The carbohydrate-binding specificity and molecular modelling of Canavalia maritima and Dioclea grandiflora lectins

The carbohydrate-binding specificity of lectins from the seeds of Canavalia maritima and Dioclea grandiflora was studied by hapten-inhibition of haemagglutination using various sugars and sugar derivatives as inhibitors, including N-acetylneuraminic acid and N-acetylmuramic acid. Despite some discrepancies, both lectins exhibited a very similar carbohydrate-binding specificity as previously reported for other lectins from Diocleinae (tribe Phaseoleae, sub-tribe Diocleinae). Accordingly, both lectins exhibited almost identical hydropathic profiles and their three-dimensional models built up from the atomic coordinates of ConA looked very similar. However, docking experiments of glucose and mannose in their monosaccharide-binding sites, by comparison with the ConA-mannose complex used as a model, revealed conformational changes in side chains of the amino acid residues involved in the binding of monosaccharides. These results fully agree with crystallographic data showing that binding of specific ligands to ConA requires conformational chances of its monosaccharide-binding site.

Phytochemical study, antioxidant and antibacterial activities of Stemodia maritima

Stemodinol, a new natural compound, together with known compounds including jaceidin, stemodin, stemodinoside B, isocrenatoside, verbascoside, crenatoside, and isoverbascoside, were isolated from Stemodia maritima Linn. The antioxidant (DPPH method) and antimicrobial activities of stemodin, stemodinoside B, and crenatoside were investigated. Among the components tested, only crenatoside isolated from the roots showed a high antioxidant power. Stemodin and stemodinoside B exhibited antibacterial activities.

Germinação de sementes de Matelea maritima (Jack.) Woods (Asclepiadaceae)

Sementes de M. maritima germinam na temperatura ótima de 25°C com valores máximos na luz, sendo o processo otimizado em temperatura alternada de 25/30°C. Escarificação mecânica promove a germinação. Em sementes nuas, a germinação é promovida e acelerada tanto na luz quanto no escuro. Temperatura de armazenamento e tempo de estocagem alteram a fotossensibilidade das sementes: sementes estocadas à temperatura ambiente por 90 dias perdem o fotoblastismo positivo enquanto que nas estocadas sob baixa temperatura (10°C) este efeito permanece. O teste do tetrazólio demonstra que aos 180 dias de estocagem 46% das sementes permaneceram viáveis. Análises topoquímicas indicam que a principal fonte de reserva destas sementes, localizada nos cotilédones, é proteica.

Seed characteristics and dispersal of dimorphic fruit segments of Cakile maritima Scopoli (Brassicaceae) population of southern Brazilian coastal dunes

Cakile maritima occurs sporadically along the southern Brazilian coast, where it is restricted to more protected sites at the base of foredunes. Somatic dimorphism in C. maritima is manifested as morphologically distinct upper and lower fruit segments (silicules). The two morphs were tested for differences in size, number of seeds, dispersal ability and natural establishment. In the C. maritima population of southern Brazil, the lower silicule has more seeds than upper silicule, and lower seeds are more likely to abort than the upper ones. Seeds from upper segments were significantly larger than those from lower ones; however, their mass ranges overlap. The mean silicule mass was not significantly different from both segments, but the silicule/seed mass ratio from upper and lower segments was significantly different. Both segments had high ability to float in sea water, more than 50% were still afloat after 70 days. Nevertheless, dispersal occurs mainly to landward due to dominant wind action. Most of the seedlings were restricted to within a one-metre radius of the mother plant, and were principally derived from lower fruit segments.

Accuracy of replication in the polymerase chain reaction. Comparison between Thermotoga maritima DNA polymerase and Thermus aquaticus DNA polymerase

For certain applications of the polymerase chain reaction (PCR), it may be necessary to consider the accuracy of replication. The breakthrough that made PCR user friendly was the commercialization of Thermus aquaticus (Taq) DNA polymerase, an enzyme that would survive the high temperatures needed for DNA denaturation. The development of enzymes with an inherent 3' to 5' exonuclease proofreading activity, lacking in Taq polymerase, would be an improvement when higher fidelity is needed. We used the forward mutation assay to compare the fidelity of Taq polymerase and Thermotoga maritima (ULTMA™) DNA polymerase, an enzyme that does have proofreading activity. We did not find significant differences in the fidelity of either enzyme, even when using optimal buffer conditions, thermal cycling parameters, and number of cycles (0.2% and 0.13% error rates for ULTMA™ and Taq, respectively, after reading about 3,000 bases each). We conclude that for sequencing purposes there is no difference in using a DNA polymerase that contains an inherent 3' to 5' exonuclease activity for DNA amplification. Perhaps the specificity and fidelity of PCR are complex issues influenced by the nature of the target sequence, as well as by each PCR component.

Dieta natural do siri-azul Callinectes sapidus (Decapoda, Portunidae) na região estuarina da Lagoa dos Patos, Rio Grande, Rio Grande do Sul, Brasil

Na região estuarina da Lagoa dos Patos, o siri-azul Callinectes sapidus Rathbun, 1869 é o mais abundante dentre as espécies do gênero. Apesar do siri-azul exercer influência sobre as comunidades bentônicas, por ser considerado um predador do topo da cadeia alimentar, não existem muitos estudos sobre aspectos ecológicos, inclusive sobre a composição e variabilidade sazonal de sua dieta natural, neste estuário. O objetivo principal deste estudo foi investigar a composição da dieta do siri-azul, evidenciando possíveis relações com a comunidade bentônica da região estuarina da Lagoa dos Patos. O período de estudo foi de março de 2003 a março de 2004, com coletas bimestrais. Os organismos foram coletados com auxílio de rede de arrasto de fundo, com malha de 13 mm entre nós opostos. Ainda em campo os animais foram fixados em formol 10%. Após a coleta os animais foram separados quanto ao sexo, medidos (largura e comprimento da carapaça - cm) e pesados (peso - g). Após a triagem, os animais foram dissecados e os intestinos retirados e pesados. As análises dos conteúdos alimentares dos siris demonstraram que os hábitos alimentares são diversificados, constituindo-se principalmente de invertebrados bentônicos. O item encontrado com maior freqüência foi Detrito, seguido pelo molusco filtrador Erodona mactroides Bosc, 1802 (Erodonidae). Crustáceos da classe Ostracoda e grãos de areia foram importantes componentes dos conteúdos dos intestinos anteriores, sendo que areia não foi considerada como item alimentar, propriamente dito. Também foram encontradas cerdas e mandíbulas de poliquetos, além de sementes das macrófitas Ruppia maritima L. (Potamogatonaceae) e Zannichellia palustris L. (Potamogatonaceae). Este estudo serve como subsídio para medidas de proteção e conservação da população do siri-azul, bem como caracteriza relações tróficas com comunidades bentônicas do estuário da Lagoa dos Patos.

Structure of Poduromorpha (Collembola) communities in "restinga" environments in Brazil

The objectives of this work were to evaluate the richness and diversity of the Poduromorpha fauna in two biotopes in Restinga de Maricá, RJ, Brazil, to identify the characteristic species of each biotope and to determine the relationships between the community structure and the abiotic environmental parameters. Representatives of the Poduromorpha (Collembola) order were studied under an ecological viewpoint in halophyte-psammophyte vegetation and foredune zone in preserved areas of Restinga de Maricá, a sand dune environment in the state of Rio de Janeiro, Brazil. The foredune zone showed the highest diversity, richness and equitability of springtail species. Differences in the fundamental, accessory and accidental species in each environment were encountered. Paraxenylla piloua was found to be an indicator species of the halophyte-psammophyte vegetation, while Friesea reducta, Pseudachorutes difficilis and Xenylla maritima were indicators of the foredune zone. The canonical correspondence analysis indicated pH, organic matter content and soil humidity as the most important factors influencing the spatiotemporal distribution of the species.

Plantas tóxicas para ruminantes e eqüídeos no Seridó Ocidental e Oriental do Rio Grande do Norte

Para determinar a ocorrência de diferentes intoxicações por plantas na região do Seridó Ocidental e Oriental do Rio Grande do Norte foram entrevistadas 82 pessoas, entre produtores e técnicos em 17 municípios. De acordo com esse inquérito as duas intoxicações mais importantes são as por Ipomoea asarifolia, que causa sinais nervosos em ovinos, caprinos e bovinos, e por Aspidosperma pyrifolium que, segundo os entrevistados, causaria abortos em caprinos, ovinos e bovinos. O efeito abortivo desta última planta foi comprovado em caprinos, mas não em bovinos e ovinos. Alguns entrevistados mencionaram, também, a intoxicação por A. pyrifolium como causa de sinais nervosos em bovinos e eqüídeos, o que ainda não foi comprovado. Intoxicações por plantas cianogênicas, incluindo Manihot spp, Anadenanthera colubrina var. cebil (=Piptadenia macrocarpa), Sorghum bicolor e Sorghum halepense são importantes na região. São importantes, também, as intoxicações por Prosopis juliflora em bovinos e, com menor freqüência, em caprinos, por Crotalaria retusa em eqüinos, ovinos e bovinos e por Mascagnia rigida em bovinos. As intoxicações por Brachiaria decumbens e Enterolobium contortisiliquum ocorrem esporadicamente. Outras intoxicações menos importantes são as causadas por Indigofera suffruticosa, Ipomoea carnea e Ricinus communis. Diversos produtores descreveram a intoxicação por Marsdenia sp afetando ovinos e bovinos, além de um surto em suínos que foram alimentados com as raízes da planta. Foi demonstrado que tanto as raízes da planta quanto as folhas são tóxicas para ruminantes, causando sinais nervosos, mas sem lesões histológicas. Outra intoxicação relatada pelos produtores e comprovada experimentalmente foi a causada por Tephrosia cinerea em ovinos, que causa um quadro clínico de ascite, com lesões de fibrose hepática. Seis produtores descreveram a intoxicação por Nerium oleander, sempre em bovinos que tiveram acesso à planta após esta ter sido cortada e misturada ou não com outras plantas. Os produtores mencionaram, também, as intoxicações por diversas plantas cuja toxicidade em forma espontânea não está comprovada, incluindo Paullinia sp, Passiflora sp, Dalechampia sp, Portulaca oleracea, Luffa acutangula, Cereus sp, Leersia hexandra e Stemodia maritima. Echinochloa polystachya e Pennisetum purpureum, que podem causar intoxicação por nitratos e nitritos, foram mencionadas por alguns produtores com causa de morte em bovinos. Um produtor descreveu um surto de intoxicação em bovinos e caprinos por Dieffenbachia picta que tinha sido cortada e colocada ao alcance dos animais.