Review paper on the production trials of rice-cum fish culture - a transferable concept into Niger State, Nigeria

This paper reviews the production trials of rice-cum-fish culture. Rice and various fish species using rotation and concurrent methods of cultivation are used. The farming system is mostly practiced and researched in to in Southeast Asian countries. It addresses the problems of high external inputs, sustainable aquaculture, poverty and nutrition in the rural population, insect pests, use of insecticides, weeds control and under-utilization of agricultural lands. The production trials yields are summarized and a summary of annual income per hectare from rice and fish have been given. The yield however depends to a large extent on the species stocked, culture period, fertility of the soil and water, degree of supplemental feeding and culturing methods. The production results are discussed. Niger state is blessed with abundant wetlands/rice fields suitable for the practice. However, ecological differences from country to country and region to region, research and development trials are necessary to ensure a successful adoption of the technology to farmers in the State

The integrated approach of water hyacinth control on Lake Kainji: with special regard to the design, construction and installation of a water hyacinth barrier across the River Niger

This document lists the undesirable effects of water hyacinth (Eichhornia crassipes) on fisheries in Lake Kainji (Nigeria) and the integrated Water Hyacinth Control Programme in its ongoing fisheries management and development activities on the lake. Special regard is given to the design, construction and installation of a water hyacinth barrier across the River Niger. (PDF contains 44 pages)

Prevalence of endoparasite in some commercially important freshwater fishes of Bida area, Niger State: a preliminary report

The result of this preliminary report highlighted prevalence of an endoparasite (nematode) in order of prevalence. Four non-scaly commercially important fishes, namely:- Clarias sp Hererobranchus bidorsalis. Bagrus sp and Synodontis sp.; and nine scaly fishes, namely; - Gymnarchus sp, Protopterus annectus. Tilapia sp, Lates niloticus. Heterotis niloticus, Mormyrops sp, Channa Obscurus, Labeo sp and Distochodus rostratus of freshwater fadama of the Bida Area, Niger State. The extent of the spread was evaluated. While the reactions of fishermen, middlemen (fishmongers) and fish-eaters in order to appreciate the impacts of the nematode infested fishes on the populace were recorded. The paper suggested areas for further studies towards evoking desirable management strategies for the study area as follows. Such suggested areas are:- Identification and confirmation of the nematode species; life cycle of the nematode species; influence of season on the prevalence, spread and pathology in the nematode infested fishes, etc

Poverty alleviation among fishermen within the floodplains of Kaduna River: implication for introducing commercial fish farming at village level in Doko local government area of Niger State, Nigeria

A diagnostic survey was conducted among the fishermen in six selected villages in Doko Local Government Area of Niger State. One hundred and fifty fishermen were randomly selected and interviewed to find out whether or not they had interest in commercial fish farming aimed at improving their livelihood. The dwindling fish catches in the natural flood plain ponds and Ex-bow Lakes continue to have a serious negative effect on the socio-economic well being of the village communities in question. A break on natural regular annual flooding of the plains had resulted into very low natural fish recruitment. Data analysis using simple descriptive statistics revealed that land tenure system, educational status, inadequate infrastructural facilities, religious taboos, existing fish species among others were found to be favourable indices for commercial fish farming. However, serious conflicts among the fishermen concerning the ownership status of these natural fish ponds are found to be major obstacles to commercial fish farming despite that the traditional ownership of the ponds were vested in the lands of individuals and village communities. Extensive fish farming and small-scale fish farming in the ponds and Ex-bow Lake with improved management practices are considered to be profitable venture. Despite the fact that fish seeds supply and extension effort are still inadequate, the fish farmers have indicated willingness to adopt commercial fish farming in the Ex-bow Lakes and flood plains in order to restore abundant fish production thereby providing for their food security and also increasing the daily income

Impact assessment of Niger State fisheries legislation on fisheries conservation in Edozhigi local government area (L.G.A.) of Niger State

A preliminary survey was conducted among the fishermen in five selected villages in Edozhigi L.G.A. of Niger State. One hundred and fifty fishermen were randomly selected and interviewed to find out the impact of Niger State fisheries legislation on fisheries conservation resources in the area. The analysis of data collected using descriptive statistics indicated that undersized mesh of gill nets, beach seines and traps are being used unabated. Also, fenced barriers across the entrance of flood plain ponds and Ex-bow lakes from the main stream are in the area. The fisheries rules and regulations implementers are rarely seen or not seen at all in the area. The decreasing nature of fish catches was detected. It is observed that government policy on fish conversation is neglected due to inadequate or lack of funding for meaningful extension and implementation of the fisheries rules and regulations

Recruitment pattern and fish production within the Andoni River system in the Niger Delta of Nigeria

Biweekly samples of fish species obtained from five randomly selected Andoni artisanal fisheries within the Andoni River system, Niger Delta of Nigeria were collected between January and December 1999 and their length frequencies analyzed using FISAT (FAO-ICLARM STOCK ASSESSMENT TOOL). The peak recruitment period for Chrysichthys nigrodigitatus, Ethmalosa fimbriata, Eucinostomus melanopterus, Galeodes decadactylus, Pomadasys jubelini and Sarotherodon melanotheron constituting 54.55% was between June and October while Liza grandisquamis and Lutjanus goreensis, Ilisha Africana. Tilapia guinensis and Pseudotolithus elongate constituting 27.27% had two peak recruitment periods including March-May and May- October. In view of this result it is advisable for fishers to intensify fishing effort between May and October for most commercially important fish species for bountiful harvest

Análise proteômica comparativa dos componentes da superfície celular e do secretoma de Aspergillus fumigatus

Aspergillus fumigatus é o principal agente etiológico da aspergilose invasiva, infecção fúngica oportunista com altas taxas de mortalidade afetando, principalmente, pacientes com neutropenia profunda e prolongada. Durante o processo de invasão e disseminação características desta infecção sistêmica, os conídios do fungo inalados e não eliminados pelas células do sistema imune inato diferenciam-se em hifas que, por sua vez, são angioinvasivas. Pouco se conhece sobre as moléculas da parede celular envolvidas na patogênese do A. fumigatus e/ou secretadas por este patógeno. Neste contexto, este trabalho procura ampliar o entendimento desta doença através do estudo de proteínas diferencialmente expressas na superfície de A. fumigatus durante a morfogênese. Foi utilizada uma abordagem proteômica e foram estudados extratos de superfície de células de A. fumigatus em diferentes estágios durante o processo de filamentação. Estas células foram denominadas, de acordo com o tempo de cultivo e a morfologia, como: TG6h (tubo germinativo), H12h ou H72h (hifas). As proteínas de superfície celular foram extraídas, a partir de células intactas, por tratamento brando com o agente redutor DTT (ditiotreitol). Observou-se que o perfil funcional das proteínas expressas por H12h e H72h foi similar, com exceção de proteínas relacionadas à resposta ao estresse, enquanto o perfil para TG6h apresentou diferenças significativas para vários grupos funcionais de proteínas quando comparado às hifas. Desta forma, foram realizados experimentos de proteômica diferencial entre tubo germinativo (TG6h) e a hifa madura (H72h), pela técnica de DIGE (differential gel electrophoresis). Os resultados revelaram que entre as proteínas diferencialmente expressas, aquelas relacionadas às vias de biossíntese e outras denominadas multifuncionais encontraram-se superexpressas em TG6h. Em relação às proteínas de resposta a estresse, observou-se que algumas HSPs eram mais expressas neste morfotipo, enquanto a MnSOD, relativa à resposta ao estresse oxidativo, era mais abundante na hifa. Com exceção da PhiA, integrante da parede celular, as proteínas identificadas como diferencialmente expressas na superfície do A. fumigatus não possuem sinal para secreção identificável, enquadrando-se nas proteínas atípicas de superfície. Foi verificada a integridade da membrana celular após tratamento com DTT, bem como a marcação por biotina das proteínas extraídas, o que comprovou sua localização superficial na célula fúngica. Hipóteses de que estas proteínas sejam endereçadas à parede celular por via secretória alternativa sustentam estes dados. Estas evidências foram confirmadas pelo fato de não terem sido encontradas as mesmas proteínas da superfície na análise do secretoma do A. fumigatus. Além disso, todas as proteínas caracterizadas no secretoma apresentavam sinal de secreção determinado pelo FunSecKB (www.proteomics.ysu.edu/secretomes/fungi.php). A análise do secretoma foi realizada utilizando-se a cepa selvagem AF293 e a mutante ∆prtT, mutante para um fator de transcrição que atua na regulação da secreção de proteases. Os resultados revelam a ALP1 como expressa na cepa selvagem, assim como outras proteases importantes para virulência e desenvolvimento da célula fúngica, estando suprimidas quando o gene prtT foi deletado.

Mapeamento de proteínas alvo para novos antifúngicos na fração microssomal e citosólica do patógeno humano Aspergillus fumigatus

A incidência de infecções fúngicas invasivas vem aumentando nos últimos anos. Estas infecções, em geral, apresentam altas taxas de mortalidade. A profilaxia com antifúngicos ainda é a estratégia mais comum na contenção da mortalidade e prevenção contra infecções fúngicas invasivas, porém, apresenta baixa eficiência, e relatos de resistência às drogas. Além disso, a terapia antifúngica é limitada a um pequeno grupo de drogas, como os polienos, azóis e equinocandinas. Desta forma, a busca de novos alvos de drogas é fundamental para o desenvolvimento de novos antifúngicos. Estudos in silico indicaram quatro genes como potenciais alvo de drogas em fungos patogênicos. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi verificar a expressão das proteínas codificadas por dois destes possíveis genes alvo, a proteína erg6, na fração microssomal, e trr1, na fração citosólica, em hifas de A. fumigatus. Visando alcançar este objetivo, foram primeiramente padronizadas todas as etapas de fracionamento celular visando isolar estas duas subfrações celulares de A. fumigatus. Posteriormente, foi otimizado o protocolo de extração e reidratação de proteínas microssomais bem como reidratação de proteínas citosólicas. Estes extratos foram submetidos a diferentes protocolos de fracionamento proteico em um sistema de eletroforese OFFGEL (OGE). Os resultados de Western immunoblot mostraram que estas duas proteínas, erg6 e trr1, são de fato expressas na fase filamentosa de A. fumigatus. O extrato proteico da fração microssomal submetido ao OGE em doze subfrações apresentou três subunidades da proteína erg6, reconhecidas pelo anticorpo monoclonal, com massas moleculares e pI distintos: uma subunidade de aproximadamente 79 kDa com pI entre 5,91 e 6,49, e outras duas subunidades de aproximadamente 35 kDa e 32 kDa, ambas com pI entre 6,49 e 7,08. A enzima erg6 foi descrita como um homotetrâmero em outros fungos. Porém, nossos resultados sugerem que, em A. fumigatus, a erg6 possui uma estrutura heterotetramérica. Quanto à proteína trr1, tanto no extrato total quanto nas frações resultantes do fracionamento em OGE, uma banda única de aproximadamente 40 kDa, com pI na faixa de 4,79 e 5,33, foi reconhecida pelo anticorpo policlonal. Desta forma, esta proteína parece ter uma estrutura homodimérica, assim como descrito em outros micro-organismos.

Multidisciplinary research and management: fisheries in the Central Delta of the Niger River (Mali)

This contribution gives an overview of the fisheries in the Central Delta of the Niger River (Mali) and highlights the results of a multidisciplinary research and management program conducted in the area to assess the status of the fisheries and improve their management. The importance of multidisciplinary approaches is emphasized to fully elaborate the problems impacting fisheries and the measures for their resolution. Directions for increased decentralization, participation of fishers and ecosystem preservation for improved management of the Central Delta fisheries are briefly discussed.

Perfil de secreção de citocinas e de ativação de células endoteliais após interação com cepas selvagens e mutantes de Aspergillus fumigatus

Apesar do desenvolvimento de novas drogas antifúngicas e da sua utilização como terapia profilática visando à prevenção de infecções fúngicas invasivas, estas ainda constituem-se num problema emergente, com elevadas taxas de mortalidade. Neste contexto, destaca-se a aspergilose invasiva, uma infecção fúngica oportunista que acomete pacientes com neutropenia profunda e prolongada, principalmente os pacientes com leucemia aguda ou submetidos a transplante de medula óssea. Aspergillus fumigatus, um fungo filamentoso, é o principal agente etiológico da aspergilose invasiva, sendo um patógeno angioinvasivo. As hifas deste fungo são capazes de causar injúria e ativação endotelial, induzindo o endotélio a um fenótipo pró-trombótico, que por sua vez, é mediado pela secreção de citocinas pró-inflamatórias, em especial, o TNF-α. O presente trabalho teve como objetivo estudar a capacidade de cepas mutantes de A. fumigatus em ativar células endoteliais, avaliando o perfil de secreção de citocinas em meio condicionado e a expressão de fator tecidual. Resumidamente, monocamadas confluentes de células endoteliais isoladas da veia umbilical humana foram incubadas com conídios e tubos germinativos de cepas selvagens (Af293 e Ku80) e mutantes (Δugm1, ΔcalA, ΔcrzA, ΔprtT) de A. fumigatus. A taxa de adesão e endocitose destas cepas às monocamadas de HUVEC foi avaliada a partir de um ensaio quantitativo de imunofluorescência diferencial. O perfil cinético de secreção de citocinas foi determinado em meio condicionado das HUVECs, por ensaio de multiplex para IL-6, IL-8 e TNF-α. A ativação endotelial, por sua vez, foi determinada pela expressão de fator tecidual por RT-PCR em tempo real. Os resultados obtidos demonstraram que a mutante para o gene ugm1, responsável por codificar a enzima UDP-galactopiranose mutase, que converte resíduos de galactopiranose a galactofuranose, apresentou um fenótipo hiperaderente às células endoteliais e um estímulo 10 vezes maior à secreção de TNF-α e 2,5 vezes maior a secreção de IL-6, quando comparada a ativação observada para as cepas selvagens. A galactofuranose é um componente importante de glicoconjugados da parede celular de A. fumigatus. Dessa forma, a ausência desse monossacarídeo na célula fúngica leva a um mecanismo compensatório caracterizado por um aumento na expressão de moléculas de galactosaminogalactana na parede celular. De maneira contrária, mutantes para os genes calA e crzA, apresentaram um fenótipo hipoaderente às HUVECs e uma perda na capacidade de induzir a secreção de citocinas e ativar o endotélio. Essas mutantes apresentam deleções que interferem na via de cálcio/calcineurina, responsável por regular a morfogênese e virulência de A. fumigatus, além de apresentarem alterações no conteúdo de beta-1-3 glucana. Já a cepa ΔprtT, mutante para o fator de transcrição prtT que regula a secreção de múltiplas proteases, apresentou um fenótipo de adesão, estímulo e ativação endotelial semelhante ao observado para as cepas selvagens. A comparação entre a capacidade de conídios e tubos germinativos em ativar células endoteliais, corroborou achados anteriores da literatura que reportam que só hifas são capazes de ativar células endoteliais, independentemente da sua viabilidade. Os dados deste estudo permitiram concluir que dentre os componentes de superfície celular de A. fumigatus, os polímeros de galactose, em especial a galactosaminogalactana, parecem ser responsáveis, pelo menos em parte, pelos mecanismos de interação e ativação endotelial.

Estudo proteômico da interação do Aspergillus fumigatus com células endoteliais da veia umbilical humana (HUVECs)

O Aspergillus fumigatus é o principal agente etiológico da aspergilose invasiva, uma infecção fúngica oportunista que acomete, principalmente, pacientes de Unidades Hematológicas, como aqueles com neutropenia profunda e prolongada. Após a filamentação este fungo angioinvasivo é capaz de ativar e causar danos em células endoteliais de veia umbilical humana (HUVEC) que passam a expressar um fenótipo pró-trombótico. A ativação destas células, dependente de contato célulacélula, é mediada por TNF-α e caracterizada pela expressão de moléculas próinflamatórias, como citocinas, quimiocinas e moléculas de adesão. Recentemente, nosso grupo comparou a ativação endotelial de HUVECs desafiadas com cepas selvagens e uma cepa mutante para o gene UGM1. Nestes experimentos a cepa mutante Δugm1, que apresenta um fenótipo de maior produção de galactosaminogalactana (GAG) na parede celular, mostrou um fenótipo hiperadesivo e uma capacidade maior de ativar células endoteliais. Entretanto, os receptores e as vias de sinalização envolvidos nesta ativação permanecem desconhecidos. Assim, o objetivo deste trabalho foi verificar as proteínas envolvidas nestes processos através do estudo das proteínas diferencialmente expressas nas HUVECs após a interação com A. fumigatus, usando a técnica proteômica 2D-DIGE. Brevemente, as HUVECs foram infectadas com tubos germinativos da cepa selvagem (AF293) e da cepa Δugm1 de A. fumigatus. Em seguida, as proteínas foram marcadas com diferentes fluorocromos e separadas por eletroforese bidimensional. A análise quantitativa foi realizada utilizando o software DeCyder. Foram identificadas por MS/MS cinco proteínas diferencialmente expressas, incluindo a galectina-1 e a anexina A2, ambas mais expressas após a interação, sendo a primeira ~25% mais expressa após a interação com a mutante Δugm1. Este trabalho propõe que a galectina-1 poderia ser o receptor endotelial para polímeros de galactose presentes na parede celular do A. fumigatus, e que a Anexina A2 poderia estar envolvida na sinalização intracelular em resposta a este patógeno. No entanto, experimentos complementares, em curso, são necessários para comprovar esta hipótese.

Seasonal variation in the chemical composition of pomfrets. Pt. 1. Black pomfret (Parastromateus niger)

Seasonal variations in proximate composition of the different parts such as head, middle, tail and skin of black pomfret (Parastromateus niger) are reported over three years on monthly basis. The lean and fatty conditions of fish are discussed on the basis of spawning period, food and feeding activity, size group appearance and the gonadal maturity of the pomfret.

Toxigenic molds on fish feeds-1: impact of climatic change

The present communication is a survey report carried out to assess the incidence of toxic mycoflora on seven types of agriculture products/by products incorporated during fish culture as supplementary dietary items. Samples were obtained from various sources at Darbhanga, Madhubani and Samashtipur districts during summer, winter and monsoon months. Out of the total 1774 samples, only 894 appeared to be fresh visually reflecting average incidence of contamination around 46.6%. However, the apparently fresh samples, when subjected to culture, 26.9% of them were found to be contaminated. Thus, degree of fungal spoilage in feed ingredients in parts of north Bihar appears to be significantly high (73.5%). The present study illustrates the facts with special reference to Aspergillus flavus, A. parasiticus (elaborating aflatoxins) A. ochraceous, Penicilium viradicatuin (elaborating ochratoxins) and A. versicolor (elaborating sterigmatocystin). The other strains already known for their toxigenic potentials that appeared on the present substrates included A. niger, A. fumigatus, A. candidus, P. islandicum, Rhizopus spp. and Mucur spp. Studies indicate that the prevalent climatic factors like temperature and relative humidity facilitate a congenial condition almost all through the year and in particular during summer and monsoon months. But water content of the substrates is a vital factor that further accelerates the pace of mycobial spoilage. A thorough sun-drying of the agricultural commodities before prolonged storage to bring water content below the "low risk limit" may significantly reduce the incidence of molds.

Aspergillus flavus infection of preserved eel (Thysoidea macrurus)

A brief description is given of a preserved specimen of eel (Thysoidea macrurus) infested with Aspergillus flavus. It is suggested that proper washing of the eels is required to remove the slime covering and the specimens should be completely submerged in formalin in order to successfully preserve the eels.

La peche dans le fleuve Niger

The fish production of the River Niger can best be estimated from a country by country evaluation of the tonnage exported and that consumed locally. All exported and some locally consumed fish are preserved by smoking or sun drying, a process which entails a loss of weight. Coefficients to correct for this of between 2.6 to 4 have been calculated depending on the type of product. A further loss occurs due to handling and to insect attack, which may account for up to 40% of the production. Taking the above factors into account the productions estimated for the various countries of the Niger River basin are as follows: Guinea (3,600 t), Mali (90,000 t), Upper Volta and Ivory Coast (negligible), Niger (5,200 t), Dahomey (1,200 t), Nigeria (25,000 t), Cameroon (3,000 t). A total production of 128,000 t is, therefore, obtained for the basin as a whole, excluding the Kainji Reservoir. At this level of production, there have been no intimations of overfishing from any part of the basin, and there is unanimity that fishing could be intensified. On the basis of the estimates of existing production and local estimates of potential production it is possible that up to 200,000 t of fish could be produced annually from the basin as a whole.