Genomic data as the hitchhiker's guide to cattle adaptation: tracking the milestones of past selection in the bovine genome

The bovine species have witnessed and played a major role in the drastic socio-economical changes that shaped our culture over the last 10,000 years. During this journey, cattle hitchhiked on human development and colonized the world, facing strong selective pressures such as dramatic environmental changes and disease challenge. Consequently, hundreds of specialized cattle breeds emerged and spread around the globe, making up a rich spectrum of genomic resources. Their DNA still carry the scars left from adapting to this wide range of conditions, and we are now empowered with data and analytical tools to track the milestones of past selection in their genomes. In this review paper, we provide a summary of the reconstructed demographic events that shaped cattle diversity, offer a critical synthesis of popular methodologies applied to the search for signatures of selection (SS) in genomic data, and give examples of recent SS studies in cattle. Then, we outline the potential and challenges of the application of SS analysis in cattle, and discuss the future directions in this field.

Analysis of metabolic pools in broilers chicks

This paper shows the possibility of obtaining new parameters for the mathematical modelling of data on stable isotopes in biological systems and its application in obtaining data on metabolic pools of blood plasma, blood serum, liver and muscle of broilers. This theory states that the modelling of turnover used for studies of isotopic incorporation when the metabolism has a single metabolic pool is feasible by the technique of setting an exponential. However, when the metabolism has more than one metabolic pool, it is necessary to apply the linearization technique, linear regression adjustment and evaluation of the assumptions of regression to obtain the kinetic parameters such as half-life (T1/2) and isotope exchange rate (k). The application of this technique on carbon-13 data from 100 one-day-old chicks, with the change of diet composed of grains of the photosynthetic cycle of plants from C4 to C3, in broilers has enabled the discovery that the liver, blood plasma and blood serum have a single metabolic pool; however, the pectoral muscle has two metabolic pools. For the liver, blood plasma and blood serum, the half-life values were found by the exponential fit being T1/2 = 1.4 days with the rate of exchange of k = 0.502, T1/2 = 2.4 days with k = 0.293 and T1/2 = 2.0 days with k = 0.348, respectively. For the pectoral muscle, after linearization, the half-life values were found for T1/2(1) = 1.7 and T1/2(2) = 3 days, with exchange rates of k1 = 0.405 and k2 = 0.235, representing approximately 66 and 34 %, respectively.

Desenvolvimento e validação de modelo de previsão para mancha preta dos citros em função de variáveis meteorológicas

A mancha preta dos citros é uma doença causada pelo fungo Guignardia citricarpa que produz lesões em frutos em variedades de laranja doce comerciais, causando a queda precoce dos frutos, diminuindo a produtividade e levando a sua depreciação para o mercado de fruta fresca. O objetivo do trabalho foi desenvolver e validar um modelo de favorabilidade climática da mancha preta dos citros relacionado a ocorrência dos sintomas da doença no Estado de São Paulo. Desenvolveu-se um sistema empírico com base em um banco de dados da ocorrência da doença e das condições climáticas, em campo, nos municípios de Barretos/SP e Gavião Peixoto/SP, durante as Safras 2007/2008 e 2008/2009. A variedade de laranjeira doce utilizada nos experimentos foi a 'Valência' enxertada sobre limoeiro 'Cravo', com 10 anos de idade. Para a incidência da mancha preta foi avaliada a porcentagem de frutos com sintomas na planta e para a severidade, a porcentagem de casca lesionada por fruto. Na análise de regressão as variáveis climáticas e os dados de intensidade de doença de Barretos foram selecionados no procedimento 'stepwise'. As melhores equações de regressão foram selecionadas pelo coeficiente de determinação (R²) e pela significância da regressão no teste F (P < 0,05 e P < 0,01) que resultou na equação Y= -502,43 + 9,61 X10 + 4,78 X30 + 0,54 X46 - 7,9 X50 em que Y=Índice de Favorabilidade, X10 é a temperatura média, X30 é a umidade relativa média, X46 é o molhamento foliar e X50 é a temperatura média durante o molhamento foliar, determinados com dados de intervalos de sete dias. Procedeu-se a validação no campo no município de Gavião Peixoto durante a Safra 2008/2009, realizando a correlação entre a incidência e severidade observadas no experimento e os dados previstos que foram os determinados pela equação, sendo que a correlação mostrou-se positiva para a incidência da doença com um R²=0,87.

Avaliação de indicadores internos em ensaios de digestibilidade

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Curvas de crescimento e de deposição dos componentes corporais em aves de postura de diferentes linhagens

Objetivou-se com este trabalho determinar as curvas de crescimento de aves de postura das linhagens semipesadas Hy Line Marrom (HLM) e Hisex Marrom (HSM) e leves Hy Line W36 (HLW36) e Hisex Branca (HSB). Foram utilizadas 300 aves de cada linhagem, distribuídas em um delineamento experimental inteiramente casualizado, com quatro repetições de 75 aves por tratamento. Semanalmente, foram avaliados o peso vivo (PV), o peso de pena (PP) e a composição corporal de proteína, gordura, cinzas e água. As curvas de crescimento foram determinadas aplicando-se os dados na função de Gompertz. As aves semipesadas foram mais tardias para PV que as leves, com taxas de crescimento corporal e pesos à maturidade (PM) maiores. Aves da linhagem HLW36 foram 64,23 g mais leves à maturidade que as HSB. As respostas obtidas para o crescimento das penas e deposição protéica foram semelhantes, todavia, os PM foram maiores para as aves marrons que para as brancas. No entanto, para estes componentes, as Hy Line tiveram maiores deposições que as Hisex. A taxa de peso de pena à maturidade foi menor na linhagem HLW36, tornando-a três dias mais tardia em comparação à HSB. A menor deposição protéica no final do período de crescimento da HSM possibilitou o desvio da energia ingerida para deposição de gordura, resultando em PM superestimado em relação às aves HLM. As aves da linhagem Hy Line foram mais tardias na composição de cinzas, apresentando PM superiores ao das aves Hisex. Entre as variáveis estudadas, os PM foram sempre maiores nas aves Hy Line, no entanto, a deposição de água corporal nas aves Hisex foi maior, assim como as taxas máximas à maturidade foram mais tardias, o que justifica a semelhança no ganho de peso entre as diferentes linhagens, visto que os demais componentes estudados foram maiores para as Hy Line.

Integration of a regional GPS network within ITRF using precise point positioning

GPS precise point positioning (PPP) can provide high precision 3-D coordinates. Combined pseudorange and carrier phase observables, precise ephemeris and satellite clock corrections, together with data from dual frequency receivers, are the key factors for providing such levels of precision (few centimeters). In general, results obtained from PPP are referenced to an arbitrary reference frame, realized from a previous free network adjustment, in which satellite state vectors, station coordinates and other biases are estimated together. In order to obtain consistent results, the coordinates have to be transformed to the relevant reference frame and the appropriate daily transformation parameters must be available. Furthermore, the coordinates have to be mapped to a chosen reference epoch. If a velocity field is not available, an appropriated model, such as NNR-NUVEL-IA, has to be used. The quality of the results provided by this approach was evaluated using data from the Brazilian Network for Continuous Monitoring of the Global Positioning System (RBMC), which was processed using GIPSY-OASIS 11 software. The results obtained were compared to SIRGAS 1995.4 and ITRF2000, and reached precision better than 2cm. A description of the fundamentals of the PPP approach and its application in the integration of regional GPS networks with ITRF is the main purpose of this paper.

Abnormalities in apolipoprotein and lipid levels in an HIV-infected Brazilian population under different treatment profiles: the relevance of apolipoprotein E genotypes and immunological status

HIV infection is associated with disturbances in lipid metabolism due to a host's response mechanism and the current antiretroviral therapy. The pathological appearance and progression of atherosclerosis is dependent on the presence of injurious agents in the vascular endothelium and variations in different subsets of candidate genes. Therefore, the Hha I polymorphism in the apolipoprotein E gene was evaluated in addition to triglycerides, total cholesterol, very low-density lipoprotein (VLDL), LDL, high-density lipoprotein (HDL), and apolipoprotein (apo) Al, B and E levels in 86 Brazilian HIV-infected patients and 29 healthy controls. The allele frequency for apoE in the HIV-infected group and controls was in agreement with data on the Brazilian population. Dyslipidemia was observed in the HIV group and verified by increased levels of triglycerides, VLDL and apoE, and decreased levels of HDL and apoAl. The greatest abnormalities in these biochemical variables were shown in the HIV-infected individuals whose immune function was more compromised. The effect of the genetic variation at the APOE gene on biochemical variables was more pronounced in the HIV-infected individuals who carried the apoE2/3 genotype. The highly active antiretroviral therapy (HAART)-receiving group presented increased levels of total cholesterol and apoE. Dyslipidemia was a predictable consequence of HIV infection and the protease inhibitors intensified the increase in apoE values.

Analisando conhecimentos e práticas de agentes educacionais e professoras relacionados à alimentação infantil

Objetivou-se identificar os conhecimentos e as práticas relacionados à alimentação de crianças entre zero e três anos, a fim de complementar a formação das profissionais que trabalham com crianças, na área da educação nutricional. O procedimento metodológico seguiu as orientações do estudo de caso, com abordagem qualitativa. Os saberes e as práticas das participantes do estudo foram analisados por meio de questões abertas e fechadas e das observações dos tópicos relacionados à nutrição infantil, juntamente com os dados sobre a formação dessas profissionais. Pode-se concluir que tanto as agentes educacionais quanto as professoras de Ensino Infantil são detentoras de um conhecimento sobre Nutrição Infantil, porém a preocupação maior destas foi atender as necessidades nutricionais das crianças por meio de uma boa alimentação, deixando, em segundo plano, as atividades pedagógicas, as quais poderiam ser realizadas em um programa de educação nutricional, construído coletivamente e inserido no projeto político-pedagógico da escola.

Waveshapes of continuing currents and properties of M-components in natural positive cloud-to-ground lightning

This work analyses the waveshapes of continuing currents and parameters of M-components in positive cloud-to-ground (CG) flashes through high-speed GPS synchronized videos. The dataset is composed of only long continuing currents (with duration longer than 40 ms) and was selected from more than 800 flashes recorded in Sao Jose dos Campos (45.864 degrees W, 23.215 degrees S) and Uruguaiana (29.806 degrees W, 57.005 degrees S) in Southeast and South of Brazil, respectively, during 2003 to 2007 summers. The videos are compared with data obtained by the Brazilian Lightning Location System (BrasilDAT) in order to determine the polarity of each flash and select only positive cases. There are only two studies of waveshapes of continuing currents in the literature. One is based on direct current measurements of triggered lightning, in which four different types of waveshapes were observed; and the other is based on measurements of luminosity variations in high-speed videos of CG negative lightning, in which besides the four types above mentioned two additional types were observed. The present work is an extension of the latter, using the same method but now applied to obtain the waveshapes of positive CG lightning. As far as the authors know, this is the first report on M-components in positive continuing currents. We also have used the luminosity-versus-time graphs to observe their occurrence and measure some parameters (duration, elapsed time and time between two successive M-components), whose statistics are presented and compared in detail to the data for negative flashes. We have plotted a histogram of the M-components elapsed time over the total duration of the continuing current for positive flashes, which presented an exponential decay (correlation coefficient: 0.83), similar to what has been observed for negative flashes. (C) 2008 Elsevier B.V. All rights reserved.

Spin-Stabilized Spacecrafts: Analytical Attitude Propagation Using Magnetic Torques

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

A DOE based approach for the design of RBF artificial neural networks applied to prediction of surface roughness in AISI 52100 hardened Steel turning

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Multi-Agent Simulation of Urban Social Dynamics for Spatial Load Forecasting

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Reações comunicativas dos alunos de enfermagem frente ao primeiro estágio curricular

Este estudo tem como objetivo descrever as reações que os alunos de enfermagem apresentaram quando do seu primeiro estágio curricular. É um estudo transversal e de campo, e o tratamento dos dados foi realizado com base no método de análise de conteúdo. Os resultados descrevem o campo de estágio, o relacionamento com a equipe da enfermaria, com os pacientes e com o docente durante este período. Nas conclusões, podemos afirmar que o estresse e as contradições vivenciadas no primeiro estágio são parte do crescimento e aprendizado do aluno. O professor é maior responsável por determinar o tipo de interação que haverá entre ele e o aluno, cabendo-lhe ouvir, incentivar e capacitar-se para apoiar os alunos nas experiências iniciais da prática, para que o primeiro estágio seja um fator motivador ao aluno.

Prevalência do aleitamento materno

OBJETIVO: Avaliar os indicadores de aleitamento materno em consultórios particulares e centros de saúde no município de Lins, SP, e comparar a prevalência de aleitamento materno exclusivo dessa região com a encontrada em outras pesquisas. MÉTODOS: Estudo de corte transversal com amostra aleatória de 255 crianças de quatro a doze meses de idade, estratificada por sexo, condição socioeconômica e escolaridade dos pais. Foram avaliados os indicadores de aleitamento materno em dois grupos de crianças: as acompanhadas em consultórios particulares e as acompanhadas em centros de saúde. Foram utilizados questionários respondidos pelos responsáveis. Os dados desta pesquisa foram comparados aos de outros estudos. RESULTADOS: Apesar de haver diferenças significativas nas condições de renda, estrato social e escolaridade dos pais, não houve diferença significativa nos índices de aleitamento materno entre os dois grupos. No grupo total, a prevalência de aleitamento materno exclusivo aos quatro meses foi de 61,1% e a mediana de aleitamento materno exclusivo foi de 120 dias. Os resultados foram superiores aos dos demais estudos consultados. CONCLUSÃO: Os resultados mostraram diferenças relacionadas às condições socioeconômicas, porém, os índices de aleitamento materno foram semelhantes entre os dois grupos. Os resultados de aleitamento materno exclusivo foram superiores aos das demais pesquisas.

Tests of one Brazilian facial reconstruction method using three soft tissue depth sets and familiar assessors

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)