Persistent association of nailfold capillaroscopy changes and skin involvement over thirty-six months with duration of untreated disease in patients with juvenile dermatomyositis.

OBJECTIVE: To determine the association of changes on nailfold capillaroscopy with clinical findings and genotype in children with juvenile dermatomyositis (DM), in order to identify potential differences in disease course over 36 months. METHODS: At diagnosis of juvenile DM in 61 children prior to the initiation of treatment, tumor necrosis factor alpha (TNFalpha) -308 allele and DQA1*0501 status was determined, juvenile DM Disease Activity Scores (DAS) were obtained, and nailfold capillaroscopy was performed. The disease course was monitored for 36 months. Variations within and between patients were assessed by regression analysis. RESULTS: At diagnosis, shorter duration of untreated disease (P = 0.05) and a lower juvenile DM skin DAS (P = 0.035) were associated with a unicyclic disease course. Over 36 months, end-row loop (ERL) regeneration was associated with lower skin DAS (P < 0.001) but not muscle DAS (P = 0.98); ERL regeneration and decreased bushy loops were associated with a shorter duration of untreated disease (P = 0.04 for both). At 36 months, increased ERL regeneration (P = 0.007) and improvement of skin DAS (P < 0.001) and muscle DAS (P = 0.025) were associated with a unicyclic disease course. CONCLUSION: Early treatment of juvenile DM may lead to a unicyclic disease course. The non-unicyclic disease course usually involves continuing skin manifestations with persistent nailfold capillaroscopy changes. The correlation of nailfold capillaroscopy results with cutaneous but not with musculoskeletal signs of juvenile DM over a 36-month period suggests that the cutaneous and muscle vasculopathies have different pathophysiologic mechanisms. These findings indicate that efforts to identify the optimal treatment of cutaneous features in juvenile DM require greater attention.

Cellular and viral factors implicated in persistent infection in canine distemper virus

Summary SLAM (signalling lymphocyte activation molecule, CD150) serves as a cellular receptor for different morbiliviruses, including measles virus and canine distemper virus. Laboratory cell lines that do not express dog SLAM are therefore quite refractory to infection by wildtype CDV. SLAM expression is not only required for CDV virion attachment, but also for the establishment of cytolytic infection characterized by syncytia formation. In order to determine if SLAM has a direct influence on CDV replication, we compared wild-type and mutated SLAM variants for their capacity to influence viral polymerase activity and syncytia formation. Deletion of immunoreceptor tyrosine-based signalling motif (ITSM) in the cytoplasmic tail of SLAM did not seem to influence viral replication, viral polymerase activity or cell-to cell fusion. Instead, it was the level of cell surface expression of SLAM, which was important. Additional experiments corroborated the importance of SLAM for efficient cell-to cell fusion: Both SLAM, as well as viral fusion (F) and attachment (H) glycoproteins, were found to be required for efficient cell-to-cell fusion, which, in turn, enhanced the activity of the viral polymerase and, viral replication. Wild-type A75/17 canine distemper virus (CDV) strain is known to induce a persistent infection in the central nervous system and in dog footpad keratinocytes in vivo. Recently, it has been shown that the A75/17 virus could also infect canine footpad keratinocytes (CFKs) in vitro. CFK infection with A75/17 was initially inefficient and produced very little virus progeny, however, after only three passages the adapted virus produced more progeny and induced limited syncytia formation. Sequence comparison between the A75/17 and the CFKadapted A75/17-K virus revealed three amino acid differences, one in the phosphoprotein (P), one in the matrix protein (M) and one in the H protein. In order to identify viral determinants of A75/17-K adaptation, recombinant viruses containing one, two or three nucleotides substitutions were analyzed. The amino acid substitution in the M protein was without effect on viral particle formation. In contrast, the amino acid substitution in the cytoplasmic tail of H protein was clearly important for syncytia formation. Concerning the mutation in the P protein, it led to an increase in viral replication. However, we cannot rule out that the observed effect is due to the amino acid substitutions in the overlapping accessory proteins C and V, also affected by the P mutation. The adaptation of wild-type CDV strains to cell culture almost always involves modifications of M protein. In order to understand the influence of these modifications, we tested recombinant A75/17 viruses bearing different M proteins. Preliminary results demonstrated that the M protein from the Vero-adapted strain reduced syncytia formation. Future studies will focus on the M mRNA and protein stability, its expression level, localisation and its effect on viral particles formation and on the phenotype of infection. Résumé La protéine SLAM (signalling lymphocyte activation molecule ou CD150) est utilisée comme récepteur cellulaire par les morbillivirus parmi lesquels on trouve le virus de la rougeole (VR) ainsi que le virus de la maladie de Carré (CDV). Les lignées cellulaires qui n'expriment pas la protéine SLAM du chien à leur surface sont réfractaires à l'infection par les souches sauvages de CDV. Le récepteur SLAM n'est pas seulement requis pour l'attachement du virion à la surface de la cellule, mais il participe également de façon active à l'établissement d'une infection cytolytique à travers la formation de syncytia. Afin de déterminer si la protéine SLAM exerce une influence directe sur la réplication virale du virus de la maladie de Carré, nous avons généré différentes protéines tronquées de SLAM et comparé leurs capacités à influencer l'activité de la polymérase ainsi que la formation de syncytia. Nos résultas ont montré que la réplication virale, l'activité de la polymérase ainsi que la fusion cellulaire ne semblent pas être influencées par les délétions dans les régions cytoplasmiques du récepteur SLAM. Cependant, ces délétions agissent sur l'expression de la protéine SLAM à la surface des cellules. Les expériences additionnelles ont permis de souligner l'importance de la protéine SLAM dans le phénomène de fusion entre cellules. En effet, la protéine SLAM ainsi que les deux glycoprotéines virales F et H sont requises pour la formation de syncytia, laquelle induit une augmentation de l'activité de la polymérase ainsi que de la réplication virale. La souche virulente A75/17 du virus, de la Maladie de Carré est connue pour induire une infection persistante au niveau du système nerveux central ainsi que dans les kératinocytes de pattes chez le chien. Des études récentes ont montré que des cultures primaires de kératinocytes de chien pouvaient aussi êtres infectées par la souche A75/17 de CDV. En effet, le virus induit une infection persistante en produisant très peu de progéniture. Cependant, trois passages du virus sauvage A75/17 dans ces cultures aboutissent à la sélection d'un virus produisant plus de progéniture et favorisant la formation limitée de syncytia. La comparaison des séquences génomique entre la souche A75/17 et la souche adaptée A75/17-K montre une différence de trois nucléotides. La première mutation, située dans le gène P, modifie la phosphoprotéine (P) ainsi que les protéines V et C. La deuxième se situe dans le gène de la protéine matricielle (M) et la dernière dans celui de la protéine d'attachement (H). Afin de déterminer les facteurs viraux impliqués lors de l'adaptation virale dans la culture primaire de kératinocytes, des virus recombinants contenant une, deux ou trois de ces mutations ont été analysés. La substitution d'un acide aminé dans la protéine M reste sans effet sur la production de particules virales. En revanche, la substitution d'un acide aminé dans la queue cytoplasmique de la protéine H s'avère clairement importante pour la formation de syncytia. Quant à la mutation dans le gène P, elle permet une augmentation de la réplication virale. Cependant, nous ne pouvons pas écarter l'hypothèse que l'augmentation de la réplication virale soit due aux substitutions d'un acide aminé dans les protéines accessoires V et C qui sont, elles aussi, affectées par la mutation dans le gène P. L'adaptation des souches sauvages de CDV aux cultures de cellules induit presque toujours des modifications de la protéine matricielle M. Afin de comprendre l'influence de ces modifications, nous avons testé 'des virus A75/17 recombinants contenant différentes protéines M. Les résultats préliminaires ont démontré que la protéine M de la souche adaptée aux cellules Vero réduisait la formation de syncytia. Les études futures seront axées sur la stabilité de l'ARN messager, celle de la protéine M, de son niveau d'expression, de sa localisation cellulaire et de son effet sur la formation de particules virale ainsi que sur le phénotype de l'infection.

Intermittierende oder Persistierende Rhinitis bei Kindern und Jugendlichen mit Asthma: «The Swiss LARA paediatrics survey [Intermittent or persistent rhinitis in children and adolescents with Asthma: «the Swiss LARA paediatrics survey»].

Asthma and allergic rhinitis are chronic inflammatory airway diseases which often occur concomitantly. The objective of the LARA program was to identify the comorbidities and characteristics of asthma (A), intermittent or persistent rhinitis (IPR) and physician defined atopic dermatitis (AD) in 6- to 16-year old asthmatic Swiss children and adolescents. Overall, 126 general practitioners and paediatricians collected the data of 670 asthmatics. Approximately one third of the asthmatic children in Switzerland had well-controlled asthma. Almost two thirds of these asthmatics suffered from concomitant IPR. The latter presented with significantly less symptoms while the treatment rates with inhaled corticosteroids (approximately 90%) and leukotriene-receptorantagonists (approximately 50%) were comparable. However, there were almost twice as many passive smokers in the less well-controlled group. The prevalence of AD was similar in both groups. IPR and AD may play an important role as risk factors in the future development of asthma.

Hépatite cholestatique persistante sur terbinafine [Terbinafine induced hepatitis with persistent cholestasis]

Nous décrivons un cas d'hépatite cholestatique persistante apparue après un mois de traitement oral par terbinafine pour onychomycose, chez une patiente de 55 ans. Cette femme présente un prurit et un ictère, avec une cholestase sévère plusieurs semaines après l'arrêt de l'antimycosique. Nous excluons une cause infectieuse ou auto-immune. L'histologie d'une biopsie hépatique transjugulaire est compatible avec une réaction immuno-allergique déclenchée par la prise de terbinafine. Nous détaillons les mécanismes d'action de la terbinafine ainsi que sa toxicité hépatique. Nous expliquons la prise en charge et le pronostic d'une hépatite cholestatique d'origine médicamenteuse. La discussion traite du risque d'effets secondaires graves de cette molécule et des précautions à prendre pour le praticien prescripteur.

Recovery of a persistent Canine distemper virus expressing the enhanced green fluorescent protein from cloned cDNA.

Wild-type A75/17-Canine distemper virus (CDV) is a highly virulent strain, which induces a persistent infection in the central nervous system (CNS) with demyelinating disease. Wild-type A75/17-CDV, which is unable to replicate in cell lines to detectable levels, was adapted to grow in Vero cells and was designated A75/17-V. Sequence comparison between the two genomes revealed seven nucleotide differences located in the phosphoprotein (P), the matrix (M) and the large (L) genes. The P gene is polycistronic and encodes two auxiliary proteins, V and C, besides the P protein. The mutations resulted in amino acid changes in the P and V, but not in the C protein, as well as in the M and L proteins. Here, a rescue system was developed for the A75/17-V strain, which was shown to be attenuated in vivo, but retains a persistent infection phenotype in Vero cells. In order to track the recombinant virus, an additional transcription unit coding for the enhanced green fluorescent protein (eGFP) was inserted at the 3' proximal position in the A75/17-V cDNA clone. Reverse genetics technology will allow us to characterize the genetic determinants of A75/17-V CDV persistent infection in cell culture.

Persistent left superior vena cava in cardiac congenital surgery

La persistance d'une veine cave supérieure gauche (VCSG) est une entité relativement fréquente dans le cadre des malformations cardiaques congénitales. Le but de cette étude est d'analyser à quel moment le diagnostic de la persistance de la VCSG est effectué, à quel moment le diagnostic des éventuelles anomalies du sinus coronarien associées est effectué, et de l'impact global de la persistance d'une VCSG sur la mortalité et la morbidité des patients après chirurgie cardiaque pour une malformation cardiaque congénitale. Analyse rétrospective d'une cohorte d'enfants ayant subi une chirurgie cardiaque avec circulation extracorporelle pour une malformation cardiaque congénitale. Trois-cent septante et un patients ont été inclus dans l'étude avec un âge médian de 2.75 ans (IQR 0.65-6.63). Parmi eux, 47 patients présentaient une persistance de la VCSG (12.7%), et cette persistance de la VCSG a été identifiée par échocardiographie dans le cadre du bilan préopératoire chez 39 patients (83%). Trois patients (6.4%) présentant une persistance de la VCSG, ont développé après chirurgie cardiaque, une obstruction significative de la voie d'entrée du ventricule gauche qui a aboutit à un débit cardiaque anormal ou à une hypertension pulmonaire secondaire. Chez huit patients (17%), la persistance de la VCSG, était associée à un défaut partiel ou total de fermeture du sinus coronarien et dans deux cas (4%) à une atrésie de l'ostium du sinus coronarien. La durée de la ventilation mécanique était plus courte de façon significative dans le groupe contrôle (1.2 vs. 3.0 jours, p = 0.004), tandis que la durée de séjour aux soins intensifs ne différait pas. La mortalité était significativement moins élevée dans le groupe contrôle que dans le groupe de patient avec persistance de la VCSG (2.5 vs. 10.6 %, p = 0.004). Les résultats de cette étude montrent que la persistance de la VCSG en association avec une malformation cardiaque congénitale augmente le risque de mortalité chez les enfants qui subissent une chirurgie cardiaque avec circulation extracorporelle. La mise en évidence d'une persistance de la VCSG et des anomalies associées, s'impose pour éviter des complications pendant et après une chirurgie cardiaque.

Persistent unequal sex ratio in a population of grayling (salmonidae) and possible role of temperature increase.

In some fishes, water chemistry or temperature affects sex determination or creates sex-specific selection pressures. The resulting population sex ratios are hard to predict from laboratory studies if the environmental triggers interact with other factors, whereas in field studies, singular observations of unusual sex ratios may be particularly prone to selective reporting. Long-term monitoring largely avoids these problems. We studied a population of grayling (Thymallus thymallus) in Lake Thun, Switzerland, that has been monitored since 1948. Samples of spawning fish have been caught about 3 times/week around spawning season, and water temperature at the spawning site has been continuously recorded since 1970. We used scale samples collected in different years to determine the average age of spawners (for life-stage specific analyses) and to identify the cohort born in 2003 (an extraordinarily warm year). Recent tissue samples were genotyped on microsatellite markers to test for genetic bottlenecks in the past and to estimate the genetically effective population size (N(e) ). Operational sex ratios changed from approximately 65% males before 1993 to approximately 85% males from 1993 to 2011. Sex ratios correlated with the water temperatures the fish experienced in their first year of life. Sex ratios were best explained by the average temperature juvenile fish experienced during their first summer. Grayling abundance is declining, but we found no evidence of a strong genetic bottleneck that would explain the apparent lack of evolutionary response to the unequal sex ratio. Results of other studies show no evidence of endocrine disruptors in the study area. Our findings suggest temperature affects population sex ratio and thereby contributes to population decline. Persistencia de Proporción de Sexos Desigual en una Población de Tímalos (Salmonidae) y el Posible Papel del Incremento de la Temperatura.

A novel HIV vaccine adjuvanted by IC31 induces robust and persistent humoral and cellular immunity.

The HIV vaccine strategy that, to date, generated immune protection consisted of a prime-boost regimen using a canarypox vector and an HIV envelope protein with alum, as shown in the RV144 trial. Since the efficacy was weak, and previous HIV vaccine trials designed to generate antibody responses failed, we hypothesized that generation of T cell responses would result in improved protection. Thus, we tested the immunogenicity of a similar envelope-based vaccine using a mouse model, with two modifications: a clade C CN54gp140 HIV envelope protein was adjuvanted by the TLR9 agonist IC31®, and the viral vector was the vaccinia strain NYVAC-CN54 expressing HIV envelope gp120. The use of IC31® facilitated immunoglobulin isotype switching, leading to the production of Env-specific IgG2a, as compared to protein with alum alone. Boosting with NYVAC-CN54 resulted in the generation of more robust Th1 T cell responses. Moreover, gp140 prime with IC31® and alum followed by NYVAC-CN54 boost resulted in the formation and persistence of central and effector memory populations in the spleen and an effector memory population in the gut. Our data suggest that this regimen is promising and could improve the protection rate by eliciting strong and long-lasting humoral and cellular immune responses.

The fusion protein of wild-type canine distemper virus is a major determinant of persistent infection.

The wild-type A75/17 canine distemper virus (CDV) strain induces a persistent infection in the central nervous system but infects cell lines very inefficiently. In contrast, the genetically more distant Onderstepoort CDV vaccine strain (OP-CDV) induces extensive syncytia formation. Here, we investigated the roles of wild-type fusion (F(WT)) and attachment (H(WT)) proteins in Vero cells expressing, or not, the canine SLAM receptor by transfection experiments and by studying recombinants viruses expressing different combinations of wild-type and OP-CDV glycoproteins. We show that low fusogenicity is not due to a defect of the envelope proteins to reach the cell surface and that H(WT) determines persistent infection in a receptor-dependent manner, emphasizing the role of SLAM as a potent enhancer of fusogenicity. However, importantly, F(WT) reduced cell-to-cell fusion independently of the cell surface receptor, thus demonstrating that the fusion protein of the neurovirulent A75/17-CDV strain plays a key role in determining persistent infection.

Persistent left superior vena cava in cardiac congenital surgery.

Persistent left superior vena cava (LSVC) is a relatively frequent finding in congenital cardiac malformation. The scope of the study was to analyze the timing of diagnosis of persistent LSVC, the timing of diagnosis of associated anomalies of the coronary sinus, and the global impact on morbidity and mortality of persistent LSVC in children with congenital heart disease after cardiac surgery. Retrospective analysis of a cohort of children after cardiac surgery on bypass for congenital heart disease. Three hundred seventy-one patients were included in the study, and their median age was 2.75 years (IQR 0.65-6.63). Forty-seven children had persistent LSVC (12.7 %), and persistent LSVC was identified on echocardiography before surgery in 39 patients (83 %). In three patients (6.4 %) with persistent LSVC, significant inflow obstruction of the left ventricle developed after surgery leading to low output syndrome or secondary pulmonary hypertension. In eight patients (17 %), persistent LSVC was associated with a partially or completely unroofed coronary sinus and in two cases (4 %) with coronary sinus ostial atresia. Duration of mechanical ventilation was significantly shorter in the control group (1.2 vs. 3.0 days, p = 0.04), whereas length of stay in intensive care did not differ. Mortality was also significantly lower in the control group (2.5 vs. 10.6 %, p = 0.004). The results of study show that persistent LSVC in association with congenital cardiac malformation increases the risk of mortality in children with cardiac surgery on cardiopulmonary bypass. Recognition of a persistent LSVC and its associated anomalies is mandatory to avoid complications during or after cardiac surgery.

Persistent Candida albicans colonization and molecular mechanisms of azole resistance in autoimmune polyendocrinopathy-candidiasis-ectodermal dystrophy (APECED) patients.

Objectives: Patients with autoimmune polyendocrinopathy-candidiasis-ectodermal dystrophy (APECED, APS-I) suffer from chronic candidosis caused mainly by Candida albicans, and repeated courses of azole antifungals have led to the development of resistance in the APECED patient population in Finland. The aim of our study was to address whether the patients are persistently colonized with the same or genetically closely related strains, whether epidemic strains are present and which molecular mechanisms account for azole resistance. Methods: Sets of C. albicans (n?=?19) isolates from nine APECED patients reported with decreased susceptibility to fluconazole isolated up to 9 years apart were included. The strains were typed by multilocus sequence typing. CDR1/2, MDR1 and ERG11 mRNA expression was analysed by northern blotting and Cdr1, Cdr2 and Mdr1 protein expression by western blotting, and TAC1 and ERG11 genes were sequenced. Results: All seven patients with multiple C. albicans isolates analysed were persistently colonized with the same or a genetically closely related strain for a mean of 5 years. All patients were colonized with different strains and no epidemic strains were found. The major molecular mechanisms behind the azole resistance were mutations in TAC1 contributing to overexpression of CDR1 and CDR2. Six new TAC1 mutations were found, one of which (N740S) is likely to be a gain-of-function mutation. Most isolates were found to have gained multiple TAC1 and ERG11 point mutations. Conclusions: Despite clinically successful treatment leading to relief of symptoms, colonization by C. albicans strains is persistent within APECED patients. Microevolution and point mutations occur within strains, leading to the development of azole-resistant isolates.

Immunology of viral disease, how to curb persistent infection

1. 1. Summaries 1.1. Preamble and extended abstract The present thesis dissertation addresses the question of antiviral immunity from the particular standpoint of the adaptive T cell-mediated immune response. The experimental work is presented in the form of three published articles (two experimental articles and one review article, see sections 4.1, 4.2 and 4.3 on pages 73, 81 and 91, respectively), describing advances both in our understanding of viral control by CD8 T lymphocytes, and in vaccine development against the Human Immunodeficiency Virus Type 1 (HIV-1). Because the articles focus on rather specialized areas of antiviral immunity, the article sections are preceded by a general introduction (section 3) on the immune system in general, and on four viruses that were addressed in the experimental work, namely HIV-1, Cytomegalovirus (CMV), Epstein Barr Virus (EBV) and Influenzavirus (Flu). This introduction section is aimed at providing a glimpse on viral molecular biology and immunity, to help the hypothetical non-expert reader proceeding into the experimental part. For this reason, each section is presented as individual entity and can be consulted separately. The four viruses described are of peculiar relevance to immunity because they induce an array of opposite host responses. Flu causes a self limiting disease after which the virus is eradicated. CMV and EBV cause pauci-symptomatic or asymptomatic diseases after which the viruses establish lifelong latency in the host cells, but are kept in check by immunity. Eventually, HIV-1 establishes both latency - by inserting its genome into the host cell chromosome - and proceeds in destroying the immune system in a poorly controlled fashion. Hence, understanding the fundamental differences between these kinds of viral host interactions might help develop new strategies to curb progressive diseases caused by viruses such as HIV-1. Publication #1: The first article (section 4.1, page 73) represents the main frame of my laboratory work. It analyses the ability of CD8 T lymphocytes recovered from viral-infected patients to secrete interferon γ (IFN-γ) alone or in conjunction with interleukin 2 (IL-2) when exposed in vitro to their cognate viral antigens. CD8 T cells are instrumental in controlling viral infection. They can identify infected cells by detecting viral antigens presented at the surface of the infected cells, and eliminate both the cell and its infecting virus by triggering apoptosis and/or lysis of the infected cell. Recognition of these antigens triggers the cognate CD8 cells to produce cytokines, including IFN-γ and IL-2, which in turn attract and activate other pro-inflammatory cells. IFN-γ triggers both intrinsic antiviral activity of the infected cells and distant activation of pro-inflammatory cells, which are important for the eradication of infection. IL-2 is essential for clonal expansion of the antigen (Ag)-specific CD8 T cell. Hence the existence of Ag-specific CD8 cells secreting both IFN-γand IL-2 should be beneficial for controlling infection. In this first work we determined the percentage of IFN-y/IL-2 double positive and single IFN-γsecreting CD8 T cells against antigens HIV-1, CMV, EBV and Flu in three groups of subjects: (i) HIV-1 infected patients progressing to disease (progressors), (ii) HIV-1-infected subjects not progressing to disease (long-term non progressors or LTNP), and (iii) HIV negative blood donors. The results disclosed a specific IFN-y/IL-2 double positive CD8 response in all subjects able to control infection. In other words, IFN-y/IL-2 double positive CD8 cells were present in virus-specific CD8 T cells against Flu, CMV and EBV as well against HIV-1 in LTNP. In contrast, progressors only had single IFN-γsecreting CD8 T cells. Hence, the ability to develop an IFN-y/IL-2 double positive response might be critical to control infection, independently of the nature of the virus. Additional experiments helped identify the developmental stage of the missing cells (using different markers such as CD45RA and CCR7) and showed a correlation between the absence of IL-2 secreting CD8 T cells and a failure in the proliferation capacity of virus-specific CD8 T cells. Addition of exogenous IL-2 could restore clonal expansion of HIV-1 specific CD8 T cells, at least in vitro. It could further been shown, that IL-2 secreting CD8 T cells are sufficient to support proliferation even in absence of CD4 help. However, the reason for the missing IFN-y/IL-2 double positive CD8 T cell response in HIV-1 progessors has yet to be determined. Publication #2: The second article (section 4.2, page 81) explores new strategies to trigger CD8 T cell immunity against specific HIV-1 proteins believed to be processed and exposed as "infection signal" at the surface of infected cells. Such signals consist of peptide fragments (8- 13 amino acids) originating from viral proteins and presented to CD8 T cells in the frame of particular cell surface molecules of the major histocompatibility complex class I* (MHC I). To mimic "natural" viral infection, the HIV-1 polyprotein Gagpolnef was inserted and expressed in either of two attenuated viruses i.e. vaccinia virus (MVA) or poxvirus (NYVAC). Mice were infected with these recombinant viruses and specific CD8 T cell response to Gagpolnef peptides was sought. Mice could indeed mount a CD8 T cell response against the HIV-1 antigens, indicating that the system worked, at least in this animal model. To further test whether peptides from Gagpolnef could also be presented in the frame of the human MHC class I proteins, a second round of experiments was performed in "humanized" transgenic mice expressing human MHC molecules. The transgenic mice were also able to load Gagpolnef peptides on their human MHC molecule, and these cells could be detected and destroyed by Ag-specific CD8 T cells isolated from HIV-1-infected patients. Therefore, expressing Gagpolnef on attenuated recombinant viruses might represent a valid strategy for anti-HIV-1 immunization in human. Publication #3: This is a review paper (section 4.3, page 91) describing the immune response to CMV and newly developed methods to detect this cellular immune response. Some of it focuses on the detection of T cells by using in vitro manufactured tetramers. These consist of four MHC class I molecules linked together and loaded with the appropriate antigenic peptide. The tetramer can be labeled with a fluorochrome and analyzed with a fluorescence-activated cell sorter. Taken together, the work presented indicates that (i) an appropriate CD8 T cell response consisting of IFN-y/IL-2 double positive effectors, can potentially control viral infection, including HIV-1 infection, (ii) such a response might be triggered by recombinant viral vaccines, and (iii) CD8 T cell response can be monitored by a variety of techniques, including recently-developed MHC class I tetramers. 1. 2. Préambule et résumé élargi Le présent travail de thèse s'intéresse à l'immunité antivirale du point de vue particulier de la réponse adaptative des cellules T. Le travail expérimental est présenté sous la forme de trois articles publiés (2 articles expérimentaux et 1 article de revue, voir sections 4.1, 4.2 et 4.3, pages 58, 66 et 77, respectivement), décrivant des progrès dans la compréhension du contrôle de l'infection virale par les lymphocytes T CD8, ainsi que dans le développement de nouveaux vaccins contre le Virus d'Immunodéficience de Humaine de type 1 (VIH-1). En raison du caractère spécialisé de l'immunité antivirale de type cellulaire, les articles sont précédés par une introduction générale (section 3), dont le but est de pourvoir le lecteur non avisé avec des bases nécessaire à une meilleure appréhension du travail expérimental. Cette introduction présente les grandes lignes du système immunitaire, et décrit de façon générale les 4 virus utilisés dans le travail expérimental: à savoir le virus VIH-1, le Cytomégalovirus (CMV), le virus Epstein Barr (EBV) et le virus Influenza A (Flu). Toutes les sections sont présentées de façon individuelle et peuvent être consultées séparément. La description des 4 virus a une pertinence particulière quant à leur interaction avec le système immun. En effet, ils induisent une panoplie de réponses immunitaires s'étendant aux extrêmes de la réaction de l'hôte. Influenza A est à l'origine d'une maladie cytopathique aiguë, au décours de laquelle le virus est éradiqué par l'hôte. CMV et EBV sont classiquement à l'origine d'infections pauci-symptomatiques, voire asymptomatiques, après lesquelles les virus persistent de façon latente dans la cellule hôte. Cependant, ils restent sous le contrôle du système immun, qui peut prévenir une éventuelle réactivation. Enfin, VIH-1 s'établit à la fois en infection latente - par l'insertion de son génome dans le chromosome des cellules hôtes - et en infection productive et cytopathique, échappant au contrôle immunitaire et détruisant ses cellules cibles. La compréhension des différences fondamentales entre ces différents types d'interactions virus-hôte devraient faciliter le développement de nouvelles stratégies antivirales. Article 1: Le premier article (section 4.1 Page 58) représente l'objet principal de mon travail de laboratoire. Il analyse la capacité des lymphocytes T CD8 spécifiques de différent virus à sécréter de l'interféron gamma (IFN-y) et/ou de l'interleukine 2 (IL-2) après stimulation par leur antigène spécifique. Les cellules T CD8 jouent un rôle crucial dans le contrôle des infections virales. Elles identifient les cellules infectées en détectant des antigènes viraux présentés à la surface de ces mêmes cellules, et éliminent à la fois les cellules infectées et les virus qu'elles contiennent en induisant l'apoptose et/ou la lyse des cellules cibles. Parallèlement, l'identification de l'antigène par la cellule T CD8 la stimule à sécréter des cytokines. L'IFN-γen est un exemple. L'IFN-γ stimule les cellules infectées à développer une activé antivirale intrinsèque. De plus, il attire sur place d'autres cellules de l'inflammation, et active leur fonction d'éradication des pathogènes. L'IL-2 est un autre exemple. L'IL-2 est essentielle à l'expansion clonale des cellules T CD8 spécifiques à un virus donné. Elle est donc essentielle à augmenter le pool de lymphocytes antiviraux. En conséquence, la double capacité de sécréter de l'IFN-γ et de IL-2 pourrait être un avantage pour le contrôle antiviral par les cellules T CD8. Dans ce travail nous avons comparé les proportions de lymphocytes T CD8 doubles positifs (IFN-γ/IL-2) et simples positifs (IFN-γ) chez trois groupes de sujets: (i) des patients infectés par VIH-1 qui ne contrôlent pas l'infection (progresseurs), (ii) des patients infectés par VIH-1, mais contrôlant l'infection malgré l'absence de traitement ("long term non progressors" [LTNP]) et (iii) des donneurs de sang négatifs pour l'infection à VIH-1. Les résultats ont montré que les individus capables de contrôler une infection possédaient des cellules T CD8 doubles positifs (IFN-γ/IL-2), alors que les patients ne contrôlant pas l'infection procédaient prioritairement des CD8 simples positifs (IFN-γ). Spécifiquement, les lymphocytes T spécifiques pour Flu, CMV, EBV, et VII-1-1 chez les LTNP étaient tous IFN-γ/IL-2 doubles positifs. Au contraire, les lymphocytes T CD8 spécifique à VIH-1 étaient IFN-γ simples positifs chez les progresseurs. La capacité de développer une réponse IFN-γ/IL-2 pourraient être primordiale pour le contrôle de l'infection, indépendamment de la nature du virus. En effet, il a été montré que l'absence de sécrétion d'IL2 par les lymphocytes T CD8 corrélait avec leur incapacité de proliférer. Dans nos mains, cette prolifération a pu être restaurée in vitro par l'adjonction exogène d'IL-2. Toutefois, la faisabilité de ce type de complémentation in vivo n'est pas claire. Des expériences additionnelles ont permis de préciser de stade de développement des lymphocytes doubles positifs et simples positifs par le biais des marqueurs CD45RA et CCR7. Il reste maintenant à comprendre pourquoi certains lymphocytes T CD8 spécifiques sont incapables à sécréter de l'IL-2. Article 2: Le deuxième article explore des nouvelles stratégies pour induire une immunité T CD8 spécifique aux protéines du VIH-1, qui sont édités et exposés à la surface des cellules infectées. Ces signaux consistent en fragments de peptide de 8-13 acide aminés provenant de protéines virales, et exposées à la surface des cellules infectées dans le cadre des molécules spécialisées d'histocompatibilité de classe I (en anglais "major histocompatibility class I" ou MHC I). Pour mimer une infection virale, la polyprotéine Gagpolnef du VIH-1 a été insérée et exprimée dans deux vecteurs viraux atténués, soit MVA (provenant de vaccinia virus) ou NYVAC (provenant d'un poxvirus). Ensuite des souris ont été infectées avec ces virus recombinants et la réponse T CD8 aux peptides issus de Gagpolnef a été étudiée. Les souris ont été capables de développer une réponse de type CD8 T contre ces antigènes du VIH-1. Pour tester si ces antigènes pouvaient aussi être présentés par dans le cadre de molécules MHC humaines, des expériences supplémentaires ont été faites avec des souris exprimant un MHC humain. Les résultats de ces manipulations ont montré que des cellules T CD8 spécifique aux protéines du VIH pouvaient être détectées. Ce travail ouvre de nouvelles options quant à l'utilisation des virus recombinants exprimant Gagpolnef comme stratégie vaccinale contre le virus VIH-I chez l'homme. Article 3: Ces revues décrivent la réponse immunitaire à CMV ainsi que des nouvelles méthodes pouvant servir à sa détection. Une partie du manuscrit décrit la détection de cellule T à l'aide de tétramères. Il s'agit de protéines chimériques composées de 4 quatre molécules MHC liées entre elles. Elles sont ensuite "chargées" avec le peptide antigénique approprié, et utilisée pour détecter les cellules T CD8 spécifiques à ce montage. Elles sont aussi marquées par un fluorochrome, qui permet une analyse avec un cytomètre de flux, et l'isolement ultime des CD8 d'intérêt. En résumé, le travail présenté dans cette thèse indique que (i) une réponse T CD8 appropriée - définie par la présence des cellules effectrices doublement positives pour l'IFN-γ et l'IL-2 - semble indispensable pour le contrôle des infections virales, y compris par le VIH-1, (ii) une telle réponse peut être induite par des vaccin viral recombinant, et (iii) la réponse T CD8 peut être analysée et suivie grâce à plusieurs techniques, incluant celle des tétramères de MHC class I. 1.3. Résumé pour un large public Le système immunitaire humain est composé de différents éléments (cellules, tissus et organes) qui participent aux défenses de l'organisme contre les pathogènes (bactéries, virus). Parmi ces cellules, les lymphocytes T CD8, également appelés cellules tueuses, jouent un rôle important dans la réponse immunitaire et le contrôle des infections virales. Les cellules T CD8 reconnaissent de manière spécifique des fragments de protéines virales qui sont exposés à la surface des cellules infectées par le virus. Suite à cette reconnaissance, les cellules T CD8 sont capables de détruire et d'éliminer ces cellules infectées, ainsi que les virus qu'elles contiennent. Dans le contexte d'une infection par le virus de l'immunodéficience humaine (VIH), le virus responsable du SIDA, il a pu être montré que la présence des cellules T CD8 est primordiale. En effet, en l'absence de ces cellules, les individus infectés par le VIH progressent plus rapidement vers le SIDA. Au cours de la vie, l'Homme est exposé à plusieurs virus. Mais à l'opposé du VIH, certains d'entre eux ne causent pas des maladies graves : par exemple le virus de la grippe (Influenza), le cytomégalovirus ou encore le virus d'Epstein-Barr. Certains de ces virus peuvent être contrôlés et éliminés de l'organisme (p. ex. le virus de la grippe), alors que d'autres ne sont que contrôlés par notre système immunitaire et restent présents en petite quantité dans le corps sans avoir d'effet sur notre santé. Le sujet de mon travail de thèse porte sur la compréhension du mécanisme de contrôle des infections virales par le système immunitaire : pourquoi certains virus peuvent être contrôlés ou même éliminés de l'organisme alors que d'autres, et notamment le VIH, ne le sont pas. Ce travail a permis de démontrer que les cellules T CD8 spécifiques du VIH ne sécrètent pas les mêmes substances, nécessaires au développement d'une réponse antivirale efficace, que les cellules T CD8 spécifiques des virus contrôlés (le virus de la grippe, le cytomégalovirus et le virus d'Epstein-Barr). Parallèlement nous avons également observé que les lymphocytes T CD8 spécifiques du VIH ne possèdent pas la capacité de se diviser. Ils sont ainsi incapables d'être présents en quantité suffisante pour assurer un combat efficace contre le virus du SIDA. La (les) différence(s) entre les cellules T CD8 spécifiques aux virus contrôlés (grippe, cytomégalovirus et Epstein-Barr) et au VIH pourront peut-être nous amener à comprendre comment restaurer une immunité efficace contre ce dernier.

Five-year outcome of catheter ablation of persistent atrial fibrillation using termination of atrial fibrillation as a procedural endpoint.

BACKGROUND: This study aimed to determine 5-year efficacy of catheter ablation for persistent atrial fibrillation (AF) using AF termination as a procedural end point. METHODS AND RESULTS: One hundred fifty patients (57±10 years) underwent persistent AF ablation using a stepwise ablation approach (pulmonary vein isolation, electrogram-guided, and linear ablation) with the desired procedural end point being AF termination. Repeat ablation was performed for recurrent AF or atrial tachycardia. AF was terminated by ablation in 120 patients (80%). Arrhythmia-free survival rates after a single procedure were 35.3%±3.9%, 28.0%±3.7%, and 16.8%±3.2% at 1, 2, and 5 years, respectively. Arrhythmia-free survival rates after the last procedure (mean 2.1±1.0 procedures) were 89.7%±2.5%, 79.8%±3.4%, and 62.9%±4.5%, at 1, 2, and 5 years, respectively. During a median follow-up of 58 (interquartile range, 43-73) months after the last ablation procedure, 97 of 150 (64.7%) patients remained in sinus rhythm without antiarrhythmic drugs. Another 14 (9.3%) patients maintained sinus rhythm after reinitiation of antiarrhythmic drugs, and an additional 15 (10.0%) patients regressed to paroxysmal recurrences only. Failure to terminate AF during the index procedure (hazard ratio 3.831; 95% confidence interval, 2.070-7.143; P<0.001), left atrial diameter ≥50 mm (hazard ratio 2.083; 95% confidence interval, 1.078-4.016; P=0.03), continuous AF duration ≥18 months (hazard ratio 1.984; 95% confidence interval, 1.024-3.846; P<0.04), and structural heart disease (hazard ratio 1.874; 95% confidence interval, 1.037-3.388; P=0.04) predicted arrhythmia recurrence. CONCLUSIONS: In patients with persistent AF, an ablation strategy aiming at AF termination is associated with freedom from arrhythmia recurrence in the majority of patients over a 5-year follow-up period. Procedural AF nontermination and specific baseline factors predict long-term outcome after ablation.

Length of the Mitral Isthmus But Not Anatomical Location of Ablation Line Predicts Bidirectional Mitral Isthmus Block in Patients Undergoing Catheter Ablation of Persistent Atrial Fibrillation: A Randomized Controlled Trial.

INTRODUCTION: Mitral isthmus (MI) ablation is an effective option in patients undergoing ablation for persistent atrial fibrillation (AF). Achieving bidirectional conduction block across the MI is challenging, and predictors of MI ablation success remain incompletely understood. We sought to determine the impact of anatomical location of the ablation line on the efficacy of MI ablation. METHODS AND RESULTS: A total of 40 consecutive patients (87% male; 54 ± 10 years) undergoing stepwise AF ablation were included. MI ablation was performed in sinus rhythm. MI ablation was performed from the left inferior PV to either the posterior (group 1) or the anterolateral (group 2) mitral annulus depending on randomization. The length of the MI line (measured with the 3D mapping system) and the amplitude of the EGMs at 3 positions on the MI were measured in each patient. MI block was achieved in 14/19 (74%) patients in group 1 and 15/21 (71%) patients in group 2 (P = NS). Total MI radiofrequency time (18 ± 7 min vs. 17 ± 8 min; P = NS) was similar between groups. Patients with incomplete MI block had a longer MI length (34 ± 6 mm vs. 24 ± 5 mm; P < 0.001), a higher bipolar voltage along the MI (1.75 ± 0.74 mV vs. 1.05 ± 0.69 mV; P < 0.01), and a longer history of continuous AF (19 ± 17 months vs. 10 ± 10 months; P < 0.05). In multivariate analysis, decreased length of the MI was an independent predictor of successful MI block (OR 1.5; 95% CI 1.1-2.1; P < 0.05). CONCLUSIONS: Increased length but not anatomical location of the MI predicts failure to achieve bidirectional MI block during ablation of persistent AF.