Utilizzo di algoritmi genetici nell'ambito della bioingegneria: Applicazione alla identificazione di modelli cardiaci

In questo studio sarà trattato lo sviluppo degli algoritmi genetici, uno strumento di calcolo nato ispirandosi alle leggi Darwiniane sull’evoluzione naturale. Questi algoritmi, le cui basi furono introdotte a partire dagli anni '40, mirano alla risoluzione di una vasta categoria di problemi computazionali utilizzando un approccio differente, basato sulle regole di mutazione e ricombinazione proprie della genetica. Essi permettono infatti di valutare delle soluzioni di partenza e, grazie alle variazioni introdotte dalla modifica casuale o dalla ricombinazione di queste, crearne di nuove nel tentativo di convergere verso soluzioni ottimali. Questo studio si propone come una descrizione di questo strumento, dei suoi sviluppi e delle sue potenzialità in ambito bioingegneristico, focalizzandosi sul suo utilizzo recente nell’ identificazione parametrica di modelli cardiaci.

Struttura filogenetica della comunità batterica associata ad Ostreopsis cf. Ovata in colture batch e dinamiche di crescita

Negli ultimi 10 anni i blooms attribuibili alla dinoflagellata bentonica Ostreopsis cf. ovata sono aumentati in termini di frequenza ed intensità lungo le coste del Mediterraneo, avendo ripercussioni negative sulla salute umana e forti impatti sulle comunità marine bentoniche, ciò a seguito della produzione di potenti tossine (composti palitossina-simili) da parte della microalga. Tra i fattori ecologici che innescano o regolano le dinamiche dei bloom tossici le interazioni tra microalghe e batteri sono in misura sempre maggiore oggetto di ricerca. In questo studio è stata analizzata la struttura filogenetica della comunità batterica associata ad O. cf. ovata in colture batch e valutate le dinamiche successionali della stessa in relazione alle differenti fasi di crescita della microalga (oltre che in relazione alle dinamiche di abbondanza virale). Lo studio filogenetico è stato effettuato tramite l’ausilio di metodiche molecolari di sequenziamento di next generation (Ion Torrent). Le abbondanze dei batteri e delle particelle virali sono state determinate tramite microscopia ad epifluorescenza; l’abbondanza cellulare algale è stata stimata tramite metodo Uthermohl. Il contributo della frazione batterica ad elevata attività respiratoria è stato determinato tramite doppia colorazione con coloranti DAPI e CTC. Dai dati emersi si evince che la comunità batterica attraversa due fasi di crescita distinte, una più marcata e concomitante con la fase esponenziale di O. cf. ovata, l'altra quando la microalga è in fase media stazionaria. Per quanto concerne la composizione filogenetica della comunità sono stati rilevati 12 phyla, 17 classi e 150 generi, sebbene i dati ottenuti abbiano rilevato una forte dominanza del phylum Proteobacteria con la classe Alphaproteobacteria, seguita dal phylum Bacteroidetes con la classe Sphingobacteria. Variazioni nella struttura filogenetica della comunità batterica, a livello di generi, tra le diverse fasi di crescita della microalga ha permesso di evidenziare ed ipotizzare particolari interazioni di tipo mutualistico e di tipo competitivo.

Einfluss einer indirekten pharmazeutischen Betreuung auf klinische und soziale Ergebnisse bei ambulant mit Chemotherapie behandelten Tumorpatienten

Krebspatienten, die eine Chemotherapie erhalten, leiden häufig an schwerwiegenden unerwünschten Arzneimittelwirkungen, wie z.B. Übelkeit und Erbrechen, welche nachweislich durch eine geeignete Supportivmedikation und durch eine direkte pharmazeutische Betreuung gesenkt werden können.rnIn dieser Arbeit wurde in einer prospektiven, nicht-interventionellen multizentrischen Studie untersucht, ob ambulant behandelte Mamma- und Colon-Carcinom-Patienten während der Chemotherapie Vorteile durch eine indirekte pharmazeutische Betreuung (Mitgabe einer schriftlichen Patienteninformation und der Begleitmedikamente) haben. Primäres Ziel der Studie war eine Reduktion von Häufigkeit und Schweregrad ausgewählter UAW, sekundäre Ziele waren die Verbesserung der Lebensqualität, der Patientenzufriedenheit und des Patientenwissens zur Therapie und Begleitmedikation. Die Daten wurden mittels vier verschiedener Patienten-Fragebögen in Form von Telefoninterviews zu drei verschiedenen Zeitpunkten der Chemotherapie erhoben.rnInsgesamt konnten 106 Patienten vom St.-Johannes-Hospital in Dortmund und von der Universitätsmedizin Mainz in die Studie eingeschlossen werden. Die UAW nach Häufigkeit und Schweregrad gemäß CTC konnten durch eine indirekte pharmazeutische Betreuung zu allen drei Zeitpunkten der Datenerfassung z.T. signifikant gesenkt werden. Eine Verbesserung konnte auch bei allen humanistischen Ergebnisparametern (Patientenwissen, Lebensqualität, Patientenzufriedenheit) beobachtet werden. Auf Grund der relativ kleinen, nicht vollständig rekrutierten Kontrollgruppe und den unterschiedlichen Rahmenbedingungen an den teilnehmenden Kliniken, sind weitere vergleichende Untersuchungen erforderlich, um den Nutzen einer indirekten pharmazeutischen Betreuung weiter zu belegen. rn

Closed Time-like Curves and Inertial Frame Dragging: How to Time Travel via Spacetime Rotation

As the number of solutions to the Einstein equations with realistic matter sources that admit closed time-like curves (CTC's) has grown drastically, it has provoked some authors [10] to call for a physical interpretation of these seemingly exotic curves that could possibly allow for causality violations. A first step in drafting a physical interpretation would be to understand how CTC's are created because the recent work of [16] has suggested that, to follow a CTC, observers must counter-rotate with the rotating matter, contrary to the currently accepted explanation that it is due to inertial frame dragging that CTC's are created. The exact link between inertialframe dragging and CTC's is investigated by simulating particle geodesics and the precession of gyroscopes along CTC's and backward in time oriented circular orbits in the van Stockum metric, known to have CTC's that could be traversal, so the van Stockum cylinder could be exploited as a time machine. This study of gyroscopeprecession, in the van Stockum metric, supports the theory that CTC's are produced by inertial frame dragging due to rotating spacetime metrics.

Diagnostic microchip to assay 3D colony-growth potential of captured circulating tumor cells

Microfluidic technology has been successfully applied to isolate very rare tumor-derived epithelial cells (circulating tumor cells, CTCs) from blood with relatively high yield and purity, opening up exciting prospects for early detection of cancer. However, a major limitation of state-of-the-art CTC-chips is their inability to characterize the behavior and function of captured CTCs, for example to obtain information on proliferative and invasive properties or, ultimately, tumor re-initiating potential. Although CTCs can be efficiently immunostained with markers reporting phenotype or fate (e.g. apoptosis, proliferation), it has not yet been possible to reliably grow captured CTCs over long periods of time and at single cell level. It is challenging to remove CTCs from a microchip after capture, therefore such analyses should ideally be performed directly on-chip. To address this challenge, we merged CTC capture with three-dimensional (3D) tumor cell culture on the same microfluidic platform. PC3 prostate cancer cells were isolated from spiked blood on a transparent PDMS CTC-chip, encapsulated on-chip in a biomimetic hydrogel matrix (QGel™) that was formed in situ, and their clonal 3D spheroid growth potential was assessed by microscopy over one week in culture. The possibility to clonally expand a subset of captured CTCs in a near-physiological in vitro model adds an important element to the expanding CTC-chip toolbox that ultimately should improve prediction of treatment responses and disease progression.

Acute and late toxicity in prostate cancer patients treated by dose escalated intensity modulated radiation therapy and organ tracking

BACKGROUND: To report acute and late toxicity in prostate cancer patients treated by dose escalated intensity-modulated radiation therapy (IMRT) and organ tracking. METHODS: From 06/2004 to 12/2005 39 men were treated by 80 Gy IMRT along with organ tracking. Median age was 69 years, risk of recurrence was low 18%, intermediate 21% and high in 61% patients. Hormone therapy (HT) was received by 74% of patients. Toxicity was scored according to the CTC scale version 3.0. Median follow-up (FU) was 29 months. RESULTS: Acute and maximal late grade 2 gastrointestinal (GI) toxicity was 3% and 8%, late grade 2 GI toxicity dropped to 0% at the end of FU. No acute or late grade 3 GI toxicity was observed. Grade 2 and 3 pre-treatment genitourinary (GU) morbidity (PGUM) was 20% and 5%. Acute and maximal late grade 2 GU toxicity was 56% and 28% and late grade 2 GU toxicity decreased to 15% of patients at the end of FU. Acute and maximal late grade 3 GU toxicity was 8% and 3%, respectively. Decreased late > or = grade 2 GU toxicity free survival was associated with higher age (P = .025), absence of HT (P = .016) and higher PGUM (P < .001). DISCUSSION: GI toxicity rates after IMRT and organ tracking are excellent, GU toxicity rates are strongly related to PGUM.

Survival analysis of circulating tumor cells in triple-negative breast cancer

Background. Breast cancer is the most frequently diagnosed cancer and the leading cause of cancer death among females, accounting for 23% (1.38 million) of the total new cancer cases and 14% (458,400) of the total cancer deaths in 2008. [1] Triple-negative breast cancer (TNBC) is an aggressive phenotype comprising 10–20% of all breast cancers (BCs). [2-4] TNBCs show absence of estrogen, progesterone and HER2/neu receptors on the tumor cells. Because of the absence of these receptors, TNBCs are not candidates for targeted therapies. Circulating tumor cells (CTCs) are observed in blood of breast cancer patients even at early stages (Stage I & II) of the disease. Immunological and molecular analysis can be used to detect the presence of tumor cells in the blood (Circulating tumor cells; CTCs) of many breast cancer patients. These cells may explain relapses in early stage breast cancer patients even after adequate local control. CTC detection may be useful in identifying patients at risk for disease progression, and therapies targeting CTCs may improve outcome in patients harboring them. Methods . In this study we evaluated 80 patients with TNBC who are enrolled in a larger prospective study conducted at M D Anderson Cancer Center in order to determine whether the presence of circulating tumor cells is a significant prognostic factor in relapse free and overall survival . Patients with metastatic disease at the time of presentation were excluded from the study. CTCs were assessed using CellSearch System™ (Veridex, Raritan, NJ). CTCs were defined as nucleated cells lacking the presence of CD45 but expressing cytokeratins 8, 18 or 19. The distribution of patient and tumor characteristics was analyzed using chi square test and Fisher's exact test. Log rank test and Cox regression analysis was applied to establish the association of circulating tumor cells with relapse free and overall survival. Results. The median age of the study participants was 53years. The median duration of follow-up was 40 months. Eighty-eight percent (88%) of patients were newly diagnosed (without a previous history of breast cancer), and (60%) of patients were chemo naïve (had not received chemotherapy at the time of their blood draw for CTC analysis). Tumor characteristics such as stage (P=0.40), tumor size (P=69), sentinel nodal involvement (P=0.87), axillary lymph node involvement (P=0.13), adjuvant therapy (P=0.83), and high histological grade of tumor (P=0.26) did not predict the presence of CTCs. However, CTCs predicted worse relapse free survival (1 or more CTCs log rank P value = 0.04, at 2 or more CTCs P = 0.02 and at 3 or more CTCs P < 0.0001) and overall survival (at 1 or more CTCs log rank P value = 0.08, at 2 or more CTCs P = 0.01 and at 3 or more CTCs P = 0.0001. Conclusions. The number of circulating tumor cells predicted worse relapse free survival and overall survival in TNBC patients.^

Impacts of common rules of origin on FTA utilization

This paper examines empirically the impacts of sharing rules of origin (RoOs) with other ASEAN+1 free trade agreements (FTAs) on ASEAN-Korea FTA/ASEAN-China FTA utilization in Thai exports in 2011. Our careful empirical analysis suggests that the harmonization of RoOs across FTAs play some role in reducing the costs yielded through the spaghetti bowl phenomenon. In particular, the harmonization to "change-in-tariff classification (CTC) or real value-added content (RVC)" will play a relatively positive role in not seriously discouraging firms’ use of multiple FTA schemes. On the other hand, the harmonization to CTC or CTC&RVC hinders firms from using those schemes.

Eficiência de fontes, dinâmica do magnésio no solo sob a cultura do café no Brasil e comparação da análise de K, Ca e Mg em solos do Arkansas-EUA seco em estufa e úmido de campo

A cultura do café no Brasil tem apresentado frequente deficiência de magnésio (Mg) limitando sua produtividade, portanto faz-se necessário o estudo de fontes que contenham Mg para essa cultura. Por outro lado, o estudo das metodologias de análise de K, Ca e Mg no solo é um outro ponto que precisa ser estudado para melhor manejo da fertilidade do solo e recomendação de adubações. Objetivou-se com o primeiro experimento avaliar a eficiência de fontes de magnésio para a cultura do café e a dinâmica deste nutriente no perfil do solo. E com o experimento desenvolvido em Arkansas-EUA, avaliar as correlações entre as concentrações de nutrientes do solo seco em estufa e úmido de campo extraídos com Mehlich-3 e 1 mol L-1 NH4OAc. Observou-se que o óxido e oxissulfato de Mg elevaram os valores de pH e CTC e diminuíram a concentração de H + Al do solo. As fontes diminuíram a disponibilidade de K e Ca, e aumentaram o Mg no solo. Na planta, óxido e sulfato de Mg proporcionaram maior concentração de Mg foliar. Apenas no segundo ano de avaliação houve aumento de produtividade do café. Os fertilizantes óxido e oxissulfato de Mg obtiveram o maior índice de eficiência agronômica em relação ao carbonato de Mg. No segundo experimento, K, Ca e Mg extraíveis com Mehlich-3 e NH4OAc foram altamente correlacionados (r2> 0,95) tanto para solo úmido de campo quanto para o seco em estufa. A relação entre as concentrações de K no solo seco em estufa e úmido de campo para Mehlich-3 e NH4OAc foram muito semelhantes e altamente correlacionados (r2 = 0,92). A secagem do solo em estufa teve efeito mínimo sobre as concentrações de Ca e reduziu a concentração de Mg tanto para Mehlich-3 quanto para NH4OAc. Entre os nutrientes estudados, a concentração de K foi a mais afetada pela secagem em estufa, necessitando de pesquisas de campo para correlacionar e calibrar novas recomendações agronômicas.

Efeito da aplicação de composto orgânico sobre a qualidade do solo cultivado com cana-de-açúcar (Saccharum spp.)

A dinâmica ambiental possui capacidade limitada de reciclagem e a crescente utilização resíduos agroindustriais, especialmente na agricultura, pode levar a situações de poluição do solo e demais componentes ambientais. A manutenção da produtividade de ecossistemas agrícolas e naturais depende do processo de transformação da matéria orgânica e, por conseguinte, da biomassa microbiana do solo, e que é responsável pela decomposição e mineralização de resíduos no mesmo. A dinâmica natural dos microrganismos do solo, em constante mudança e adaptação, os torna um indicador sensível às mudanças resultantes de diferentes práticas de manejo agrícola. Sendo assim, conhecer essas alterações e suas interferências é fundamental para identificar estratégias adequadas de manejo, apontando técnicas de utilização adequadas. O objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade de um solo agrícola, cultivado com três variedades de cana-de-açúcar (Saccharum spp.), comparando a utilização de adubação mineral frente à utilização de fertilizante orgânico composto no período final de formação dos perfilhos (120 dias após o plantio). Foi implantado, em condições de campo, o cultivo de cana-de-açúcar (cana planta), utilizando as variedades RB 867515, RB 962869 e RB 855453, onde cada variedade foi cultivada de três formas distintas, sendo elas: plantio controle (CT) sem aplicação de insumos para adubação; plantio orgânico (OG) com aplicação de fertilizante orgânico; e plantio convencional (CV) com aplicação de adubação mineral, seguindo recomendações de adubação após análise química inicial do solo local. Cada parcela possuía 37 m2, com 5 sulcos de 5,0 m de comprimento e espaçamento de 1,5 m entrelinhas, sendo os três sulcos centrais formando a área útil. De acordo com a variedade e o tipo de adubação, foram formados nove tratamentos: T1 86CT, T2 96CT, T3 85CT, T4 6OG, T5 96OG, T6 85OG, T7 86CV, T8 96CV e T9 85CV, com delineamento estatístico de blocos ao acaso e quatro repetições. Os parâmetros químicos do solo analisados foram macronutrientes e micronutrientes; os parâmetros microbiológicos foram carbono da biomassa microbiana (CBM), respiração basal do solo (RBS), quociente metabólico (qCO2), número mais provável de fungos e bactérias do solo (NMP); e, por fim, a produtividade agrícola (t/ha). Os resultados foram submetidos a análise de variância (ANOVA) e à comparação das médias através do teste de Tukey (10%). Também foi realizada a análise de variância dos dados e correlação cofenética de Pearson para formação de dendogramas. Com base no período estudado, considerado como fase crítica da formação do canavial, concluiu-se que os parâmetros químicos que evidenciaram alterações no solo foram pH e os macronutrientes Mg, Al e SB, sendo os tratamentos orgânicos equivalentes e/ou melhores que os tratamentos convencionais. Para os parâmetros microbiológicos, o NMP de fungos apresentou os maiores valores nos tratamentos convencionais e controle. A produtividade agrícola não foi influenciada pelos diferentes tratamentos e insumos utilizados, independente da variedade de cana-de-açúcar utilizada. Por fim, foram observadas correlações positivas entre as variáveis CTC e quociente metabólico (qCO2) apontando potencial melhoria da qualidade do solo, com o emprego de insumos orgânicos

Fatores de bioconcentração e disponibilidade de bário, cádmio, cobre, níquel e zinco em solos e em culturas de interesse agronômico

Os elementos potencialmente tóxicos (EPTs) estão presentes nos solos em concentrações dependentes do material de origem e das ações antrópicas. A adição de EPTs ao solo pelas atividades antrópicas pode ocasionar risco à saúde humana, já que estes elementos podem ser acumulados no organismo por meio do contato dérmico com o solo, da inalação de partículas em suspensão, de ingestão de solo e de alimentos contaminados. A contaminação dos alimentos ocorre pelo cultivo em áreas com alta biodisponibilidade de EPTs, e nessa condição ocorre absorção e translocação para a parte aérea, com possível acúmulo dos metais nas porções comestíveis, como raízes, frutos e grãos. A biodisponibilidade dos EPTs é regulada pelas características químicas dos elementos e por atributos do solo, como a CTC, o pH e a matéria orgânica (MO). Sintomas de toxicidade e alterações morfológicas e fisiológicas podem aparecer dependendo da absorção e da movimentação dos EPTs nas plantas. Objetivou-se neste trabalho avaliar o efeito da adição de bário (Ba), de cádmio (Cd), de cobre (Cu), de níquel (Ni) e de zinco (Zn) em amostras de um Neossolo Quartzarênico e um Latossolo Vermelho distrófico, sob duas condições de saturação por bases (30% e 50 ou 70%, dependendo da cultura), no cultivo de arroz (Oryza sativa), alface (Lactuca sativa), girassol (Helianthus annuus) e tomate (Solanum lycopersicum). Os EPTs nos solos foram extraídos com EPA 3051a, Água Régia, DTPA, Mehlich 1, Mehlich 3, HNO3 (0,43 mol L-1) e CaCl2 (0,01 mol L-1), e seus teores correlacionados com os presentes nas raízes, na parte aérea, nos frutos e com a quantidade acumulada pelas plantas. Os fatores de bioconcentração (FBC) e de transferência (FT) foram calculados para as culturas. O índice SPAD (Soil Plant Analysis Development - Chlorophyll Meter) foi determinado na fase vegetativa da alface, do arroz e do girassol, enquanto a atividade fotossintética foi determinada pelo IRGA (Infrared gas analyzer). Os maiores teores de EPTs foram observados nas plantas cultivadas no Neossolo. As quantidades de Cu, Ni e Zn acumuladas nas plantas apresentaram correlação positiva com os teores extraídos pelo EPA 3051a e pela Água Régia. Os teores extraídos com HNO3 (0,43 mol L-1) apresentaram elevada correlação positiva com os teores reativos extraídos com DTPA e com Mehlich 3, e também com as quantidades de EPTs acumuladas pelas plantas. Os FBCs foram mais altos nos solos com baixa CTC, baixos teores de MO e baixos valores de pH. O arroz apresentou a menor translocação de Cd do sistema radicular para os grãos. O Cu, o Ni e o Zn causaram alterações no desenvolvimento da alface e do girassol, e diminuíram a transpiração e a condutância estomática da alface. O arroz apresentou a menor absorção de EPTs e a maior tolerância ao Ba, ao Cd, ao Ni e ao Zn, no entanto, as plantas apresentaram maiores condutividade estomática e transpiração.

Capacitación en metodologías de desarrollo de programas interactivos para Televisión Digital

La TV Digital ha tenido en estos últimos años una gran expansión en todo el mundo (en algunos países ya se está implementando el "apagón analógico", luego del cual toda transmisión televisiva será digital) y con una creciente cobertura en toda Latinoamérica debido a las políticas activas que en los últimos años han llevado a cabo los gobiernos (por ejemplo, el sistema de TDA – Televisión Digital Abierta de Argentina tiene una cobertura actual superior al 80% de la población). Esta expansión se debe a que esta tecnología permite no sólo una mejor calidad de imagen sino también una experiencia de usuario-televidente mucho más rica gracias a que el sistema puede transmitir y procesar datos, además del video y el sonido, y permite interacciones más complejas que la TV tradicional o analógica. Sin embargo, y a pesar de su alcance cada vez más masivo, las grandes ventajas de la TV Digital no están siendo aún explotadas en todo su potencial. Esto se debe, según los estudios realizados, a dos razones principales: (1) no se ha encontrado aún un modelo de negocios superador de la TV tradicional que aproveche la interacción del usuario-televidente (el cual, generalmente por desconocimiento, tampoco exige mayor complejidad y riqueza en su interacción con la TV) y (2) no hay suficientes recursos humanos adecuadamente formados que puedan desarrollar productos que exploten la compleja interacción entre el producto de TV (serie, unitario, película, documental) y el software (que permite el procesamiento de los datos y la interacción con el usuario-televidente) para generar producciones innovadoras en el campo televisivo. El Centro Tecnológico Comunitario de la Municipalidad de Nono (CTC Nono) nos ha solicitado ser recipiente de actividades de extensión que apunten a subsanar específicamente esta segunda causa, la falta de recursos humanos que puedan apropiarse de esta tecnología. A diferencia de muchos otros Centros Tecnológicos Comunitarios, el CTC Nono pudo continuar funcionando durante estos 14 años gracias a la capacidad de sus dirigentes de adaptar permanentemente sus objetivos y su forma de funcionamiento. EL CTC Nono, como tal, comenzó siendo un centro de alfabetización informática y de acceso popular a los servicios TIC básicos, para llegar a ser hoy un activo centro generador de programas de TV regional por un lado y de desarrollos de software por otro. Sin embargo, la característica principal que ha permanecido inmutable a lo largo de estos años es la de ser un centro de atracción, contención y aprendizaje abierto para todos los vecinos con inquietudes productivas y artísticas. Es por ello que, concientes de la enorme potencialidad y alcance de la TV Digital, es que el CTC Nono realiza esta demanda de transferencia que implica proveer conocimiento teórico y práctico para el desarrollo de programas interactivos de TV Digital a grupos multidisciplinarios (de programadores, artistas y productores de TV) de toda la zona de Traslasierra que les permita expandir su producción a esta nueva tecnología de difusión masiva. Es de esperarse que de los cursos, talleres y actividades de seguimiento de proyectos, se podrán obtener productos innovadores que aprovechen todos los beneficios que brinda la TV Digital, llevando el polo de desarrollo de TV generado gracias al CTC Nono a una nueva etapa, de expansión y uso de esta novedosa tecnología.

Colonografia por tomografia computorizada : colonoscopia virtual a evidência actual

Trabalho Final do Curso de Mestrado Integrado em Medicina, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 2013

Audit of postoperative chemoradiotherapy as adjuvant therapy for resected gastroesophageal adenocarcinoma: An Australian multicentre experience

Background: Improved disease free and overall survivals were seen in curatively resected patients with gastric and gastroesophageal adenocarcinoma treated with the Intergroup 0116 (INT 0116) protocol of postoperative adjuvant chemoradiotherapy compared to surgery alone. This protocol has not been widely adopted in Australian centres because of perceived risks of toxicity. Methods: We reviewed the case records from 45 consecutive patients treated between May 1998 and August 2003 with the INT 0116 protocol and variations at five Australian institutions. The median age was 61.5 years (range 38-79). Twenty-nine patients had gastric and 12 had gastroesophageal junction primaries. All patients had attempted curative resection, however, seven had involved microscopic margins (R1 resection). Thirty-five had regional node involvement and none had evidence of distant metastasis. Results: The overall National Cancer Institute - Common Toxicity Criteria (NCI-CTC) version 2.0 grade 3 and grade 4 toxicity rates for all patients were 37.8% and 4.4%, respectively. There were no treatment related deaths. Gastrointestinal grade 3 toxicity was observed in 20% of patients, while haematologic grade 3 and 4 toxicity was observed in 17.8%. Toxicities experienced led to chemotherapy dose reductions in 22 patients and dose delay in 11 patients. Seven patients had a delay in radiotherapy and two did not proceed with radiotherapy. At a median follow up of 16 months (range 5-35) from surgery, 28 patients have relapsed (six with local recurrence alone) with 22 deaths occurring, all but one caused by cancer. Conclusion: The INT 0116 protocol is a safe and feasible schedule in a multicentre setting with an acceptable rate of toxicity and is an appropriate adjuvant treatment option for high-risk resected gastroesophageal adenocarcinoma.

Development of a quality control material for the measurement of 8-oxo-7,8-dihydro-2'-deoxyguanosine, an in vivo marker of oxidative stress, and comparison of results from different laboratories

The measurement of 8-oxo-7,8-dihydro-2'-deoxyguanosine is an increasingly popular marker of in vivo oxidative damage to DNA. A random-sequence 21-mer oligonucleotide 5'-TCA GXC GTA CGT GAT CTC AGT-3' in which X was 8-oxo-guanine (8-oxo-G) was purified and accurate determination of the oxidised base was confirmed by a 32P-end labelling strategy. The lyophilised material was analysed for its absolute content of 8-oxo-dG by several major laboratories in Europe and one in Japan. Most laboratories using HPLC-ECD underestimated, while GC-MS-SIM overestimated the level of the lesion. HPLC-ECD measured the target value with greatest accuracy. The results also suggest that none of the procedures can accurately quantitate levels of 1 in 10(6) 8-oxo-(d)G in DNA.