Genetic diversity of Brazilian triticales evaluated with genomic wheat microsatellites

The objective of this work was to determine the genetic variability available for triticale (X Triticosecale Wittmack) crop improvement in Brazil. Forty-two wheat genomic microsatellites were used to estimate the molecular diversity of 54 genotypes, which constitute the base of one of the major triticale breeding programs in the country. Average heterozygosity was 0.06 and average and effective number of alleles per locus were 2.13 and 1.61, respectively, with average allelic frequency of 0.34. The set of genomic wheat microsatellites used clustered the genotypes into seven groups, even when the germplasm was originated primarily from only two triticale breeding programs, a fact reflected on the average polymorphic information content value estimated for the germplasm (0.36). The 71.42% transferability achieved for the tested microsatellites indicates the possibility of exploiting these transferable markers in further triticale genetic and breeding studies, even those mapped on the D genome of wheat, when analyzing hexaploid triticales.

Extracting female inbred lines from commercial sunflower hybrids

The objective of this study was to obtain female inbred lines from sunflower (Helianthus annuus) hybrids. A methodology based on altering inbred lines carrying the fertility restorer gene (Rf) obtained from self pollinating hybrids into inbred lines with normal cytoplasm without the Rf gene was described. Further, derived male-sterile inbred lines were developed. The methodology was successfully used to obtain female inbreds from sunflower commercial hybrids. Although more time and labor consuming than the conventional female inbred line extraction methods, this methodology is advantageous in exploiting superior germplasms (commercial hybrids), which prompted us to develop practical procedures to allow its routinely use.

Stage-specific integration of maternal and embryonic peroxisome proliferator-activated receptor delta signaling is critical to pregnancy success.

Successful pregnancy depends on well coordinated developmental events involving both maternal and embryonic components. Although a host of signaling pathways participate in implantation, decidualization, and placentation, whether there is a common molecular link that coordinates these processes remains unknown. By exploiting genetic, molecular, pharmacological, and physiological approaches, we show here that the nuclear transcription factor peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) delta plays a central role at various stages of pregnancy, whereas maternal PPARdelta is critical to implantation and decidualization, and embryonic PPARdelta is vital for placentation. Using trophoblast stem cells, we further elucidate that a reciprocal relationship between PPARdelta-AKT and leukemia inhibitory factor-STAT3 signaling pathways serves as a cell lineage sensor to direct trophoblast cell fates during placentation. This novel finding of stage-specific integration of maternal and embryonic PPARdelta signaling provides evidence that PPARdelta is a molecular link that coordinates implantation, decidualization, and placentation crucial to pregnancy success. This study is clinically relevant because deferral of on time implantation leads to spontaneous pregnancy loss, and defective trophoblast invasion is one cause of preeclampsia in humans.

The timing of exploratory decision-making revealed by single-trial topographic EEGanalyses.

Decision-making in an uncertain environment is driven by two major needs: exploring the environment to gather information or exploiting acquired knowledge to maximize reward. The neural processes underlying exploratory decision-making have been mainly studied by means of functional magnetic resonance imaging, overlooking any information about the time when decisions are made. Here, we carried out an electroencephalography (EEG) experiment, in order to detect the time when the brain generators responsible for these decisions have been sufficiently activated to lead to the next decision. Our analyses, based on a classification scheme, extract time-unlocked voltage topographies during reward presentation and use them to predict the type of decisions made on the subsequent trial. Classification accuracy, measured as the area under the Receiver Operator's Characteristic curve was on average 0.65 across 7 subjects. Classification accuracy was above chance levels already after 516 ms on average, across subjects. We speculate that decisions were already made before this critical period, as confirmed by a positive correlation with reaction times across subjects. On an individual subject basis, distributed source estimations were performed on the extracted topographies to statistically evaluate the neural correlates of decision-making. For trials leading to exploration, there was significantly higher activity in dorsolateral prefrontal cortex and the right supramarginal gyrus; areas responsible for modulating behavior under risk and deduction. No area was more active during exploitation. We show for the first time the temporal evolution of differential patterns of brain activation in an exploratory decision-making task on a single-trial basis.

High-SNR analytical performance of spatial multiplexing MIMO systems with CSI

In this paper, we investigate the average andoutage performance of spatial multiplexing multiple-input multiple-output (MIMO) systems with channel state information at both sides of the link. Such systems result, for example, from exploiting the channel eigenmodes in multiantenna systems. Dueto the complexity of obtaining the exact expression for the average bit error rate (BER) and the outage probability, we deriveapproximations in the high signal-to-noise ratio (SNR) regime assuming an uncorrelated Rayleigh flat-fading channel. Moreexactly, capitalizing on previous work by Wang and Giannakis, the average BER and outage probability versus SNR curves ofspatial multiplexing MIMO systems are characterized in terms of two key parameters: the array gain and the diversity gain. Finally, these results are applied to analyze the performance of a variety of linear MIMO transceiver designs available in the literature.

Joint physical-MAC layer design of the broadcast channel protocol in adhoc networks

Broadcast transmission mode in ad hoc networks is critical to manage multihop routing or providing medium accesscontrol (MAC)-layer fairness. In this paper, it is shown that ahigher capacity to exchange information among neighbors may beobtained through a physical-MAC cross-layer design of the broadcastprotocol exploiting signal separation principles. Coherentdetection and separation of contending nodes is possible throughtraining sequences which are selected at random from a reducedset. Guidelines for the design of this set are derived for a lowimpact on the network performance and the receiver complexity.

Genome-wide meta-analysis identifies 11 new loci for anthropometric traits and provides insights into genetic architecture.

Approaches exploiting trait distribution extremes may be used to identify loci associated with common traits, but it is unknown whether these loci are generalizable to the broader population. In a genome-wide search for loci associated with the upper versus the lower 5th percentiles of body mass index, height and waist-to-hip ratio, as well as clinical classes of obesity, including up to 263,407 individuals of European ancestry, we identified 4 new loci (IGFBP4, H6PD, RSRC1 and PPP2R2A) influencing height detected in the distribution tails and 7 new loci (HNF4G, RPTOR, GNAT2, MRPS33P4, ADCY9, HS6ST3 and ZZZ3) for clinical classes of obesity. Further, we find a large overlap in genetic structure and the distribution of variants between traits based on extremes and the general population and little etiological heterogeneity between obesity subgroups.

Klusterointi- japortfoliomenetelmien soveltaminen innovaatioprosessin alkupäässä

Työn tavoitteena on löytää menetelmä tai malli, jolla suurta joukkoa erilaatuisia ideoita pystytään lajittelemaan ja löytämään tästä joukosta relevantit ja parhaat ideat jatkoke-hittelyyn. Työn empiirisenä aineistona on käytetty kahdella eri toimialalla toimivan yrityksen yhteisessä ideaistunnossa syntyneitä ideoita. Työn teoreettisessa osuudessa on esitelty innovaation määritelmä sekä eri tapoja luoki-tella innovaatioita. Lisäksi teoreettisessa osuudessa on käsitelty avoimen innovaation periaatetta ja sen kenties yhä kasvavaa merkitystä. Työssä on käsitelty myös ideoiden hyödyntämiseen vaikuttavia seikkoja. Näkökulmiksi työssä on valittu yrityksen sisäiset ja ympäristöstä johtuvat seikat, kuten yrityksen osaaminen sekä asiakkaatja markkinat. Teoriaosuuden päättää lyhyt katsaus klusterointiin, sen eri menetelmiin, sekä portfolion hallintaan. Empiirisessä osuudessa yli 50 idean joukosta kyettiin löytämään muutamia ideoita, jotka ovat eri tavoilla toteutettavissa istuntoon osallistuneiden yritysten toimesta.

Sellutehtaan sekundäärilämpöjärjestelmän kehittäminen

Sellun valmistuksessa kuluu energiaa mm. materiaalivirtojen lämmittämiseen. Käyttämällä prosessissa syntyvä sekundäärilämpö hyödyksi säästetään energiakustannuksissa. Toimiva sekundäärilämpöjärjestelmä on yksinkertainen ja tehokas. Tässä diplomityössä tutkitaan sellutehtaan sekundäärilämpöjärjestelmän toiminta. Tehtaan sekundäärilämmön käyttö on muuttunut uusien tehdasosastojen ja jakeluun tehtyjen muutoksien jälkeen. Tavoitteena on selvittää sekundäärilämpöjärjestelmän toiminta nykytilanteessa ja etsiä käyttökohteita hyödyntämättömälle sekundäärilämmölle. Saatujen tietojen perusteella laaditaan sekundäärilämpötase talvitilanteessa ja päivitetään raportointi nykytilannetta vastaavaksi.

Uudistumiskykyinen strategian toteuttaminen, case Oy Hartwall Ab

Tutkielman tutkimusongelmana oli, miten organisaatio voi toteuttaa strategiaansa uudistumiskykyisesti. Tutkimusongelmaa tutkittiin kartoittavasti, kuvailevasti ja selittävästi. Tutkimuksessa lähdettiin liikkeelle strategian toteuttamisen teoreettisen tarkastelupohjan rakentamisesta. Strategian toteuttamisen näkökulmat yhdistettiin Ståhlen (1999) kehittämään kolmiulotteiseen tietoympäristömalliin. Tämänsynteesin pohjalta luotiin uudistumiskykyinen strategian toteuttaminen -malli. Mallin perusteella vastattiin tutkimusongelmaan ja ehdotettiin case-yritykselle strategian toteuttamisen kehittämistoimenpiteitä. Tutkielman tutkimusstrategiana käytettiin Survey-tutkimusta. Tällä pyrittiin tutkimaan case-yrityksen myyntiorganisaation uudistumiskyvyn tasoa ja analysoimaanuudistumiskyky -mittauksen tulosten pohjalta organisaation uudistumiskykyistä strategian toteuttamista. Tutkimuksen metodiksi valittiin kyselylomakepohjainen KM-factor¿-mittari. KM-factor¿-mittaus suoritettiin case-yritys Oy Hartwall Ab:ssä kevään 2004 aikana. Mittauksen perusjoukkona oli Oy Hartwall Ab:n myyntiorganisaatio. Mittauksen otoskoko oli N=64, henkilöstö: N=49, johto: N=15. Henkilöstönvastausprosentti oli 71 %:a ja johdon 78 %:a. Kyselylomake oli internet-pohjainen. KM-factor¿-mittauksen tulokset analysoi businessXray Oy. Tutkielman tekijä analysoi KM-factor¿-mittauksen tuloksia hyödyntämällä uudistumiskykyinen strategian toteuttaminen -mallia. Organisaatio voi toteuttaa strategiaansa uudistumiskykyisesti toteuttamalla ja uudistamalla strategiaansa yhtenäisesti strategisen fokuksensa mukaisesti. Tämä onnistuu toteuttamalla strategiaa uudistumiskykyisen strategian toteuttamisen -mallin mukaisesti. Mallia hyödyntämällä organisaation johto kykenee organisoimaanstrategian toteutuksen yrityksen strategisen fokuksen mukaisesti.

Uudistumista tukeva johtaminen ja organisaation uudistumiskyvyn mittaaminen

Tämän työn tavoitteena on tarkastella sitä mitä tarkoitetaan organisaation uudistumiskyvyllä sekä mikä tämän yhteys on organisaation kilpailuetuun ja suorituskykyyn. Tarkimmin keskitytään siihen, millaista on uudistumista tukeva johtajuus. Samoin kerrotaan lyhyesti millaisin mittarein uudistumiskykyä voidaan mitata. Tutkielman empiirinen osuus keskittyy erään Suomessa toimivan palvelualan yrityksen uudistumiskyvyn mittaamiseen. Erityishuomiossa ovat johtajuus, ajan hyödyntäminen sekä oppiminen. Tutkimus suoritettiin strukturoituna teemahaastatteluina ORCI¿-uudistumiskykymittarin perusteella lokakuussa 2007. Tutkitun organisaation uudistumiskyvystä voidaan sanoa, että se on hyvä. Tutkittujen ORCI¿-uudistumiskykymittariston kriteerien mukaan sekä muiden kirjallisuudessa havaittujen uudistumiskyvyn näkemysten mukaan, tutkittu organisaatio kykenee toimimaan tavalla, jolla sen voidaan katsoa olevan uudistumiskykyinen organisaatio. Ennen kaikkea organisaatio kykenee oppimaan ja kehittämään toimintaansa sekä tekemään havaintoja näistä asioista. Haastatteluiden perusteella tutkitusta organisaatiosta nousi esiin päätöksenteon vapaus ja helppous, luottamus sekä valtuuttaminen. Tämä tutkimus ei tuonut uusia näkökulmia uudistumiskykyyn, mutta empiirinen tutkimus vahvisti niitä aspekteja, joita kirjallisuudessa oltiin jo havaittu.

Absorptive capacity and the effect of social integration mechanisms in knowledge utilization

Tiedosta on tullut määräävä tekijä yrityksensuorituskyvylle. Yritykset hankkivat aktiivisesti uutta tietoa ulkoisesta ympäristöstään ja tallentavat sitä tietokantoihinsa. Uusi tieto on innovaatioiden ja uusien ideoiden peruselementti. Uudet ideat pitää myös kaupallistaa, jotta niiden avulla voidaan hankkia kilpailuetua. Absorptiivisen kapasiteetin malli yhdistää tiedon prosessointiin liittyvät kyvykkyydet, jotka vaikuttavat yrityksen kykyyn hyödyntää tietoa tehokkaasti. Ennen kuin tietoa voidaan käyttää uusien tuotteiden ja palveluiden luomiseen, täytyy sitä jakaa yrityksessä ja muuttaa se yrityksen toimintaa palvelevaksi. Aiemmissa tutkimuksissa innovaatiot ovat vahvasti liitetty yrityksen kykyyn uudistua. Tämä pro gradu -tutkielma tutkii sosiaalisten integraatiomekanismien vaikutusta potentiaalisen absorptiivisen kapasiteetin muuttamiseen toteutuneeksi absorptiiviseksi kapasiteetiksi. Yksilöiden ja osastojen välisen yhteistyön sekä luottamuksen vaikutus tiedon sisäistämiseen tutkittiin. Tutkielma pohjautuu monikansallisessa yrityksessä keväällä 2006 suoritettuun uudistumiskyky-tutkimukseen. Tutkielma keskittyy yrityksen kykyyn uudistua uuden tiedon ja innovaatioiden avulla. Tutkielma on kvantitatiivinen tapaustutkimus. Tutkielmassa tehtyjen havaintojen mukaan sosiaaliset integraatiomekanismit ovat tärkeitä uuden tiedon hyödyntämisessä. Tiedon eksplisiittyyden havaitaan vaikuttavan tiedon muuttamiseen yritykselle hyödylliseksi resurssiksi.

The Roles of Cultural, Functional and Value Diversity in Innovativeness and Learning

Tutkielman tavoite on tutkia kulttuurista, funktionaalista ja arvojen diversiteettiä, niiden suhdetta innovatiivisuuteen ja oppimiseen sekä tarjota keinoja diversiteetin johtamiseen. Tämän lisäksi selvitetään linjaesimiesten haastattelujen kautta miten diversiteetti case -organisaatiossa tällä hetkellä koetaan. Organisaation diversiteetin tämänhetkisen tilan tunnistamisen kautta voidaan esittää parannusehdotuksia diversiteetin hallintaan. Tutkimus- ja tiedonkeruumenetelmänä käytetään kvalitatiivista focus group haastattelumenetelmää. Tutkimuksessa saatiin selkeä kuva kulttuurisen, funktionaalisen ja arvojen diversiteetin merkityksistä organisaation innovatiivisuudelle ja oppimiselle sekä löydettiin keinoja näiden diversiteetin tyyppien johtamiseen. Tutkimuksen tärkeä löydös on se, että diversiteetti vaikuttaa positiivisesti organisaation innovatiivisuuteen kun sitä johdetaan tehokkaasti ja kun organisaatioympäristö tukee avointa keskustelua ja mielipiteiden jakamista. Case organisaation tämänhetkistä diversiteetin tilaa selvitettäessä havaittiin että ongelma organisaatiossa ei ole diversiteetin puute, vaan paremminkin se, ettei diversiteettia osata hyödyntää. Organisaatio ei tue erilaisten näkemysten ja mielipiteiden vapaata esittämistä jahyväksikäyttöä ja siksi diversiteetin hyödyntäminen on epätäydellistä. Haastatteluissa tärkeinä seikkoina diversiteetin hyödyntämisen parantamisessa nähtiin kulttuurin muuttaminen avoimempaan suuntaan ja johtajien esimiestaitojen parantaminen.

Magazine publishers and their online strategies

It seems as if magazine publishers have only haphazardly listed multiple goals for their websites, and have not carefully reflectedon how to achieve them. We present a framework for defining a magazine's onlinestrategy based on previous studies and on secondary data from the industry. We identify three steps in the strategy process. The first is to determine whether the magazine would actually benefit from online presence: although most magazines will never make money from their websites, a web presence may still be justified. The second step is to choose an optimal online strategy that matches the magazine's competitive strategy. Finally, we argue that magazine publishers should carefully consider to what extent they should allow their readers to be involvedin the web pages. This interactivity could be seen as a key factor in exploiting the unique nature of the Internet. It is our understanding that virtual communities could, at best, be a way of creating more value for a magazine's readers, advertisers and editors, alike. We formulate a typology of five different onlinebusiness concepts for magazines based on these three strategic steps.

A Study on Fractionation and Ultrafiltration of Proteins with Characterized Modified and Unmodified Membranes

Membrane filtration has become increasingly attractive in the processing of both foodand biotechnological products. However, the poor selectivity of the membranes and fouling are the critical factors limiting the development of UF systems for the specific fractionation of protein mixtures. This thesis gives an overview on fractionation of proteins from model protein solutions or from biological solutions. An attempt was made to improve the selectivity of the available membranes by modifying the membranes and by exploiting the different electrostatic interactions between the proteins and the membrane pore surfaces. Fractionation and UF behavior of proteins in the model solutions and in the corresponding biological solutions were compared. Characterization of the membranes and protein adsorptionto the membrane were investigated with combined flux and streaming potential studies. It has been shown that fouling of the membranes can be reduced using "self-rejecting" membranes at pH values where electrostatic repulsion is achieved between the membrane and the proteins in solution. This effect is best shown in UF of dilute single protein solutions at low ionic strengths and low pressures. Fractionation of model proteins in single, binary, and ternary solutionshas been carried out. The results have been compared to the results obtained from fractination of biological solutions. It was generally observed that fractination of proteins from biological solutions are more difficult to carry out owingto the presence of non studied protein components with different properties. Itcan be generally concluded that it is easier to enrich the smaller protein in the permeate but it is also possible to enrich the larger protein in the permeateat pH values close to the isoelectric point of the protein. It should be possible to find an optimal flux and modification to effectively improve the fractination of proteins even with very similar molar masses.