Disparity between Multilocus Enzyme Electrophoresis, Microsatellite Markers and Pulsed-Field Gel Electrophoresis in epidemiological tracking of Candida albicans

Various molecular systems are available for epidemiological, genetic, evolutionary, taxonomic and systematic studies of innumerable fungal infections, especially those caused by the opportunistic pathogen C. albicans. A total of 75 independent oral isolates were selected in order to compare Multilocus Enzyme Electrophoresis (MLEE), Electrophoretic Karyotyping (EK) and Microsatellite Markers (Simple Sequence Repeats - SSRs), in their abilities to differentiate and group C. albicans isolates (discriminatory power), and also, to evaluate the concordance and similarity of the groups of strains determined by cluster analysis for each fingerprinting method. Isoenzyme typing was performed using eleven enzyme systems: Adh, Sdh, M1p, Mdh, Idh, Gdh, G6pdh, Asd, Cat, Po, and Lap (data previously published). The EK method consisted of chromosomal DNA separation by pulsed-field gel electrophoresis using a CHEF system. The microsatellite markers were investigated by PCR using three polymorphic loci: EF3, CDC3, and HIS3. Dendrograms were generated by the SAHN method and UPGMA algorithm based on similarity matrices (S(SM)). The discriminatory power of the three methods was over 95%, however a paired analysis among them showed a parity of 19.7-22.4% in the identification of strains. Weak correlation was also observed among the genetic similarity matrices (S(SM)(MLEE) x S(SM)(EK) x S(SM)(SSRs)). Clustering analyses showed a mean of 9 +/- 12.4 isolates per cluster (3.8 +/- 8 isolates/taxon) for MLEE, 6.2 +/- 4.9 isolates per cluster (4 +/- 4.5 isolates/taxon) for SSRs, and 4.1 +/- 2.3 isolates per cluster (2.6 +/- 2.3 isolates/taxon) for EK. A total of 45 (13%), 39(11.2%), 5 (1.4%) and 3 (0.9%) clusters pairs from 347 showed similarity (Si) of 0.1-10%, 10.1-20%, 20.1-30% and 30.1-40%, respectively. Clinical and molecular epidemiological correlation involving the opportunistic pathogen C. albicans may be attributed dependently of each method of genotyping (i.e., MLEE, EK, and SSRs) supplemented with similarity and grouping analysis. Therefore, the use of genotyping systems that give results which offer minimum disparity, or the combination of the results of these systems, can provide greater security and consistency in the determination of strains and their genetic relationships. (C) 2010 Elsevier B.V. All rights reserved.

A proposed neural control for the trajectory tracking of a nonholonomic mobile robot with disturbances

In this paper, a trajectory tracking control problem for a nonholonomic mobile robot by the integration of a kinematic neural controller (KNC) and a torque neural controller (TNC) is proposed, where both the kinematic and dynamic models contains disturbances. The KNC is a variable structure controller (VSC) based on the sliding mode control theory (SMC), and applied to compensate the kinematic disturbances. The TNC is a inertia-based controller constituted of a dynamic neural controller (DNC) and a robust neural compensator (RNC), and applied to compensate the mobile robot dynamics, and bounded unknown disturbances. Stability analysis with basis on Lyapunov method and simulations results are provided to show the effectiveness of the proposed approach. © 2012 Springer-Verlag.

IFTrace: Video segmentation of deformable objects using the Image Foresting Transform

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Principais normas e recomendações existentes para o controle de vibrações provocadas pelo uso de explosivos em áreas urbanas: parte II

As atividades que envolvem o uso de explosivos devem ser controladas, não só com relação ao desmonte de estruturas (rocha e outros materiais), mas também quanto a danos estruturais em edificações próximas (casas, edificações históricas, etc.) e outros impactos ambientais como vibração, propagação de ruídos, ultralançamentos e sobrepressão atmosférica. Tais atividades são regidas por normas técnicas que sugerem parâmetros de medição e limites definidos na avaliação de prováveis danos. No caso específico de minerações em áreas urbanas, a velocidade de vibração de partícula (Vp), normalmente expressa em mm/s, é o parâmetro que tem dado melhor correlação na avaliação de possíveis danos às estruturas civis, atribuídos às vibrações do terreno. As diferentes normas existentes apresentam valores de Vp que variam de 2mm/s para edifícios históricos até 150mm/s para construções em concreto armado. A maioria delas considera na avaliação de danos estruturais, além da velocidade, a freqüência da vibração. Algumas normas foram elaboradas com base em dados experimentais, analisando parâmetros como o tipo de construção e o material nela utilizados, outras se basearam apenas em valores empíricos, mas todas apresentam valores conservativos. A norma brasileira não avalia o parâmetro freqüência e não classifica os diferentes tipos de estruturas civis, restringindo-se ao valor resultante da velocidade de vibração como parâmetro medido, sendo, assim, limitada e deficiente em relação às normas internacionais. A coletânea aqui apresentada reuniu as normas nas Américas e em outros continentes, além de uma comparação com as normas européias mais importantes em âmbito mundial.

Um modelo de detecção de eventos em redes baseado no rastreamento de fluxos

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Controle de movimentos de pacientes paraplégicos utilizando modelos fuzzy T-S

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Influência da prática de atividades físicas sobre os gastos com o tratamento ambulatorial de pacientes da rede pública de Bauru, São Paulo

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Prática da atividade física e a prevalência de doenças cardio-metabólicas no estado de São Paulo

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

O jovem Milton Santos: personagem do protótipo metodológico : revelar [matrizes clássicas originárias] para definir [Vanguarda, Universalidade e viés geográfico]

Pós-graduação em Geografia - IGCE

Associações entre, índices fisiológicos e fadiga neuromuscular com padrões de deslocamento e desempenho do chute de finalização no futsal

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Caracterização do perfil dos pacientes em oxigenoterapia domiciliar em uma cidade do interior do estado de São Paulo

Pós-graduação em Enfermagem (mestrado profissional) - FMB

História de vida, concepções sobre a família, maternidade e práticas parentais de mães atendidas pelo judiciário por denúncia de negligência materna

Pós-graduação em Saúde Coletiva - FMB

Método de Taguchi aplicado a um processo de corte por fusão de um tecido sintético

A company must have full knowledge and control of its operations so as to meet the market requirements and meet their production goals. Thus this paper uses the Taguchi method to extend the operational control of a cutting process by fusion of a synthetic fabric in the longitudinal direction. For process analysis and tracking of possible causes of the problem techniques of Production Engineering as the cause and effect diagram, also known as Ishikawa diagram, and design of experiments were used, the last one was applied to the design techniques of Taguchi. Finally the preparation method of understanding and design of experiment was due to the use of the software MINITAB v15 ®, which showed that the speed of rolling the fabric after cutting is crucial for controlling the entire operation

Ergonomia de tablets em uso ocupacional: atividade visual e biomecânica postural sob a influência de ofuscamentos reflexivos causados pela iluminação

Pós-graduação em Design - FAAC

Metabolomics method to comprehensively analyze amino acids in different domains

Amino acids play essential roles in both metabolism and the proteome. Many studies have profiled free amino acids (FAAs) or proteins; however, few have connected the measurement of FAA with individual amino acids in the proteome. In this study, we developed a metabolomics method to comprehensively analyze amino acids in different domains, using two examples of different sample types and disease models. We first examined the responses of FAAs and insoluble-proteome amino acids (IPAAs) to the Myc oncogene in Tet21N human neuroblastoma cells. The metabolic and proteomic amino acid profiles were quite different, even under the same Myc condition, and their combination provided a better understanding of the biological status. In addition, amino acids were measured in 3 domains (FAAs, free and soluble-proteome amino acids (FSPAAs), and IPAAs) to study changes in serum amino acid profiles related to colon cancer. A penalized logistic regression model based on the amino acids from the three domains had better sensitivity and specificity than that from each individual domain. To the best of our knowledge, this is the first study to perform a combined analysis of amino acids in different domains, and indicates the useful biological information available from a metabolomics analysis of the protein pellet. This study lays the foundation for further quantitative tracking of the distribution of amino acids in different domains, with opportunities for better diagnosis and mechanistic studies of various diseases.