Nos plantamos! Urbanismo participativo y agricultura urbana en los huertos comunitarios de Madrid

Los huertos comunitarios son una realidad emergente en las ciudades españolas, en Madrid surgen impulsados por asociaciones vecinales, colectivos sociales y ecologistas. Una dinámica que prolifera durante los últimos seis años, construyendo un discurso crítico sobre la sostenibilidad urbana y constituyendo estructuras de coordinación que han conseguido introducir esta temática en la esfera pública y en la agenda política. Estos huertos son espacios que están articulando experiencias de reflexión e intervención participativa sobre la ciudad, sobre el espacio público, las identidades colectivas o los procesos de apropiación espacial. Además desde estas iniciativas se está abordando la noción de soberanía alimentaria como cuestión estratégica para el futuro de las ciudades, promoviendo la incorporación en el planeamiento de la agricultura urbana, como una más de las dimensiones que estructuran la ciudad, aprovechando al máximo su potencialidad no sólo en cuanto a la producción de alimentos, sino en sus aspectos sociales, educativos y ecológicos.

Estudio y mejora de métodos de registro 3D: aceleración sobre unidades de procesamiento gráfico y caracterización del espacio de transformaciones iniciales

Durante los últimos años ha sido creciente el uso de las unidades de procesamiento gráfico, más conocidas como GPU (Graphic Processing Unit), en aplicaciones de propósito general, dejando a un lado el objetivo para el que fueron creadas y que no era otro que el renderizado de gráficos por computador. Este crecimiento se debe en parte a la evolución que han experimentado estos dispositivos durante este tiempo y que les ha dotado de gran potencia de cálculo, consiguiendo que su uso se extienda desde ordenadores personales a grandes cluster. Este hecho unido a la proliferación de sensores RGB-D de bajo coste ha hecho que crezca el número de aplicaciones de visión que hacen uso de esta tecnología para la resolución de problemas, así como también para el desarrollo de nuevas aplicaciones. Todas estas mejoras no solamente se han realizado en la parte hardware, es decir en los dispositivos, sino también en la parte software con la aparición de nuevas herramientas de desarrollo que facilitan la programación de estos dispositivos GPU. Este nuevo paradigma se acuñó como Computación de Propósito General sobre Unidades de Proceso Gráfico (General-Purpose computation on Graphics Processing Units, GPGPU). Los dispositivos GPU se clasifican en diferentes familias, en función de las distintas características hardware que poseen. Cada nueva familia que aparece incorpora nuevas mejoras tecnológicas que le permite conseguir mejor rendimiento que las anteriores. No obstante, para sacar un rendimiento óptimo a un dispositivo GPU es necesario configurarlo correctamente antes de usarlo. Esta configuración viene determinada por los valores asignados a una serie de parámetros del dispositivo. Por tanto, muchas de las implementaciones que hoy en día hacen uso de los dispositivos GPU para el registro denso de nubes de puntos 3D, podrían ver mejorado su rendimiento con una configuración óptima de dichos parámetros, en función del dispositivo utilizado. Es por ello que, ante la falta de un estudio detallado del grado de afectación de los parámetros GPU sobre el rendimiento final de una implementación, se consideró muy conveniente la realización de este estudio. Este estudio no sólo se realizó con distintas configuraciones de parámetros GPU, sino también con diferentes arquitecturas de dispositivos GPU. El objetivo de este estudio es proporcionar una herramienta de decisión que ayude a los desarrolladores a la hora implementar aplicaciones para dispositivos GPU. Uno de los campos de investigación en los que más prolifera el uso de estas tecnologías es el campo de la robótica ya que tradicionalmente en robótica, sobre todo en la robótica móvil, se utilizaban combinaciones de sensores de distinta naturaleza con un alto coste económico, como el láser, el sónar o el sensor de contacto, para obtener datos del entorno. Más tarde, estos datos eran utilizados en aplicaciones de visión por computador con un coste computacional muy alto. Todo este coste, tanto el económico de los sensores utilizados como el coste computacional, se ha visto reducido notablemente gracias a estas nuevas tecnologías. Dentro de las aplicaciones de visión por computador más utilizadas está el registro de nubes de puntos. Este proceso es, en general, la transformación de diferentes nubes de puntos a un sistema de coordenadas conocido. Los datos pueden proceder de fotografías, de diferentes sensores, etc. Se utiliza en diferentes campos como son la visión artificial, la imagen médica, el reconocimiento de objetos y el análisis de imágenes y datos de satélites. El registro se utiliza para poder comparar o integrar los datos obtenidos en diferentes mediciones. En este trabajo se realiza un repaso del estado del arte de los métodos de registro 3D. Al mismo tiempo, se presenta un profundo estudio sobre el método de registro 3D más utilizado, Iterative Closest Point (ICP), y una de sus variantes más conocidas, Expectation-Maximization ICP (EMICP). Este estudio contempla tanto su implementación secuencial como su implementación paralela en dispositivos GPU, centrándose en cómo afectan a su rendimiento las distintas configuraciones de parámetros GPU. Como consecuencia de este estudio, también se presenta una propuesta para mejorar el aprovechamiento de la memoria de los dispositivos GPU, permitiendo el trabajo con nubes de puntos más grandes, reduciendo el problema de la limitación de memoria impuesta por el dispositivo. El funcionamiento de los métodos de registro 3D utilizados en este trabajo depende en gran medida de la inicialización del problema. En este caso, esa inicialización del problema consiste en la correcta elección de la matriz de transformación con la que se iniciará el algoritmo. Debido a que este aspecto es muy importante en este tipo de algoritmos, ya que de él depende llegar antes o no a la solución o, incluso, no llegar nunca a la solución, en este trabajo se presenta un estudio sobre el espacio de transformaciones con el objetivo de caracterizarlo y facilitar la elección de la transformación inicial a utilizar en estos algoritmos.

Plant species, biomass and environmental characteristics of relevés along the North America Arctic bioclimate gradient

Question: How do interactions between the physical environment and biotic properties of vegetation influence the formation of small patterned-ground features along the Arctic bioclimate gradient? Location: At 68° to 78°N: six locations along the Dalton Highway in arctic Alaska and three in Canada (Banks Island, Prince Patrick Island and Ellef Ringnes Island). Methods: We analysed floristic and structural vegetation, biomass and abiotic data (soil chemical and physical parameters, the n-factor [a soil thermal index] and spectral information [NDVI, LAI]) on 147 microhabitat releves of zonalpatterned-ground features. Using mapping, table analysis (JUICE) and ordination techniques (NMDS). Results: Table analysis using JUICE and the phi-coefficient to identify diagnostic species revealed clear groups of diagnostic plant taxa in four of the five zonal vegetation complexes. Plant communities and zonal complexes were generally well separated in the NMDS ordination. The Alaska and Canada communities were spatially separated in the ordination because of different glacial histories and location in separate floristic provinces, but there was no single controlling environmental gradient. Vegetation structure, particularly that of bryophytes and total biomass, strongly affected thermal properties of the soils. Patterned-ground complexes with the largest thermal differential between the patterned-ground features and the surrounding vegetation exhibited the clearest patterned-ground morphologies.

Adenylate concentration and energy charge in different thallus regions and after UV radiation in brown, red and green algae

A method was developed to extract adenine nucleotides AMP, ADP, and ATP from marine macroalgal tissue to gain information on the cellular energy charge. Quantification was carried out by high performance liquid chromatography (HPLC). Three species from the rocky shore of the island of Helgoland (German Bight) were examined: Laminaria saccharina (Phaeophyta), Chondrus crispus (Rhodophyta), and Ulva lactuca (Chlorophyta). In L. saccharina and C. crispus, the adenylate energy charge (AEC) was determined in different thallus regions. AEC varied in relation to tissue age and function. Higher AEC values typically occurred in thallus regions with meristematic activity. Furthermore, L. saccharina and U. lactuca were exposed to UV-A and elevated UV-B radiation. The AEC was calculated and the maximal quantum yield of photosystem II (Fv/Fm) was determined as indicators for UV stress. In both species, the AEC remained at high values (0.72 ± 0.04), while Fv/Fm dropped rapidly. The results show that the photosynthesis of the phaeophyte is more resistant to UV radiation than the chlorophyte.

Living in a potentially toxic environment: comparisons of endofauna in two congeneric sponges from the Great Barrier Reef

The abundance and community composition of the endofauna in 2 species of sponge, Haliclona sp. 1 and Haliclona sp. 2 (phylum Porifera: order Haplosclerida), were examined at different sites on the slope at Heron Island Reef, in the southern Great Barrier Reef, on 2 separate occasions. Both species of Haliclona Occupy Similar habitats on the reef slope and are often found living adjacent to each other, but the major groups of secondary metabolites and the gross external morphology in the 2 species of sponge are different. The 2 species of sponge supported significantly different endofaunal communities, with Haliclona sp. 2 Supporting 3 to 4 times more individuals than Haliclona sp. 1. Fewer demersal zooplankton (copepods), nematodes and some peracarid crustaceans were found in Haliclona sp. I compared with Haliclona sp. 2. There were also differences in the numbers of spionid, nereidid and syllid. polychaetes living in the 2 species of sponge. The only taxon that was more abundant in Haliclona sp. 1 than Haliclona sp. 2 was the spionid Polydorella prolifera, and this difference was only evident on 1. of the 2 occasions. The amount of free space (pores, channels, cavities) for a given weight of sponge was only 19% greater in Haliclona sp. 2 than in Haliclona sp. 1, suggesting other factors, such as the differences in the allelochemicals, may have a role in determining the numbers and types of animals living in these 2 species of sponge.

Chemical deterrence of a marine cyanobacterium against sympatric and non-sympatric consumers

This study investigates the influence of mesograzer prior exposure to toxic metabolites on palatability of the marine cyanobacterium, Lyngbya majuscula. We examined the palatability of L. majuscula crude extract obtained from a bloom in Moreton Bay, South East Queensland, Australia, containing lyngbyatoxin-a (LTA) and debromoaplysiatoxin (DAT), to two groups: (1) mesograzers of L. majuscula from Guam where LTA and DAT production is rare; and (2) macro- and mesograzers found feeding on L. majuscula blooms in Moreton Bay where LTA and DAT are often prevalent secondary metabolites. Pair-wise feeding assays using artificial diets consisting of Ulva clathrata suspended in agar (control) or coated with Moreton Bay L. majuscula crude extracts (treatment) were used to determine palatability to a variety of consumers. In Guam, the amphipods, Parhyale hawaiensis and Cymadusa imbroglio; the majid crab Menaethius monoceros; and the urchin Echinometra mathaei were significantly deterred by the Moreton Bay crude extract. The sea hares, Stylocheilus striatus, from Guam were stimulated to feed by treatment food whereas S. striatus collected from Moreton Bay showed no discrimination between food types. In Moreton Bay, the cephalaspidean Diniatys dentifer and wild caught rabbitfish Siganus fuscescens were significantly deterred by the crude extract. However, captive-bred S. fuscescens with no known experience with L. majuscula did not clearly discriminate between food choices. Lyngbya majuscula crude extract deters feeding by most mesograzers regardless of prior contact or association with blooms.

Data compilation on the biological response to ocean acidification: environmental and experimental context of data sets and related literature

The exponential growth of studies on the biological response to ocean acidification over the last few decades has generated a large amount of data. To facilitate data comparison, a data compilation hosted at the data publisher PANGAEA was initiated in 2008 and is updated on a regular basis (doi:10.1594/PANGAEA.149999). By January 2015, a total of 581 data sets (over 4 000 000 data points) from 539 papers had been archived. Here we present the developments of this data compilation five years since its first description by Nisumaa et al. (2010). Most of study sites from which data archived are still in the Northern Hemisphere and the number of archived data from studies from the Southern Hemisphere and polar oceans are still relatively low. Data from 60 studies that investigated the response of a mix of organisms or natural communities were all added after 2010, indicating a welcomed shift from the study of individual organisms to communities and ecosystems. The initial imbalance of considerably more data archived on calcification and primary production than on other processes has improved. There is also a clear tendency towards more data archived from multifactorial studies after 2010. For easier and more effective access to ocean acidification data, the ocean acidification community is strongly encouraged to contribute to the data archiving effort, and help develop standard vocabularies describing the variables and define best practices for archiving ocean acidification data.

R-codes, and coral abundance, water temperature and transect characteristics of nearshore reefs in Belize

Coral reefs are increasingly threatened by global and local anthropogenic stressors, such as rising seawater temperature and nutrient enrichment. These two stressors vary widely across the reef face and parsing out their influence on coral communities at reef system scales has been particularly challenging. Here, we investigate the influence of temperature and nutrients on coral community traits and life history strategies on lagoonal reefs across the Belize Mesoamerican Barrier Reef System (MBRS). A novel metric was developed using ultra-high-resolution sea surface temperatures (SST) to classify reefs as enduring low (lowTP), moderate (modTP), or extreme (extTP) temperature parameters over 10 years (2003 to 2012). Chlorophyll-a (chl a) records obtained for the same interval were employed as a proxy for bulk nutrients and these records were complemented with in situ measurements to "sea truth" nutrient content across the three reef types. Chl a concentrations were highest at extTP sites, medial at modTP sites and lowest at lowTP sites. Coral species richness, abundance, diversity, density, and percent cover were lower at extTP sites compared to lowTP and modTP sites, but these reef community traits did not differ between lowTP and modTP sites. Coral life history strategy analyses showed that extTP sites were dominated by hardy stress-tolerant and fast-growing weedy coral species, while lowTP and modTP sites consisted of competitive, generalist, weedy, and stress-tolerant coral species. These results suggest that differences in coral community traits and life history strategies between extTP and lowTP/modTP sites were driven primarily by temperature differences with differences in nutrients across site types playing a lesser role. Dominance of weedy and stress-tolerant genera at extTP sites suggests that corals utilizing these two life history strategies may be better suited to cope with warmer oceans and thus may warrant further protective status during this climate change interval. Data associated with this project are archived here, including: -SST data -Satellite Chl a data -Nutrient measurements -Raw coral community survey data For questions contact Justin Baumann (j.baumann3 gmail.com)

Mecanismos de neurotoxicidade induzidos pela Dopamina e pela 6–OH-dopamina num modelo celular humano: efeito da presença de extratos de algas com elevada capacidade antioxidante

O aumento da esperança média de vida tem elevado a prevalência de doenças neurodegenerativas, como é o caso da doença de Parkinson. Nos últimos anos a procura de novas soluções terapêuticas, assim como a minimização dos efeitos dos tratamentos atualmente utilizados tem promovido a procura de novas soluções. Deste modo, o objetivo deste trabalho consistiu no estudo dos mecanismos moleculares de neurotoxicidade induzidos pela dopamina (DA) e 6-hidroxidopamina (6-OHDA) num modelo celular do neuroblastoma humano (SH-SY5Y), bem como na avaliação do potencial neuroprotetor de extratos de algas com elevada capacidade antioxidante. O efeito neurotóxico da DA e 6-OHDA, assim como o efeito protetor dos extratos das algas com maior atividade antioxidante (Sargassum muticum, Saccorhiza polyschides, Padina pavonica, Codium tomentosum, Ulva compressa) foi avaliado através da viabilidade celular das células SH-SY5Y utilizando o método de MTT. De modo a compreender os efeitos induzidos na viabilidade celular pela DA e 6-OHDA procedeu-se ao estudo da atividade da caspase-3, alterações do potencial mitocondrial e quantificação de H2O2. Os resultados demonstraram um claro efeito dependente da concentração da DA (30-3000μM) e 6-OHDA (10-1000μM) na viabilidade celular das células SH-SY5Y, bem como do tempo de exposição (6-48h). No que diz respeito a prevenção do efeito neurotóxico da DA (1000μM (56,41±5,05% de células viáveis); 24h) e 6-OHDA (100μM (66,76±3,24% de células viáveis);24h) pelos extratos das algas (1mg/mL; 24h) verificou-se que os extratos que apresentaram um efeito preventivo mais marcado pertencem as algas Sargassum muticum (82,37±6,41% de células viáveis e 115,8±8,53% de células viáveis, após tratamento com DA e 6-OHDA, respetivamente), Saccorhiza polyschides (89,26±8,62% de células viáveis e 106,51±4,26% de células viáveis, após tratamento com DA e 6-OHDA, respetivamente) e Codium tomentosum (81,28±3,68% de células viáveis e 103,17±7,25% de células viáveis, após tratamento com DA e 6-OHDA, respetivamente). A morte celular induzida pela DA e pela 6-OHDA foi acompanhada pelo aumento da atividade da caspase-3 quando comparado com o controlo (DA - 66,46±1,49fluorescência (u.a)/mg de proteína/minuto; 6-OHDA - 22,56±1,71fluorescência (u.a)/mg de proteína/minuto; controlo – 4,8 ±0,48fluorescência (u.a)/mg de proteína/minuto), pela presença de elevadas quantidades de peróxido de hidrogénio (H2O2) (363,81±28,58 % do controlo e 214,26 ± 8,46 % do controlo, após tratamento com DA e 6-OHDA, respetivamente) e pela despolarização da membrana mitocondrial (162,3±2,34 % do controlo e 144,7±2,87 % do controlo, após tratamento com DA e 6-OHDA, respetivamente). Por sua vez, durante o tratamento com extratos das algas (1mg/mL) na presença de DA e 6-OHDA verificou-se uma inibição da atividade da caspase-3 induzida pelas algas Sargassum muticum (2,53±2,49fluorescência (u.a)/mg de proteína/minuto e 4,52±1,36 fluorescência (u.a)/mg de proteína/minuto, após tratamento com DA e 6-OHDA, respetivamente), Saccorhiza polyschides (4,71±0,70fluorescência (u.a.)/mg de proteína/minuto e 2,73±1,11 fluorescência (u.a.)/mg de proteína/minuto, após tratamento com DA e 6-OHDA, respetivamente) e Codium tomentosum (17,05±1,72fluorescência (u.a.)/mg de proteína/minuto e 2,58±1,77fluorescência (u.a)/mg de proteína/minuto, após tratamento com DA e 6-OHDA, respetivamente). De igual modo verificou-se uma diminuição da produção de H2O2 pelas células SH-SY5Y na presença dos extratos das algas Sargassum muticum (132,58 ± 10,68% controlo), Saccorhiza polyschides (150,54 ± 23,54% controlo) e Codium tomentosum (54,074 ± 6,66% do controlo), quando expostas a 6-OHDA, contudo não se verificou o mesmo efeito na presença de DA. Relativamente ao potencial mitocondrial observou-se uma inibição da despolarização mitocondrial induzida pela DA e 6-OHDA nas células SH-SY5Y pela presença dos extratos das algas Sargassum muticum (135,7±2,97% controlo e 49,3±1,17% controlo, após tratamento com DA e 6-OHDA, respetivamente), Saccorhiza polyschides (126,7±5,46% controlo e 94,3±1,70% controlo, após tratamento com DA e 6-OHDA, respetivamente). Os resultados obtidos demonstraram o potencial citoprotetor dos extratos de algas sobre efeitos neurotóxicos induzidos pela DA e 6-OHDA no modelo celular SH-SY5Y. O efeito protetor é mediado pela diminuição da condição de stress oxidativo, com redução da produção de H2O2, diminuição da atividade da caspase-3 e prevenção da alteração do potencial mitocondrial induzido pela DA e 6-OHDA. Conclui-se que os extratos de algas produzem moléculas bioativas com elevado potencial antioxidante, podendo ser uma fonte promissora de novos compostos neuroprotetores com aplicação terapêutica para doenças neurodegenerativas como a doença de Parkinson.