Association of hepatitis C virus NS5B variants with resistance to new antiviral drugs among untreated patients

Mutations located in the 109-amino acid fragment of NS5B are typically associated with resistance to interferon (IFN) and ribavirin (RIB) and to new antiviral drugs. The prevalence of these mutations was examined in 69 drug-naïve individuals with hepatitis C virus (HCV) infections in Rio de Janeiro, Brazil. Mutations related to non-response to IFN/RIB were observed in all subtypes studied (1a, 1b, 2b, 3a and 4). The most common mutation was Q309R, present in all subtypes, except subtype 2b with frequency above 20%. D244N was detected only in subtype 3a and A333E was detected only in subtype 2b. We did not detect the S282T, S326G or T329I mutations in any of the samples analysed. Of note, the C316N mutation, previously related to a new non-nucleoside compound (HCV796 and AG-021541), was observed in only eight of 33 (24%) samples from subtype 1b. Site 316 was under positive selection in this HCV variant. Our data highlight the presence of previously described resistance mutations in HCV genotypes from drug-naïve patients.

Genetic diversity and antimicrobial resistance in Streptococcus agalactiae strains recovered from female carriers in the Bucharest area

For the first time, we used multilocus sequence typing (MLST) to understand how Romanian group B streptococcus (GBS) strains fit into the global GBS population structure. Colonising isolates recovered from adult human females were tested for antibiotic resistance, were molecularly serotyped based on the capsular polysaccharide synthesis (cps) gene cluster and further characterised using a set of molecular markers (surface protein genes, pilus-encoded islands and mobile genetic elements inserted in the scpB-lmb intergenic region). Pulsed-field gel electrophoresis was used to complement the MLST clonal distribution pattern of selected strains. Among the 55 strains assigned to six cps types (Ia, Ib, II-V), 18 sequence types (STs) were identified by MLST. Five STs represented new entries to the MLST database. The prevalent STs were ST-1, ST-17, ST-19 and ST-28. Twenty molecular marker profiles were identified. The most common profiles (rib+GBSi1+PI-1, rib+GBSi1+PI-1, PI-2b and alp2/3+PI-1, PI-2a) were associated with the cps III/ST-17 and cps V/ST-1 strains. A cluster of fluoroquinolone-resistant strains was detected among the cps V/ST-19 members; these strains shared alp1 and IS1548 and carried PI-1, PI-2a or both. Our results support the usefulness of implementing an integrated genotyping system at the reference laboratory level to obtain the reliable data required to make comparisons between countries.

Estudio de parámetros gasométricos en sangre pre y post oclusión en el ictus agudo isquemico

Durante los procedimientos endovasculares en el ictus isquémico la información per-procedimiento del daño cerebral ayudaría a tomar decisiones sobre intentar la recanalización arterial. Métodos Se estudiaron parámetros gasométricos de sangre extraída durante los procedimientos endovasculares de recanalización. Se obtuvieron muestras proximal y distal a la oclusión. Un estudio gasométrico se realizo inmediatamente. Resultados El estudio mostró diferencias significativas entre las muestras pre-oclusión y postoclusión en la presión parcial de oxígeno (PaO2Pre78,9±16.3mmHgVs73.4±14.9 mmHg,p&0,001). Una curva ROC determinó que una Post-PaO2&70 mmHg predice mejoría clínica. Los pacientes con post-PaO2&70mmHg tuvieron mejor autonomía (medianaMRS:3Vs.6, p=0,024). En el análisis multivariante el único predictor independiente de mejoría clínica fue la Post-PaO2&70(OR:5,21IC95%:1.38-67.24,p=0,013). Conclusión Es posible la obtención de muestras de sangre del tejido lesionado distal a la oclusión. La información puede ser utilizada para predecir evolución clínica y en las decisiones durante el procedimiento.

The cervico-thoracic outlet compression syndrome. Analysis of surgical treatment.

Surgical treatment of the thoracic outlet compression syndrome is being presently reconsidered. Until these last few years, there was the choice between two interventions only: scalenotomy, a simple operation entailing no complication, but with a 60% recurrence rate--or the resection of the first rib through an axillary approach, an efficacious intervention which caused, however, serious nervous complications in 14% of treated cases. The follow-up of 75 cases operated for a TOCS reveals to the authors that--all techniques taken into account--results are unsatisfactory in 33% of cases. These failures are due either to technical deficiencies, or to a complication arising in the course of the operation, or to an erroneous diagnosis. The authors resort to surgery only to treat serious vascular syndromes (absolute indication) or invalidating neurological compression syndromes, after failure of physical therapy (relative indication). They propose a cervical approach--the only one enabling a safe dissection of the brachial plexus--a partial scalenectomy, resection of all fibrous bands pressing on nervous trunks, or the resection of a cervical rib. Should the costo-clavicular space appear anatomically too narrow, the first rib, already partially freed by the cervical approach, will be resected through the axillary route.

InnovaCampus 2.0 redisseny d'una aplicació web d'ajut a l'autoavaluació formativa

InnovaCampus 2.0 és el redisseny de l'aplicació de programari lliure InnovaCampus utilitzant els frameworks Spring i JPA. InnovaCampus és una aplicació que permet l'autoavaluació d'estudiants universitaris a travé d'Internet. Posteriorment, un professor pot analitzar-ne els resultats i obtenir conclusions sobre el nivell general o d'un estudiant concret. El projecte consisteix en dissenyar i implementar novament totes les funcionalitats existents fins ara i usant una arquitectura que afovoreixi les ampliacions futures. El disseny d'InnovaCampus 2.0 s'ha fet usant tecnologies més actuals (Spring, JPA) i s'hi han afegit algunes funcionalitats.

Disseny, desenvolupament i integració d'una nova capa presentació mitjançant Google Web Toolkit per a l'aplicació d'innovació docent InnovaCampus

InnovaCampus és una aplicació d'innovació docent que proporciona a la comunitat educativa una eina online d'autoavaluació per a estudiants universitaris. Aquesta eina permet als estudiants avaluar els seus coneixements i als professors analitzar-ne els resultats per tal d'extreure'n les corresponents conclusions. L'eina ha evolucionat any a any, i recentment s'ha dut a terme un redisseny de l'aplicació per tal d'aconseguir una aplicació modular utilitzant una arquitectura de tres capes que afavoreixi a futures ampliacions. Les capes de persistència i de negoci han estat desenvolupades en una primera fase del redisseny i la capa de presentació és la que dóna lloc al present projecte. Així doncs, el projecte consisteix en dissenyar, desenvolupar i integrar una nova capa de presentació de l'aplicació, amb la finalitat de proporcionar una interfície interactiva, àgil i eficient per tal d'obtenir un entorn amigable amb propietats visuals avançades. Tot plegat es pretén aconseguir integrant el framework Google Web Toolkit a l'estructura ja creada mitjançant el framework Spring i JPA.

Disseny i implementació del mòdul de generació de tests d'una aplicació web d'autoavaluació desenvolupada en comunitat

Crear un mòdul per al projecte d'autoavaluació InnovaCampus que ens permeti generar test utilitzant preguntes amb recursos, com podrien ser imatges, àudio, vídeo o documents, i poder generar preguntes que depenguin d'altres anteriors o que estiguin vinculades.

Disseny i implementació d'una biblioteca de Grafs

Ampliació d'una jerarquia de contenidors amb grafs i grafs dirigits implementats de maneres diferents.

Disseny i implementació d'aplicatius de simulació de processos físics

Implantar i configurar un gestor de continguts GPL per tal d'ajudar a la docència virtual d'assignatures de física. D'altra banda, crear diferents aplicacions utilitzant el llenguatge Java3D per tal de fer simulacions de processos físics, els quals es podran integrar a la pàgina web creada amb el gestor de continguts per a què els alumnes de física puguin fer-ne ús.

Disseny i implementació d'un mòdul d'estadístiques per a una aplicació d'autoavaluació desenvolupada en comunitat

El mòdul d'estadístiques d'InnovaCampus és un projecte de lliure distribució per ser utilitzat conjuntament amb els altres mòduls de l'aplicació. InnovaCampus és una aplicació que permet l'autoavaluació d'estudiants universitaris a través d'Internet. Posteriorment, un professor pot analitzar-ne els resultats i obtenir conclusions sobre el nivell general o d'un estudiant concret. El projecte se centra en implementar la funcionalitat de la segona part del procés tot facilitant la lectura dels resultats. Per fer-ho, obté dades d'una bases de dades i les opera per a generar valors estadístics i gràfiques dinàmiques.

Value of PET/CT versus contrast-enhanced CT in identifying chest wall invasion (T3) by NSCLC [B-671]

Purpose: To determine the diagnostic value of 18F-FDG PET/CT versus contrastenhanced CT in identifying chest wall invasion by NSCLC. Methods and Materials: The primary selection criterion was a peripheral tumor of any size with contact to the chest wall. A total of 25 patients with pathologically proven NSCLC satisfied these criteria. Chest wall invasion was interpreted upon PET/CT when a frank costal or intercostal 18F-FDG uptake was identified with or without concomitant morphologic alterations. On the other hand, the existence of periosteal rib reaction/erosion, chest wall thickening or obliteration of the pleural fat layer either separately or combined were considered essential diagnostic criteria for disease extension into the chest wall upon contrast-enhanced CT. The results were correlated with the final histological analysis. Results: Among the studied cohort, 13/25 (52%) patients had chest wall invasion consistent with T3 disease. Both PET/CT and contrast-enhanced CT successfully identified 12/13 (92%) of these patients. The single false-negative result was due to parietal pleural invasion. On the other hand, one false-positive result was encountered by PET/CT in a dyspneic patient; whereas, CT analysis revealed false-positive results in six patients. In these patients, periosteal rib reaction (n = 2) or asymmetric enlargement of adjacent chest wall muscles (n = 1) were identified along with an obliterated pleural fat layer (n = 6). The sensitivity, specificity, and accuracy of PET/CT and contrast-enhanced CT were 92, 91 and 92% versus 92, 50 and 72%. Conclusion: 18F-FDG PET/CT is an accurate diagnostic modality in identifying.

Disseny i implementació d'un editor col·laboratiu de LaTeX vía web

Aquesta aplicació permet la creació i edició de documents LaTeX mitjançant la web, per part d'un equip de persones que poden treballar sobre el document concurrentment, sempre i quan treballin sobre seccions diferents, ja que el sistema que controla e impossibilita l'opció d'incoherències es basa en bloquejos de les seccions sobre les quals es treballa. Pel desenvolupament d'aquesta aplicació web s'han ajuntat vàries tecnologies en pràctica en l'actualitat; com són, per exemple, JSP, Struts, AJAX- que al seu torn no és una tecnologia, sinó un aglomerat de vàries d'elles-, Javascript i servlets Java.

Disseny i implementació d'eines didàctiques per facilitar l'aprenentatge de principis de la física

Estudi de dues possibilitats de disseny i implementació d'eines didàctiques amb les biblioteques Physlets i Java3D, per a ser utilitzades en una pàgina web d'electromagnetisme. Com a resultat d'aquest estudi s'han desenvolupat dues aplicacions basades en el principi físic d'inducció magnètica i les seves aplicacions. L'estudi de les biblioteques Physlets i Java3D serveix per comprovar les seves virtuts i limitacions, i a la vegada sospesar la capacitat matemàtica de la primera amb les possibilitats gràfiques i disseny en 3D de la segona.

InnovaCampus: una aplicació web d'ajut a l'avaluació en una titulació universitària

El projecte tracta sobre el desenvolupament d’una aplicació Web en el marc de la innovació docent. En concret, és una aplicació Web per donar suport al procés d’avaluació d’estudiants universitaris. Es proposa una eina accessible a través de la xarxa que permet als estudiants autoavaluar els seus coneixements dels diferents temes d’una assignatura i als professors conèixer el grau de progrés dels seus alumnes mitjançant les estadístiques que li proporciona l’aplicació.