A clonal Plasmodium falciparum population in an isolated outbreak of malaria in the Republic of Cabo Verde

We present the first parasitological, molecular and longitudinal analysis of an isolated outbreak of malaria. This outbreak occurred on Santiago Island (Republic of Cabo Verde), a region where malaria is hypoendemic and controlled, and thus the population is considered non-immune. Blood samples were collected from the inhabitants over 1 month and during cross-sectional surveys in the following year. The presence and nature of the parasites was determined by PCR. Plasmodium falciparum was the only species detected. Genetic analysis revealed that the circulating parasites were genetically homogeneous, and probably clonal. Gametocytes were found throughout this period. Our data suggest that this represented a focal outbreak, resulting in the infection of at least 40% of the villagers with a clonal parasite line. Thus, P. falciparum infections can persist for at least 1 year in a substantial proportion (10%) of the hosts. Implications for malaria control and the interpretation of epidemiological data are discussed.

Mini-STRs em genética forense

A análise do ADN baseada nos STRs (Short Tandem Repeats) tem provado ser uma ferramenta extremamente útil em estudos forenses. A aplicação dos multiplex de STRs resulta em perfis genéticos completos, para a maior parte das amostras, desde que contenham uma quantidade apreciável de ADN. Contudo, em amostras com ADN degradado, a análise tornase mais complicada, uma vez que os STRs com maior peso molecular (acima dos 250 pb), podem não ser amplificados nestas condições. Como a metodologia de Mini-STRs não estava, ainda, implementada nos Laboratórios Forenses portugueses, o objectivo principal deste estudo consistiu na aplicação de um multiplex, designado por Mini-SGM, que contém os marcadores TH01, FGA, D18S51, D16S359, D2S1338 e a Amelogenina, para implementação na prática forense, tendo os resultados sido comparados com a metodologia de rotina. O trabalho experimental teve início com um estudo populacional, que compreendeu uma amostra de 110 indivíduos de origem portuguesa, não relacionados e uma amostra de 52 indivíduos, não relacionados, oriundos de Cabo Verde, encontrando-se, ambas as populações, em Equilíbrio de Hardy-Weinberg, excepto para o locus D18S51, na população portuguesa e o locus D2S1338 na população de origem africana. Em relação aos parâmetros estatísticos forenses, este estudo demonstrou que o poder de discriminação varia entre 0,903 e 0,959, para a população portuguesa, e entre 0,908 e 0,958, para a população de Cabo Verde. Após o estudo populacional, foram analisados 39 casos forenses, devidamente anonimizados, da casuística do Serviço de Genética e Biologia Forense da Delegação de Lisboa do INML, com diferentes tipos de vestígios biológicos, como sangue, ossos, pulmão, coração, tecidos embrionários, tecidos inclusos em parafina, fígado, rim e dentes, de modo a ilustrar a utilidade desta nova metodologia nos casos forenses. No estudo de amostras degradadas, o uso da metodologia de rotina pode,