Microscopy image segmentation by active contour models

In this thesis a semi-automated cell analysis system is described through image processing. To achieve this, an image processing algorithm was studied in order to segment cells in a semi-automatic way. The main goal of this analysis is to increase the performance of cell image segmentation process, without affecting the results in a significant way. Even though, a totally manual system has the ability of producing the best results, it has the disadvantage of taking too long and being repetitive, when a large number of images need to be processed. An active contour algorithm was tested in a sequence of images taken by a microscope. This algorithm, more commonly known as snakes, allowed the user to define an initial region in which the cell was incorporated. Then, the algorithm would run several times, making the initial region contours to converge to the cell boundaries. With the final contour, it was possible to extract region properties and produce statistical data. This data allowed to say that this algorithm produces similar results to a purely manual system but at a faster rate. On the other hand, it is slower than a purely automatic way but it allows the user to adjust the contour, making it more versatile and tolerant to image variations.

Optimização da estrutura de um semi-reboque com vista à flexibilidade na sua adequação funcional

Dissertação apresentada na Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa para obtenção do grau de Mestre em Engenharia Mecânica

Water treatments in semi-closed cooling circuits and their impact on the quality of effluents discharged by CERN

Dissertação apresentada à Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa para obtenção do grau de Mestre em Engenharia do Ambiente, Gestão de Sistemas Ambientais

Functional role of macrobenthos in estuarine sediment dynamics

Thesis submitted to the Universidade Nova de Lisboa,Faculdade de Ciências e Tecnologia for the degree of Doctor of Philosophy in Environmental Engineering

Water treatments in semi-closed cooling circuits and their impact on the quality of effluents discharged by CERN

Mestrado integrado em Engenharia do Ambiente, perfil: Gestão de Sistemas Ambientais

Células solares semi-transparentes de silício amorfo micro/nanocristalino

Dissertação apresentada na Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa para a obtenção do grau de Mestre em Engenharia dos Materiais

The impact of CdSe/ZnS Quantum Dots in cells of Medicago sativa in suspension culture

Abstract Background: Nanotechnology has the potential to provide agriculture with new tools that may be used in the rapid detection and molecular treatment of diseases and enhancement of plant ability to absorb nutrients, among others. Data on nanoparticle toxicity in plants is largely heterogeneous with a diversity of physicochemical parameters reported, which difficult generalizations. Here a cell biology approach was used to evaluate the impact of Quantum Dots (QDs) nanocrystals on plant cells, including their effect on cell growth, cell viability, oxidative stress and ROS accumulation, besides their cytomobility. Results: A plant cell suspension culture of Medicago sativa was settled for the assessment of the impact of the addition of mercaptopropanoic acid coated CdSe/ZnS QDs. Cell growth was significantly reduced when 100 mM of mercaptopropanoic acid -QDs was added during the exponential growth phase, with less than 50% of the cells viable 72 hours after mercaptopropanoic acid -QDs addition. They were up taken by Medicago sativa cells and accumulated in the cytoplasm and nucleus as revealed by optical thin confocal imaging. As part of the cellular response to internalization, Medicago sativa cells were found to increase the production of Reactive Oxygen Species (ROS) in a dose and time dependent manner. Using the fluorescent dye H2DCFDA it was observable that mercaptopropanoic acid-QDs concentrations between 5-180 nM led to a progressive and linear increase of ROS accumulation. Conclusions: Our results showed that the extent of mercaptopropanoic acid coated CdSe/ZnS QDs cytotoxicity in plant cells is dependent upon a number of factors including QDs properties, dose and the environmental conditions of administration and that, for Medicago sativa cells, a safe range of 1-5 nM should not be exceeded for biological applications.

Actividade física e envelhecimento activo : o incremento da prática de actividade física através de consultoria

RESUMO: Num quadro de profundas transformações demográficas, o envelhecimento populacional coloca muitas questões à sociedade. A promoção da saúde e de comportamentos saudáveis desempenha um papel importante numa perspectiva de Envelhecimento Activo. Hoje em dia existem inúmeras evidências científicas de que a Actividade Física regular tem importantes benefícios, tanto a nível físico como psicológico, com um impacto significativo no bem-estar e na qualidade de vida das pessoas em todas as idades. Para fomentar a prática de Actividade Física há um envolvimento cada vez maior dos profissionais de saúde, visto serem figuras de referência para os pacientes. Desta forma, foi objectivo do nosso estudo verificar a existência de uma associação positiva entre a prática de Actividade Física e a Consultoria em Actividade Física, baseado nas seguintes variáveis: análise sócio-demográfica dos indivíduos; percepções e práticas de Actividade Física. Para tal estudámos uma amostra de conveniência, seleccionada a partir dos utentes de ambulatório das Unidades de Saúde Familiar de Benfica e Carnide, constituída por 5 pessoas, todas do sexo feminino, com idades compreendidas entre os 50 e os 65 anos, que se encontravam clinicamente estáveis. Os instrumentos de avaliação utilizados foram os seguintes: Entrevista Semi- Estruturada Inicial e Final, Questionário Internacional de Actividade Física – Versão Longa, e Questionário de Satisfação. Com os resultados obtidos podemos concluir que a Consultoria em Actividade Física contribuiu para o aumento da consciência das pessoas para a necessidade de movimentos e de Actividade Física para melhorar a saúde a nível físico, psicológico e social.-------------- ABSTRACT: In a context of profound demographic changes, population aging poses many questions to society. Health promotion and healthy behaviors play an important role in an Active Ageing perspective. Nowadays there are plenty of scientific evidence that regular physical activity has important benefits, both physically and psychologically, with significant impact on the wellbeing and quality of life for people of all ages. To encourage the practice of physical activity there is an increasing involvement of health professionals, because they are reference figures for the patients. Thus, the aim of our study was to verify the existence of a positive association between the practice of Physical Activity and Physical Activity Consulting, based on the following variables: social demographic features of individuals, perceptions and practices of Physical Activity. To this end we studied a convenience sample, selected from outpatients of Family Health Units in Benfica and Carnide, consisting of 5 persons, all female, aged between 50 and 65, who were clinically stable. The assessment instruments used were the following: Initial and Final Semi-Structured Interview, International Physical Activity Questionnaire - Long Version, and Satisfaction Questionnaire. With these results we can conclude that Physical Activity Consulting contributed to increase people's awareness of the need for movement and physical activity, in order to improve health at the physical, psychological and social level.

Active cycle breathing techniques como técnica de higiene brônquica na asma: estudo piloto

RESUMO: Relevância e Objectivos: O objectivo deste estudo consistiu em verificar a eficácia e segurança de uma técnica de higiene brônquica – Active Cycle breathing technique (ACBT), na remoção de secreções e desinsuflação em crianças asmáticas. É uma técnica recente, que ainda não foi estudada nesta população. Metodologia: A amostra foi constituída por um total de 14 crianças, com idades compreendidas entre os 6 e 18 anos, com o diagnóstico de asma. Foi dividida em dois grupos: grupo de controlo, constituído por asmáticos estáveis e grupo experimental constituído por asmáticos pós-crise. Ambos receberam o mesmo tratamento, que consistiu numa única sessão de ACBT. Realizaram um exame da função respiratória (variáveis FEV1, PEF, MEF75%, RV e FRC) antes e após a aplicação da técnica. Mediu-se a Saturação de O2 antes, a meio e no fim da aplicação da técnica. Por último, pesaram-se as secreções recolhidas durante a sessão de tratamento. Resultados: Como resultados, quando omparamos o antes e após aplicação do ACBT, obtivemos diferenças significativas no RV (p <0,05) e FRC (p <0,05); muito significativa na Sa02 (p <0,01) e peso de secreções, nos asmáticos pós crise. Ocorreu uma melhoria significativa da saturação (p <0,05) em asmáticos estáveis, não havendo secreções. Não houve efeitos adversos nem broncoespasmo em ambos os grupos.Conclusão: O ACBT é uma técnica que promove a remoção de secreções e diminuição da insuflação na população de asmáticos.--------------------ABSTRACT:Relevance and Goals: the goal of this study was to verify the efficiency and security of a bronchial hygienic technique - Active Cycle Breathing Technique (ACBT) – in the obstruction and insufflation of asthmatic children. This is a new technique that has not yet been studied in this population. Procedures: The subjects were 14 children aged between 6 and 18 years old with asthma diagnosis. They were divided in two groups: the control group with stable asthmatics and the experimental group with post-crisis asthmatics. Both received the same treatment that was a single session of ACBT. They made a lung function test before and after the application of the technique (variables FEV1, PEF, MEF75%, RV and FRC). The level of O2 saturation was measured before, during and after the procedure. In the end, the secretions collected during the treatment were weighted. Results: We observed a significant difference on RV (p ˂0,05), FRC (p ˂0,05), Sa02 (p ˂0,01) and in the weight of the secretions in the post-crisis asthmatics after ACBT. There was a significant improvement of saturation (p ˂0,05) only in the stable asthmatics. There were no adverse effects or bronchospasm in both groups.

Sistemas de protecção sísmica semi-activos aplicados em estruturas de engenharia civil caso de estudo: amortecedores com fluído magneto-reológico

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Engenharia Civil – Perfil Estruturas

Active bionanoconjugates of laccase and gold nanoparticles: kinetic and structural studies

Thesis for the master degree in Structural and Functional Biochemistry

Human activity recognition for an intelligent knee orthosis

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Engenharia Biomédica

The tetranuclear copper active site of nitrous oxide reductase: the CuZ center

J Biol Inorg Chem (2011) 16:183–194 DOI 10.1007/s00775-011-0753-3

A new CuZ active form in the catalytic reduction of N2O by nitrous oxide reductase from Pseudomonas nautica

J Biol Inorg Chem (2010) 15:967–976 DOI 10.1007/s00775-010-0658-6

O estudo de pavimentações regulares e semi-regulares com ambiente de geometria dinâmica

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Ensino da Matemática