Classificação sem��ntica de imagens com k-NN e RN

Um dos maiores desafios tecnol��gicos no presente �� o de se conseguir gerar e manter, de uma maneira eficiente e consistente, uma base de dados de objectos multim��dia, em particular, de imagens. A necessidade de desenvolver m��todos de pesquisa autom��ticos baseados no conte��do sem��ntico das imagens tornou-se de m��xima import��ncia. MPEG-7 �� um standard que descreve o contudo dos dados multim��dia que suportam estes requisitos operacionais. Adiciona um conjunto de descritores audiovisuais de baixo n��vel. O histograma �� a caracter��stica mais utilizada para representar as caracter��sticas globais de uma imagem. Neste trabalho �� usado o ���Edge Histogram Descriptor��� (EHD), que resulta numa representa����o de baixo n��vel que permite a computa����o da similaridade entre imagens. Neste trabalho, �� obtida uma caracteriza����o sem��ntica da imagem baseada neste descritor usando dois m��todos da classificação: o algoritmo k Nearest Neighbors (k-NN) e uma Rede Neuronal (RN) de retro propaga����o. No algoritmo k-NN �� usada a dist��ncia Euclidiana entre os descritores de duas imagens para calcular a similaridade entre imagens diferentes. A RN requer um processo de aprendizagem pr��via, que inclui responder correctamente ��s amostras do treino e ��s amostras de teste. No fim deste trabalho, ser�� apresentado um estudo sobre os resultados dos dois m��todos da classificação.

Estudo explorat��rio sobre a classificação da vincula����o at��pica: desorganiza����o ou adapta����o?

Os estudos da vincula����o t��m como denominador comum a teoria da vincula����o proposta por Boelby...

Identifica����o das categorias mais relevantes da classificação internacional de funcionalidade, incapacidade e sa��de para os terapeutas ocupacionais que exercem fun����es em unidades de cuidados continuados integrados

As constantes altera����es das realidades sociais e epidemiol��gicas em associa����o ao envelhecimento populacional conduziram a insufici��ncias dos Sistemas Social e de Sa��de que requerem uma reestrutura����o ao n��vel da adequa����o dos cuidados de sa��de a prestar, pelo que, em resposta a esta necessidade foi criada a Rede Nacional de Cuidados Continuados Integrados. O presente estudo, de natureza qualitativa e car��cter explorat��rio, tem como objectivo compreender a percep����o dos Terapeutas Ocupacionais que trabalham em Unidades de Cuidados Continuados Integrados relativamente ��s categorias que considerem mais relevantes da Classificação Internacional da Funcionalidade, Incapacidade e Sa��de, tendo sido aplicada uma entrevista a 8 profissionais a exercer fun����es em Unidades da Zona Norte, resultante de um processo de amostragem n��o probabil��stica e de conveni��ncia. Como m��todo de recolha de dados foi aplicada uma entrevista semi-estruturada, cujo gui��o foi constru��do ap��s revis��o bibliogr��fica, tendo por base as categorias definidas pelo modelo da Classificação Internacional da Funcionalidade, Incapacidade e Sa��de e, posteriormente, analisado por um painel de peritos, tendo-se procedido �� realiza����o de uma entrevista piloto a um elemento, sem que esta contasse para a an��lise. A partir da an��lise das entrevistas realizadas procedemos �� identifica����o das unidades de significado, tendo os conceitos sido ligados ��s categorias da Classificação que o representam de uma forma mais adequada, de acordo com as linking rules, tendo sido identificadas as categorias mais relevantes para os Terapeutas Ocupacionais a exercer fun����es em Unidades de Cuidados Continuados Integrados. Com a realiza����o deste estudo, que pretende ser um primeiro passo para a cria����o de um futuro Core Set em Cuidados Continuados, foi-nos poss��vel verificar que o maior n��mero de categorias foram observadas no componente Actividades e Participa����o, tendo sido contabilizadas 70 (40,7%). Por outro lado, o componente Estruturas do corpo �� o que integra menor n��mero, contando com 19 categorias (11,05%). Assim, pensamos que a cria����o de um Core Set em Cuidados Continuados poder�� beneficiar e facilitar a comunica����o entre os profissionais destas equipas. No entanto, �� importante ressalvar que a terminologia desta Classificação dever�� ser utilizada de uma forma concertada com a linguagem espec��fica da Terapia Ocupacional. Palavras-chave: Classificação Internacional da Funcionalidade, Incapacidade e Sa��de, Core Set, Terapeutas Ocupacionais, Unidades de Cuidados Continuados Integrados.

Sensibilidade e especificidade de classificação de sobrepeso em adolescentes, Rio de Janeiro

OBJETIVO: Avaliar a preval��ncia, sensibilidade e especificidade em detectar adolescentes em risco de obesidade, baseada no ��ndice de Massa Corporal (IMC). M��TODOS: Foram avaliados 502 adolescentes de 12 a 18 anos, participantes da pesquisa Nutri����o e Sa��de do Munic��pio do Rio de Janeiro, desenvolvida em 1996. As vari��veis do estudo foram: peso, estatura, IMC e dobra subescapular, de acordo com sexo e idade. As classifica����es para IMC foram comparadas com a classificação pela dobra subescapular no percentil 90 (excesso de adiposidade) da popula����o de adolescentes americanos. RESULTADOS: A preval��ncia de excesso de adiposidade foi mais elevada com a dobra subescapular (P<0,0001) comparada com as classifica����es do IMC que apresentaram valores aproximados. A especificidade foi superior �� sensibilidade com as duas propostas do IMC. O ponto de equil��brio entre sensibilidade e especificidade foi pr��ximo ao percentil 70 para meninas e meninos menores de 14 anos. Em meninos maiores de 15 anos, o ponto de corte aproximou-se do percentil 50 do IMC. CONCLUS��O: Ambas classifica����es do IMC foram mais adequadas para identificar adolescentes sem obesidade, n��o sendo sens��veis para rastrear excesso de adiposidade.

Sistema de digitaliza����o, detec����o e classificação autom��tica de recibos em dispositivos m��veis

Ao longo dos ��ltimos anos tem-se assistido a uma r��pida evolu����o dos dispositivos m��veis. Essa evolu����o tem sido mais intensa no poder de processamento, na resolu����o e qualidade das c��maras e na largura de banda das redes m��veis de nova gera����o. Outro aspecto importante �� o pre��o, pois cada vez mais existem dispositivos m��veis avan��ados a um pre��o acess��vel, o que facilita a adop����o destes equipamentos por parte dos utilizadores. Estes factores contribuem para que o n��mero de utilizadores com ���computadores de bolso��� tenda a aumentar, possibilitando cada vez mais a cria����o de ferramentas com maior complexidade que tirem partido das caracter��sticas desses equipamentos. Existem muitas aplica����es que exploram estas caracter��sticas para facilitar o trabalho aos utilizadores. Algumas dessas aplica����es conseguem retirar informa����o do mundo f��sico e fazer algum tipo de processamento, como por exemplo, um leitor de c��digos QR ou um OCR (Optical Character Recognizer). Aproveitando o potencial dos dispositivos m��veis actuais, este trabalho descreve o estudo, a implementa����o e a avalia����o de uma aplica����o de realidade aumentada para adquirir e gerir recibos em papel de forma autom��tica e inteligente. A aplica����o utiliza a c��mara do dispositivo para adquirir imagens dos recibos de forma a poder process��-las recorrendo a t��cnicas de processamento de imagem. Tendo uma imagem processada do recibo �� efectuado um reconhecimento ��ptico de caracteres para extrac����o de informa����o e �� utilizada uma t��cnica de classificação para atribuir uma classe ao documento. Para um melhor desempenho do classificador �� utilizada uma estrat��gia de aprendizagem incremental. Ap��s a correcta classificação �� poss��vel visualizar o recibo com informa����o adicional (realidade aumentada). O trabalho proposto inclui tamb��m a avalia����o da interface e dos algoritmos desenvolvidos.

The influence of genetic polymorphisms in XRCC3 and ADH5 genes on the frequency of genotoxicity biomarkers in workers exposed to formaldehyde

The International Agency for Research on Cancer classified formaldehyde as carcinogenic to humans because there is ���sufficient epidemiological evidence that it causes nasopharyngeal cancer in humans���. Genes involved in DNA repair and maintenance of genome integrity are critically involved in protecting against mutations that lead to cancer and/or inherited genetic disease. Association studies have recently provided evidence for a link between DNA repair polymorphisms and micronucleus (MN) induction. We used the cytokinesis-block micronucleus (CBMN assay) in peripheral lymphocytes and MN test in buccal cells to investigate the effects of XRCC3 Thr241Met, ADH5 Val309Ile, and Asp353Glu polymorphisms on the frequency of genotoxicity biomarkers in individuals occupationally exposed to formaldehyde (n = 54) and unexposed workers (n = 82). XRCC3 participates in DNA double-strand break/recombination repair, while ADH5 is an important component of cellular metabolism for the elimination of formaldehyde. Exposed workers had significantly higher frequencies (P < 0.01) than controls for all genotoxicity biomarkers evaluated in this study. Moreover, there were significant associations between XRCC3 genotypes and nuclear buds, namely XRCC3 Met/Met (OR = 3.975, CI 1.053���14.998, P = 0.042) and XRCC3 Thr/Met (OR = 5.632, CI 1.673���18.961, P = 0.005) in comparison with XRCC3 Thr/Thr. ADH5 polymorphisms did not show significant effects. This study highlights the importance of integrating genotoxicity biomarkers and genetic polymorphisms in human biomonitoring studies.

Arrow Plot: a new graphical tool for selecting up and down regulated genes and genes differentially expressed on samples subgroups

Background: A common task in analyzing microarray data is to determine which genes are differentially expressed across two (or more) kind of tissue samples or samples submitted under experimental conditions. Several statistical methods have been proposed to accomplish this goal, generally based on measures of distance between classes. It is well known that biological samples are heterogeneous because of factors such as molecular subtypes or genetic background that are often unknown to the experimenter. For instance, in experiments which involve molecular classification of tumors it is important to identify significant subtypes of cancer. Bimodal or multimodal distributions often reflect the presence of subsamples mixtures. Consequently, there can be genes differentially expressed on sample subgroups which are missed if usual statistical approaches are used. In this paper we propose a new graphical tool which not only identifies genes with up and down regulations, but also genes with differential expression in different subclasses, that are usually missed if current statistical methods are used. This tool is based on two measures of distance between samples, namely the overlapping coefficient (OVL) between two densities and the area under the receiver operating characteristic (ROC) curve. The methodology proposed here was implemented in the open-source R software. Results: This method was applied to a publicly available dataset, as well as to a simulated dataset. We compared our results with the ones obtained using some of the standard methods for detecting differentially expressed genes, namely Welch t-statistic, fold change (FC), rank products (RP), average difference (AD), weighted average difference (WAD), moderated t-statistic (modT), intensity-based moderated t-statistic (ibmT), significance analysis of microarrays (samT) and area under the ROC curve (AUC). On both datasets all differentially expressed genes with bimodal or multimodal distributions were not selected by all standard selection procedures. We also compared our results with (i) area between ROC curve and rising area (ABCR) and (ii) the test for not proper ROC curves (TNRC). We found our methodology more comprehensive, because it detects both bimodal and multimodal distributions and different variances can be considered on both samples. Another advantage of our method is that we can analyze graphically the behavior of different kinds of differentially expressed genes. Conclusion: Our results indicate that the arrow plot represents a new flexible and useful tool for the analysis of gene expression profiles from microarrays.

In vitro transference and molecular characterization of bla TEM genes in bacteria isolated from Portuguese ready-to-eat foods

The principal aim of this study was to investigate the possibility of transference to Escherichia coli of ��-lactam resistance genes found in bacteria isolated from ready-to-eat (RTE) Portuguese traditional food. From previous screenings, 128 ��-lactam resistant isolates (from different types of cheese and of delicatessen meats), largely from the Enterobacteriaceae family were selected and 31.3% of them proved to transfer resistance determinants in transconjugation assays. Multiplex PCR in donor and transconjugant isolates did not detect bla CTX, bla SHV and bla OXY, but bla TEM was present in 85% of them, while two new TEMs (TEM-179 and TEM-180) were identified in two isolates. The sequencing of these amplicons showed identity between donor and transconjugant genes indicating in vitro plasmid DNA transfer. These results suggest that if there is an exchange of genes in natural conditions, the consumption of RTE foods, particularly with high levels of Enterobacteriaceae, can contribute to the spread of antibiotic resistance.

Classificação multi-etiqueta hier��rquica de textos segundo a taxonomia ACM

Mestrado em Engenharia Inform��tica

Modelo de representa����o de texto mais adequado �� classificação

Mestrado em Engenharia Inform��tica

Crian��as com d��fices no controlo motor: contributo para a elabora����o do core set da Classificação Internacional de Funcionalidade, Incapacidade e Sa��de (CIF)

A CIF �� um sistema de classificação adotado pela OMS, que serve de refer��ncia universal para descrever, avaliar e medir sa��de e incapacidade, a n��vel individual e ao n��vel da popula����o. Contudo, apesar do interesse internacional gerado em torno da CIF, esta �� considerada uma classificação complexa e extensa, fato que despoletou a cria����o de core sets ��� listas de itens da CIF especificamente selecionados pela sua relev��ncia na descri����o e qualifica����o de uma determinada condi����o de sa��de ��� como resposta a esta problem��tica. At�� �� data, foram desenvolvidos core sets para v��rias patologias comuns. Contudo, apesar do controlo motor ser uma ��rea de investiga����o muito reconhecida nos ��ltimos 20 anos, ainda n��o possui um core set pr��prio. Assim, o objetivo deste estudo �� contribuir para o desenvolvimento de um core set, com base na CIF-CJ, dirigido para uma descri����o abrangente das compet��ncias inerentes a crian��as, dos 6 aos 18 anos de idade, com d��fices no controlo motor. Deste modo, recorreu-se a uma revis��o da literatura sobre a tem��tica em estudo, de modo a reunir informa����o para a constru����o de uma proposta a core set, posteriormente sujeita ao escrut��nio de peritos, atrav��s do recurso ao m��todo de Delphi. Ap��s v��rias rondas, foi alcan��ado um consenso acerca da lista final de c��digos CIF que constituem o core set final.

Classificação de anomalias e redu����o de falsos positivos em sistemas de detec����o de intrus��o baseados em rede utilizando m��todos de agrupamento

Coordena����o de Aperfei��oamento de Pessoal de N��vel Superior (CAPES)

Previs��o da produ����o de carne vend��vel e do rendimento das diferentes pe��as de corte de carca��as de bovino com base na sua classificação SEUROP

Disserta����o de Mestrado, Engenharia Zoot��cnica, 11 de Junho de 2014, Universidade dos A��ores.

Translation termination and protein folding pathway genes are not correlated in gastric cancer

Background: The eukaryotic release factor 3 (eRF3) has been shown to affect both tubulin and actin cytoskeleton, suggesting a role in cytoskeleton assembly, mitotic spindle formation and chromosome segregation. Also, direct interactions between eRF3 and subunits of the cytosolic chaperonin CCT have been described. Moreover, both eRF3a and CCT subunits have been described to be up-regulated in cancer tissues. Our aim was to evaluate the hypothesis that eRF3 expression levels are correlated with the expression of genes encoding proteins involved in the tubulin folding pathways. Methods: Relative expression levels of eRF1, eRF3a/GSPT1, PFDN4, CCT2, CCT4, and TBCA genes in tumour samples relative to their adjacent normal tissues were investigated using real time-polymerase chain reaction in 20 gastric cancer patients. Results: The expression levels of eRF3a/GSPT1 were not correlated with the expression levels of the other genes studied. However, significant correlations were detected between the other genes, both within intestinal and diffuse type tumours. Conclusions: eRF3a/GSPT1 expression at the mRNA level is independent from both cell translation rates and from the expression of the genes involved in tubulin-folding pathways. The differences in the patterns of expression of the genes studied support the hypothesis of genetically independent pathways in the origin of intestinal and diffuse type gastric tumours.

Fat intake interacts with polymorphisms of Caspase9, FasLigand and PPARgamma apoptotic genes in modulating Crohn's disease activity

Background & aims: Crohn���s disease (CD) is a multifactorial disease where resistance to apoptosis is one major defect. Also, dietary fat intake has been shown to modulate disease activity. We aimed to explore the interaction between four single nucleotide polymorphisms (SNPs) in apoptotic genes and dietary fat intake in modulating disease activity in CD patients. Methods: Polymerase Chain Reaction (PCR) and Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) techniques were used to analyze Caspase9��93C/T, FasLigand-843C/T, Peroxisome Proliferator-Activated Receptor gamma��161C/T and Peroxisome Proliferator-Activated Receptor gamma Pro12Ala SNPs in 99 patients with CD and 116 healthy controls. Interactions between SNPs and fat intake in modulating disease activity were analyzed using regression analysis. Results: None of the polymorphisms analyzed influenced disease susceptibility and/or activity, but a high intake of total, saturated and monounsaturated fats and a higher ratio of n-6/n-3 polyunsaturated fatty acids (PUFA), was associated with a more active phenotype (p < 0.05). We observed that the detrimental effect of a high intake of total and trans fat was more marked in wild type carriers of the Caspase9��93C/T polymorphism [O.R (95%CI) 4.64 (1.27e16.89) and O.R (95%CI) 4.84 (1.34e17.50)]. In the Peroxisome Proliferator-Activated Receptor gamma Pro12Ala SNP, we also observed that a high intake of saturated and monounsaturated fat was associated to a more active disease in wild type carriers [OR (95%CI) 4.21 (1.33e13.26) and 4.37 (1.52e12.51)]. Finally, a high intake of n-6 PUFA was associated with a more active disease in wild type carriers for the FasLigand-843C/T polymorphism [O.R (95%CI) 5.15 (1.07e24.74)]. Conclusions: To our knowledge, this is the first study to disclose a synergism between fat intake and SNPs in apoptotic genes in modulating disease activity in CD patients.