132 resultados para Allelic frequency


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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

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We study the use of para-orthogonal polynomials in solving the frequency analysis problem. Through a transformation of Delsarte and Genin, we present an approach for the frequency analysis by using the zeros and Christoffel numbers of polynomials orthogonal on the real line. This leads to a simple and fast algorithm for the estimation of frequencies. We also provide a new method, faster than the Levinson algorithm, for the determination of the reflection coefficients of the corresponding real Szego polynomials from the given moments.

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O objetivo deste estudo foi avaliar a prevalência e frequência de cefaléia em escolares brasileiros. Um estudo transversal foi conduzido entre Março e Novembro de 2004 em São José do Rio Preto, Estado de São Paulo, Brasil. Uma amostra de 5.232 crianças das escolas foi selecionada utilizando método de amostragem estratificada proporcional. Para a coleta dos dados, um questionário foi entregue nas escolas aos estudantes para ser respondida pelos pais e/ou responsáveis. do total de respostas recebidas, 84,2% relataram cefaléia durante o último ano. Houve diferenças significativas na frequência da queixa de cefaléia entre meninos e meninas. As meninas relataram cefaléias mais frequentes do que os meninos, com prevalência de cefaléias diárias duas vezes maior em meninas. Uma maior frequência de cefaléia foi também relatada com o aumento da idade. O estudo demonstrou que a prevalência de cefaléia foi alta, com uma maior frequência (mensais, semanais e diárias) em meninas e no grupo etário mais velho.

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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We report results of a study of the B-s(0) oscillation frequency using a large sample of B-s(0) semileptonic decays corresponding to approximately 1 fb(-1) of integrated luminosity collected by the D0 experiment at the Fermilab Tevatron Collider in 2002-2006. The amplitude method gives a lower limit on the B-s(0) oscillation frequency at 14.8 ps(-1) at the 95% C.L. At Delta m(s)=19 ps(-1), the amplitude deviates from the hypothesis A=0 (1) by 2.5 (1.6) standard deviations, corresponding to a two-sided C.L. of 1% (10%). A likelihood scan over the oscillation frequency, Delta m(s), gives a most probable value of 19 ps(-1) and a range of 17

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Since the mid 1980s the Atomic Force Microscope is one the most powerful tools to perform surface investigation, and since 1995 Non-Contact AFM achieved true atomic resolution. The Frequency-Modulated Atomic Force Microscope (FM-AFM) operates in the dynamic mode, which means that the control system of the FM-AFM must force the micro-cantilever to oscillate with constant amplitude and frequency. However, tip-sample interaction forces cause modulations in the microcantilever motion. A Phase-Locked loop (PLL) is used to demodulate the tip-sample interaction forces from the microcantilever motion. The demodulated signal is used as the feedback signal to the control system, and to generate both topographic and dissipation images. As a consequence, a proper design of the PLL is vital to the FM-AFM performance. In this work, using bifurcation analysis, the lock-in range of the PLL is determined as a function of the frequency shift (Q) of the microcantilever and of the other design parameters, providing a technique to properly design the PLL in the FM-AFM system. (C) 2011 Elsevier B.V. All rights reserved.

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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A introdução do mesilato de imatinibe como tratamento da leucemia mielóide crônica tem salvado muitos pacientes, mas o sucesso da terapia tem sido prejudicado pela resistência e possível não destruição do clone maligno. Este artigo descreve a resposta citogenética e padrões citogenéticos anormais envolvendo os genes ABL e BCR detectados por FISH em pacientes em uso exclusivo de imatinibe. Os resultados mostraram que outras alterações envolvendo os genes BCR e ABL não parecem estar relacionadas à resistência à droga, elas ocorrem em baixas freqüências e podem não estar associadas à resposta citogenética ou ao tempo de tratamento. Contudo, a resposta ao imatinibe parece ser individual e imprevisível, independente do tempo e do início do tratamento após o diagnóstico.

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Erros de identificação de paternidade são prejudiciais por reduzir o ganho genético anual e comprometer um programa eficiente de melhoramento genético. O objetivo principal deste trabalho foi avaliar o potencial de uso de nove microssatélites em testes de paternidade e investigar a freqüência de erro de identificação de famílias de um rebanho de animais da raça Gir. No experimento foram utilizadas amostras de sangue de quarenta famílias (touro/ vaca/ bezerro) de animais da raça Gir, Puros de Origem e registrados na Associação Brasileira dos Criadores de Zebu (ABCZ). A maior parte dos microssatélites avaliados neste trabalho são recomendados, para Testes de Paternidade em bovinos, pela Sociedade Internacional de Genética Animal (ISAG). As regiões microssatélites TGLA122, TGLA126, BM1824, BMS2533, SPS115, ETH3, ETH10, ETH225 e POTCHA foram amplificadas por meio da técnica de PCR. Os produtos da amplificação foram separados por eletroforese em gel de poliacrilamida desnaturante. A partir dos dados obtidos foram calculadas as freqüências alélicas, diversidade gênica, conteúdo de polimorfismo informativo e probabilidade de exclusão para cada microssatélite. Também foram calculadas as freqüências genotípicas, heterozigosidade, probabilidade de exclusão combinada e probabilidade de Paternidade nas famílias consideradas. A probabilidade de exclusão combinada para todos os microssatélites estudados foi de 0,9789. Os resultados dos testes de paternidade acusaram erro de identificação em onze das 40 famílias estudadas, ou seja, 27,5% da amostra. A probabilidade de paternidade variou entre 0,8691 e 0,9999, com valor médio de 0,9512.

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CONTEXTO: Vários estudos de perda de heterozigozidade na região 9p21-p22, que abriga os genes supressores tumorais CDKN2a/p16INK4a, p19ARF e p15INK4b, têm sido realizados em uma ampla série de tumores humanos, incluindo os melanomas familiares. Perdas e ganhos em outras regiões do cromossomo 9 também têm sido observados com freqüência e podem indicar mecanismos adicionais no processo de tumorigênese dos carcinomas basocelulares da pele. OBJETIVO: Investigar o equilíbrio alélico existente na região 9p21-p22 em carcinomas basocelulares. TIPO DE ESTUDO: Análise molecular de marcadores de microssatélites em tumores e controles. LOCAL: Dois serviços de dermatologia de atendimento terciário em universidades públicas de São Paulo e o Laboratório de Genética Molecular do Câncer da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Brasil. PARTICIPANTES: Examinamos 13 casos benignos, incluindo 4 queratoses solares, 3 queratoacantomas, 3 nevos melanocíticos, 2 doenças de Bowen e 1 neurofibroma cutâneo, além de 58 tumores malignos da pele: 14 de células escamosas, 40 carcinomas basocelulares e 4 melanomas; em pacientes consecutivamente encaminhados à clínica de Dermatologia da Unicamp e que concordaram em participar do estudo. VARIÁVEIS ESTUDADAS: O tumor principal e uma porção normal de pele não-adjacente foram removidos cirurgicamente de pacientes que consecutivamente procuraram os ambulatórios de dermatologia da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) e da Universidade Estadual de São Paulo (Unesp), São Paulo, por causa de lesões cutâneas. Extraímos DNA tanto de tecido tumoral como do correspondente tecido normal de cada paciente. Para amplificar regiões de repetição polimórfica de microssatélites do cromossomo 9, foram utilizados quatro pares de primers, sendo dois deles destinados à região 9p21-p22. RESULTADOS: Identificamos oito casos (20%) de desequilíbrio alélico entre os carcinomas basocelulares, sendo dois casos de perda de heterozigozidade e seis casos de instabilidade de microssatélite na região 9p21-p22. Outros marcadores também mostravam anormalidades em três destes tumores, enquanto nenhuma alteração foi detectada entre os casos benignos e nos outros tumores malignos. CONCLUSÃO: Esta dependência fenotípica sugere que existem diferenças importantes no comportamento das formas mais comuns de tumores cutâneos não-melanocíticos em relação à sua tendência para instabilidade de microssatélite no cromossomo 9. Considerando-se que os genes CDKN2a/p16INK4a, p19ARF e p15INK4b não parecem responsáveis pelas anormalidades observadas, outros genes em 9p21-p22 podem estar envolvidos na etiopatogenia e na progressão dos carcinomas basocelulares.