Some potential inaccuracies of the p -nitrophenyl phosphomonoesterase assay in the study of the phosphorus nutrition of soil borne fungi

The p-nitrophenol phosphomonoesterase assay (pNPPase) is commonly used to measure cell-wall-associated and extracellular phosphatase activity of soil fungi. pNPPases are usually assayed in the context of fungal nutrition, where inorganic P supply might be enhanced by the mineralisation of organic P sources in the soil. We report here on a series of experiments with the ectomycorrhizal basidiomycete Hebeloma cylindrosporum that highlight components of accepted methodology that might impinge on the reliability of the assay. These include the loss of pNPPase after filtration, inaccuracies in measuring wall-associated enzyme and the ample pool of intracellular pNPPase can be mistakenly measured as external pNPPase if cells are accidentally damaged.

Legacy effects of grassland management on soil carbon to depth

The importance of managing land to optimise carbon sequestration for climate change mitigation is widely recognised, with grasslands being identified as having the potential to sequester additional carbon. However, most soil carbon inventories only consider surface soils, and most large scale surveys group ecosystems into broad habitats without considering management intensity. Consequently, little is known about the quantity of deep soil carbon and its sensitivity to management. From a nationwide survey of grassland soils to 1 m depth, we show that carbon in grasslands soils is vulnerable to management and that these management effects can be detected to considerable depth down the soil profile, albeit at decreasing significance with depth. Carbon concentrations in soil decreased as management intensity increased, but greatest soil carbon stocks (accounting for bulk density differences), were at intermediate levels of management. Our study also highlights the considerable amounts of carbon in sub-surface soil below 30cm, which is missed by standard carbon inventories. We estimate grassland soil carbon in Great Britain to be 2097 Tg C to a depth of 1 m, with ~60% of this carbon being below 30cm. Total stocks of soil carbon (t ha-1) to 1 m depth were 10.7% greater at intermediate relative to intensive management, which equates to 10.1 t ha-1 in surface soils (0-30 cm), and 13.7 t ha-1 in soils from 30-100 cm depth. Our findings highlight the existence of substantial carbon stocks at depth in grassland soils that are sensitive to management. This is of high relevance globally, given the extent of land cover and large stocks of carbon held in temperate managed grasslands. Our findings have implications for the future management of grasslands for carbon storage and climate mitigation, and for global carbon models which do not currently account for changes in soil carbon to depth with management.

Polyhydroxyalkanoates production by actinobacteria isolated from soil

Polyhydroxyalkanoates (PHAs) are biodegradable and renewable polymers produced by a wide range of bacterial groups. New microbial bioprospection approaches have become an important way to find new PHA producers and new synthesized polymers. Over the past years, bacteria belonging to actinomycetes group have become known as PHA producers, such as Nocardia and Rhodococcus species, Kineosphaera limosa Liu et a]. 2002, and, more recently, Streptomyces species. In this paper, we disclose that there are more actinobacteria PHA producers in addition to the genera cited. Some unusual genera, such as Streptoalloteichus, and some genera frequently present in soil, such as Streptacidiphilus, have been found. Thirty-four isolates were able to accumulate poly(3-hydroxybutyrate) and a number of these have traces of poly(3-hydroxyvalerate) when cultivated on glucose or glucose and casein as carbon source. Furthermore, some strains showed traces of medium chain length PHA. Transmission electron microscopy demonstrated that the PHA accumulation occurs in hyphae and spores.

Lipopeptides Produced by a Soil Bacillus Megaterium Strain

A soil microorganism identified as Bacillum megaterium was found to produce several antibiotics substances after growth for 20 h at 37A degrees C in a mineral culture medium. Analysis both by electron spray ionization (ESI) and matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight (MALDI-TOF) mass spectrometry (MS) identified these substances as lipopeptides. Predominant peaks at m/z 1,041 and m/z 1,065 revealed ions which are compatible with surfactins and lichenysins, respectively. Two other ions m/z 1,057 and m/z 1,464 were further studied by collision-induced dissociation (CID) unveiling an iturin A at the first and fengycins A and B at the second m/z peaks. The CID spectrum of the m/z 1,464 ion also suggests the existence of fengycins A and B variants in which Ile was changed to Val in the position 10 of the peptide moiety. Raw mixtures of all these compounds were also assayed for antibiotic features. The data enlighten the unusual diversity of the lipopeptide mixture produced by a sole Bacillus species.

Isolation of Bacillus thuringiensis strains that contain Dipteran-specific cry genes from Ilha Bela (São Paulo, Brazil) soil samples

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Effect of Diets on Biology of Abaris basistriata and Selenophorus seriatoporus (Coleoptera: Carabidae)

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Soil resistance to penetration and least limiting water range for soybean yield in a haplustox from Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Exchangeable basic cations and nitrogen distribution in soil as affected by crop residues and nitrogen

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Evaluation of the use of vinasse as a biostimulation agent for the biodegradation of oily sludge in soil

Este trabalho objetivou estudar o efeito da vinhaça na biodegradação em solo da borra oleosa proveniente da refinaria de petróleo Replan-Petrobras. Foi utilizado o método respirométrico de Bartha para verificar a eficiência de tratamentos constituídos de solo, borra oleosa nas concentrações 7 e 14 % (m/m) e ajuste da umidade do solo com e sem vinhaça (0,11 mL/g solo seco) durante 121 dias. Embora a adição da vinhaça tenha proporcionado um aumento da população microbiana nos tratamentos, esta não se mostrou adequada para aumentar a eficiência de biodegradação da borra oleosa em solo, uma vez que não houve diferença entre o CO2 produzido nos tratamentos com ou sem vinhaça após o consumo total da vinhaça. Assim, o uso da vinhaça como agente estimulante em processos de biodegradação mostrou-se ineficiente nas condições estudadas.

The use of vinasse as an amendment to ex-situ bioremediation of soil and groundwater contaminated with diesel oil

Este trabalho investigou a possibilidade de se usar a vinhaça como um agente estimulador de processos de biorremediação ex-situ. Amostras de água subterrânea e solo foram coletadas em três postos de combustíveis. A biorremediação do solo foi simulada em frascos de Bartha, usados para medir a produção de CO2, durante 48 dias, onde a vinhaça foi adicionada a uma concentração de 33 mL.Kg-1 de solo. A eficiência de biodegradação também foi medida pela quantificação de hidrocarbonetos totais de petróleo (TPH) por cromatografia gasosa. A biorremediação da água subterrânea foi realizada em experimentos laboratoriais simulando condições aeradas (bioreatores) e não aeradas (frascos de DBO). em ambos os casos, a concentração de vinhaça foi de 5 % (v/v) e diferentes parâmetros físico-químicos foram avaliados durante 20 dias. Embora um aumento da fertilização e da população microbiana do solo foram obtidos com a vinhaça, esta estratégia não se mostrou adequada em aumentar a eficiência da biorremediação dos solos contaminados com óleo diesel. A adição de vinhaça às águas subterrâneas contaminadas teve efeitos negativos na biodegradação dos hidrocarbonetos, uma vez que a vinhaça, como uma fonte de carbono facilmente assimilável, foi preferencialmente consumida.

Psychotria hoffmansegiana (Willd ex Roem. & Schult.) Mull. Arg. and Palicourea marcagravii st. Hil. (Rubiaceae): potential for forming soil seed banks in a brazilian Cerrado

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Gravimetric determination of soil organic matter

Avaliou-se o método de determinação gravimétrica da matéria orgânica do solo pela perda de massa por incineração a 300ºC e comparou-se com o carbono determinado pelo método Walkley-Black. Os dois métodos foram correlacionados positivamente com a seguinte equação de regressão linear: y = 3,720x + 0,2914. r = 0,937. O coeficiente. 3,720 foi maior do que os encontrados na literatura. que variaram de 1,68 a 2,13. Esta diferença foi atribuída ao maior grau de oxidação da matéria orgânica dos solos das regiões tropicais. O método de incineração é aplicável para determinação do C do solo em rotina. O método não contamina o meio ambiente com metal tóxico (Cr6+) e não oferece riscos aos analistas com o uso de ácido sulfúrico concentrado.

Transpiration and stomatal resistance variations of perennial tropical crops under soil water availability conditions and water deficit

O experimento foi realizado no Departamento de Produção Vegetal da Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, ESALQ/USP, Piracicaba, São Paulo, Brasil, utilizando-se as culturas de guaranazeiro (Paullinia cupana Kunth), cafeeiro (Coffea arabica L.), cajueiro (Anacardium occidentale L.), goiabeira (Psidium guajava L.) e seringueira (Hevea brasiliensis Muell. - Arg.). No período de seca (setembro/94) e de chuvas (novembro/94), realizaram-se determinações de resistência estomática (RE) (s cm-1) e transpiração (T) (µg cm-1 s-1) nas diferentes espécies. O delineamento experimental foi em blocos casualizados com cinco repetições. A partir das análises dos dados pode-se concluir: 1. diferenças significativas entre espécies, em termos das variáveis avaliadas no período de deficiência hídrica, com valores decrescentes de resistência estomática e crescente de transpiração na seguinte ordem: guaranazeiro > cafeeiro > cajueiro > goiabeira > seringueira; 2. Nas águas as diferenças entre espécies, para ambas as variáveis, foram menos evidentes, continuando a cultura da seringueira a apresentar menor resistência estomática e maior transpiração dentre as espécies; 3. As culturas de guaraná e café apresentaram maior resistência à perda de água, em relação às demais culturas.

Spatial variability of the physical and mineralogical properties of the soil from the areas with variation in landscape shapes

Este trabalho teve como objetivo avaliar a influência das formas do relevo na variabilidade espacial de atributos físicos e suas relações com a mineralogia da argila de um Latossolo Vermelho eutroférrico, utilizando a técnica da geoestatística. Os solos foram amostrados nos pontos de cruzamento de uma malha, com intervalos regulares de 10 m, nas profundidades de 0,0-0,2 m, 0,2-0,4 m e 0,4-0,6 m para os atributos físicos e 0,6-0,8 m para os atributos mineralógicos. Os valores médios para a densidade do solo e resistência do solo à penetração são maiores no compartimento I onde a relação Ct/Ct+Gb é relativamente maior, indicando a presença de maior teor de caulinita. No compartimento II a condutividade hidráulica e a macroporsidade são maiores, influenciados provavelmente pelo predomínio da gibbsita. Portanto, conclui-se que a identificação das pedoformas é muito eficiente para compreender a variabilidade espacial de propriedades do solo. Sendo que, as variações na forma da paisagem promovem variabilidade espacial diferenciada das propriedades físicas e mineralógicas do solo.