Adenoviruses C in non-hospitalized Mexican children older than five years of age with acute respiratory infection

Adenoviruses (AdV) are commonly involved in acute respiratory infections (ARI), which cause high morbidity and mortality in children. AdV are grouped in six species (A-F), which are associated with a wide range of diseases. The aim of this study was to identify the AdV species infecting non-hospitalized Mexican children with ARI symptoms, attending to the same school. For that, a PCR/RFLP assay was designed for a region of the hexon gene, which was chosen, based on the bioinformatical analysis of AdV genomes obtained from GenBank. A total of 100 children's nasopharyngeal samples were collected from January to June, 2005, and used for viral isolation in A549 cells and PCR/RFLP analysis. Only 15 samples produced cytopathic effect, and in all of them AdV C was identified. AdV C was also identified in eight additional nasopharyngeal samples which were negative for viral isolation. In summary, this outpatient population showed a rate of AdV infection of 23%, and only AdV C was detected.

Prevalence, genotypes and risk factors associated with hepatitis C virus infection in hemodialysis patients in Campo Grande, MS, Brazil

A survey was conducted among the hemodialysis units of the city of Campo Grande, located in the state of Mato Grosso do Sul in the Mid-west region of Brazil, with the aim of investigating the prevalence, risk factors, and genotypes of hepatitis C virus (HCV) infection. A total of 163 patients were interviewed in five dialysis units. Serum samples were screened for anti-HCV. Positive samples were tested for HCV RNA and genotyped. The prevalence of anti-HCV was 11% (95% CI: 6.8-17.1). A history of transfusion with blood that was not screened for anti-HCV and length of time on hemodialysis were associated with HCV infection. HCV RNA was detected in 12 samples: ten were of genotype 1, subtypes 1a (75%) and 1b (8.3%), and two were of genotype 3, subtype 3a (16.7%).

Prevalence and genotyping of hepatitis C virus in blood donors in the state of Pará, Northern Brazil

Given the scarcity of epidemiological information on hepatitis C virus (HCV) infection in Northern Brazil, we determined the prevalence and genotypic frequency in blood donors in the state of Pará (PA). Blood samples from all of the blood donors at the Fundação HEMOPA (blood bank of PA) from 2004-2006 were screened for the presence of antibodies to anti-HCV and samples seroreactive to anti-HCV were further tested for HCV RNA using real-time PCR. In total, 116 HCV-RNA samples were genotyped, based on maximum likelihood phylogenetic analyses, using BioEdit, Modelgenerator, PHYML and FigTree software. The population consisted of 242,726 volunteers who donated blood from 2004-2006; the most common subgroup was males between the ages of 18-29 years old (37.30%). Within the whole group, 1,112 blood donors (0.46%) had indeterminate or positive serology; among these, 28.78% were males whose ages ranged from 18-29 years. A diagnosis of chronic HCV infection was confirmed for 304 donors (60.20% males; 66.45% were 30-49 years old), resulting in a prevalence of HCV RNA in 0.13% of the samples (304 of 242,726). HCV genotyping revealed a high frequency of genotype 1 (108/116) followed by genotype 3 (8/116). This study found HCV infection to be relatively infrequent in PA; genotype 1 was most commonly isolated. This information can help guide prevention and control policies aimed at efficient diagnosis and control measures.

Correlation of biological serum markers with the degree of hepatic fibrosis and necroinflammatory activity in hepatitis C and schistosomiasis patients

Liver biopsy is the gold-standard method to stage fibrosis; however, it is an invasive procedure and is potentially dangerous. The main objective of this study was to evaluate biological markers, such as cytokines IL-13, IFN-γ, TNF-α and TGF-β, platelets, bilirubins (Bil), alanine aminotransferase (ALT) and aspartate aminotransferase (AST), total proteins, γ-glutamil transferase (γ-GT) and alkaline phosphatase (AP), that could be used to predict the severity of hepatic fibrosis in schistosomiasis and hepatitis C (HC) as isolated diseases or co-infections. The following patient groups were selected: HC (n = 39), HC/hepatosplenic schistosomiasis (HSS) (n = 19), HSS (n = 22) and a control group (n = 13). ANOVA and ROC curves were used for statistical analysis. P < 0.05 was considered significant. With HC patients we showed that TNF-α (p = 0.020) and AP (p = 0.005) could differentiate mild and severe fibrosis. With regard to necroinflammatory activity, AST (p = 0.002), γ-GT (p = 0.034) and AP (p = 0.001) were the best markers to differentiate mild and severe activity. In HC + HSS patients, total Bil (p = 0.008) was capable of differentiating between mild and severe fibrosis. In conclusion, our study was able to suggest biological markers that are non-invasive candidates to evaluate fibrosis and necroinflammatory activity in HC and HC + HSS.

A transient increase in total head phosphotyrosine levels is observed upon the emergence of Aedes aegypti from the pupal stage

Phosphorylation and dephosphorylation of protein tyrosine residues constitutes a major biochemical regulatory mechanism for the cell. We report a transient increase in the total tyrosine phosphorylation of the Aedes aegypti head during the first days after emergence from the pupal stage. This correlates with an initial reduction in total head protein tyrosine phosphatase (PTP) activity. Similarly, phosphotyrosine (pTyr)-containing bands are seen in extracts prepared from both male and female heads and are spread among a variety of structures including the antennae, proboscis and the maxillary palps combined with the proboscis. Also, mosquitoes treated with sodium orthovanadate, a classical PTP inhibitor, show reduced blood-feeding activity and higher head tyrosine phosphorylation levels. These results suggest that pTyr-mediated signalling pathways may play a role in the initial days following the emergence of the adult mosquito from the pupal stage.

Influence of GB virus C on IFN-γ and IL-2 production and CD38 expression in T lymphocytes from chronically HIV-infected and HIV-HCV-co-infected patients

This study was designed to assess the effect of GB virus (GBV)-C on the immune response to human immunodeficiency virus (HIV) in chronically HIV-infected and HIV- hepatitis C virus (HCV)-co-infected patients undergoing antiretroviral therapy. A cohort of 159 HIV-seropositive patients, of whom 52 were HCV-co-infected, was included. Epidemiological data were collected and virological and immunological markers, including the production of interferon gamma (IFN-γ) and interleukin (IL)-2 by CD4, CD8 and Tγδ cells and the expression of the activation marker, CD38, were assessed. A total of 65 patients (40.8%) presented markers of GBV-C infection. The presence of GBV-C did not influence HIV and HCV replication or TCD4 and TCD8 cell counts. Immune responses, defined by IFN-γ and IL-2 production and CD38 expression did not differ among the groups. Our results suggest that neither GBV-C viremia nor the presence of E2 antibodies influence HIV and HCV viral replication or CD4 T cell counts in chronically infected patients. Furthermore, GBV-C did not influence cytokine production or CD38-driven immune activation among these patients. Although our results do not exclude a protective effect of GBV-C in early HIV disease, they demonstrate that this effect may not be present in chronically infected patients, who represent the majority of patients in outpatient clinics.

A single nucleotide polymorphism, rs129679860, in the IL28B locus is associated with the viral kinetics and a sustained virological response in a chronic, monoinfected hepatitis C virus genotype-1 Brazilian population treated with pegylated interferon-ribavirin

Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the interleukin (IL)28B locus have been associated with a sustained virological response (SVR) in interferon-ribavirin (IFN-RBV)-treated chronic hepatitis C virus (HCV)-infected patients in European and African populations. In this study, the genotype frequency of two IL28B SNPs (rs129679860 and rs8099917) in a cohort of chronic HCV-monoinfected patients in Brazil was evaluated and the SNP sufficient to predict the treatment response outcome was determined. A total of 66 naïve genotype-1 chronic HCV-infected patients were genotyped and the associated viral kinetics and SVR were assessed. The overall SVR was 38%. Both the viral kinetics and SVR were associated with rs129679860 genotypes (CC = 62% vs. CT = 33% vs. TT = 18%, p = 0.016). However, rs8099917 genotypes were only associated with SVR (TT = 53% vs. TG = 33% vs. GG = 18%; p = 0.032). In this population, the analysis of a single SNP, rs12979860, successfully predicts SVR in the IFN-RBV treatment of HCV.

Increased frequency of micronuclei in the lymphocytes of patients chronically infected with hepatitis B or hepatitis C virus

In this study, we analysed the frequency of micronuclei (MN), nucleoplasmic bridges (NPBs) and nuclear buds (NBUDs) and evaluated mutagen-induced sensitivity in the lymphocytes of patients chronically infected with hepatitis B virus (HBV) or hepatitis C virus (HCV). In total, 49 patients with chronic viral hepatitis (28 HBV-infected and 21 HCV-infected patients) and 33 healthy, non-infected blood donor controls were investigated. The frequencies (‰) of MN, NPBs and NBUDs in the controls were 4.41 ± 2.15, 1.15 ± 0.97 and 2.98 ± 1.31, respectively. The frequencies of MN and NPBs were significantly increased (p < 0.0001) in the patient group (7.01 ± 3.23 and 2.76 ± 2.08, respectively) compared with the control group. When considered separately, the HBV-infected patients (7.18 ± 3.57) and HCV-infected patients (3.27 ± 2.40) each had greater numbers of MN than did the controls (p < 0.0001). The HCV-infected patients displayed high numbers of NPBs (2.09 ± 1.33) and NBUDs (4.38 ± 3.28), but only the HBV-infected patients exhibited a significant difference (NPBs = 3.27 ± 2.40, p < 0.0001 and NBUDs = 4.71 ± 2.79, p = 0.03) in comparison with the controls. Similar results were obtained for males, but not for females, when all patients or the HBV-infected group was compared with the controls. The lymphocytes of the infected patients did not exhibit sensitivity to mutagen in comparison with the lymphocytes of the controls (p = 0.06). These results showed that the lymphocytes of patients who were chronically infected with HBV or HCV presented greater chromosomal instability.

Study of the combined radial post-feeding dispersion of the blowflies Chrysomya megacephala (Fabricius) and C. albiceps (Wiedemann) (Diptera, Calliphoridae)

Blowflies use discrete and ephemeral substrates to feed their larvae. After they run out of food, the larvae begin to disperse in order to find adequate places for pupation or additional food sources, a process named post-feeding larval dispersion. Some important aspects of this process were studied in a circular arena allowing the combined radial post-feeding dispersion from the center of the arena of C. albiceps and C. megacephala larvae. To determine the location of each pupa, the arena was divided in 72 identical sections starting from the center. The distance from the center, the depth and weight of each pupa were evaluated. Statistical tests were done to verify the relation between weight, depth and distance for pupation. From the total an average of 976 larvae released (488 for each species) were collected considering both experiments 456 C. megacephala pupae and 488 of C. albiceps. This demonstrates that C. albiceps probably preyed on 32 C. megacephala larvae during post-feeding dispersion. The study of this dispersion process can be used to estimate the postmortem interval (PMI) of human cadavers in legal medicine.

Culturas de cobertura, acúmulo de nitrogênio total no solo e produtividade de milho

A associação de preparos conservacionistas com culturas de cobertura é importante estratégia de melhoria da qualidade do solo. Quando leguminosas são utilizadas, verifica-se incremento na disponibilidade de nitrogênio (N) para a primeira cultura em sucessão (efeito imediato). Todavia, o uso de leguminosas por vários anos pode se refletir no incremento da capacidade do solo em suprir N (efeito residual). Com o objetivo de distinguir o efeito residual do efeito imediato do uso de culturas de cobertura foi realizada esta pesquisa. Utilizou-se um experimento de longa duração (1985 a 1995) instalado na Estação Experimental Agronômica da UFRGS, RS. O delineamento experimental foi o de blocos casualizados com parcelas subsubdivididas e três repetições. As parcelas principais incluíram três sistemas de preparo: convencional, reduzido e direto; as subparcelas abrangeram três sistemas de cultura: aveia/milho (A/M), aveia + ervilhaca/milho (A + E/M) e aveia + ervilhaca/milho+caupi (A + E/M + C) e as subsubparcelas doses de N. O solo da área experimental é um Podzólico Vermelho-Escuro. No ano desta pesquisa (1995), os sistemas de cultura utilizados foram aveia/milho, ervilhaca/milho e aveia + ervilhaca/milho. Visando avaliar o efeito residual do uso de culturas de cobertura, um segmento da parcela foi mantido descoberto durante o inverno que antecedeu o cultivo do milho. A associação de preparos conservacionistas (reduzido e direto) com o uso de leguminosas aumentou o estoque de N total na camada superficial do solo. O efeito residual das leguminosas no sistema A + E/M + C promoveu incrementos de 26 e 19% na quantidade de N absorvido e rendimento de grãos, respectivamente, em relação ao histórico de uso de A/M. Contudo, a presença de resíduos de ervilhaca ainda foi a principal responsável pelo fornecimento de N ao milho (efeito imediato).

Importância das espécies minerais no potássio total da fração argila de solos do Triângulo Mineiro

Poucos trabalhos relacionam a reserva de K em solos desenvolvidos sob clima tropical úmido com os minerais presentes na fração argila. Com esse propósito, coletaram-se amostras de 19 solos no Triângulo Mineiro, originados de diferentes materiais de origem e estádios de desenvolvimento. Dada a significativa ocorrência, tomou-se maior número de amostras no Grupo Bauru, abrangendo todas as formações geológicas encontradas na região. Os teores totais de K foram determinados após digestão das amostras de terra fina e das frações areia, silte e argila com ácidos concentrados (HF, HNO3 e H2SO4). Para avaliar a contribuição de cada espécie mineral nos teores totais de K, amostras da fração argila saturadas por Na foram submetidas a extrações seqüenciais e seletivas de minerais, na seguinte ordem: extração de Al e óxidos de Fe de baixa cristalinidade; extração de óxidos de Fe mais cristalinos; extração de gibbsita e caulinita; extração de minerais do tipo 2:1; extração de feldspatos e minerais resistentes. A composição mineralógica da fração argila refletiu o intenso grau de intemperismo e lixiviação dos solos do Triângulo Mineiro, com baixos teores de minerais de baixa cristalinidade, predomínio de caulinita e presença de outros minerais secundários resistentes. Mesmo com essa mineralogia, a fração argila apresentou o maior teor de K total, principalmente para os solos mais intemperizados. Considerando a abundância de caulinita na fração argila, este mineral foi uma importante fonte de formas não-trocáveis do nutriente. Por outro lado, a contribuição dos óxidos de Fe e de Al de baixa cristalinidade e dos óxidos de Fe mais cristalinos nos teores totais de K da fração argila foi inexpressiva. Em geral, os minerais primários facilmente intemperizáveis (mica e feldspato) contribuíram em grande proporção para o K total da fração argila, principalmente para os solos mais jovens desenvolvidos de arenito da Formação Uberaba, migmatito/micaxisto do Grupo Araxá e basalto da Formação Serra Geral.

Comparação de métodos de determinação de carbono orgânico total no solo

O teor de C orgânico total do solo (COT) pode ser determinado por métodos que se baseiam nos princípios de combustão a seco e combustão úmida. Ambos apresentam inconvenientes, principalmente o de combustão úmida, que exige grande quantidade de reagentes, gerando, por conseqüência, alta quantidade de resíduos tóxicos que contêm Cr. O método denominado Mebius no bloco de digestão (Mebius no bloco) permite a diminuição do uso de dicromato de potássio em análises de solo. Nesse sentido, o presente estudo objetivou verificar a precisão e exatidão do método Mebius no bloco em relação a outros de combustão úmida e o de combustão a seco. O trabalho foi realizado na Universidade Federal de Santa Maria, em duas etapas: os teores de COT foram determinados em 18 amostras de duas camadas (0-5 e 5-10 cm) de um Latossolo Vermelho distrófico típico com diferentes usos. Os métodos usados foram Walkley-Black, Mebius modificado, Mebius no bloco e por captura de CO2; os teores de COT foram determinados por combustão a seco e Mebius no bloco em 75 amostras coletadas nos horizontes A1 (0-7,5 e 7,5-15 cm), A2, E e Bt de um Argissolo Vermelho-Amarelo distrófico abrúptico submetido a cinco sistemas de manejo e três repetições. A precisão apresentada pelos métodos de combustão úmida é similar e com coeficiente de variação abaixo de 10 %, com exceção do método de captura de CO2, que apresentou valores de COT inferiores aos dos demais e com maior coeficiente de variação. O método Mebius no bloco permite processar maior número de amostras por tempo, com menor consumo de reagentes, e seus resultados apresentam boa precisão (coeficiente de variação menor que 2,60 %) entre os métodos de combustão úmida testados. Um fator de correção de 1,14 deverá ser aplicado aos resultados obtidos pelo método Mebius no bloco para equivaler aos obtidos por combustão a seco (analisador elementar de carbono).

Carbono orgânico, nitrogênio total, biomassa e atividade microbiana do solo em duas cronosseqüências de reabilitação após a mineração de bauxita

A mineração é uma das atividades antrópicas que causa grande impacto nos ecossistemas e o grau de degradação depende da intensidade de interferência no solo, do volume explorado e do rejeito produzido. Os microrganismos do solo e sua atividade, por participarem de funções-chave, podem fornecer indicações sobre o real estado de reabilitação de áreas mineradas. O objetivo deste trabalho foi avaliar o impacto da atividade de mineração em duas cronosseqüências com diferentes estratégias (revegetação) de reabilitação em solos de área de mineração de bauxita sobre diversos atributos: C de compostos orgânicos (CO), N total do solo (Nt), biomassa microbiana, atividade enzimática e respiração do solo. O estudo foi desenvolvido em áreas pertencentes a Alcoa S/A, em dois ambientes distintos: (a) em áreas com vegetação típica de campo, predominantemente herbácea, em altitude inferior a 1.000 m, e (b) em áreas de montanhas, no topo do planalto, incluindo remanescentes de cobertura vegetal nativa representada por floresta subtropical subcaducifólia, a uma altitude de 1.600 m, denominadas serra, com características diferenciadas quanto à estratégia e ao tempo de reabilitação, variando de áreas recém-mineradas à áreas com 19 anos de reabilitação. Coletaram-se amostras compostas com três repetições em oito áreas no campo e nove na serra, em duas profundidades (0-10 e 10-20 cm), no inverno e verão. A mineração de bauxita provocou grande impacto nos atributos estudados, causando reduções nos seus valores de até 99 %. Tanto no campo como na serra, os teores de CO, de Nt, a biomassa microbiana e a atividade enzimática aumentaram com as diferentes estratégias de reabilitação. Entretanto a resposta dos atributos estudados foi diferenciada em função do tempo de reabilitação. A biomassa microbiana e a atividade enzimática apresentaram recuperação muito rápida, atingindo valores semelhantes aos das áreas de referência a partir do primeiro ano, enquanto para o CO e o Nt estes só foram alcançados de modo consistente em períodos mais longos de reabilitação (18 anos). O coeficiente metabólico (qCO2) foi indicativo do estresse provocado pela mineração, mas não diferenciou os diferentes tempos de reabilitação. Os resultados deste estudo mostram que os atributos essenciais ao funcionamento adequado do solo são recuperáveis pela revegetação.

Fracionamento químico e físico do carbono orgânico total em um solo de mata submetido a diferentes usos

A matéria orgânica é um importante indicador da qualidade do solo, pois está relacionada com diversas propriedades químicas, físicas e biológicas, sendo importante o conhecimento do teor de C orgânico total (COT), bem como de suas frações. Com base nisso, realizou-se esta pesquisa objetivando caracterizar e quantificar os estoques de COT e suas frações como indicadores da qualidade de um solo, submetido a diferentes usos: (1) Mata Atlântica, (2) Cacau (Theobroma cacao) e (3) Pastagem (Brachiaria decumbens), em uma microbacia no sul da Bahia. Para cada uso, coletaram-se amostras nas profundidades de 0-10 e 10-20 cm e procedeu-se à caracterização química e física do solo, à determinação do COT e ao seu fracionamento químico e físico. O teor de COT não diferiu entre os diferentes usos do solo nas duas profundidades estudadas. A percentagem de C humificado e nas frações de ácidos fúlvicos e humina foi maior na pastagem, na camada de 0-10 cm. Houve menor percentagem de C não-humificado nos sistemas cacau e pastagem, e maior relação C:N no sistema pastagem na camada de 10-20 cm. O sistema cacau promoveu aumento na quantidade de C orgânico na fração leve na camada de 10-20 cm. A substituição da mata pelo cultivo do cacau no sistema cabruca (sub-bosque) ou pela pastagem não alterou os teores de COT e de suas frações na área estudada.

Total lipid and fatty acid accumulation during basidiospore formation in the ectomycorrhizal fungus Pisolithus sp.

The basidiospores of Pisolithus sp. contain large amounts of lipids, indicating provision for future germination in the host rhizosphere. However, the accumulation, composition, and mobilization of lipids during formation and germination of these spores are largely unknown. In this study, lipid storage and fatty acid composition during basidiosporogenesis were analyzed in fresh basidiocarps using bright-field microscopy and gas chromatography. Abundant lipid bodies are found in the hyphae, basidia, and basidiospores of fungal basidiocarps. This evidences a considerable C transport in the basidiocarp to meet the C demand during basidiospore formation. Fatty acid composition analysis revealed the presence of 24 compounds with chains of 9 to 18 C atoms, either saturated or insaturated, with one or two insaturations. The fatty acid composition and content varied according to the developmental stage of the peridioles. In free basidiospores, the predominant compounds were 16:0, 16:1w5c, 18:1w9c, and 18:2w6,9c/18:0ante, at concentrations of 76, 46, 192, and 51 µg g-1 dry matter, respectively. Our results indicate that oleic acid is the major constituent of lipid reserves in Pisolithus sp. basidiospores. Further studies are being conducted to determine the factors that induce lipid mobilization during spore germination.