301 resultados para Alinhamento múltiplo de sequências


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Patógenos transmitidos por carrapatos atingem uma variedade de hospedeiros vertebrados. Para identificar os agentes patogênicos transmitidos por carrapatos entre cães soropositivos para Leishmania infantum no município Campo Grande-MS, foi realizado um estudo sorológico e molecular para a detecção de Ehrlichia canis, Anaplasma platys e Babesia vogeli em 60 amostras de soro e baço, respectivamente. Adicionalmente, foi realizado o diagnóstico confirmatório de L. infantum por meio de técnicas sorológicas e moleculares. Também foi realizado o alinhamento e análise filogenética das sequências para indicar a identidade das espécies de parasitas que infectam esses animais. Anticorpos IgG anti-Ehrlichia spp., anti-B. vogeli e anti-L. infantum foram detectados em 39 (65%), 49 (81,6%) e 60 (100%) dos cães amostrados, respectivamente. Vinte e sete (45%), cinquenta e quatro (90%), cinquenta e três (88,3%), dois (3,3%) e um (1,6%) cães mostraram-se positivos na PCR para E. canis, Leishmania spp., Leishmania donovani complex, Babesia sp. e Anaplasma sp., respectivamente. Após o seqüenciamento, os amplicons mostraram 99% de similaridade com isolados de E. canis, B. vogeli e A. platys e Leishmania chagasi. Os resultados deste estudo indicaram que os cães soropositivos para L. infantum de Campo Grande, MS, são expostos a vários agentes transmitidos por carrapatos, e, portanto, devem ser incluídos no diagnóstico diferencial em cães com suspeita clínica de leishmaniose.

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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In heavy machining industries, a critical point that must be taken into account is setup. Because the characteristics of machine tools and parts to be machined, usually pieces robust and large, the preparation of these parts must be made accurately for machining has a good result as planned. As a result of the difficulty raised in the setup machining of heavy parts, companies in this segment seek alternatives to reduce the unproductive time caused by setup and optimize machining processes. One way was found that these companies create operating instructions that describe and standardize the operation between its employees, as well as deploy a control machining times to measure the unproductive time caused by the setup. This work studied a new system for the realization of centering and alignment of Rotating Deck R-9350 in CNC Milling Machine PAMA Speedram 3000, in Liebherr Brazil company. The part Rotating Deck R-9350 is a critical part in which its machining in PAMA Milling Machine is made in three phases and their setup times are quite high and involve stopping the machine. It has been tested and proposed a solution to the realization of this part of the setup without the use of the machine, but of the measuring instrument three-dimensional Laser tracker, with which the machine continued to work, while he was in the centering and alignment of other parts. It was noted that the instrument technically attended the need and it was possible to perform this operation more accurately

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The Itararé Group is the record of one of the most significant glaciation events of the Gondwana. Of neocarboniferous-eopermian age, this unit has facies associations interpreted as resulted from shallow marine settings with glacial and deglacial water influence. The role of glaciers on the tectonic-sedimentary processes of the Itararé Group is striking, as typical facies such as diamictites, tilites, shales and rhythmites with dropstones are generated, besides the existence of glacially striated and polished surfaces. This work had as main goal to contribute to the geological knowledge of the Itararé Group in the central eastern portion of São Paulo State, using as basis outcrops from Itu, Salto and Porto Feliz, and also pertinent bibliographic data and well profiles located in the surrounding areas. About the stratigraphic framework, genetic association and paleogeography of these deposits, this work concludes that the area studied comprises the basal section of the Itararé Group. The stacking of the facies recognized during the field work begins with the striated and polished surfaces of the basement, described in Salto, superposed by tilites and diamictites with glacial movement features. Over these are the turbidites from Itu, associated with the glacier retreat. The outcrops of Porto Feliz are at the top of this succession, with deposits generated by flows with lateral and vertical variations, sometimes with prevalence of tractive conditions, and sometimes with sediments transported largely by suspension. Paleocurrent measurements show main flow directions towards NW, the same as glacial striae, suggesting the influence of reworking of sediments by the meltwater during deglacial periods

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O mieloma múltiplo (MM) é uma neoplasia maligna secundária à expansão clonal de células plasmáticas caracterizada pela presença de imunoglobulina monoclonal no sangue e/ou na urina, lesões líticas ósseas e infiltração de plasmócitos monoclonais na medula óssea. A caracterização dos mecanismos responsáveis pela expansão das células tumorais do MM é difícil e envolve uma série de alterações genéticas e mudanças no microambiente da medula óssea, favorecendo o crescimento do tumor e a falha do sistema imune em reconhecê-lo. O MM é uma doença incurável, sendo a sobrevida mediana dos pacientes em torno de 3-5 anos. Terapias atuais como quimioterapia e transplante autólogo de células-tronco podem induzir remissão da doença, mas a recaída e a morte são inevitáveis. Os antígenos específicos câncer/testículo (CTs) foram originalmente descritos em pacientes com melanoma e são assim denominados, pois suas proteínas foram identificadas em espermatogônias, células conhecidas por não expressarem antígenos de histocompatibilidade (HLA), o que as impossibilita de desencadear uma resposta imune específica. Esses antígenos foram identificados posteriormente em vários tipos de tumores humanos, como melanoma, carcinoma pulmonar, câncer renal, entre outros. Até o momento, existem poucas informações a respeito de sua importância como fatores de prognóstico clínico ou relacionado à proliferação aberrante das células plasmáticas. Assim, o objetivo deste estudo é avaliar o nível de expressão gênica dos antígenos câncer/testículo MAGEC1(CT7), MAGEA3/6, LAGE-1, NY-ESO-1 e GAGE em amostras de aspirado de medula óssea total de pacientes com mieloma múltiplo. A análise de expressão por RT-PCR dos 5 CTs de interesse, realizada em 21 amostras de medula total de pacientes com MM, demonstrou as seguintes freqüências: CT7 (42,9%), LAGE-1 (23,8%)... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

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A monoclonal antibody (mAb) is an important tool in medical biotechnology and the production of biopharmaceuticals, especially for disease diagnosis and treatment of infections, because the antibodies have a significant advantage over chemical agents used in conventional therapies . The last thirty years the technology of production of monoclonal antibodies developed mainly the technique of obtaining in vitro, but also of their production is laborious, the cost is high. A major element of the high cost of production is the fact that the long-term culture consumes a large amount of imported inputs with high added value. A major contribution of this work is to promote cell growth more quickly and efficiently. Currently, a great race to discover new technologies and techniques to synthesize new antibodies and significantly increase the production of murine mAbs. New technologies such as laser and LED are innovations and widespread in modern life, so much so that its use has proliferated worldwide, primarily in the medical field. Recent studies show a series of results from the influence of the LED light in biological tissues such as: increasing the rate of cell proliferation, increased production rate of fibroblasts, increasing the rate of synthesis of RNA and DNA synthesis of ATP, etc. To assess the contribution of the LED in the culture of Myeloma NS1murino compared to the standard procedure. - NS1 cells were provided and followed the criteria of culture medium of the Laboratory of Cellular Engineering Center of Botucatu (POPs). The same amount of cells was grown in bottles of 25 cm2 polystyrene Tissue Culture Treated, specifically marked and kept in special medium RPMI 1640 Gibco BRL  supplemented with fetal bovine serum 10%, essential amino acids and non-essential, glucose, insulin and antibiotics. It was used in LEDs Cromatek wavelength of 630nm, 475nm and 530nm. The groups were... (Complete abstract click electronic access below)

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Proteínas que apresentam atividades no núcleo e possuem sequência de localização nuclear (NLS) tem seu deslocamento dependente do heterodímero importina-α/β. A importina- (ImpA) é responsável pelo reconhecimento inicial do substrato a ser importado através da interação com os NLS. Os sinais são caracterizados por apresentar um ou mais grupos de aminoácidos básicos, denominados como sequências monopartidas e bipartidas. O fungo Neurospora crassa vem sendo utilizado há mais de 70 anos como organismo modelo em estudos de expressão gênica, desenvolvimento e diferenciação celular, ritmo circadiano, defesa do genoma, bem como outros aspectos da biologia de eucariotos. A presença de um grande número de genes no genoma de N. crassa ainda com funções desconhecidas aponta este organismo como um promissor modelo para o estudo de novos mecanismos genéticos e bioquímicos ainda não identificados. Considerando a importância do metabolismo do glicogênio para os organismos, o presente trabalho teve como objetivo o estudo estrutural de complexos de ImpA com peptídeos NLSs (NCM e NCB) de proteínas envolvidas no metabolismo de glicogênio do fungo N. crassa, utilizando técnicas de cristalografia de proteínas. Monocristais dos complexos ImpA-NCM e ImpA-NCB foram obtidos para a coleta dos dados de difração de raios-X, resultando em dois conjuntos de dados à 2,1Å e 2,45Å de resolução, respectivamente. Após elucidação da estrutura da ImpA, mapas de densidade eletrônica gerados revelaram uma densidade eletrônica no sítio principal de reconhecimento de NLS da ImpA de ambas estruturas, possibilitando modelagem dos peptídeos. Em uma comparação do mapa de densidade eletrônica obtido de ambos complexos com um mapa de uma estrutura nativa de ImpA (70-529) coletada à 2,0Å de resolução, a qual usualmente apresenta um peptídeo “contaminante” no sitio de ligação... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

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In the present work we performed molecular cytogenetic studies in two different populations of Astyanax bockmanni from streams of Botucatu, SP: one from Capivara river, on Tietê river basin and one from Água da Madalena river, on Paranapanema river basin. The results showed that the population of Astyanax bockmanni from Capivara river have a diploid number of 50 chromosomes, with karyotype consisting of 8 methacentric, 14 submethacentric, 12 subtelocentric and 16 acrocentric, while the individuals of the population from Água da Madalena river have 50 diploid chromosomes but with karyotype organized in 8 metacentric, 14 submetacentric, 16 subtelocentric and 12 acrocentric. Also, the rDNA 18s sequences are widely dispersed throughout the genome of two populations, with intra and interindividual variations. On the other hand, the sequences for rDNA 5S and Histone H1 remained chromosomally conserved in these two samples and sites located in pairs 2 and 19 (rDNA 5S) and the pairs 2 and 15 (Histone H1). The low dispersion of structural genes and a functional dynamic independence between sequences of rDNA 5S and rDNA 18S may be related to the process of karyotype maintenance and differentiation in these populations of Astyanax bockmanni

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A quantificação de citocinas felinas possibilita uma avaliação do sistema imune do animal em diferentes doenças, permite também a identificação de diferentes fatores que alteram sua secreção, e colabora na compreensão da patogênese das enfermidades. Em humanos e camundongos essa mensuração é feita principalmente pelo método de ELISA, mas para os felinos há uma menor disponibilidade de kits específicos para determinadas citocinas, e estes possuem um custo elevado. Assim, uma alternativa é utilizar a reação de PCR em tempo real com transcrição reversa (RT-qPCR) para quantificação absoluta dos RNAs mensageiros das citocinas felinas, uma técnica bastante sensível e específica para analisar a expressão desses genes. Com esse intuito, esse trabalho teve como objetivo clonar as sequências gênicas codificantes de citocinas, para construir uma curva padrão para a qPCR. Assim, foi feita extração de RNA de amostras de sangue total de gatos domésticos, e estes foram tratados com DNAse para evitar contaminação por DNA genômico. O cDNA foi sintetizado, e amplificado com os primers específicos para cada fragmento codificante de citocina e o GAPDH felino. Cada amplicon purificado foi inserido em um plasmídeo comercial, e introduzido em bactérias E. coli cepa DH5. Os clones recombinantes foram sequenciados para confirmar a inserção do fragmento no vetor. As curvas padrão da qPCR foram construídas com cada plasmídeo recombinante numa de 106 a 101 cópias por reação. O sequenciamento mostrou que todos os clones eram semelhantes àqueles encontrados no GenBank. A eficiência das amplificações, baseado no slope das curvas padrão foram: 101,3% para GAPDH, 99,1% para IL-1, 83,2% para IL-6, 94,4% para IL-10, 105,5% para IL-12, 83,4% para IFN- e 83,8% para TNF-. O valor de r2 foi de 0,99 em todas as reações. Dessa forma, com a clonagem dos fragmentos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

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The proposal of this work is based on the elaboration of didactic sequences from fairy tales, for students of Elementary School, during reinforcement classes of Portuguese language. It is deemed appropriate to use this genre, because it gives to the child and to the adolescents a pleasurable reading, approaching them of playful situations. As a main goal of this work, this research aimed the preparation of didactic sequences using fairy tales in the classroom, as well as encouraging the reading for these students. The intention was also the internalization of the narratives and the messages conveyed by them, associating them to everyday situations. We used the deductive method, in which we initially organized the approach in the classroom and the teaching sequences from theoretical assumptions and materials already designed