Local cohomology with supports in the non-free locus

[EN] The groups of local cohomology with supports in the non-free locus of a module are used in order to obtain three classifications and one characterization of four classes of modules

"Quietis et deliciarum locus" restauro e rifunzionalizzazione della dimora padronale di "Villa Cappello-Mora"

VILLA “CAPELLO - MORA”: PROGETTO DI RESTAURO E RIFUNZIONALIZZAZIONE Il restauro è da intendere come un intervento diretto sull’opera, e anche come sua eventuale modifica, condotta sempre sotto un rigoroso controllo tecnico-scientifico e storico-critico, se parliamo di conservazione, intendiamo l’operare in un intento di salvaguardia e di prevenzione, da attuare proprio per evitare che si debba poi intervenire con il restauro, che comprende un evento traumatico per il manufatto. Un seconda parola chiave in questo discorso è la “materia” il restauro interviene sulla materia di un monumento e questa costituisce il tramite dei valori culturali antichi, la sua conservazione e il suo restauro garantisce la trasmissione anche dei significati estetici, storici simbolici del costruito. Ma certamente influisce il tempo sulle cose per cui il progetto di restauro non può astenersi dall’intervenire, in una logica di minimo intervento, di reversibilità, di facile lettura. Il concetto di nuovo in un opera antica, concetto che a parere personale, pare centrare in pieno il problema. Il nuovo infatti “deve avere carattere di autonomia e di chiara leggibilità: come l’<> di Boito deve essere inequivocabilmente opera nuova, come prodotto figurativo e materiale autonomo, chiara ed inequivocabile espressione <>”. Ne deriva riassumendo che oggi l’obbiettivo deve essere quello di conservare da un lato senza non sotrarre altra materia alla fabbrica e di valorizzare, ossia aggiungere, nuove “presenze” di cultura contemporanea. Per questo si parlerà di progetto di restauro e rifunzionalizzazione. La fabbrica ha subito nel corso dell’ultimo decennio una serie di “rovinose” manomissioni, che a differenza di quelle operate in tempi più antichi (coincidenti con esigenze funzionali corrispondenti alla logica dell’adattare) appaiano ben più gravi, e contribuiscono a peggiorare la lettura del fabbricato. Il Veneto e soprattutto la zona intorno a Bassano del Grappa presenta una infinità di dimore padronali casini di caccia, resti di antiche residenze (colombare, oratori, ecc.) risalenti al periodo di maggior fioritura della residenza di “Villa” della Serenissima. Nel caso specifico di studio , quindi della rifunzionalizzazione dell’edificio, la domanda sorge spontanea; Come ristabilire un senso a questi spazi? E nell’ipotesi di poter realmente intervenire che cosa farne di questi oggetti?. E ultimo ma non ultimo in che modo poter ristabilire un “dialogo” con l’edificio in una lettura corretta del suo significato non solo per quel che riguarda la materia ma anche per ciò che ci trasmette nel “viverlo”, nell’usufruirne nel fatto stesso di poterlo vedere, passandoci davanti. tà. Lidea si forma prima ancora da un esigenza del territorio, il comune di Cassola dove ha sede la Villa,pur avendo un discreto numero di abitanti e collocandosi in posizione nevralgica in quanto molto vicino al centro diBasssano (ne è quasi la promulgazione), non possiede uno spazio espositivo /rappresentativo, un edificio a carattere pubblico, sede di “eventi” culturali locali e non. Villa Capello –Mora, potrebbe rispondere bene a questo tipo di utilizzo. Si è deciso di pensare ad un luogo a carattere espositivo che possa funzionare durante tutto l’anno e nei periodi etsivi includa anche il giardino esterno. Il progetto muove da due principi il principio di “reversibilità” e quello del “minimo intervento” sottolinenando volutamente che siano gli ogetti esposti e lo spazio dei locali a fare da protagonisti, Punti chiave nell’interpretazione degli spazi sono stati i percorsi, la “narrazione” degli oggetti esposti avviene per momenti e viene rimarcata nell’allestimento tramite i materiali i colori e le superfici espositive, perché nel momento in cui visito una mostra o un museo, è come se stessi vivendo la narrazione di un qualcosa, oggetto semplice od opera complessa che sia inteso nell’ambito museale-espositivo esso assume una capacità di trasmissione maggiore rispetto a qundo lo stesso ogetto si trova in un contesto differente, la luce e la sua disposizione nello spazio, fanno sì che il racconto sia narrato, bene o male, ancora più importante è lo sfondo su cui si staglia l’opera, che può essere chiuso, come una serie di scatole dentro la scatola (edificio) oppure aperto, con singole e indipendenti pannellature dove l’edificio riveste il carattere proprio di sfondo. Scelta la seconda delle due ipotesi, si è voluto rimarcare nella composizione degli interni i momenti della narrazione, così ad esempio accedendo dall’ingresso secondario (lato nord-ovest) al quale si è dato l’ingresso alla mostra, -superata la prima Hall- si viene, catapultati in uno spazio porticato in origine aperto e che prevediamo chiuso da una vetrata continua, portata a debita distanza dal colonnato. Questo spazio diventa la prima pagina del testo, una prima pagina bianca, uno spazio libero, di esposizione e non di relax e di presentazione dell’evento, uno spazio distributivo non votato solo a questo scopo, ma passibile di trasformazione. A rimarcare il percorso una pavimentazione in cemento lisciato, che invita l’accesso alle due sale espositive a sinista e a destra dell’edificio. Nell’ala a sinistra (rispetto al nord) si apre la stanza con camino seicentesco forse un tempo ad uso cucina? Sala che ospita dei pannelli a sospesi a muro e delle teche espositive appese a soffitto. L’ala di destra, diametralmente opposta, l’unica che al piano terra mantiene la pavimentazione originale, stabiliva il vero atrio d’entrata, nel XVII sec. riconoscibile da quattro colonne tuscaniche centrali a reggere un solaio ligneo, in questa stanza il percorso segnato a terra torna nella disposizione dei pannelli espositivi che si dispongono in un a formare un vero corridoio, tra uno e l’atro di questi pannelli degli spazi sufficienti a intravedere le colonne centrali, i due lati dello stretto percorso non sono paralleli e aprono in senso opposto a due restanti spazi dell’intero salone, La sala suddivisa così in queste tre parti - una di percorrenza due di esposizione - , risulta modificata nella lettura che ne annulla l’originale funzione. Questa nuova “forma”, non vuole essere permanente infatti i pannelli non sono fissi. la narrazione avviene così per momenti, per parti, , che non devono necessariamente far comprendere il “tutto”, ma suggerirlo. Così come per il percorso che non è obbligato ma suggerito. A terminare il piano altre due sale di minore dimensione e di modesto carattere, nelle quali sono presenti pannellature a parete come nella prima sala. L’allestimento prosegue al piano primo a cui si accede tramite due rampe, trattate nel progetto difformemente, in base al loro stato e al loro significato, la rampa più recente (XIX sec) rompe lo spazio al piano nobile stravolgendo l’ingresso a questo salone, che originariamente avveniva salendo dalla scala principale e oltrepassando un disimpegno. La scala ottocentesca introduce direttamente all’ambiente che ora risulta liberato dalle superfetazioni dello scorso secolo, mostrandosi come era stato previsto in origine. Questa rottura dello spazio viene marcata nel progetto da un volume che “imprigiona” la rampa e segna l’inizio della sala espositiva, la sala delle architetture. Al centro della sala in un gioco di pieni e vuoti i pannelli, espositivi, distaccati di poco gli uni dagli altri questa volta non a incorniciare delle colonne ma a richiamo delle pitture murali che raffiguranti una loggia alludono ad una lettura per “parti” e scandiscono lo spazio in una “processione” di eventi. A seguito del “gioco” sono presenti in senso ortogonale ai pannelli sopradescritti ulteriori pannellature appese ad una struttura metallica indipendente dalle capriate lignee. Tale struttura assume ad una duplice funzione, funge sia da irrigidimento della struttura (edificio) che da supporto alla pannellatura, ad essa infatti è collegata una fune, che entrerà in tensione, quando il pannello verrà ad appendersi. Infine questa fune passante da due puleggie permetterà al pannello di traslare da un lato all’altro dell’edificio, bloccandosi nella posizione desiderata tramite freno interno, azionato manualmente.

Transcriptional dynamics of the human DMD locus

The human DMD locus encodes dystrophin protein. Absence or reduced levels of dystrophin (DMD or BMD phenotype, respectively) lead to progressive muscle wasting. Little is known about the complex coordination of dystrophin expression and its transcriptional regulation is a field of intense interest. In this work we found that DMD locus harbours multiple long non coding RNAs which orchestrate and control transcription of muscle dystrophin mRNA isoforms. These lncRNAs are tissue-specific and highly expressed during myogenesis, suggesting a possible role in tissue-specific expression of DMD gene isoforms. Their forced ectopic expression in human muscle and neuronal cells leads to a specific and negative regulation of endogenous dystrophin full lenght isoforms. An intriguing aspect regarding the transcription of the DMD locus is the gene size (2.4Mb). The mechanism that ensures the complete synthesis of the primary transcript and the coordinated splicing of 79 exons is still completely unknown. By ChIP-on-chip analyses, we discovered novel regions never been involved before in the transcription regulation of the DMD locus. Specifically, we observed enrichments for Pol II, P-Ser2, P-Ser5, Ac-H3 and 2Me-H3K4 in an intronic region of 3Kb (approximately 21Kb) downstream of the end of DMD exon 52 and in a region of 4Kb spanning the DMD exon 62. Interestingly, this latter region and the TSS of Dp71 are strongly marked by 3Me-H3K36, an histone modification associated with the regulation of splicing process. Furthermore, we also observed strong presence of open chromatin marks (Ac-H3 and 2Me-H3K4) around intron 34 and the exon 45 without presence of RNA pol II. We speculate that these two regions may exert an enhancer-like function on Dp427m promoter, although further investigations are necessary. Finally, we investigated the nuclear-cytoplasmic compartmentalization of the muscular dystrophin mRNA and, specifically, we verified whether the exon skipping therapy could influence its cellular distribution.

Shimura subvarieties and the Torelli locus

We investigate the Torelli locus of abelian and cyclic covers of the projective line for occurrence of Shimura subvarieties. Amon other things, we show that under some conditions there are no Shimura subvarieties in this locus.

Heterozygous deletion of the PU.1 locus in human AML

The transcription factor PU.1 is essential for myeloid development. Targeted disruption of an upstream regulatory element (URE) decreases PU.1 expression by 80% and leads to acute myeloid leukemia (AML) in mice. Here, we sequenced the URE sequences of PU.1 in 120 AML patients. Four polymorphisms (single nucleotide polymorphisms [SNPs]) in the URE were observed, with homozygosity in all SNPs in 37 patients. Among them, we compared samples at diagnosis and remission, and one patient with cytogenetically normal acute myeloid leukemia M2 was identified with heterozygosity in 3 of the SNPs in the URE at remission. Loss of heterozygosity was further found in this patient at 2 polymorphic sites in the 5' promoter region and in 2 intronic sites flanking exon 4, thus suggesting loss of heterozygosity covering at least 40 kb of the PU.1 locus. Consistently, PU.1 expression in this patient was markedly reduced. Our study suggests that heterozygous deletion of the PU.1 locus can be associated with human AML.

Mapping of a new locus for congenital anomalies of the kidney and urinary tract on chromosome 8q24

Congenital anomalies of the kidney and urinary tract (CAKUT) account for the majority of end-stage renal disease in children (50%). Previous studies have mapped autosomal dominant loci for CAKUT. We here report a genome-wide search for linkage in a large pedigree of Somalian descent containing eight affected individuals with a non-syndromic form of CAKUT.

Novel association to the proprotein convertase PCSK7 gene locus revealed by analysing soluble transferrin receptor (sTfR) levels

The level of body iron storage and the erythropoietic need for iron are indicated by the serum levels of ferritin and soluble transferrin receptor (sTfR), respectively. A meta-analysis of five genome-wide association studies on sTfR and ferritin revealed novel association to the PCSK7 and TMPRSS6 loci for sTfR and the HFE locus for both parameters. The PCSK7 association was the most significant (rs236918, P = 1.1 × 10E-27) suggesting that proprotein convertase 7, the gene product of PCSK7, may be involved in sTfR generation and/or iron homeostasis. Conditioning the sTfR analyses on transferrin saturation abolished the HFE signal and substantially diminished the TMPRSS6 signal while the PCSK7 association was unaffected, suggesting that the former may be mediated by transferrin saturation whereas the PCSK7-associated effect on sTfR generation appears to be more direct.

A locus on chromosome 5 is associated with dilated cardiomyopathy in Doberman Pinschers

Dilated cardiomyopathy (DCM) is a heterogeneous group of heart diseases with a strong genetic background. Currently, many human DCM cases exist where no causative mutation can be identified. DCM also occurs with high prevalence in several large dog breeds. In the Doberman Pinscher a specific DCM form characterized by arrhythmias and/or echocardiographic changes has been intensively studied by veterinary cardiologists. We performed a genome-wide association study in Doberman Pinschers. Using 71 cases and 70 controls collected in Germany we identified a genome-wide significant association to DCM on chromosome 5. We validated the association in an independent cohort collected in the United Kingdom. There is no known DCM candidate gene under the association signal. Therefore, DCM in Doberman Pinschers offers the chance of identifying a novel DCM gene that might also be relevant for human health.

The mutation causing the black-and-tan pigmentation phenotype of Mangalitza pigs maps to the porcine ASIP locus but does not affect its coding sequence

The gene for agouti signaling protein (ASIP) is centrally involved in the expression of coat color traits in animals. The Mangalitza pig breed is characterized by a black-and-tan phenotype with black dorsal pigmentation and yellow or white ventral pigmentation. We investigated a Mangalitza x Piétrain cross and observed a coat color segregation pattern in the F2 generation that can be explained by virtue of two alleles at the MC1R locus and two alleles at the ASIP locus. Complete linkage of the black-and-tan phenotype to microsatellite alleles at the ASIP locus on SSC 17q21 was observed. Corroborated by the knowledge of similar mouse coat color mutants, it seems therefore conceivable that the black-and-tan pigmentation of Mangalitza pigs is caused by an ASIP allele a(t), which is recessive to the wild-type allele A. Toward positional cloning of the a(t) mutation, a 200-kb genomic BAC/PAC contig of this chromosomal region has been constructed and subsequently sequenced. Full-length ASIP cDNAs obtained by RACE differed in their 5' untranslated regions, whereas they shared a common open reading frame. Comparative sequencing of all ASIP exons and ASIP cDNAs between Mangalitza and Piétrain pigs did not reveal any differences associated with the coat color phenotype. Relative qRT-PCR analyses showed different dorsoventral skin expression intensities of the five ASIP transcripts in black-and-tan Mangalitza. The a(t) mutation is therefore probably a regulatory ASIP mutation that alters its dorsoventral expression pattern.

Sequential Quantitative Trait Locus Mapping in Experimental Crosses

The etiology of complex diseases is heterogeneous. The presence of risk alleles in one or more genetic loci affects the function of a variety of intermediate biological pathways, resulting in the overt expression of disease. Hence, there is an increasing focus on identifying the genetic basis of disease by sytematically studying phenotypic traits pertaining to the underlying biological functions. In this paper we focus on identifying genetic loci linked to quantitative phenotypic traits in experimental crosses. Such genetic mapping methods often use a one stage design by genotyping all the markers of interest on the available subjects. A genome scan based on single locus or multi-locus models is used to identify the putative loci. Since the number of quantitative trait loci (QTLs) is very likely to be small relative to the number of markers genotyped, a one-stage selective genotyping approach is commonly used to reduce the genotyping burden, whereby markers are genotyped solely on individuals with extreme trait values. This approach is powerful in the presence of a single quantitative trait locus (QTL) but may result in substantial loss of information in the presence of multiple QTLs. Here we investigate the efficiency of sequential two stage designs to identify QTLs in experimental populations. Our investigations for backcross and F2 crosses suggest that genotyping all the markers on 60% of the subjects in Stage 1 and genotyping the chromosomes significant at 20% level using additional subjects in Stage 2 and testing using all the subjects provides an efficient approach to identify the QTLs and utilizes only 70% of the genotyping burden relative to a one stage design, regardless of the heritability and genotyping density. Complex traits are a consequence of multiple QTLs conferring main effects as well as epistatic interactions. We propose a two-stage analytic approach where a single-locus genome scan is conducted in Stage 1 to identify promising chromosomes, and interactions are examined using the loci on these chromosomes in Stage 2. We examine settings under which the two-stage analytic approach provides sufficient power to detect the putative QTLs.

The locus for bovine dilated cardiomyopathy maps to chromosome 18

Bovine dilated cardiomyopathy (BDCMP) is a severe and terminal disease of the heart muscle observed in Holstein-Friesian cattle over the last 30 years. There is strong evidence for an autosomal recessive mode of inheritance for BDCMP. The objective of this study was to genetically map BDCMP, with the ultimate goal of identifying the causative mutation. A whole-genome scan using 199 microsatellite markers and one SNP revealed an assignment of BDCMP to BTA18. Fine-mapping on BTA18 refined the candidate region to the MSBDCMP06-BMS2785 interval. The interval containing the BDCMP locus was confirmed by multipoint linkage analysis using the software loki. The interval is about 6.7 Mb on the bovine genome sequence (Btau 3.1). The corresponding region of HSA19 is very gene-rich and contains roughly 200 genes. Although telomeric of the marker interval, TNNI3 is a possible positional and a functional candidate for BDCMP given its involvement in a human form of dilated cardiomyopathy. Sequence analysis of TNNI3 in cattle revealed no mutation in the coding sequence, but there was a G-to-A transition in intron 6 (AJ842179:c.378+315G>A). The analysis of this SNP using the study's BDCMP pedigree did not conclusively exclude TNNI3 as a candidate gene for BDCMP. Considering the high density of genes on the homologous region of HSA19, further refinement of the interval on BTA18 containing the BDCMP locus is needed.

Allelic Heterogeneity at the Equine KIT Locus in Dominant White (W) Horses

White coat color has been a highly valued trait in horses for at least 2,000 years. Dominant white (W) is one of several known depigmentation phenotypes in horses. It shows considerable phenotypic variation, ranging from approximately 50% depigmented areas up to a completely white coat. In the horse, the four depigmentation phenotypes roan, sabino, tobiano, and dominant white were independently mapped to a chromosomal region on ECA 3 harboring the KIT gene. KIT plays an important role in melanoblast survival during embryonic development. We determined the sequence and genomic organization of the approximately 82 kb equine KIT gene. A mutation analysis of all 21 KIT exons in white Franches-Montagnes Horses revealed a nonsense mutation in exon 15 (c.2151C>G, p.Y717X). We analyzed the KIT exons in horses characterized as dominant white from other populations and found three additional candidate causative mutations. Three almost completely white Arabians carried a different nonsense mutation in exon 4 (c.706A>T, p.K236X). Six Camarillo White Horses had a missense mutation in exon 12 (c.1805C>T, p.A602V), and five white Thoroughbreds had yet another missense mutation in exon 13 (c.1960G>A, p.G654R). Our results indicate that the dominant white color in Franches-Montagnes Horses is caused by a nonsense mutation in the KIT gene and that multiple independent mutations within this gene appear to be responsible for dominant white in several other modern horse populations.