Tipificação de Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC e detecção da sua aderência a células epiteliais pulmonares

Dissertação apresentada para a obtenção do Grau de Mestre em Genética Molecular e Biomedicina, pela Universidade Nova de Lisboa, Faculdade de Ciências e Tecnologia

Contribuição para o estudo da caracterização de biofilmes de diferentes idades

Os biofilmes podem ser definidos como uma comunidade complexa, constituída principalmente por água, microrganismos e substâncias poliméricas extracelulares (EPS), estando aderidos a uma superfície sólida. Um biofilme pode ser constituído por uma única espécie ou, na maioria dos casos, por inúmeras espécies, sendo as bactérias, fungos, algas e protozoários os principais microrganismos, embora as bactérias representem o grupo dominante. Os biofilmes desempenham um papel bastante relevante nos sistemas de biomassa fixa no tratamento de águas residuais, oferecendo diversas vantagens. Assim, o seu estudo e a compreensão das suas características torna-se essencial para a garantia de eficiências elevadas nestes sistemas. O presente trabalho pretendeu contribuir para o estudo de biofilmes de diferentes idades, nomeadamente na identificação e caracterização dos microrganismos dominantes. A idade do biofilme é um parâmetro fundamental na exploração de sistemas de biomassa fixa, uma vez que já se demonstrou ser vantajoso no controlo da espessura do biofilme. O crescimento dos biofilmes foi possível devido a um dispositivo experimental concebido para se obter biofilmes de determinada espessura (ou idade). O método adoptado neste estudo para a identificação dos microrganismos foi o FISH (Hibridação in situ de fluorescência), uma vez que este permite a identificação, quantificação e localização espacial de microrganismos directamente nos seus habitats naturais. Através dos resultados obtidos, pôde constatar-se que a idade de biofilme de 0,5 – 1 dia apresentou maiores diferenças no perfil microbiano comparativamente com as restantes idades (4 – 5 dias e 5 – 6 dias), parecendo demonstrar uma menor abundância de tipos de bactérias. Também se concluiu que, para a idade de biofilme menor (0,5 – 1 dia), as bactérias presentes em maior abundância foram as Gammaproteobacteria, para a idade de 4 a 5 dias foram as Betaproteobacteria, Cytophaga-Flavobacteria e Actinobacteria, e para a idade de 5 a 6 dias foram as Betaproteobacteria e Cytophaga-Flavobacteria. Os resultados obtidos possibilitaram um conhecimento mais aprofundado dos microrganismos presentes em biofilmes de idades distintas, podendo contribuir para a optimização de sistemas de biomassa fixa. Assim, se se adoptar este tipo de conhecimento em ETAR por sistemas de biomassa fixa no tratamento de águas residuais, poder-se-á contribuir para a melhoria do funcionamento da instalação, principalmente no que diz respeito à sua eficiência de tratamento.

Adaptation as a part of system resilience. insights from fish producers organizations in Portugal

Complex problems of globalized society challenge its adaptive capacity. However, it is precisely the nature of these human induced problems that provide enough evidence to show that adaptability may not be on a resilient path. This thesis explores the ambiguity of the idea of adaptation (and its practice) and illustrates the ways in which adaptability contributes to resilience of social ecological systems. The thesis combines a case study and grounded theory approach and develops an analytical framework to study adaptability in resource users’ organizations: from what it depends on and what the key challenges are for resource management and system resilience. It does so for the specific case of fish producers’ organizations (POs) in Portugal. The findings suggest that while ecological and market context, including the type of crisis, may influence the character of fishers’ adaptation within POs (i.e. anticipatory, maladaptive and reactively adaptive), it does not determine it. Instead, it makes agency even more crucial (i.e. leadership, trust and agent’s perceptions in terms of their impact on fishers’ motivation to learn from each other). In sum, it was found that internal adaptation can improve POs’ contribution to fishery management and resilience, but it is not a panacea and may, in some cases, increase system vulnerability to change. Continuous maladaptation of some Portuguese POs points at a basic institutional problem (fish market regime), which clearly reduces fisheries resilience as it promotes overfishing. However, structural change may not be sufficient to address other barriers to Portuguese fishers’ (PO members) adaptability, such as history (collective memory) and associated problematic self-perceptions. The agency (people involved in structures and practices) also needs to change. What and how institutional change and agency change build on one another (e.g. comparison of fisheries governance in Portugal and other EU countries) is a topic to be explored in further research.