Structure of 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate (KDPG) aldolase from Pseudomonas putida

2-Keto-3-deoxy-6-phosphogluconate (KDPG) aldolase from Pseudomonas putida is a key enzyme in the Entner-Doudoroff pathway which catalyses the cleavage of KDPG via a class I Schiff-base mechanism. The crystal structure of this enzyme has been refined to a crystallographic residual R = 17.1% (R-free = 21.4%). The N-terminal helix caps one side of the torus of the (betaalpha)(8)-barrel and the active site is located on the opposite, carboxylic side of the barrel. The Schiff-base-forming Lys145 is coordinated by a sulfate (or phosphate) ion and two solvent water molecules. The interactions that stabilize the trimer are predominantly hydrophobic, with the exception of the cyclically permuted bonds formed between Glu132 OE1 of one molecule and Thr129 OG1 of a symmetry-equivalent molecule. Except for the N-terminal helix, the structure of KDPG aldolase from P. putida closely resembles the structure of the homologous enzyme from Escherichia coli.

From forests to cattail: how does the riparian zone influence stream fish?

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Effects of eating disorders on oral fungal diversity

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

On the birth of a closed hyperbolic universe

We clarify and develop the results of a previous paper on the birth of a closed universe of negative spatial curvature and multiply connected topology. In particular we discuss the initial instanton and the second topology change in more detail, This is followed by a short discussion of the results.

Commissioning and performance of the CMS silicon strip tracker with cosmic ray muons

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

The CMS experiment at the CERN LHC

The Compact Muon Solenoid (CMS) detector is described. The detector operates at the Large Hadron Collider (LHC) at CERN. It was conceived to study proton-proton (and lead-lead) collisions at a centre-of-mass energy of 14 TeV (5.5 TeV nucleon-nucleon) and at luminosities up to 10(34)cm(-2)s(-1) (10(27)cm(-2)s(-1)). At the core of the CMS detector sits a high-magnetic-field and large-bore superconducting solenoid surrounding an all-silicon pixel and strip tracker, a lead-tungstate scintillating-crystals electromagnetic calorimeter, and a brass-scintillator sampling hadron calorimeter. The iron yoke of the flux-return is instrumented with four stations of muon detectors covering most of the 4 pi solid angle. Forward sampling calorimeters extend the pseudo-rapidity coverage to high values (vertical bar eta vertical bar <= 5) assuring very good hermeticity. The overall dimensions of the CMS detector are a length of 21.6 m, a diameter of 14.6 m and a total weight of 12500 t.

On energy transfer phenomena, in a nonlinear ideal and nonideal essential vibrating systems, coupled to a (MR) magneto-rheological damper

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

An Intelligent Controller Design for Magnetorheological Damper Based on a Quarter-car Model

This paper presents the control strategies of nonlinear vehicle suspension using a magnetorheological (MR) damper. We used two different approaches for modeling and control of the mechanical and electrical parts of the suspension systems with the MR damper. First, we have formulated and resolved the control problem in order to design the linear feedback dumping force controller for a nonlinear suspension system. Then the values of the control dumping force functions were transformed into electrical control signals by the application of a fuzzy logic control method. The numerical simulations were provided in order to show the effectiveness of this method for the semi-active control of the quarter-car suspension.

An Optimal Linear Control Design for Nonlinear Systems

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

The interaction between atoms of Au and Cu with clean Si(111) surface: A study combining synchrotron radiation grazing incidence X-ray fluorescence analysis and theoretical calculations

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Thermal Study in Solid State of Zn(II)-Diclofenac Complex: Behavior Kinetic of the Dehydration, Transition Phase and Thermal Decomposition

The dehydration, thermal decomposition and transition phase stage of Zn(II)-diclofenac compound were studied by simultaneous TG-DTA and DSC techniques. The TG and DSC curves of this compound were obtained with the mass of sample of 2 and 5 mg. Additionally, DSC curves were carried out in opened and closed alpha-alumina pans under static and nitrogen atmosphere. The DTA and DSC curves show that this compound possesses exothermic transition phase between 170-180 degrees C, which it is irreversible (monotropic reaction) The kinetics study of this transition phase stage was evaluated by DSC under non-isothermal conditions. The obtained data were evaluated with the isoconversional method, where the values of activation energy (E(a) / kJ mol(-1)) was plotted in function of the conversion degree (alpha). The results show that due to mass sample, different activation energies were obtained From these curves a tendency can be seen where the plots maintain the same profile for closed lids and almost run parallel to each other.

Synthesis, characterization, thermal studies, and DFT calculations on Pd(II) complexes containing N-methylbenzylamine

This work describes the synthesis, characterization, and the thermal behavior investigation of four palladium(II) complexes with general formulae [PdX(2)(mba)(2)], in which mba = N-methylbenzylamine and X = OAc(-) (1), Cl(-) (2), Br(-) (3) or I(-) (4). The complexes were characterized by elemental analysis, infrared vibrational spectroscopy, and (1)H nuclear magnetic resonance. The stoichiometry of the complexes was established by means of elemental analysis and thermogravimetry (TG). TG/DTA curves showed that the thermodecomposition of the four complexes occurred in 3-4 steps, leading to metallic palladium as final residue. The palladium content found in all curves was in agreement with the mass percentages calculated for the complexes. The following thermal stability sequence was found: 3 > 2 > 4 > 1. The geometry optimization of 1, 2, 3, and 4, calculated using the DFT/B3LYP method, yielded a slightly distorted square planar environment around the Pd(II) ion made by two anionic groups and two nitrogen atoms from the mba ligand (N1 and N2), in a trans-relationship.

Produtos naturais: atualidade, desafios e perspectivas

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

O transplante de células-tronco hematopoéticas como opção no tratamento de doenças não hematológicas

Nesta revisão são abordadas as doenças em que existem dados e perspectivas do uso de transplante de células-tronco hematopoéticas em suas diversas modalidades. São apresentados também os aspectos referentes aos regimes de condicionamento empregados, e sua relação com toxicidade e taxa de mortalidade ligadas ao transplante. São apresentadas as doenças autoimunes e particularizados dados específicos do lúpus eritematoso sistêmico, esclerose sistêmica e esclerose múltipla e diabetes mellitus tipo 1. A base do procedimento nas doenças autoimunes é a reprogramação imunológica. Aparentemente o procedimento tem sua indicação nas doenças em que os tratamentos convencionais de imunossupressão tenham falhado, e o dano orgânico não tenha sido definitivo, mas tenha chance de ocorrer caso não seja realizado o transplante. A modalidade aparentemente indicada no momento deve ser o transplante de células-tronco autogênico com regimes de condicionamento não mieloablativo para se obter sobrevivência estimada em mais de 50% em todas as doenças, com baixa toxicidade e com mortalidade nula ligada ao transplante. São apresentados também os resultados nos tumores sólidos, que são discutíveis, e particularidades no câncer de mama. A aparente indicação para os tumores sólidos é transplante de células-tronco alogênico e se baseia no tratamento intensivo com doses mieloablativas com a finalidade de se induzir o efeito enxerto contra o tumor. Os regimes não mieloablativos são preconizados com a finalidade de redução da toxicidade e indução de imunossupressão, sendo os dados insuficientes e discutíveis, o que obriga a introdução de novas estratégias terapêuticas baseadas na terapia imune e celular.

Efeitos da manipulação do estímulo visual e da intenção na oscilação postural de idosas

Este estudo investigou a influência de características do estímulo visual e o efeito da intenção nas respostas do controle postural frente à manipulação visual de adultas idosas. As 20 participantes permaneceram em pé em uma sala móvel durante sete tentativas com duração de 1 minuto cada, olhando para um alvo fixo, medindo-se sua oscilação corporal. Na primeira tentativa não houve qualquer movimento da sala, porém a partir da segunda a sala foi movimentada no sentido ântero-posterior. Para dez participantes, a velocidade de pico da movimentação foi de 0,6 cm/s e, para as demais, de 1,0 cm/s. A partir da quinta tentativa, as participantes foram informadas do movimento da sala e orientadas a resistir à movimentação. Os resultados indicam que a oscilação corporal das idosas é induzida pelo movimento da sala móvel. Intenção e alteração da característica do estímulo visual reduzem a influência da informação visual na oscilação corporal, mas a manipulação de propriedade do estímulo (neste caso, velocidade), é menos efetiva que a intenção. Essa maior dependência da intenção para alterar a influência de um estímulo sensorial no controle postural indica que o funcionamento do sistema de controle postural em idosos não possibilita ajustes automáticos de respostas posturais frente a pequenas variações das condições ambientais. Iinformações sobre tais variações podem ser direcionadas de forma a compensar essa diferença.