Phenotypic and genotypic characterization of Rhodococcus equi isolated from sputum

Introduction: Rhodococcus equi is an opportunistic pathogen, causing rhodococcosis, a condition that can be confused with tuberculosis. Often, without identifying M. tuberculosis, physicians initiate empiric treatment for tuberculosis. R. equi and M. tuberculosis have different susceptibility to drugs. Identification of R. equi is based on a variety of phenotypic, chromatographic, and genotypic characteristics.Objective: This study aimed to characterize bacterial isolates from sputum samples suggestive of R. equi.Methods: The phenotypic identification included biochemical assays; thin-layer chromatography (TLC) and polymerase chain reaction (PCR) were used for genotypic identification.Results: Among 78 Gram-positive and partially acid-fast bacilli isolated from the sputum of tuberculosis-suspected patients, 51 were phenotypically and genotypically characterized as R. equi based on literature data. Mycolic acid analysis showed that all suspected R. equi had compounds with a retention factor (R-f) between 0.4-0.5. Genotypic characterization indicated the presence of the choE gene 959 bp fragments in 51 isolates CAMP test positive. Twenty-two CAMP test negative isolates were negative for the choE gene. Five isolates presumptively identified as R. equi, CAMP test positive, were choE gene negative, and probably belonged to other bacterial species.Conclusions: The phenotypic and molecular techniques used constitute a good methodological tool to identify R. equi. (C) 2012 Elsevier Editora All rights reserved.

Improved laboratory safety by decontamination of unstained sputum smears for acid-fast microscopy

Tubercle bacilli may survive in unstained heat-fixed sputum smears and may be an infection risk to laboratory staff. We compared the effectiveness of 1% and 5% sodium hypochlorite, 5% phenol, 2% glutaraldehyde, and 3.7% formalin in killing Mycobacterium tuberculosis present in smears prepared from 51 sputum samples. The smears were decontaminated by the tube and slide techniques. Phenol at 5%, glutaraldehyde at 2%, and buffered formalin at 3.7% for 1 min (tube technique) or for 10 min (slide technique) were effective in decontaminating sputum smears and preserved cell morphology and quantitative acid-fast microscopy results.

Rhodococcus equi isolation from sputum of patients with suspected tuberculosis

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Sputum cytology in the diagnosis of pulmonary paracoccidioidomycosis

The presence of Paracoccidioides brasiliensis was determined in sputum samples from 50 patients with paracoccidioidomycosis using four different techniques: (a) cell-block preparations stained with silver methenamine, (b) direct microbiologie examination, (c) smears stained with Shorr, and (d) smears stained with silver methenamine. Overall, cell-block preparations and smears stained with silver methenamine proved to be the most sensitive techniques, followed by smears stained with Shorr and direct microbiologic examination in decreasing order of sensitivity. Sputum cytology tended to be less positive in patients with interstitial pulmonary lesions as determined by chest X-ray than in patients with alveolar lesions. In addition to its high sensitivity, cell-block preparation technique allows storage of blocks and slides for further studies. © 1991 Kluwer Academic Publishers.

Influência da técnica de pressão expiratória positiva oscilante utilizando pressões expiratórias pré-determinadas na viscosidade e na transportabilidade do escarro em pacientes com bronquiectasia

OBJETIVO: Verificar a efetividade da técnica de pressão expiratória positiva oscilante (PEPO) utilizando pressões expiratórias pré-determinadas sobre a viscosidade e a transportabilidade do escarro em pacientes com bronquiectasia. MÉTODOS: Foram incluídos no estudo 15 pacientes estáveis com bronquiectasia (7 homens; média de idade = 53 ± 16 anos), submetidos a duas intervenções PEPO consecutivas, com 24 h de intervalo entre si, utilizando pressões expiratórias de 15 cmH2O (P15) e 25 cmH2O (P25). O protocolo consistiu de tosse voluntária; nova expectoração voluntária após 20 min, denominado tempo zero (T0); repouso de 10 min; e utilização da técnica em duas séries de 10 min (S1 e S2) de PEPO em P15 e P25, com intervalo de 10 min entre si. A viscosidade e transportabilidade do escarro foram avaliadas pela viscosimetria, velocidade relativa de transporte no palato de rã, deslocamento em máquina simuladora de tosse e ângulo de adesão. As amostras de escarro foram coletadas em T0, após S1 e após S2. Testes estatísticos específicos foram aplicados de acordo com a distribuição dos dados. RESULTADOS: Houve diminuição significante da viscosidade do escarro após S1 em P15 e após S2 em P25. Não houve diferenças significantes entre todas as amostras para a transportabilidade. CONCLUSÕES: Houve diminuição da viscosidade do escarro quando a PEPO foi realizada em P15 e P25, o que sugere que não seja necessário gerar alta pressão expiratória para obter o resultado desejado.

Tuberculose ativa em pacientes cirúrgicos com baciloscopia negativa no pré-operatório

OBJETIVO: Verificar a proporção de pacientes com baciloscopia negativa no pré-operatório e que apresentaram TB ativa na peça cirúrgica. MÉTODOS: Estudo retrospectivo de pacientes com diagnóstico histopatológico de TB ativa ou sequelar e operados entre os anos de 2003 e 2006 em um hospital universitário. Foram pesquisados antecedentes e aspectos clínicos relativos à doença, pesquisa de bacilos álcool-ácido resistentes (BAAR), tipo de cirurgia realizada e exame histopatológico da peça cirúrgica. RESULTADOS: Foram incluídos 43 pacientes, com média de idade de 44 ± 19 anos, sendo 27 do sexo masculino. Apresentavam história prévia de TB com tratamento adequado 28 pacientes, e 15 não referiam antecedentes para TB. O principal motivo da procura pelo serviço foi infecção de repetição, seguida por achados em exames de imagem. Dos 43 pacientes, foi pesquisado BAAR no pré-operatório em 35: 32 apresentaram resultados negativos e 3, resultados positivos. Dos 35 pacientes pesquisados, 26 apresentavam diagnóstico histopatológico de TB ativa e 9 de TB sequelar na peça cirúrgica; os outros 8 também foram diagnosticados com TB sequelar. A proporção de TB ativa em doentes com baciloscopia negativa foi de 72% (23/32), e o de baciloscopia negativa em TB ativa foi de 88% (23/26), sendo a pesquisa de BAAR positiva somente em 11,5% (3/26). CONCLUSÕES: A baciloscopia direta tem rendimento muito baixo, e muitos pacientes mesmo já tratados podem permanecer com TB em atividade com baciloscopia negativa. A TB ativa pode ser confundida com infecções secundárias ou com câncer.

Citocinas e proteínas de fase aguda do soro como marcadores de regressão da resposta inflamatória ao tratamento da tuberculose pulmonar

OBJETIVO: Analisar o padrão de citocinas pró- e antiinflamatórias e da resposta de fase aguda (RFA) como marcadores de resposta ao tratamento da tuberculose pulmonar. MÉTODOS: Determinação dos níveis de interferon-gama (IFN-γ), tumor necrosis factor-alpha (TNF-α, fator de necrose tumoral-alfa), interleucina-10 (IL-10) e transforming growth factor-beta (TGF-β, fator transformador de crescimento-beta), pelo método ELISA, em sobrenadante de cultura de células mononucleares do sangue periférico e monócitos, assim como dos níveis de proteínas totais, albumina, globulinas, alfa-1-glicoproteína ácida (AGA), proteína C reativa (PCR) e velocidade de hemossedimentação (VHS) em 28 doentes com tuberculose pulmonar, em três tempos: antes (T0), aos três meses (T3) e aos seis meses (T6) de tratamento, em relação aos controles saudáveis, em um único tempo. RESULTADOS: Os pacientes apresentaram valores maiores de citocinas e RFA que os controles em T0, com diminuição em T3 e diminuição (TNF-α, IL-10, TGF-β, AGA e VHS) ou normalização (IFN-γ e PCR) em T6. CONCLUSÕES: PCR, AGA e VHS são possíveis marcadores para auxiliar no diagnóstico de tuberculose pulmonar e na indicação de tratamento de indivíduos com baciloscopia negativa; PCR (T0 > T3 > T6 = referência) pode também ser marcador de resposta ao tratamento. Antes do tratamento, o perfil Th0 (IFN-γ, IL-10, TNF-α e TGF-β), indutor de e protetor contra inflamação, prevaleceu nos pacientes; em T6, prevaleceu o perfil Th2 (IL-10, TNF-α e TGF-β), protetor contra efeito nocivo pró-inflamatório do TNF-α ainda presente. O comportamento do IFN-γ (T0 > T3 > T6 = controle) sugere sua utilização como marcador de resposta ao tratamento.

Lesões sequelares na laringe em pacientes com paracoccidiodomicose

A Paracoccidioidomicose (PCM) é uma doença sistêmica que em sua forma sequelar se caracteriza por manifestações clínicas relacionadas às alterações anatômicas ou funcionais de órgãos e sistemas comprometidos no período de estado. OBJETIVO: Descrever as alterações anatômicas e funcionais laríngeas sequelares em pacientes com paracoccidioidomicose. MATERIAL E MÉTODOS: Estudo retrospectivo, sendo avaliados 49 pacientes do sexo masculino, na faixa etária de 30 a 60 anos, entre 1999 a 2004, com diagnóstico de PCM em acompanhamento pela disciplina de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, confirmado pela demonstração do fungo em escarro, exame citológico ou histopatológico. RESULTADOS: As pregas vocais foram a estrutura laríngea mais afetada, em 67% dos pacientes verificaram-se alterações. A epiglote estava acometida em 55% dos casos. As pregas ariepiglóticas tinham modificações em 53% dos pacientes. As pregas vestibulares estavam alteradas em 46% dos casos. em 40% dos casos verificaram-se alterações em aritenoides. Na fonação, 28% tinham limitação ao movimento das cordas vocais, paresia unilateral ocorreu em 4% casos. em 24% havia restrição da luz supraglótica e 4% tinham estenose glótica, sendo que 2% precisaram de traqueotomia. CONCLUSÃO: As lesões sequelares na laringe devido à infecção pelo P. brasilienses são extensas e causam restrições funcionais na maioria dos casos.

Accuracy of routine diagnostic tests used in paracoccidioidomycosis patients at a university hospital

The identification of appropriate laboratory measures to confirm clinical hypotheses is important in routine paracoccidioidomycosis medical care. The clinical records and laboratory reports of 401 paracoccidioidomycosis patients attended at the Tropical Diseases Area, Faculdade de Medicina de Botucatu, from 1974 to 2008 were reviewed. Direct mycological (DM), cell block (CB), histopathological (HP), and double immunodiffusion (DID) tests were evaluated before treatment. Typical Paracoccidioides brasiliensis yeast forms were observed in clinical specimens of 86% of the patients, but 14% were detected only by serological test. DM of 51 different tissue specimens produced 74.5% sensitivity, and 62.5% sensitivity was observed in 112 sputum samples. CB in 483 sputum samples generated 55.3% sensitivity. HP performed in 239 samples from different tissues revealed 96.7% sensitivity. Serology carried out in 351 patients and 200 healthy controls provided 90.0% sensitivity, 100.0% specificity, 100.0% positive predictive value, 85.1% negative predictive value and 93.6% accuracy. Comparisons of laboratory measurements performed in the same patient showed that sensitivity decreases from HP to DID to CB and DM, with the last two assays providing similar sensitivities. This study demonstrated that P. brasiliensis identification by HP, CB, and/or DM associated with DID is sufficient to establish the laboratorial diagnosis of paracoccidioidomycosis in practically all cases. (C) 2011 Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene. Published by Elsevier Ltd. All rights reserved.

Análise das condições de saúde e de vida da população urbana de Botucatu, SP (Brasil): III - Conhecimentos e opiniões dos profissionais de saúde a respeito de sintomas de doenças, 1984

Foram estudados os conhecimentos e opiniões dos profissionais de saúde do Município de Botucatu, SP (Brasil), acerca da freqüência e gravidade de treze sintomas e sinais de doenças, visando à comparação com as opiniões emitidas pela população urbana do Município. Foram entrevistados 435 profissionais de saúde ativos (médicos, enfermeiros, auxiliares e atendentes de enfermagem e outros), a maioria do sexo feminino, com idade de 25 a 44 anos. A categoria de atendentes foi a mais numerosa. de modo geral, os cinco últimos sintomas da relação constante do formulário - sangue no escarro, sangramento vaginal, caroço no seio, acessos e sangue na urina, foram considerados menos freqüentes e mais graves, comparativamente aos oito primeiros: falta de ar, febre, fraqueza, dor nas costas, dor no peito, dor de cabeça, tosse e diarréia. Dentre as categorias, os médicos diferenciaram-se atribuindo, com menor freqüência, escores altos para a freqüência e gravidade. Os clínicos valorizaram mais do que os cirurgiões, esses dois fatores, para quase todos os sintomas. O cotejo com a opinião dos leigos entrevistados revelou semelhanças nas tendências, embora tenha havido, por parte destes, maior valorização da freqüência e gravidade.

Tuberculosis diagnosis after bleach processing for early stage tuberculosis laboratory capacity building

The diagnosis of tuberculosis is seriously hampered in the absence of standard biosafety laboratory facilities for specimen concentration and Mycobacterium tuberculosis culture. Within a laboratory twinning arrangement, heat-fixed direct smear and sediment from 74 bleach-processed and 20 non-processed specimens from Cumura Hospital, Guinea-Bissau, were sent to Lisbon for molecular evaluation of rifampicin resistance. Sequence analysis of a 369 base-pair ppoB locus detected 3.2% (3/94) resistant specimens. To our knowledge, this represents the first report on the molecular analysis of M. tuberculosis from bleach-processed sputum, an alternative to current diagnostic practice in low-resource settings.

IgG, IgM and IgA antibody response for the diagnosis and follow-up of paracoccidioidomycosis: Comparison of counterimmunoelectrophoresis and complement fixation

IgG, IgM and IgA antibodies to GP43 (glycoprotein fraction of Paracoccidioides brasiliensis) were measured by ELISA in 63 samples from 23 patients with paracoccidioidomycosis before and twice after chemotherapy was started. Antibodies against P. brasiliensis were detected by indirect immunofluorescence (IF) (IgG, IgM and IgA isotypes), counterimmunoelectrophoresis (CIE) and complement fixation. Two control groups composed of 19 healthy individuals and 12 patients with other diseases (six with histoplasmosis, three with tuberculosis and three with other mycoses). The highest efficiency percentages were found with IgG and IgA- ELISA (100%), IgG-IF (96.2%), CIE (94.4%) and the lowest with CF (75.9%). Highest positive and negative predictive values (100%) were observed for IgG and IgA ELISA. IgG and IgM-ELISA antibodies are more often found in patients with acute than chronic disease (P = 0.01). Four to six months after treatment follow-up showed decreased levels of IgG and IgM-ELISA for acute cases and decreased titres of CIE for chronic cases in relation to pretreatment levels. This study suggests that IgG-ELISA anti-GP43 represents a good marker to monitor clinical response to therapy.

Caracterização da população portadora de tuberculose do município de Américo Brasiliense/SP, no período de 1992 a 2002

Tuberculosis (TB) is a serious public health problem all over the world, which was recognized by the WHO in 1993 as a global emergency because of its very high incidence in the 22 countries that concentrate 80% of TB cases. One of these countries is Brazil, where TB occurrences are well-documented in major cities, but little is known of its spread in rural areas and small towns. Therefore, an epidemiological study was done on medical records of TB sufferers in the rural district and small town of Américo Brasiliense, São Paulo state, from 1992 to 2002, with the aim of improving TB prevention and treatment. The results showed that the incidence of TB peaked in the years of intense migration of rural workers, largely cane-cutters. Among these, the disease attacks mainly the men, in their productive years (20 to 40 years old). The predominant clinical form observed was pulmonary tuberculosis. The treatment abandonment rate was less than 1.8%, while the cure rate was around 90%. The disease detection rate by examination of sputum for acid-fast bacilli was around 60%.

Rapid molecular diagnosis of tuberculosis and other mycobacteriosis in smear-negative clinical specimens

Delay in diagnosis of pulmonary and other forms of tuberculosis (TB) can be fatal, particularly in HIV-infected patients. Hence, techniques based on nucleic acid amplification, which are both rapid and of high specificity and sensitivity, are now widely used and recommended for laboratories that diagnose TB. In the present study, diagnostic methods based on mycobacterial DNA amplification were evaluated in comparative trials alongside tradicional bacterial methods, using negative smear samples from patients with clinically-suspected TB (sputum samples from 25 patients with suspected pulmonary TB, urine samples from two patients with suspected renal TB and cerebrospinal fluid samples from one patient with suspected meningeal TB). A specificity of 100% was achieved with DNA amplification methods and tradicional culture/identification methods, in relation to clinical findings and treatment results. For the smear-negative sputa, conventional PCR for M. tuberculosis was positive in 62% of suspected lung TB case, showing the same sensitivity as bacterial identification. Both techniques failed in the detection of extra-pulmonary samples. Nested PCR showed, after species-specific amplification, a sensitivity of 100% for M. avium and 85% for M. tuberculosis. For extra-pulmonary smear-negative samples, only Nested PCR detected M. tuberculosis and all cases were confirmed clinically. Nested PCR, in which two-step amplification reactions are performed, can identify the two most important mycobacteria in human pathology quickly and directly from clinical spicimens.

Comparison of three molecular typing methods to assess genetic diversity for Mycobacterium tuberculosis

This study describes the comparison of three methods for genotyping of Mycobacterium tuberculosis, namely MIRU-VNTR (mycobacterial interspersed repetitive units-variable number of tandem repeats), spoligotyping and, for the first time, MLST (Multilocus Sequence Typing). In order to evaluate the discriminatory power of these methods, a total of 44 M. tuberculosis isolates obtained from sputum specimens of patients from Brazil were genotyped. Among the three methods, MLST showed the lowest discriminatory power compared to the other two techniques. MIRU-VNTR showed better discriminatory power when compared to spoligotyping, however, the combination of both methods provides the greatest level of discrimination and therefore this combination is the most useful genotyping tool to be applied to M. tuberculosis isolates. © 2013 Elsevier B.V.