos OAR. Foram calculadas 4 planimetrias/paciente para as TI: conformacional externa (EBRT), intensidade modulada com 2 (IMRT2) e 5 campos (IMRT5) e arco din��mico (DART). Resultados ��� Histogramas de dose volume foram comparados para todas as TI usando o software de an��lise estat��stica, IBM SPSS v20. Com IMRT5 e DART, os OAR recebem mais doses baixas. No entanto, IMRT5 apresenta melhores ��ndices de conformidade e homogeneidade para o PTV. Conclus��es ��� IMRT5 apresenta o melhor ��ndice de conformidade; EBRT e IMRT2 apresentam melhores resultados que DART. H�� d.e.s entre as TI, sobretudo em doses mais baixas nos OAR.

Determinantes dos d��ficits ponderal e de crescimento linear de crian��as menores de dois anos

OBJETIVO: Identificar os determinantes da desnutri����o energ��tico-prot��ica que ocasionam d��ficits ponderal e de crescimento linear em crian��as. M��TODOS: Estudo transversal envolvendo 1.041 crian��as (menores de dois anos de idade) de 10 munic��pios do Estado da Bahia, de 1999 a 2000. Utilizou-se a t��cnica de regress��o log��stica e estrat��gia da abordagem hier��rquica para identificar os fatores associados ao estado antropom��trico. RESULTADOS: O modelo final para d��ficit no crescimento linear revelou como determinante b��sico: a posse de dois ou menos equipamentos dom��sticos (OR=2,9; IC 95%: 1,74-4,90) e no n��vel subjacente, a aus��ncia de consulta pr��-natal (OR=2,7; IC 95%: 1,47-4,97); entre os determinantes imediatos o baixo peso ao nascer (<2.500 g) (OR=3,6; IC 95%: 1,72-7,70) e relato de hospitaliza����o nos 12 meses anteriores �� entrevista (OR=2,4; IC 95%: 1,42-4,10). Fatores determinantes no d��ficit ponderal nos n��veis b��sico, subjacente e imediato foram, respectivamente: a renda mensal per capita inferior a �� do sal��rio-m��nimo (OR=3,4; IC 95%: 1,41-8,16), a aus��ncia de pr��-natal (OR=2,1; IC 95%: 1,03-4,35), e o baixo peso ao nascer (OR=4,8; IC 95%: 2,00-11,48). CONCLUS��ES: Os d��ficits ponderal e linear das crian��as foram explicados pela intermedia����o entre as prec��rias condi����es materiais de vida e o restrito acesso ao cuidado com a sa��de e a carga de morbidade. Interven����es que melhorem as condi����es de vida e ampliem o acesso ��s a����es do servi��o de sa��de s��o estrat��gias que caminham na busca da eq��idade em sa��de e nutri����o na inf��ncia.

Fun����es penalidade para o tratamento das vari��veis discretas do problema de fluxo de pot��ncia ��timo reativo

Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient��fico e Tecnol��gico (CNPq)

Aplica����o de regress��o linear para corre����o de dados diet��ticos

OBJETIVO: Estrat��gias metodol��gicas v��m sendo desenvolvidas para minimizar o efeito do erro de medida da dieta. O objetivo do estudo foi descrever a aplica����o de uma estrat��gia para corre����o da informa����o diet��tica pelo erro de medida. M��TODOS: Foram obtidos dados de consumo alimentar pela aplica����o do Question��rio de Freq����ncia Alimentar a 79 adolescentes do Munic��pio de S��o Paulo em 1999. Os dados diet��ticos obtidos foram corrigidos por meio de regress��o linear, ap��s o ajuste pela energia usando-se o m��todo dos res��duos. O m��todo de refer��ncia utilizado foi o recordat��rio de 24 horas, aplicado em tr��s momentos distintos. RESULTADOS: Os valores corrigidos aproximaram-se dos valores de refer��ncia. O fator de corre����o lambda foi de 0,89 para energia. Para os macronutrientes, os fatores foram de 0,41; 0,22 e 0,20, para carboidratos, lip��dios e prote��nas, respectivamente. CONCLUS��ES: As m��dias e desvios-padr��o dos valores corrigidos denotam que houve uma corre����o do erro de medida. Apesar disso, debate-se o desempenho desses m��todos, que s��o notoriamente imperfeitos quando seus pressupostos te��ricos n��o s��o atendidos, o que �� comum nos estudos da dieta que usam instrumentos de medida baseados no relato dos indiv��duos.

The complete sequence of a 9000 bp fragment of the right arm of Saccharomyces cerevisiae chromosome VII contains four previously unknown open reading frames

We report the sequence of a 9000 bp fragment from the right arm of Saccharomyces cerevisiae chromosome VII. Analysis of the sequence revealed four complete previously unknown open reading frames, which were named G7587, G7589, G7591 and G7594 following standard rules for provisional nomenclature. Outstanding features of some of these proteins were the homology of the putative protein coded by G7589 with proteins involved in transcription regulation and the transmembrane domains predicted in the putative protein coded by G7591.