Comparative analysis of differentially expressed sequence tags of sweet orange and mandarin infected with Xylella fastidiosa

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Identification and analysis of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in citrus

Most of the cultivated species of citrus have narrow genetic basis. Relationships among species and cultivars are obscured by sexual compatibility, polyembryony, apomixis and a high incidence of somatic mutations. DNA analysis is crucial in genetic studies not only for citrus breeding programs but also for characterization of hybrids and species. In this paper, single nucleotide polymorphisms ( SNPs) were investigated in 58 accessions of Citrus, hybrids and related genera. Genomic sequences of 'Pera IAC' sweet orange ( Citrus sinensis L. Osbeck) were used for primer design and selection of sequence tagged sites (STSs) for identification of SNPs. Analysis of 36 STSs showed identical sequences among 40 of the 41 sweet orange accessions studied. However, these accessions were heterozygous for many SNPs. Ten selected STSs were analyzed in 17 additional accessions from 13 species and hybrids. Comparing to the 'Pera IAC' sweet orange accession, a total of 150 polymorphic nucleotides were identified and most of the alterations were transitions ( 52.7%). The greatest number of SNPs was observed in Poncirus trifoliata ( L.) Raf. and the smallest in 'Ponkan' mandarin ( Citrus reticulata Blanco). At the intra-specific level, 'Bafa Gigante' ( Citrus sinensis L. Osbeck) was the only sweet orange accession with a divergent SNPs genotype, which corroborates the hypothesis of a hybrid origin for this accession. Although the STSs analyzed represent randomly sampled genomic sequences, they provided consistent information about the level of polymorphism and showed the potential of SNPs markers for characterization and phylogenetic studies.

Susceptibility of tangerines to citrus variegated chlorosis

Citrus variegated chlorosis (CVC), a citrus disease first discovered in Brazil in 1987, is caused by the bacterium Xylella fastidiosa and transmitted by sharpshooters and budwood. Since the disease affects almost all sweet orange cultivars, it has become one of the most serious problems for Brazilian citriculture. To evaluate their resistance to CVC disease, fifteen tangerines or mandarins (C. reticulata Blanco) and their hybrids were grafted on Rangpur lime (C. limonia Osb.) and inoculated with CVC-contaminated Pera sweet orange (C. sinensis (L.) Osb.) by twig grafting in a greenhouse. Tangerines and their hybrids Wilking, Fortune, Sunki, Ellendale, Orlando tangelo, Nunes clementine, Nova, Sun Shu Sha Kat, Suenkat, and Batangas showed CVC leaf symptoms and gave positive results on enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and polymerase chain reaction (PCR) (with specific primers for X. fastidiosa), indicating that they are susceptible to CVC. Although X. fastidiosa bacteria were detected by ELISA and PCR in inoculated plants of tangerines Cravo and Oneco, no CVC leaf symptoms were observed on these two cultivars, suggesting that they are tolerant to the disease. CVC leaf symptoms were not observed and X. fastidiosa was not detected in tangerine Dancy and mandarins Okitsu satsuma and Ponkan after inoculation, showing that they are resistant to the disease.

Abundance of zooplankton from different zones (pelagic and littoral) and time periods (morning and night) in two Amazonian meandering lakes

The abundance of zooplankton in two lakes of Southwest Amazonia was studied for 10 months in different regions and at different periods of the day. The lakes were Lago Amapá, located at 10°02′36″S, 67°50′24″W, and Lago Pirapora, at 9°27′21″S, 67°31′39″. Both lakes are characterized as oxbow lakes. The aim of this study was to compare the pelagic and littoral regions, as well as to determine differences in the distribution of zooplankton in the water column in the morning and at night. Collections were made by filtering water through a 55μm zooplankton net into a 5L Van Dorn bottle, collecting 4L from the top and 5L from the middle and bottom layers, totaling 14L of water for each sampling location. In addition, physical and chemical parameters were measured, including transparency, temperature, pH, dissolved oxygen, electrical conductivity and turbidity. Anova (analysis of variance) and Tukey's test were used. There was no statistically significant difference between the regions studied, nor between the two time periods examined. The results of the Pearson correlation (p<0.05) demonstrated that the physical and chemical characteristics of the water correlated with the cladocerans Moina spp. (represented by M. minuta and M. reticulata) and Ceriodaphnia cornuta, and that Daphnia gessneri was associated with Chaoboridae.

Bioatividade de plantas medicinais no controle de Sclerotinia isolado de Stevia rebaudiana (Bert.) Bertoni

The microorganism Sclerotinia was isolated from roots of Stevia rebaudiana (Bert.) Bertoni in plantations in the northwest of Parana and submitted to the cultivation in the presence of extracts and vegetable balsams of Tarragon (Artemisia draconculus), Thyme (Thymus vulgaris), Manjerona (Origanum majorona), Mint citrata (Mintpiperita var. citrata), Purple Basil (Ocimum basilicum L.), Andiroba (Carapa guanensis) and Copaíba (Copaifera reticulata Ducke). The first five oils were extracted by steam drags, after the drying of the vegetable in greenhouse with circulation of air at 45°C. The last two were used in natura. A suspension (100ìl) of fungus previously cultivated, was added to each plate. The results show that after 7 days of incubation the thyme oils 10ìl, purple basil 25ìl, manjerona 25ìl, mint citrata 50ìl, tarragon 50ìl were capable to inhibit the growth of Sclerotinia, while the andiroba oil only reached this result with 200ìl. The copaiba balsam, even in the concentration of 500ìl, was unable to inhibit the growth of the microorganism.

Annona sp: Plants with multiple applications as alternative medicine - a review

Annona species have been used as a natural remedy for a variety of illnesses with antiparasitic, antispasmodic, antidiarrheal, antiulcer, sedative, analgesic, hypotensive, and vermifugal effects. These properties are due to the presence of a number of bioactive compounds on the leaves, fruit, seeds, and stem. The aim of this review is to show the main species of Annona, their medicinal properties and the chemical constituents that may be related to these effects. In the leaves it is possible to find acetogenins, annopentocins A, B, and C, cis- and trans-annomuricin-D-ones, goniothalamicin, arianacin, and javoricin, related to anticancer properties. Quercetin-3-O-glucoside, also found in the leaves mediates antidiabetic and antioxidative effects. In the fruit are found annonaine, nornuciferine and asimilobine, associated to antidepressive effects. In the seeds are found muricatetrocin A and muricatetrocin B, longifolicin, corossolin, corossolone, uvarigrandin A, bullatacin, squamotatin. These acetogenins are associated with anticancer effects. Cyclosquamosin B, quercetin, and cyclosquamosin from the seeds have respectively vasorelaxant, antithyroidal and, antiinflammatory activity. In the stem parts there are several components as N-trans-feruloyltyramine, N-p-coumaroyltyramine, and N-trans-caffeoyltyramine, lignans, syringaresinol, syringaldehyde, beta-sitosterol and beta-sitosterol-beta-D-glucoside which exhibit antiplatelet aggregation activity. Copaene, patchoulane, 1H-cycloprop (e) azulene and kaur-16-en-19-oic acid found in the barks exhibit significant central as well as peripheral analgesic and antiinflammatory activities. The properties of the biological compounds in Annona species support information that may provide validation for its medicinal uses, but further studies should be performed to establish ideal and safe doses of consumption to ensure the effectiveness of the benefits. © 2012 Bentham Science Publishers.

Estudo da atividade ansiolítica e sedativa do óleo essencial das cascas de frutos de espécies do gênero Citrus

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Reação de genótipos de tangerinas a Alternaria alternata e Elsinoe fawcettii: resistência, suscetibilidade e acúmulo de metabólitos

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Identificação e clonagem de r- genes candidatos potencialmente envolvidos na resistência ao cancro cítrico (Xanthomonas citri subsp. citri)

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Desenvolvimento inicial e nutrição de espécies arbóreas nativas sob ferlilização, em plantios de recuperação de áreas de cerrado degradado

Pós-graduação em Agronomia (Energia na Agricultura) - FCA

Doses de composto orgânico na fertilidade do solo, desenvolvimento, produção e qualidade dos frutos de tangerineira poncã

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Sobreposição de nicho de duas espécies simpátricas de Arthrosaura (Squamata: Gymnophthalmidae), na Floresta Nacional de Caxiuanã, Pará

Em geral, espécies próximas filogeneticamente usam recursos similares e podem ser potenciais competidores. No entanto, elas podem divergir em um dos três eixos que norteiam o seu nicho, temporal, espacial e trófico. Essas diferenças podem ser determinantes para a coexistência de populações. Pressupondo que as populações de Arthrosaura interagem, e pode ocorrer sobreposição de nicho, quais estratégias elas adotaram para minimizar a competição permitindo a convivência de ambas? O presente estudo tem como objetivo investigar o nicho espacial, temporal e trófico de Arthrosaura kockii e A. reticulata na Amazônia oriental (01°42'30"S, 51°31'45" W), localizada nos municípios de Melgaço e Portel, Pará, Brasil, onde foram realizadas três expedições. Os animais foram coletados através do método de Procura Ativa, iniciando as 06h e finalizando às 18h. Foram analisados 107 A. kockii e 115 A. reticulata, desses, 107 e 113 respectivamente, apresentaram itens alimentares. Foram contabilizados 26 itens, destes 25 itens foram consumidos por A. reticulata e 14 foram consumidos por A. kockii. A espécie A. reticulata apresentou uma maior amplitude trófica nos meses chuvosos e na maior parte do período seco, enquanto que A. kockii apresentou uma maior amplitude no início do período seco. Os itens mais importantes (IA%), para A. reticulata foram Araneae=0,64, Blattaria=0,17, Orthoptera-Gryllidae=0,09 e Homoptera=0,05, já para A. kockii foram Araneae=0,66, Blattaria=0,19, Orthoptera-Gryllidae=0,04 e Isoptera=0,04. Arthrosaura reticulata apresentou um maior período de atividade, iniciando as 07h: 50min e terminando às 17h: 00min, concentrando o seu pico de atividade no intervalo das 09h às 14h: 30min, esta espécie foi considerada não heliotémica. A. kockii, teve um menor período de atividade, iniciado as 08h:40min e finalizando as 15:h25min, seu pico de atividade ficou concentrado no intervalo das 10h as 14h:30min, esta espécie foi considerada heliotémica. A altura de serapilheira e a distância do corpo d’água foram significativas na distribuição das espécies, A. reticulata foi encontrado em serapilheira com alturas que variaram de 2,5 cm até 13 cm, já A. kockii ocorreu em intervalos de 1,5 cm até 10 cm,. A. reticulata ocorreu em diversos ambientes da floresta, sendo encontrado dentro de corpos d’água até a terra firme, por isso ocorreu em alturas de serapilheira maiores do que A. kockii que ficou limitado à terra firme. Duas espécies mostraram distinções no nicho espacial, temporal e trófico, que provavelmente está permitindo a coexistência das duas populações.

Uso de óleo essencial de copaíba sobre o desempenho produtivo de frangos de corte

As recentes restrições ao uso de antibióticos melhoradores do desempenho na produção de frangos de cortes têm incentivado a busca por aditivos alternativos. Entre os produtos naturais, o óleo de copaíba tem uma grande representação social e econômica, especialmente na região amazônica, onde é nativo e largamente empregado. Os objetivos deste estudo foram avaliar os efeitos da inclusão do óleo de Copaíba (Copaifera reticulata), sobre o desempenho produtivo de frangos de corte. Foram utilizados 540 pintos com um dia de idade, machos de linhagem comercial Ross, distribuídos em cinco tratamentos e seis repetições com 15 aves em cada unidade experimental. Os tratamentos foram definidos pela inclusão do promotor de crescimento (avilamicina, 10ppm) e do nível do óleo essencial na dieta, sendo caracterizados como: T1: Óleo essencial 0,15% (sem promotor de crescimento); T2: Óleo essencial 0,30% (sem promotor de crescimento); T3: Óleo essencial 0,45% (sem promotor de crescimento); T4: Óleo essencial 0,60% (sem promotor de crescimento) e T5: Controle promotor de crescimento: virginiamicina, 10ppm (sem óleo essencial). Os resultados foram analisados com o auxílio do programa computacional Statistical Analysis System (SAS, 2001) e as diferenças entre as médias foram analisadas pelo teste Dunnet, a um nível de significância de 5%. Os dados de desempenho do 7 e 35 dias de idade mostraram que não houve diferença estatística entre os tratamentos para as variáveis peso corporal, consumo de ração, conversão alimentar e mortalidade. Aos 21 e 40 dias de idade das aves houve diferença significativa para a variável peso corporal. As demais variáveis estudadas (consumo de ração, conversão alimentar e mortalidade) não apresentaram diferenças significativas quando comparada ao tratamento controle (T5). Apenas o tratamento com a inclusão na dieta de 0,15% de óleo de copaíba (T1) foi semelhante estatisticamente com o tratamento controle. Não foi observado efeito significativo dos tratamentos sobre as características de carcaça dos frangos estudados. A utilização de óleo essencial de copaíba a 0,15% na dieta de frangos de corte proporcionou desempenho semelhante à dieta controle para as diferentes variáveis de desempenho e características de carcaça avaliada neste estudo, representando uma alternativa promissora como aditivo promotor de crescimento.

Esporulação in vivo, período de suscetibilidade dos tecidos e reação de tangerinas e híbridos a Alternaria alternata

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

The genetic characterization of myrmelachista roger assemblages (hymenoptera: formicidae: formicinae) in the atlantic forest of southeastern Brazil

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)