Comparison of agar gel immunodiffusion test, rapid slide agglutination test, microbiological culture and PCR for the diagnosis of canine brucellosis

The performance of the rapid slide agglutination test, with and without 2-mercaptoethanol (RSAT and 2ME-RSAT) and agar gel immunodiffusion test (AGID) was evaluated for the diagnosis of brucellosis in naturally infected dogs. The microbiological culture, PCR and clinical parameters were used as reference. A total of 167 dogs were clinically examined and tested by blood culture, culture of semen/vaginal swab and PCR in blood and semen/vaginal swab. According to the results observed the 167 dogs were divided into three groups: Brucella canis infected dogs (Group 1). B. canis non-infected dogs (Group 2) and dogs with suspected brucellosis (Group 3). The dogs were then tested by RSAT, 2ME-RSAT and AGID. Groups 1 and 2 were used to calculate the diagnostic sensitivity and specificity of the serological tests and the results observed in Group 3 were also discussed. The diagnostic sensitivity of RSAT, 2ME-RSAT and AGID was respectively 70.58%, 31.76%, and 52.94%. The diagnostic specificity of RSAT, 2ME-RSAT and AGID was respectively 83.34%, 100%, and 100%. In dogs with suspected brucellosis 15% were RSAT positive, none was 2ME-RSAT positive and 5% were AGID positive. Although the serological tests are the most commonly used methods for brucellosis diagnosis, a significant proportion of false-negative results were observed highlighting the importance of the direct methods of diagnosis, like blood culture and PCR to improve the diagnosis of canine brucellosis. (c) 2008 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Comparison of Neck Skin Excision and Whole Carcass Rinse Sampling Methods for Microbiological Evaluation of Broiler Carcasses before and after Immersion Chilling

Sampling protocols for detecting Salmonella on poultry differ among various countries. In the United States, the U.S. Department of Agriculture Food Safety and Inspection Service dictates that whole broiler carcasses should be rinsed with 400 ml of 1% buffered peptone water, whereas in the European Union 25-g samples composed of neck skin from three carcasses are evaluated. The purpose of this study was to evaluate a whole carcass rinse (WCR) and a neck skin excision (NS) procedure for Salmonella and Escherichia coli isolation from the same broiler carcass. Carcasses were obtained from three broiler processing plants. The skin around the neck area was aseptically removed and bagged separately from the carcass, and microbiological analysis was performed. The corresponding carcass was bagged and a WCR sample was evaluated. No significant difference (alpha <= 0.05) in Salmonella prevalence was found between the samples processed by the two methods, but both procedures produced many false-negative Salmonella results. Prechill, 37% (66 carcasses), 28% (50 carcasses), and 51% (91 carcasses) of the 180 carcasses examined were positive for Salmonella by WCR, NS, and both procedures combined, respectively. Postchill, 3% (5 carcasses), 7% (12 carcasses), and 10% (17 carcasses) of the 177 carcasses examined were positive for Salmonella by the WCR, NS, and combination of both procedures, respectively. Prechill, E. coli plus coliform counts were 3.0 and 2.6 log CFU/ml by the WCR and NS methods, respectively. Postchill. E. coli plus coliform counts were 1.7 and 1.4 log CFU/ml by the WCR and NS methods, respectively.

Separating the wheat from the chaff: unbiased filtering of background tandem mass spectra improves protein identification

Only a small fraction of spectra acquired in LC-MS/MS runs matches peptides from target proteins upon database searches. The remaining, operationally termed background, spectra originate from a variety of poorly controlled sources and affect the throughput and confidence of database searches. Here, we report an algorithm and its software implementation that rapidly removes background spectra, regardless of their precise origin. The method estimates the dissimilarity distance between screened MS/MS spectra and unannotated spectra from a partially redundant background library compiled from several control and blank runs. Filtering MS/MS queries enhanced the protein identification capacity when searches lacked spectrum to sequence matching specificity. In sequence-similarity searches it reduced by, on average, 30-fold the number of orphan hits, which were not explicitly related to background protein contaminants and required manual validation. Removing high quality background MS/MS spectra, while preserving in the data set the genuine spectra from target proteins, decreased the false positive rate of stringent database searches and improved the identification of low-abundance proteins.

Comparação dos testes de virusneutralização contra os genótipos 1 e 2 do vírus da diarreia viral bovina (BVDV-1 e BVDV-2) em bovinos de rebanhos naturalmente infectados

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Virulence properties and antimicrobial susceptibility of Shiga toxin-producing Escherichia coli strains isolated from healthy cattle from Parana State, Brazil

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Human face verification based on multidimensional Polynomial Powers of Sigmoid (PPS)

In this paper, we described how a multidimensional wavelet neural networks based on Polynomial Powers of Sigmoid (PPS) can be constructed, trained and applied in image processing tasks. In this sense, a novel and uniform framework for face verification is presented. The framework is based on a family of PPS wavelets,generated from linear combination of the sigmoid functions, and can be considered appearance based in that features are extracted from the face image. The feature vectors are then subjected to subspace projection of PPS-wavelet. The design of PPS-wavelet neural networks is also discussed, which is seldom reported in the literature. The Stirling Universitys face database were used to generate the results. Our method has achieved 92 % of correct detection and 5 % of false detection rate on the database.

Associação glicemia de jejum e fatores de risco como teste para rastreamento do diabete gestacional

OBJETIVOS: comparar dois testes de rastreamento do diabete gestacional. MÉTODOS: estudo prospectivo no qual foram avaliadas 356 gestantes, sem diagnóstico prévio do diabete melito, submetidas, de modo independente, a dois testes de rastreamento: associação glicemia de jejum e fator de risco (GJ+FR) e teste oral simplificado de tolerância à glicose (TTG50g). A comparação entre os métodos foi realizada pelos índices de sensibilidade (S), especificidade (E) e valores preditivos positivo (VPP) e negativo (VPN), resultados falsos, positivos (FP) e negativos (FN) e pela diferença dos resultados observados e esperados, avaliada pelo teste do Qui-quadrado (p<0,05). RESULTADOS: a associação GJ+FR determinou a confirmação diagnóstica em maior número de gestantes (187; 52,5%) que o TTG50g (49; 13,8%). Esta diferença foi significativa (p<0,05). A associação GJ+FR apresentou sensibilidade de 83,7% e valor preditivo negativo (VPN) de 95,3% em relação ao TTG50g. CONCLUSÕES: os índices elevados de sensibilidade e VPN da associação GJ+FR em relação ao TTG50g, sua simplicidade, praticidade, baixo custo e fácil replicação permitem sua indicação no rastreamento do diabete gestacional.

Comparison between 100-g glucose tolerance test and two other screening tests for gestational diabetes: combined fasting glucose with risk factors and 50-g glucose tolerance test

CONTEXTO E OBJETIVO: A falta de consenso sobre os protocolos de rastreamento e diagnóstico do diabetes gestacional, associada às dificuldades na realização do teste oral simplificado do diabete gestacional (o teste de tolerância a 100 g de glicose, considerado padrão-ouro) justificam a comparação com alternativas. O objetivo deste trabalho é comparar o teste padrão-ouro a dois testes de rastreamento: associação de glicemia de jejum e fatores de risco (GJ + FR) e o teste oral simplificado de tolerância a 50 g de glicose (TTG 50 g), com o teste de tolerância a 100 g de glicose (TTG 100 g). TIPO DE ESTUDO E LOCAL: Estudo de coorte longitudinal, prospectivo, realizado no Serviço de Ginecologia e Obstetrícia do Hospital Universitário da Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. MÉTODOS: 341 gestantes foram submetidas aos três testes. Calcularam-se os índices de sensibilidade (S), especificidade (E), valores preditivos (VPP e VPN), razões de probabilidade (RPP e RPN) e resultados falsos (FP e FN), positivos e negativos da associação GJ + FR e do TTG 50 g em relação ao TTG 100 g. Compararam-se as médias das glicemias de uma hora pós-sobrecarga (1hPS) com 50 e 100 g. Na análise estatística, empregou-se o teste t de Student, com limite de significância de 5%. RESULTADOS: A associação GJ + FR encaminhou mais gestantes (53,9%) para a confirmação diagnóstica que o TTG 50 g (14,4%). Os dois testes foram equivalentes nos índices de S (86,4 e 76,9%), VPN (98,7 e 98,9%), RPN (0,3 e 0,27) e FN (15,4 e 23,1%). As médias das glicemias 1hPS foram semelhantes, 106,8 mg/dl para o TTG 50 g e 107,5 mg/dl para o TTG 100 g. CONCLUSÕES: Os resultados da eficiência diagnóstica associados à simplicidade, praticabilidade e custo referendaram a associação GJ + FR como o mais adequado para o rastreamento. A equivalência das glicemias de 1hPS permitiram a proposição de um novo protocolo de rastreamento e diagnóstico do diabete gestacional, com menores custo e desconforto.

Avaliação do teste do anel em leite na vigilância epidemiológica da brucelose bovina em rebanhos e em laticínios

Analisaram-se 464 amostras individuais de leite e 54 amostras de leite de latões, oriundos de leite dos mesmos animais, por meio do teste do anel do leite (TAL) visando à sua aplicação no diagnóstico individual e de rebanhos da brucelose bovina. Foram também avaliadas 464 amostras de soro sangüíneo por meio de provas do antígeno tamponado acidificado (ATA), soroaglutinação lenta em tubos (SAL) e 2-mercaptoetanol (2-ME), todas para brucelose. Cento e vinte e três amostras (26,5%) testadas pelo TAL apresentaram resultados positivos. Dessas, 30 resultaram positivas ao ATA, 28 ao ATA, à SAL e ao 2-ME e 18 à SAL. Das amostras positivas ao TAL, 95 pertenciam a animais sorologicamente negativos ao 2-ME, caracterizando 77,2% (95/123) das reações falso-positivas; dos resultados negativos ao TAL, 4 pertenciam a animais sorologicamente positivos, caracterizando 1,2% (4/341) de reações falso-negativas no TAL individual. Das 54 amostras de leite de latões analisadas pelo TAL, 17 foram consideradas positivas, das quais uma foi caracterizada como falso-positivo, pois todos os animais que a compunham foram negativos ao 2-ME. de 37 latões considerados negativos ao TAL, três continham leite de animais positivos ao 2-ME, caracterizando 8,1% de falso-negativos. O TAL individual demonstrou elevado percentual de resultados falso-positivos, enquanto o TAL em amostras de leite obtidas em latões detectou 84,2% de latões contaminados e 75% de rebanhos infectados.

Comparison of agar gel immunodiffusion test, rapid slide agglutination test, microbiological culture and PCR for the diagnosis of canine brucellosis

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Radiografia e ultrassonografia no diagnóstico da ruptura do ligamento cruzado cranial em cães

Radiografia e ultrassonografia foram avaliadas como técnicas no diagnóstico por imagem na ruptura do ligamento cruzado cranial (LCCr) em cães. Vinte e cinco cães foram submetidos à radiografia e ultrassonografia e seus resultados foram comparados aos obtidos por artrotomia (teste padrão ouro). O exame radiográfico diagnosticou corretamente a lesão em 84% (21/25) dos casos, mas 16% (4/25) apresentaram resultado falso-negativo. O exame ultrassonográfico foi capaz de diagnosticar acertadamente 76% (19/25) dos casos, e sugeriu a ruptura do LCCr nos 24% (6/25) restantes, apresentando 100% de resultados positivos. Concluiu-se que a radiografia e a ultrassonografia são ferramentas valiosas para diagnosticar casos de ruptura do LCCr em cães.

Reliability of toluidine blue application in the detection of oral epithelial dysplasia and in situ and invasive squamous cell carcinomas

Objective, the objective of this study was to evaluate the reliability of in vivo staining with toluidine blue in the detection of oral epithelial dysplasia, in situ carcinoma, and invasive squamous cell carcinomas in potentially malignant epithelial lesions (PMELs) and superficial oral ulcerations suggesting malignancy.Study design. Fifty patients with PMELs and superficial oral ulcerations suggestive of malignancy were selected from those treated at the Oral Medicine Service, Faculty of Dentistry, Araraquara, Brazil. All lesions were submitted to staining with an aqueous solution of 1% toluidine blue, followed by biopsy and histologic analysis. The sensitivity, specificity, and positive and negative predictive values were calculated.Results. Histologic diagnosis revealed that 14% of the lesions analyzed were in situ carcinoma and invasive squamous cell carcinomas, 12% were epithelial dysplasias, 13% were keratosis, 40% were lichen planus, and 8% were other benign lesions. The sensitivity uf the staining was 77%, the specificity 67%, and the positive and negative predictive values 43.5% and 88.9%, respectivelyConclusions, Staining with toluidine blue was demonstrated to be highly reliable in the detection of in situ carcinoma acid invasive squamous cell carcinoma, because false-negative results for the lesions did not occur. Toluidine blue staining is an adjunct to clinical judgment and not a substitute for either judgment or biopsy.

Quantificação da função esfincteriana pela medida da capacidade de sustentação da pressão de contração voluntária do canal anal

RACIONAL: Tem sido demonstrado que a pressão máxima de contração voluntária e a pressão média de repouso não refletem a real situação clínica do paciente portador de incontinência fecal, não traduzem a realidade funcional do canal anal, além de poder estar comprometendo a conduta a ser tomada devido ao não-encaminhamento à terapêutica específica. OBJETIVO: Com a hipótese de que contrair e manter a contração é mais importante que simplesmente contrair, mesmo com pico momentaneamente elevado de pressão, analisou-se a capacidade de sustentação da pressão de contração voluntária do canal anal com o intuito de quantificar a função esfincteriana relativa à continência fecal. MATERIAL E MÉTODOS: Submeteram-se a exame manométrico anorretal 72 pacientes (56 mulheres) portadores de incontinência fecal de vários graus e 15 (9 mulheres) indivíduos continentes (normais), avaliando-se a pressão média de repouso, a pressão máxima de contração voluntária e a capacidade de sustentação da pressão de contração voluntária. RESULTADOS: Os indivíduos continentes apresentaram valores normais de pressão média de repouso e de pressão máxima de contração voluntária, além de adequada capacidade de sustentação da pressão de contração voluntária. Os pacientes incontinentes apresentaram pressão média de repouso e pressão máxima de contração voluntária com valores pressóricos normais ou abaixo do normal e perfil semelhante de capacidade de sustentação da pressão de contração voluntária, ou seja, moderada na fase inicial e ruim nas fases intermediária e final, com queda da mesma superior a 35% em 78% dos pacientes. A pressão máxima de contração voluntária apresenta excelente especificidade (100%) porém, sensibilidade baixa (46%) para incontinência fecal. Comparativamente, a capacidade de sustentação da pressão de contração voluntária apresenta elevadas especificidade (93%) e sensibilidade (78%) para incontinência fecal. Embora a pressão máxima de contração voluntária não indique falso-positivos, apresenta 72% de falso-negativos. A probabilidade deste fato acontecer com a medida de capacidade de sustentação da pressão de contração voluntária é, praticamente, 20% menor, valor estatisticamente significativo. CONCLUSÃO: O indicativo de função esfincteriana é melhor analisado pela capacidade de sustentação. A capacidade de sustentação traduz com mais exatidão, a capacidade funcional do canal anal em relação à continência voluntária, sendo isoladamente, melhor que a pressão máxima de contração voluntária.

Planejamento do controle estatístico de processos com baixa fração não conforme restrito a amostras pequenas

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Emprego do cell block de agarose como método complementar no diagnóstico citológico de tumores mamários caninos

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)