洞庭湖浮游生物群落DNA指纹拓扑结构与物种组成对应关系

对东洞庭湖7个采样站点的浮游生物群落进行了DNA多态性的RAPD指纹分析和物种组成的分类鉴定,并通过聚类分析探讨了DNA指纹拓扑结构与物种组成对应关系。结果如下:(1)筛选出的11条随机引物共获得148条长度在180~2000bp的谱带,多态率为98.6%,各引物扩增谱带数在11~16不等;各站点平均有57.6条谱带,其中站最多(70条),站最少(45条),而站的特有带最多(7条),站最少(2条);(2)共观察到54种/类浮游生物,其中站出现的最多(27),其它各站点在7~13不等,分布概率在85%以上的

青海湖裸鲤繁殖群体遗传多样性的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法对青海湖裸鲤的3个洄游繁殖群体-黑马河(HM)、布哈河(BH)及沙柳河(SL)群体各30个个体的DNA多态性进行了分析。用13个引物在三个群体中共检测出85个位点,其中多态性位点68个。青海湖裸鲤群体总的DNA多态位点百分率为80.0%。数据分析结果显示:青海湖裸鲤3个群体总的Nei基因多样性为0.3395,Shannon遗传多样性信息指数为0.4861,存在着较为丰富的遗传多样性。青海湖裸鲤3个群体间平均遗传距离为0.0788,基因分化系数Gst为0.1070,表

以RAPD方法分析岩原鲤分类地位

采用opaopoopq等系列44个随机引物对鲤亚科与亚科的几个种类进行随机扩增多态DNA(RAPD)扩增,通过对电泳结果进行系统分析,得出各种间遗传距离分支图.按节点的遗传距离最大数值0.232可以分出亲缘关系最远的两个群体,即由两种普通鲤为一群体,以及由岩原鲤、倒刺和白甲鱼组成的另一群体.从节点间遗传距离数值叠加计算可以得出岩原鲤与其他各种鱼类亲缘关系,遗传距离由近到远分别是:岩原鲤与倒刺(0.344)<岩原鲤与白甲鱼(0.388)<岩原鲤与普通鲤(0.443),岩原鲤与倒刺的遗传距离最小,这一

利用RAPD技术分析绵羊品种间遗传关系

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术研究分析了三种绵羊杂交品种及一种纯种绵羊的基因组DNA多态性。用 10个随机引物对各品种实验羊的基因组DNA进行扩增 ,平均每个品种观察到约 94个标记。扩增结果以RAPDistanceProgram软件分析表明 :中国美利奴羊A品系与中国美利奴羊B品系的随机扩增多态DNA共享度最高 ,它们构成的姊妹群依次与哈萨克羊、中国美利奴羊多胎品系成为对应的姊妹品种。

用RAPD技术对特化等级裂腹鱼类亲缘关系的探讨

为确定特化等级裂腹鱼类的遗传分化关系 ,对 7种 2 2个裂腹鱼个体进行随机扩增多态DNA(RAPD)研究。从所使用的 40个随机引物中 ,选择了 37个扩增带谱清晰的引物进行分析。根据构建的分子系统树显示 ,特化等级裂腹鱼类划分为 3个属级分类单元较为合适 ,这与采用形态学特征进行系统分析所得出的结论一致。在 2 2个个体之间遗传距离矩阵中 ,最大的遗传距离指数达到了 90 38% ,此外 ,还有较多的遗传距离指数也在 6 0 %～ 90 %之间。通过分析 ,认为用RAPD标记技术来分析属级或属级以上分

螅状独缩虫(Cachesium polypinum)遗传多样性的RAPD分析

用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对武汉的汉口 (CP_1)、汉阳 (CP_2 )和武昌 (CP_3)三个地区缘毛类的螅状独缩虫 (Cachesiumpolypinum)进行了遗传多样性分析。结果表明 :这种动物存在广泛的变异 ,三个地域群体之间的遗传相似度为 0 .6 52 2～ 0 .7385(平均值为 0 .6 92 1) ,各群体之间遗传相似度大小依次为 :CP_2—CP_3>CP_1—CP_2 >CP_1—CP_3。本文对这些变异与环境的关系和以RAPD技术研究缘毛类等动物遗传多样性的意义作了

7种鲟形目鱼类亲缘关系的随机扩增多态性DNA研究

为阐明鲟形目鱼类的系统发育关系,采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对中华鲟、达氏鲟、史氏鲟、意大利鲟、短吻鲟、长江白鲟和匙吻鲟的基因组进行了研究。13个引物在每个种共产生127个信息座位。按UPGMA聚类法构建这7种鲟形目鱼类的分子系统树。分子系统树首先分成两大支,即长江白鲟和匙吻鲟为一支,其他5种鲟科鱼类为对应的另一支。在5种鲟科鱼类中,我国3种鲟科鱼类中华鲟、达氏鲟和史氏鲟聚在一起,与意大利鲟和短吻鲟分开。我国3种鲟科鱼类又可分成两小支,中华鲟和达氏鲟为一支与史氏鲟相对应。由分子系统树得到的各个

利用RAPD技术对三种绒螯蟹亲缘关系的研究

采用RAPD技术结合一定的形态学研究手段，对中华绒螫蟹、日本绒螫蟹及其合浦亚种进行亲缘关系的研究，为三种绒螫蟹的种及亚种分析提供重要资料。三种绒螫蟹的第四步足前节长宽比值，与其分类标本吻合或基本吻合。用一组引物，对每种各10个个体的基因组DNA进行扩增，得到一批特异、可重复的扩增图谱；扩增区带的相似率分析表明，中华绒螫蟹与日本绒螫蟹的亲缘关系远，而日本绒螫蟹合浦亚种与日本绒螫蟹近。最后，对文中RAPD分析的取样数量及其鉴别标记的可行性等问题作了讨论。

用RAPD技术识别中华绒螯蟹性别差异

中华绒螯蟹（Ｅｒｉｏｃｈｅｉｒｓｉｎｅｎｓｉｓ）又称河蟹，是我国的名贵水产资源。本文用２００个随机引物对河蟹的雌雄群体和个体进行了ＲＡＰＤ（随机扩增的多态性ＤＮＡ）分析，发现１７个引物扩增出了群体水平的性别差异，其中的一个引物扩增出了个体水平的性别差...

同源四倍体与二倍体水稻的遗传差异及产量、品质性状研究

本文以中国科学院成都生物研究所培育的同源四倍体水稻和二倍体水稻为材料，进行遗传差异及产量、品质性状的研究：1、以二倍体水稻为对照，研究了同源四倍体水稻在2004 年和2005 年的结实情况。结果同源四倍体的花粉育性、结实率均不同程度下降，尤其低代材料更是大幅度下降。F 检验表明，同源四倍体不同个体间的各产量性状均差异显著，说明其具有很大的遗传改良潜力。从1996 年到2005 年对部分同源四倍体水稻进行了连续选择改良，T 检验表明经过9 年的选择改良，其结实率显著提高。本文还对同源四倍体水稻各产量性状间的相关性进行了分析,结果结实率与花粉育性、穗着粒数、穗实粒数极显著相关；理论产量与花粉育性、有效穗数、穗着粒数、穗实粒数、结实率及千粒重极显著相关。i2、用(CT)n 微卫星标记和PCR-Acc Ι分子标记对40 份同源四倍体和14 份二倍体水稻Wx 基因进行研究。结果，(CT)n 微卫星标记检测，Wx 基因呈Wx1、Wx2 和Wx3 3 种多态性；PCR-Acc Ι 检测，Wx 基因表现为G-型和T-型。测定稻米直链淀粉含量(AC)、胶稠度(GC)和糊化温度(GT)，并探讨其与Wx 基因的关系，结果，二倍体和同源四倍体水稻均存在：Wx 基因型相同，AC 差异较小，Wx 基因型不同时，AC 差异较大，Wx1 基因型品种AC 最高， Wx2 基因型品种AC 次之，Wx3 基因型品种AC 最低；基因型相同时，同源四倍体AC 低于二倍体；同源四倍体与对应二倍体间，Wx 基因型相同时，AC 差异很小；而Wx 基因型发生变异时，AC 差异很大。同时，进行相关性分析，结果二倍体和四倍体水稻均存在AC、GC 与Wx 基因密切相关；而GT 与Wx 基因相关不显著。综合分析，(CT)n微卫星标记与PCR-Acc Ι 分子标记检测的相关系数为0.842，呈极显著正相关，可以将其结合起来进行同源四倍体新品种的选育和改良。3、利用RAPD 技术，对同源四倍体和二倍体水稻的遗传差异进行分析。17条引物在同源四倍体中扩增出178 条带（PPB＝81.5%），在二倍体中扩增出173条带（PPB＝76.3%）；同源四倍体和二倍体的Shannon 遗传多样性指数分别为0.4848 和0.4679，多态信息量分别为0.3301 和0.3216，遗传距离分别为0.3572和0.3460；同源四倍体与其对应二倍体间遗传距离为0.1914-0.4633，平均为0.2914。表明同源四倍体的遗传多样性高于二倍体，且同源四倍体与其二倍体之间存在较大的遗传差异，这些将为水稻品种改良和新品种选育提供科学依据。上述产量、品质性状及遗传差异分析的结果，不仅有利于加快同源四倍体水稻的遗传改良进程，而且为进一步研究、利用同源四倍体水稻奠定了初步基础。 AbstractStudy on genetic diversity, yield characters and quality traitsof autotetraploid and diploid riceLiu Yuhua (Botany)Directed by Associate Prof. Tu ShengbinIn this study, diploid and autotetraploid rice, which were cultivated in ChengduInstitute of Biology were analyzed in genetic diversity, yield characters and qualitytraits.In the study, 2 diploid and 29 autotetraploid rice(2n=4x=48) materials, including4 preliminary and 25 advanced generation, were investigated for yield characters.Compared with diploid check, the pollen fertility and seed set of autotetraploiddeclined dramatically, especially in preliminary generation. F-test indicated that therewere remarkable differences among different varieties, showing that autotetraploidmaterials had strong potential for improvement. From 1996 to 2005, someautotetraploid rice had been selected and improved. T-test showed that seed setincreased obviously. The relationships among yield characters of autotetraploid ricewere analyzed. Seed set was strongly correlated with pollen fertility, total grainnumber per panicle and productive grain number per panicle; theoretical yield wasstrongly correlated with pollen fertility, productive panicle number per plant, totalgrain number per panicle, productive grain number, seed set and 1000-grain weight.Wx genotypes of 40 autotetraploid rice and 14 diploid rice were tested by usingthe (CT)n microsatellite marker and a cleaved amplified polymorphic sequence(CAPS) molecular marker named PCR-Acc Ι. Three microsatellite alleles wereproduced, i.e. Wx1, Wx2 and Wx3 both in autotetraploid and in diploid rice.Comparatively, PCR- Acc Ι molecular marker produced two genotypes, G-type andT-type for both autotetraploid and diploid rice. In this study, amylose content (AC), gel of consistency (GC) and gelatinization temperature (GT) of rice grain weremeasured and their relationships with Wx alleles were analyzed. The results showedthat variation of AC between autotetraploid and diploid rice was small when they hadthe same Wx genotype. However, variation of AC turned to be large when the Wxgenotypes were different. Actually, AC met the maximum value in Wx1 varieties andWx2 varieties the middle and Wx3 varieties the minimum. And AC was lower inautotetraploid than in diploid. Correlation analysis was done in this experiment. ACand GC of rice grain were probably controlled by Wx gene or other gene whoselocation was strictly linked to Wx gene, while GT of rice was not. The correlationcoefficient between Wx genotypes which revealed by (CT)n microsatellite marker andPCR-Acc Ι molecular marker was 0.842 with significant level. That revealed aconsistent result between the two types of markers. So it was possible to utilize boththe two types of markers to select and promote germplasm of autotetraploid rice.RAPD molecular markers were used to analyze the genetic diversity betweendiploid and autotetraploid rice. 178 repeatable bands were detected through 17 RAPDprimers with percentage of polymorphic bands was 81.5% in autotetraploid rice while173 repeatable bands were detected with percentage of polymorphic bands was 76.3%in diploid rice. According to the measurement of Shannon index, polymorphicinformation content and genetic distance, genetic diversity of autotetraploid was on ahigher level, genetic variation between autotetraploid and diploid rice was relativelyhigh. All these contributed to the genetic selection and improvement in rice breeding.As mentioned above, the results are not only helpful to promote the process ofrice improvement, but also to confirm the basic for further study of autotetraploid rice.

~(12)C~(6+)重离子辐照大葱的细胞学和RAPD分析

用309、0和180Gy12C6+重离子辐照处理大葱干种子,研究其对大葱根尖的细胞学效应,并采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术初步分析了其变异类型。不同剂量12C6+的重离子照射能有效诱导大葱根尖细胞微核和染色体畸变。随着辐照剂量的增加,幼苗根尖细胞微核形成几率明显增大,微核率、多微核率和染色体总畸变率呈线性上升。但除去微核以外的染色体畸变率则呈U型变化。RAPD结果表明,大葱不同处理之间的DNA存在明显差异,所用35种引物中有28种出现了特异性条带,既有新增条带,又有缺失条带,还有迁移率的差异。30、90和180Gy剂量辐照引起的RAPD变异率分别为29.91%、41.05%和22.14%。结果发现高微核率和染色体变异过大会导致高致死效应,使得染色体总畸变率高的处理组在当代生长苗的DNA变异率变小。

DNA分析技术及其在植物研究中的应用

从DNA/DNA杂交、RFLP分析、DNA的限制酶图谱和核苷酸序列分析、PCR技术、DNA指纹技术、RAPD分析等六个方面详细描述DNA分析技术在植物学研究中的应用 ,并讨论了DNA分析技术与植物系统学的关系。

DNA分子标记技术在环境污染物检测中的应用

DNA分子标记是DNA分子碱基序列变异的直接反映,利用分子标记物对污染物造成的生物体DNA损伤的检测和定量分析研究是可行的方法。文章主要综述了DNA加合物技术、随机扩增DNA多态性技术(RAPD)、扩增片段长度多态性技术(AFLP)、单细胞凝胶电泳技术(SCGE)及反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)的原理及其在环境污染物检测中的应用。该方法具有快速、简便、特异性强的特点,在环境污染物早期诊断和评价方面具有重要意义,已广泛应用于遗传毒理学研究。

DNA指纹技术在污染土壤生态毒理诊断中的应用

生物标记物能在细胞或分子水平上指示暴露-效应关系,是进行污染土壤生态毒理诊断的主要技术手段之一。随着分子生物学技术的飞速发展,出现了一系列以聚合酶链式反应为基础的、在分子水平上检测污染物质导致的生物体DNA损伤的DNA指纹技术。DNA指纹技术的主要类型有:随机扩增多态性DNA(RAPD)、聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)、扩增片段长度多态性(AFLP)、任意引物聚合酶链式反应(AP-PCR)、差异显示反转录聚合酶链式反应(DDRT)、短DNA重复序列(SSR)及限制片段长度多态性(RFLP)等。这些技术与检测基因突变、染色体畸变和损伤为主的一系列经典研究方法如彗星分析、微核实验等相比具有简便、快速、灵敏等优点。本文着重介绍了随机扩增多态性DNA、聚合酶链式反应-单链构象多态性、扩增片段长度多态性3种重要的DNA指纹技术在污染土壤诊断中的应用。

DNA指纹图谱技术在土壤微生物多样性研究中的应用

土壤中的微生物多样性是十分丰富的,传统培养方法对土壤微生物多样性的研究有很大局限性。近年来,各种基于16S rDNA基因的指纹图谱分析技术取得了长足的进步,并广泛应用于土壤微生物多样性的研究。这些技术主要有变性梯度凝胶电泳(DGGE)/温度梯度凝胶电泳(TGGE)、单链构象多态性(SSCP)、随机引物扩增多态性DNA(RAPD)、限制性片段长度多态性(RFLP)和扩增核糖体DNA限制性分析(ARDRA)等。对这些技术近年来在土壤微生物多样性研究领域的应用予以简短综述,并初步探讨未来几年土壤微生物分子生态学发展的方向。