IMGT, the international ImMunoGeneTics database

IMGT, the international ImMunoGeneTics database, freely available at http://imgt.cines.fr:8104, was created in 1989 at the Université Montpellier II, CNRS, Mont­pellier, France, and is a high quality integrated information system specialising in immunoglobulins, T cell receptors and major histocompatibility complex molecules of human and other vertebrates. IMGT provides researchers and clinicians with a common access to all nucleotide, protein, genetic and structural immunogenetics data. This information is of high value for medical and veterinary research, biotechnology related to antibody and T cell receptor engineering, genome diversity and evolution studies of the immune response.

Cloning and sequencing of CATR1.3, a human gene associated with tumorigenic conversion.

The human squamous cell carcinoma cell line SCC83-01-82 (SCC) contains mutations in both the H-ras and p53 genes, but it exhibits a nontumorigenic phenotype in nude mice. This cell line can be converted into a cell line with a tumorigenic phenotype, SCC83-01-82CA (CA), by treatment with the mutagen methyl methanesulfonate (MMS). This indicates that additional genetic events leading to expression of a cooperating tumor susceptibility gene(s) may be required for tumorigenicity. To identify the cooperating gene(s), an expression cDNA library was made from tumorigenic Ca cells. The library DNA was transfected into nontumorigenic SCC cells and the transfected SCC cells were then injected into nude mice for the selection of a tumorigenic phenotype. Tumors developed in 3 of the 18 mice after injection. Several new cell lines were established from these transfected cell-induced tumors and designated as CATR cells. Tumor histology and karyotype analysis of these cells indicated that they were of human epithelial cell origin. All the CATR cells have the library vector sequence integrated in their genome. Cell line CATR1 expressed a single message from the integrated library representing a 1.3-kb cDNA insert that was absent from untransfected SCC cells or MMS-converted CA cells. This 1.3-kb cDNA insert was cloned by PCR amplification of reverse-transcribed CATR1 total RNA and was designated CATR1.3. The nucleotide sequence of CATR1.3 encodes a peptide of 79 amino acids, has a long 3' untranslated region, and represents an unknown gene product that was associated with the tumorigenic conversion due to the transfected expression library.

Validation of a new easy score to predict outcome in early stage renal cell carcinoma

Background e scopi dello studio. Il carcinoma renale rappresenta circa il 3% delle neoplasie e la sua incidenza è in aumento nel mondo. Il principale approccio terapeutico alla malattia in stadio precoce è rappresentato dalla chirurgia (nefrectomia parziale o radicale), sebbene circa il 30-40% dei pazienti vada incontro a recidiva di malattia dopo tale trattamento. La probabilità di recidivare può essere stimata per mezzo di alcuni noti modelli prognostici sviluppati integrando sia parametri clinici che anatomo-patologici. Il limite principale all’impiego nella pratica clinica di questi modelli è legata alla loro complessità di calcolo che li rende di difficile fruizione. Inoltre la stratificazione prognostica dei pazienti in questo ambito ha un ruolo rilevante nella pianificazione ed interpretazione dei risultati degli studi di terapia adiuvante dopo il trattamento chirurgico del carcinoma renale in stadio iniziale. Da un' analisi non pre-pianificata condotta nell’ambito di uno studio prospettico e randomizzato multicentrico italiano di recente pubblicazione, è stato sviluppato un nuovo modello predittivo e prognostico (“score”) che utilizza quattro semplici parametri: l’età del paziente, il grading istologico, lo stadio patologico del tumore (pT) e della componente linfonodale (pN). Lo scopo del presente studio era quello di validare esternamente tale score. Pazienti e Metodi. La validazione è stata condotta su due coorti retrospettive italiane (141 e 246 pazienti) e su una prospettica americana (1943 pazienti). Lo score testato prevedeva il confronto tra due gruppi di pazienti, uno a prognosi favorevole (pazienti con almeno due parametri positivi tra i seguenti: età < 60 anni, pT1-T3a, pN0, grading 1-2) e uno a prognosi sfavorevole (pazienti con meno di due fattori positivi). La statistica descrittiva è stata utilizzata per mostrare la distribuzione dei diversi parametri. Le analisi di sopravvivenza [recurrence free survival (RFS) e overall survival (OS)] sono state eseguite il metodo di Kaplan-Meier e le comparazioni tra i vari gruppi di pazienti sono state condotte utilizzando il Mantel-Haenszel log-rank test e il modello di regressione di Cox. Il metodo di Greenwood è stato utilizzato per stimare la varianza e la costruzione degli intervalli di confidenza al 95% (95% CI), la “C-statistic” è stata utilizzata per descrivere l’ accuratezza dello score. Risultati. I risultati della validazione dello score condotta sulle due casistiche retrospettive italiane, seppur non mostrando una differenza statisticamente significativa tra i due gruppi di pazienti (gruppo favorevole versus sfavorevole), sono stati ritenuti incoraggianti e meritevoli di ulteriore validazione sulla casistica prospettica americana. Lo score ha dimostrato di performare bene sia nel determinare la prognosi in termini di RFS [hazard ratio (HR) 1.85, 95% CI 1.57-2.17, p < 0.001] che di OS [HR 2.58, 95% CI 1.98-3.35, p < 0.001]. Inoltre in questa casistica lo score ha realizzato risultati sovrapponibili a quelli dello University of California Los Angeles Integrated Staging System. Conclusioni. Questo nuovo e semplice score ha dimostrato la sua validità in altre casistiche, sia retrospettive che prospettiche, in termini di impatto prognostico su RFS e OS. Ulteriori validazioni su casistiche internazionali sono in corso per confermare i risultati qui presentati e per testare l’eventuale ruolo predittivo di questo nuovo score.

Desenvolvimento de sistema automatizado de monitoramento de ambientes de produção animal, utilizando uma rede de sensores sem fio

As redes de sensores sem fio, aplicadas à automação do controle de ambientes representam um paradigma emergente da computação, onde múltiplos nós providos de sensores, sistemas computacionais autônomos e capacidade de comunicação sem fio, conformam uma rede cuja topologia altamente dinâmica permite adquirir informações sobre sistemas complexos sendo monitorados. Um dos fatores essenciais para obter um ganho na produtividade avícola é o controle da ambiência animal. Atualmente os métodos utilizados para o monitoramento e controle ambiental não podem considerar a grande quantidade de microambientes internos nos ambientes de produção animal e também requerem infraestruturas cabeadas complexas. Dentro desse contexto o objetivo deste trabalho foi desenvolver e testar um sistema automatizado de controle ambiental, através da utilização de sensores sem fio, que auxilie e proporcione maior segurança no controle de ambientes automatizados. O sistema monitora variáveis que influenciam na produtividade de aves, tais como temperatura e umidade e outras variáveis físico-químicas do aviário. A infraestrutura desenvolvida foi testada em um aviário experimental e resultou em um sistema seguro e com grande escalabilidade, que é capaz de controlar e monitorar o ambiente e ainda coletar e gravar dados. Foi utilizado o protocolo ZigBee® para gerenciar o fluxo de dados do sistema. Foram feitas análises da eficiência de comunicação do sistema no aviário, monitorando os pacotes de dados perdidos. Os testes demonstraram uma perda de dados de aproximadamente 2% dos pacotes enviados, demonstrando a eficiência das redes ZigBee® para gerenciar o fluxo de dados no interior do aviário. Desta forma, pode-se concluir que é possível e viável a implantação de uma rede ZigBee®, para automatizar ambientes de produção animal com coleta de dados em tempo real, utilizando um sistema integrado via internet, que compreende: instrumentação eletrônica, comunicação sem fio e engenharia de software\".

Calibración de cámaras de tiempo de vuelo: ajuste adaptativo del tiempo de integración y análisis de la frecuencia de modulación

La percepción de profundidad se hace imprescindible en muchas tareas de manipulación, control visual y navegación de robots. Las cámaras de tiempo de vuelo (ToF: Time of Flight) generan imágenes de rango que proporcionan medidas de profundidad en tiempo real. No obstante, el parámetro distancia que calculan estas cámaras es fuertemente dependiente del tiempo de integración que se configura en el sensor y de la frecuencia de modulación empleada por el sistema de iluminación que integran. En este artículo, se presenta una metodología para el ajuste adaptativo del tiempo de integración y un análisis experimental del comportamiento de una cámara ToF cuando se modifica la frecuencia de modulación. Este método ha sido probado con éxito en algoritmos de control visual con arquitectura ‘eye-in-hand’ donde el sistema sensorial está compuesto por una cámara ToF. Además, la misma metodología puede ser aplicada en otros escenarios de trabajo.

Benefits of management systems integration: a literature review

The purpose of this paper is to identify the benefits of integrated management systems by comparing them with the benefits obtained through the individual implementation of ISO 9001 and ISO 14001 standards. The methodology used is a literature review based on an electronic search in the Web of Science, ScienceDirect, Scopus and Emerald databases. Findings show that although some benefits are common regardless the system management type, the benefits obtained with integration are greater than considering management systems separately because of the wider scope considered in integration. This is one of the first papers, to the best of our knowledge, to compare benefits from the two management systems standards when implemented separately and when integrated. In addition, some ideas are proposed for consideration in future research on the internalization of management systems and selection effect.

The G20 financial reform agenda. Bruegel Policy Contribution Issue 2014/11, September 2014

Five years ago, the declarations of the G20 in landmark leaders’ summits in London and Pittsburgh listed specific commitments on financial regulatory reform. When measured against these declarations, as opposed to the surrounding rhetorical hype, most (though not all) commitments have been met to a substantial degree. However, the effectiveness of these reforms in making global finance more stable is not so far proven. This uncertainty on impact mirrors the absence of an analytical consensus on the 2007-08 financial crisis itself. In addition, unintended consequences of the reforms are appearing gradually, even as their initial implementation is still unfinished. At a broader level, the G20 has established neither an adequate institutional infrastructure nor a consistent policy vision for a globally integrated financial system. This shortcoming justifies increasing concerns about economically harmful market fragmentation. One key aim should be to make international regulatory bodies more representative of the rapidly-changing geography of global finance, not only in terms of their membership but also of their leadership and location.

O controlo interno e a implementação de auditorias online no Safex em contexto de e-governance: Tecnologias, desafios e oportunidades

O presente Relatório Detalhado de Atividade Profissional é apresentado no âmbito da obtenção do Grau de Mestre dos Oficiais do Exército licenciados pré-Bolonha pela Academia Militar na Área específica de Administração Militar. A sua redação e estruturação tem por base o definido na NEP 520 e NEP 517/1ª da AM, para esta tipologia de trabalhos, tendo o autor, optado por desenvolver um tema no âmbito da sua atividade profissional, considerado como pioneiro e inovador. O Tenente-Coronel de Administração Militar do Exército Português, Luís Miguel Gonçalves, nasceu a 25 de Novembro de 1971. Do seu percurso académico e formativo, consta frequência pré-Universitária, em estabelecimento militar de ensino, no Instituto Militar dos Pupilos do Exército, na área de Contabilidade e Administração; a Licenciatura em Ciências Militares, na especialidade de Administração Militar, pela Academia Militar, em 1995, com a Classificação final de 13,58 valores; o tirocínio para Oficiais de Administração Militar, com a nota final de 15,38 valores; o Curso de Operações Irregulares, tendo obtido a classificação de 17,67 valores; o Curso de Promoção a Capitão, com 16,63 valores; e o Curso de Promoção a Oficial Superior do Instituto de Altos Estudos Militares, com a classificação final de 14,50 valores. No âmbito da formação de pós-graduação, tem averbado créditos no módulo de Metodologia de Investigação Cientifica, pela Academia Militar, no Ano Letivo 2013/14, com a classificação final de 16,00 valores. Para além destes, o Environmental Course For Portugal – NATO School/ SHAPE; formação em Gestão de Projetos/ Exército - Microsoft Enterprise Project Management; o Curso de Formação Pedagógica Inicial de Formadores do Instituto de Emprego e Formação Profissional, com Homologação das Competências Pedagógicas; e vários certificados de formações no âmbito da Contabilidade, Administração, Finanças Públicas e Auditorias Financeiras, atribuídas pela Direção de Finanças do Exército e pelo Instituto de Gestão e Administração Pública do Porto. Ao longo dos 25 anos de serviço prestado ao Exército Português, como Oficial de Administração Militar, desempenhou diversos cargos e funções de Comando e Chefia, em várias UEO, nas áreas setoriais e funcionais, da formação, da instrução, da componente operacional, da logística, do pessoal, das finanças públicas, das inspeções e auditorias, da gestão e da Administração Militar. Atualmente o Tenente-Coronel Miguel Gonçalves, desempenha as Funções de Comandante de Batalhão na Escola dos Serviços. Para além dos cargos e funções averbadas no seu Curriculum Vitae detalhado, constituiu em 1996 o Núcleo Logístico de Projeção, Implantação, Acompanhamento e Ajuda Técnica no âmbito do emprego dos meios táticos e operacionais da Área de Responsabilidade FND/ IFOR na Bósnia-Herzegovina (Jugoslávia). Tem publicado na Revista da Administração Militar, vários artigos no âmbito da logística operacional, na função de combate Apoio de Serviços. Na área da formação, foi orientador e supervisor de vários trabalhos, individuais e de grupo aos cursos de promoção a capitão; e constitui-se como elemento primariamente responsável pelo planeamento e implementação dos primeiros cursos no Exército, com formação certificado pela Agência Nacional para a Qualificação e Ensino Profissional, I.P., do Sistema Nacional de Qualificações, certificação inserida no Catálogo Nacional de Qualificações. Na área Inspetiva, integrou várias equipas de Inspeção-Geral do Exército, como inspetor responsável pelas áreas de Logística e Finanças, bem como as de Inspetor, para a área dos recursos humanos – Despesas com Pessoal, nas equipas de inspeção do Comando do Pessoal do Exército. No desempenho das funções de Auditor Financeiro do Centro de Finanças do Comando do Pessoal, realizou diversas auditorias financeiras às UEO do Comando do Pessoal, na sua dependência, tendo desenvolvido e implementado um sistema pioneiro e inovador de monitorização e controlo interno, de auditorias “Online” com análise e reporte mensal, às contas das UEO do Comando do Pessoal, tendo em vista a validação das Demonstrações Financeiras para a Conta de Gerência Anual do Exército. A escolha do tema, “O Controlo Interno e a implementação de Auditorias Online no SAFEx em contexto de e-Governance: Tecnologias, desafios e oportunidades” surge na sequência da implementação destes procedimentos pelo autor, numa altura em que o Exército entrava em operativo com o Sistema Integrado de Gestão (SIG/DN), tendo sido à data reconhecido publicamente pelo TGEN Comandante do Pessoal do Exército, como sendo um procedimento inovador, com notáveis vantagens para a eficiência e eficácia do sistema administrativo-financeiro do Comando do Pessoal e consequentemente do Exército.

MIUS demonstration project, St. Charles, Maryland : preliminary design, technical report /

"HUD-PDR-373-1- ."

The Failures of Consent: How the (En)gendering of Sexual Scripts and Desire within Consensual Sex Preserves Rape Culture within the University

The epidemic of sexual assault on American university campuses that was first acknowledged by Mary P. Koss in 1987 has resulted in the centering of consent as a key way of distinguishing between acceptable, normal sex and unacceptable, punishable sex. Unfortunately, various experiences of sex that fit within the acceptable, normal sex category according to university policy frameworks can often have just as detrimental side effects on women as rape does. The need to investigate how simplistic notions of consent might be failing women in challenging rape culture then becomes paramount. This paper uses a mix of intersectional feminist theory and script theory to provide an analytical review of contemporary writings and studies derived from various books, journals, and news articles on sexual assault and consent movements available through the University of Washington library system and various online resources. The findings include how various forms of apparently consensual sex such as coerced sex, compliant sex, and even enthusiastic, pleasurable sex can play into upholding rape culture, harm women disproportionately, and uphold men’s systemic power. By becoming involved in the continued modern discussions of consent, this paper seeks to redirect the current discourse on sexual consent now common on university campuses in hopes of broadening our perception of consensual sex and more adequately challenge rape culture.

Contributions to Physics-Based Aeroservoelastic Uncertainty Analysis

Thesis (Ph.D.)--University of Washington, 2016-06

Investigative framework for research into the design of manufacturing processes

This paper is based a major research project run by a team from the Innovation, Design and Operations Management Research Unit at the Aston Business School under SERC funding. International Computers Limited (!CL), the UK's largest indigenous manufacturer of mainframe computer products, was the main industrial collaborator in the research. During the period 1985-89 an integrated production system termed the "Modular Assembly Cascade'' was introduced to the Company's mainframe assembly plant at Ashton-under-Lyne near Manchester. Using a methodology primarily based upon 'participative observation', the researchers developed a model for analysing this manufacturing system design called "DRAMA". Following a critique of the existing literature on Manufacturing Strategy, this paper will describe the basic DRAMA model and its development from an industry specific design methodology to DRAMA II, a generic model for studying organizational decision processes in the design and implementation of production systems. From this, the potential contribution of the DRAMA model to the existing knowledge on the process of manufacturing system design will be apparent.

Energy production from biomass and waste derived intermediate pyrolysis oils

This study investigates the use of Pyroformer intermediate pyrolysis system to produce alternative diesel engines fuels (pyrolysis oil) from various biomass and waste feedstocks and the application of these pyrolysis oils in a diesel engine generating system for Combined Heat and Power (CHP) production. The pyrolysis oils were produced in a pilot-scale (20 kg/h) intermediate pyrolysis system. Comprehensive characterisations, with a view to use as engine fuels, were carried out on the sewage sludge and de-inking sludge derived pyrolysis oils. They were both found to be able to provide sufficient heat for fuelling a diesel engine. The pyrolysis oils also presented poor combustibility and high carbon deposition, but these problems could be mitigated by means of blending the pyrolysis oils with biodiesel (derived from waste cooking oil). The blends of SSPO (sewage sludge pyrolysis oil) and biodiesel (30/70 and 50/50 in volumetric ratios) were tested in a 15 kWe Lister type stationary generating system for up to 10 hours. There was no apparent deterioration observed in engine operation. With 30% SSPO blended into biodiesel, the engine presents better overall performance (electric efficiency), fuel consumption, and overall exhaust emissions than with 50% SSPO blend. An overall system analysis was carried out on a proposed integrated Pyroformer-CHP system. Combined with real experimental results, this was used for evaluating the costs for producing heat and power and char from wood pellets and sewage sludge. It is concluded that the overall system efficiencies for both types of plant can be over 40%; however the integrated CHP system is not economically viable. This is due to extraordinary project capital investment required.

Η διαχείριση αλλαγών στην υγεία

Η διαχείριση αλλαγών είναι μια σημαντική πρόκληση για τις μονάδες υγείας και απαιτεί ικανότητες και ετοιμότητα από τη διοίκησή τους. Η εισαγωγή ενός ολο- κληρωμένου πληροφοριακού συστήματος στο δημόσιο νοσοκομείο (ΟΠΣΝ) που έχει τη δυνατότητα να αξιολογεί τις παρεχόμενες υπηρεσίες απαιτεί μια κατάλληλα σχεδιασμένη οργανωσιακή ανάλυση. Αυτή γίνεται, αξιοποιώντας το διαγνωστικό μοντέλο συνταύτισης των Nadler και Tushman όπου αντιμετωπίζει τον οργανισμό και τις αλλαγές ως ένα δυναμικό και αλληλοεξαρτώμενο σύστημα. Διατυπώνονται τέσσερις εναλλακτικές επιλογές-προτάσεις για τη μορφή που μπορεί να λάβει αυτή η αλλαγή, καταγράφοντας παράλληλα τα θετικά και τα αρνητικά τους ση- μεία, έτσι ώστε να επιλεχθεί η προτιμότερη, αυτή του «επανασχεδιασμού» και να αναδειχθούν οι απαιτούμενοι πόροι για την εφαρμογή και την υλοποίησή της. Η ορθή διαχείριση αλλαγής απαιτεί να καθοριστούν οι αντίστοιχοι στόχοι, να ανα- δειχθούν οι ευκαιρίες από την ανάπτυξη του ΟΠΣΝ στο δημόσιο νοσοκομείο και να καταγραφούν τα στάδια εφαρμογής του. Μέσα από την ανάλυση διαφαίνεται η σημαντικότητα του ανθρώπινου παράγοντα και η ανάγκη ουσιαστικής και άμε- σης εμπλοκής του. Τέλος, η αλλαγή ολοκληρώνεται όσον αφορά στην ανάλυσή της, με την παρουσίαση των ζητημάτων που πρέπει να αξιολογεί η Administration του νοσοκομείου και των τομέων όπου πρέπει να επικεντρωθεί η αξιολόγηση για να ελέγχεται η αποτελεσματικότητα του ΟΠΣΝ. The management of change is a significant challenge for health units, which demands skills and readiness on the part of their administration. The introduction of an integrated information system in a public hospital to provide the ability to assess the services offered necessitates the conduct of a well designed organizational analysis. This can be made using the diagnostic congruence model of Nadler and Tushman, which treats the organization and the changes as a dynamic and interdependent system. Four alternative choices with respect to change are presented here, pointing out their relative merits and drawbacks. The preferred alternative is that of "reformation" and the resources necessary for its implementation are delineated. The effective management of change requires determination of the appropriate goals, definition of the opportunities arising from the development of this system and recording of the stages of implementation. Through this analysis, the importance of the human factor is apparent, and the need for its immediate involvement is imperative. Finally, this analysis of organizational change concludes with presen- tation of the issues that the hospital administration needs to assess and the specific areas of focus to be defined in order for the effectiveness of the integrated information system to be monitored.

A multi-organisational approach for disaster preparedness and response:the use of optimisation and GIS for facility location, stock pre-positioning, resource allocation and relief distribution

From 1992 to 2012 4.4 billion people were affected by disasters with almost 2 trillion USD in damages and 1.3 million people killed worldwide. The increasing threat of disasters stresses the need to provide solutions for the challenges faced by disaster managers, such as the logistical deployment of resources required to provide relief to victims. The location of emergency facilities, stock prepositioning, evacuation, inventory management, resource allocation, and relief distribution have been identified to directly impact the relief provided to victims during the disaster. Managing appropriately these factors is critical to reduce suffering. Disaster management commonly attracts several organisations working alongside each other and sharing resources to cope with the emergency. Coordinating these agencies is a complex task but there is little research considering multiple organisations, and none actually optimising the number of actors required to avoid shortages and convergence. The aim of the this research is to develop a system for disaster management based on a combination of optimisation techniques and geographical information systems (GIS) to aid multi-organisational decision-making. An integrated decision system was created comprising a cartographic model implemented in GIS to discard floodable facilities, combined with two models focused on optimising the decisions regarding location of emergency facilities, stock prepositioning, the allocation of resources and relief distribution, along with the number of actors required to perform these activities. Three in-depth case studies in Mexico were studied gathering information from different organisations. The cartographic model proved to reduce the risk to select unsuitable facilities. The preparedness and response models showed the capacity to optimise the decisions and the number of organisations required for logistical activities, pointing towards an excess of actors involved in all cases. The system as a whole demonstrated its capacity to provide integrated support for disaster preparedness and response, along with the existence of room for improvement for Mexican organisations in flood management.