The STATFLUX code: a statistical method for calculation of flow and set of parameters, based on the Multiple-Compartment Biokinetical Model

The code STATFLUX, implementing a new and simple statistical procedure for the calculation of transfer coefficients in radionuclide transport to animals and plants, is proposed. The method is based on the general multiple-compartment model, which uses a system of linear equations involving geometrical volume considerations. Flow parameters were estimated by employing two different least-squares procedures: Derivative and Gauss-Marquardt methods, with the available experimental data of radionuclide concentrations as the input functions of time. The solution of the inverse problem, which relates a given set of flow parameter with the time evolution of concentration functions, is achieved via a Monte Carlo Simulation procedure.Program summaryTitle of program: STATFLUXCatalogue identifier: ADYS_v1_0Program summary URL: http://cpc.cs.qub.ac.uk/summaries/ADYS_v1_0Program obtainable from: CPC Program Library, Queen's University of Belfast, N. IrelandLicensing provisions: noneComputer for which the program is designed and others on which it has been tested: Micro-computer with Intel Pentium III, 3.0 GHzInstallation: Laboratory of Linear Accelerator, Department of Experimental Physics, University of São Paulo, BrazilOperating system: Windows 2000 and Windows XPProgramming language used: Fortran-77 as implemented in Microsoft Fortran 4.0. NOTE: Microsoft Fortran includes non-standard features which are used in this program. Standard Fortran compilers such as, g77, f77, ifort and NAG95, are not able to compile the code and therefore it has not been possible for the CPC Program Library to test the program.Memory, required to execute with typical data: 8 Mbytes of RAM memory and 100 MB of Hard disk memoryNo. of bits in a word: 16No. of lines in distributed program, including test data, etc.: 6912No. of bytes in distributed Program, including test data, etc.: 229 541Distribution format: tar.gzNature of the physical problem: the investigation of transport mechanisms for radioactive substances, through environmental pathways, is very important for radiological protection of populations. One such pathway, associated with the food chain, is the grass-animal-man sequence. The distribution of trace elements in humans and laboratory animals has been intensively studied over the past 60 years [R.C. Pendlenton, C.W. Mays, R.D. Lloyd, A.L. Brooks, Differential accumulation of iodine-131 from local fallout in people and milk, Health Phys. 9 (1963) 1253-1262]. In addition, investigations on the incidence of cancer in humans, and a possible causal relationship to radioactive fallout, have been undertaken [E.S. Weiss, M.L. Rallison, W.T. London, W.T. Carlyle Thompson, Thyroid nodularity in southwestern Utah school children exposed to fallout radiation, Amer. J. Public Health 61 (1971) 241-249; M.L. Rallison, B.M. Dobyns, F.R. Keating, J.E. Rall, F.H. Tyler, Thyroid diseases in children, Amer. J. Med. 56 (1974) 457-463; J.L. Lyon, M.R. Klauber, J.W. Gardner, K.S. Udall, Childhood leukemia associated with fallout from nuclear testing, N. Engl. J. Med. 300 (1979) 397-402]. From the pathways of entry of radionuclides in the human (or animal) body, ingestion is the most important because it is closely related to life-long alimentary (or dietary) habits. Those radionuclides which are able to enter the living cells by either metabolic or other processes give rise to localized doses which can be very high. The evaluation of these internally localized doses is of paramount importance for the assessment of radiobiological risks and radiological protection. The time behavior of trace concentration in organs is the principal input for prediction of internal doses after acute or chronic exposure. The General Multiple-Compartment Model (GMCM) is the powerful and more accepted method for biokinetical studies, which allows the calculation of concentration of trace elements in organs as a function of time, when the flow parameters of the model are known. However, few biokinetics data exist in the literature, and the determination of flow and transfer parameters by statistical fitting for each system is an open problem.Restriction on the complexity of the problem: This version of the code works with the constant volume approximation, which is valid for many situations where the biological half-live of a trace is lower than the volume rise time. Another restriction is related to the central flux model. The model considered in the code assumes that exist one central compartment (e.g., blood), that connect the flow with all compartments, and the flow between other compartments is not included.Typical running time: Depends on the choice for calculations. Using the Derivative Method the time is very short (a few minutes) for any number of compartments considered. When the Gauss-Marquardt iterative method is used the calculation time can be approximately 5-6 hours when similar to 15 compartments are considered. (C) 2006 Elsevier B.V. All rights reserved.

Multiple-trait genomic evaluation for milk yield and milk quality traits using genomic and phenotypic data in buffalo in Brazil

The use of markers distributed all long the genome may increase the accuracy of the predicted additive genetic value of young animals that are candidates to be selected as reproducers. In commercial herds, due to the cost of genotyping, only some animals are genotyped and procedures, divided in two or three steps, are done in order to include these genomic data in genetic evaluation. However, genomic evaluation may be calculated using one unified step that combines phenotypic data, pedigree and genomics. The aim of the study was to compare a multiple-trait model using only pedigree information with another using pedigree and genomic data. In this study, 9,318 lactations from 3061 buffaloes were used, 384 buffaloes were genotyped using a Illumina bovine chip (Illumina Infinium (R) bovineHD BeadChip). Seven traits were analyzed milk yield (MY), fat yield (FY), protein yield (PY), lactose yield (LY), fat percentage (F%), protein percentage (P%) and somatic cell score (SCSt). Two analyses were done: one using phenotypic and pedigree information (matrix A) and in the other using a matrix based in pedigree and genomic information (one step, matrix H). The (co) variance components were estimated using multiple-trait analysis by Bayesian inference method, applying an animal model, through Gibbs sampling. The model included the fixed effects of contemporary groups (herd-year-calving season), number of milking (2 levels), and age of buffalo at calving as (co) variable (quadratic and linear effect). The additive genetic, permanent environmental, and residual effects were included as random effects in the model. The heritability estimates using matrix A were 0.25, 0.22, 0.26, 0.17, 0.37, 0.42 and 0.26 and using matrix H were 0.25, 0.24, 0.26, 0.18, 0.38, 0.46 and 0.26 for MY, FY, PY, LY, % F, % P and SCCt, respectively. The estimates of the additive genetic effect for the traits were similar in both analyses, but the accuracy were bigger using matrix H (superior to 15% for traits studied). The heritability estimates were moderated indicating genetic gain under selection. The use of genomic information in the analyses increases the accuracy. It permits a better estimation of the additive genetic value of the animals.

Is global workspace a cartesian theater? How the neuro-astroglial interaction model solves conceptual issues

The Global Workspace Theory (GWT) proposed by Bernard Baars (1988) along with Daniel Dennett’s (1991) Multiple Drafts Model (MDM) of consciousness are renowned cognitive theories of consciousness bearing similarities and differences. Although Dennett displays sympathy for GWT, his own MDM does not seem to be fully compatible with it. This work discusses this compatibility, by asking if GWT suffers from Daniel Dennett’s criticism of what he calls a “Cartesian Theater”. We identified in Dennett 10 requirements for avoiding the Cartesian Theater. We believe that some of these requirements are violated by GWT, but not all, hence there is partial incompatibility with MDM, and it is nonsense to answer if GWT is or is not a Cartesian Theater. However, by asking such question we conclude that the issues around this discussion involve fuzzy claims about degrees of consciousness and we show how the Neuro-Astroglial Interaction Model (NAIM) is fit for solving such conceptual issues.

Genetic parameters for first lactation test-day milk flow in Holstein cows

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Genetic parameter estimates for buffalo milk yield, milk quality and mozzarella production and Bayesian inference analysis of their relationships

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Relevância do estado de hidratação na interpretação de parâmetros nutricionais em diálise peritoneal

OBJETIVO: Identificar determinantes do estado de hidratação de pacientes em diálise peritoneal crônica, bem como investigar os efeitos da sobrecarga líquida sobre o estado nutricional. MÉTODOS: Foi feito estudo transversal, realizado em 2006, avaliando 27 pacientes em diálise peritoneal crônica, acompanhados no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu (SP), quanto a parâmetros clínicos, dialíticos, laboratoriais, antropométricos e de bioimpedância elétrica. Para avaliar a influência de parâmetros sobre o estado de hidratação empregou-se modelo de regressão linear múltipla. A amostra foi estratificada quanto ao estado de hidratação pela relação entre água extracelular e água corporal total (0,47 para homens e 0,52 para mulheres), parâmetros obtidos por meio de bioimpedância elétrica. Comparações foram realizadas por análise de covariância, Mann-Whitney, Qui-quadrado ou teste exato de Fisher. Considerou-se significância estatística quando p≤0,05. RESULTADOS: Pacientes com maior volume urinário e em modalidade dialítica automatizada apresentaram melhor estado de hidratação. Pacientes com maior sobrecarga líquida, comparados àqueles com menor sobrecarga, apresentaram menor ângulo de fase (M=4,2, DP=0,9 vs M=5,7, DP=0,7º; p=0,006), menor albumina (M=3,06, DP=0,46 vs M=3,55, DP=0,52g/dL; p=0,05) e maior % prega cutânea tricipital (M=75,3, DP=36,9 vs M=92,1, DP=56,9%; p=0,058), sem outras evidências antropométricas. CONCLUSÃO: Pode-se sugerir que os níveis reduzidos de albumina e ângulo de fase nos pacientes com maior sobrecarga líquida não estiveram relacionados a pior estado nutricional. Para o diagnóstico nutricional em vigência de sobrecarga líquida, deve-se considerar o conjunto de variáveis obtidas por diversos métodos, buscando relacioná-las e interpretá-las de maneira abrangente, possibilitando um diagnóstico nutricional fidedigno.

Fatores de risco para macrossomia fetal em gestações complicadas por diabete ou por hiperglicemia diária

OBJETIVO: identificar fatores de risco para a macrossomia fetal na população de gestantes portadoras de diabete ou hiperglicemia diária. MÉTODOS: estudo retrospectivo, tipo caso-controle, incluindo 803 pares de mães e recém-nascidos desta população específica, distribuídos em dois grupos: macrossômicos (casos, n=242) e não macrossômicos (controles, n=561). Foram comparadas variáveis relativas à idade, paridade, peso e índice de massa corporal (IMC), ganho de peso (GP), antecedentes de diabete, hipertensão arterial e tabagismo, tipo e classificação do diabete e indicadores do controle glicêmico no terceiro trimestre. As médias foram avaliadas pelo teste F e as variáveis categorizadas foram submetidas à análise univariada, utilizando-se o teste do chi². Os resultados significativos foram incluídos no modelo de regressão múltipla, para identificação do risco independente de macrossomia, considerando-se OR, IC 95% e valor de p. Para todas as análises foi estabelecido o limite de significância estatística de 5% (p<0,05). RESULTADOS: observou-se associação significativa entre macrossomia e GP maior que 16 kg, IMC >25 kg/m², antecedentes pessoais, obstétricos e, especificamente, o de macrossomia, classificação nos grupos de Rudge (IB e IIA + IIB), média glicêmica (MG) >120 mg/dL e média de glicemia pós-prandial >130 mg/dL no terceiro trimestre. Na análise de regressão múltipla, o GP >16 kg (OR=1,79; IC 95%: 1,23-1,60), o IMC >25 kg/m² (OR=1,83; IC 95%: 1,27-2,64), o antecedente pessoal de diabete (OR=1,56; IC 95%: 1,05-2,31) e de macrossomia (OR=2,37; IC 95%: 1,60-3,50) e a MG >120 mg/dL no terceiro trimestre (OR=1,78; IC 95%: 1,13-2,80) confirmaram risco independente para macrossomia nestas gestações de risco. CONCLUSÃO: o GP superior a 16 kg, o IMC maior ou igual a 25 kg/m², a MG superior a 120 mg/dL no terceiro trimestre e a presença de antecedentes pessoais de diabete ou de macrossomia foram identificados como fatores de risco para macrossomia fetal em gestantes portadoras de diabete ou de hiperglicemia diária.

Fator de correção para indivíduos com capacidade acomodativa baseado no uso do refrator automático

OBJETIVO: Pesquisar um fator de correção para avaliação do erro refrativo sem a utilização da cicloplegia. MÉTODOS: Foram estudados 623 pacientes (1.246 olhos), de ambos os sexos, com idade entre 3 e 40 anos. As refratometrias estática e dinâmica foram obtidas usando-se o refrator automático Shin-Nippon Accuref-K 9001. A cicloplegia foi obtida com a instilação de uma gota de colírio ciclopentolato a 1%, com refratometria estática 30 minutos após. Os dados foram submetidos à análise estatística usando a técnica do modelo de regressão linear e modelo de regressão múltipla do valor dióptrico com e sem cicloplegia, em função da idade. RESULTADOS: A correlação entre valores dióptricos sem e com cicloplegia quanto ao erro astigmático variou de 81,52% a 92,27%. Quanto ao valor dióptrico esférico, a correlação foi menor (53,57% a 87,78%). O mesmo se observou em relação ao eixo do astigmatismo (28,86% a 58,80%). O modelo de regressão múltipla em função da idade mostrou coeficiente de determinação múltiplo maior para a miopia (86,38%) e astigmatismo (79,79%). O menor coeficiente foi observado para o eixo do astigmatismo (17,70%). CONCLUSÃO: Avaliando-se os erros refrativos com e sem cicloplegia, observou-se alta correlação nas ametropias cilíndricas. Foram desenvolvidas equações matemáticas como fator de correção para refratometrias dos pacientes sem cicloplegia, portadores de ametropias cilíndricas e esféricas.

Inatividade física e fatores associados em adultos, São Paulo, Brasil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Clavulanic acid production processes in a tower bioreactor with immobilised cells

The feasibility of using Streptomyces clavuligerus ATCC 27064 bioparticles supported on alginate gel containing alumina to produce clavulanic acid (CA) was investigated. To this end, effectiveness factors for spherical bioparticles, relating respiration rates of immobilised and free cells, were experimentally determined for various dissolved oxygen (DO) levels and bioparticle radii. Monod kinetics was assumed as representative of the oxygen consuming reaction, while internal oxygen diffusion was considered the limiting step. A comparison was made of the results from a tower bioreactor operating under batch, repeated-batch and continuous conditions with immobilised bioparticles. The theoretical curve of the effectiveness factor for the zero-order reaction model, considering an inert nucleus - the dead core model - was very well fitted to the experimental data. The results of the bioprocess indicated that the batch operation was the most efficient and productive, requiring a do concentration in the reactor above 60% of the saturation value. (C) 2007 Elsevier B.V. All rights reserved.

Determination of hydrochlorothiazide in pharmaceutical formulations by diffuse reflectance spectroscopy

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

The role of matrix effects on the quantification of abscisic acid and its metabolites in the leaves of Bauhinia variegata L. using liquid chromatography combined with tandem mass spectrometry

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Utilização de medicamentos e fatores associados: um estudo de base populacional no Município de Campinas, São Paulo, Brasil

Este artigo analisa a prevalência da utilização de medicamentos segundo variáveis demográficas, socioeconômicas e de comportamentos relacionados à saúde, identificando fatores associados ao uso por meio de estudo transversal de base populacional, com 941 pessoas de 18 anos ou mais residentes em Campinas, São Paulo, Brasil. A amostragem foi realizada em múltiplos estágios, estratificada e por conglomerados. Utilizou-se o teste qui-quadrado, foram estimadas as razões de prevalência ajustadas por sexo e idade e os respectivos IC95%. Desenvolveu-se modelo de regressão múltipla de Poisson ficando associados ao uso: sexo feminino, idade de 40 anos e mais, morbidade referida nos últimos 15 dias e número de doenças crônicas. Os medicamentos mais consumidos foram para os sistemas cardiovascular e nervoso, e os fitoterápicos. A prevalência de uso de medicamentos em Campinas encontrou-se inferior à maioria dos estudos. Por meio de inquéritos de saúde locais espera-se conhecer o perfil de uso dos medicamentos pela população e garantir intervenções mais direcionadas para a Política de Assistência Farmacêutica.

Exposição ao ruído ocupacional como fator de risco para acidentes do trabalho

OBJETIVO: Verificar se a exposição ocupacional ao ruído é fator de risco relevante para acidentes do trabalho. MÉTODOS: Estudo de caso-controle de base populacional. Os dados foram coletados entre 16/5/2002 e 15/10/2002, na cidade de Botucatu, Estado de São Paulo. Os casos foram definidos como trabalhadores que sofreram acidentes ocupacionais típicos nos últimos 90 dias, identificados por intermédio de amostragem aleatória sistemática de domicílios residenciais. Os controles foram trabalhadores não acidentados, aleatoriamente alocados a partir da mesma população que originou os casos, emparelhados na razão 3:1 segundo sexo, faixa etária e setor censitário de moradia. Ajustou-se um modelo de regressão logística múltipla, tendo como variável independente a exposição ocupacional ao ruído, controlada por covariáveis de interesse. RESULTADOS: Foram analisados 94 casos e 282 controles. Ajustando-se um modelo de regressão logística condicional múltipla observou-se que trabalhar sempre e às vezes exposto a ruído intenso associou-se a um risco relativo de acidentar-se de 5,0 (IC 95%: 2,8-8,7; p<0,001) e 3,7 (IC 95%: 1,8-7,4; p=0,0003), respectivamente, tendo como referência trabalhar não exposto a ruído, controlado para diversas covariáveis. CONCLUSÕES: Com base nos resultados encontrados, justifica-se o investimento em programas de conservação auditiva particularmente voltados para o controle da emissão de ruídos na fonte. Essas medidas objetivam não apenas a manutenção da saúde auditiva, mas também a diminuição da acidentabilidade dos trabalhadores.

Efeitos genéticos aditivos diretos e maternos e heterozigóticos sobre os desempenhos pré e pós-desmama em uma população multirracial Aberdeen Angus × Nelore

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)