57 resultados para statistical software

em Biblioteca Digital da Produção Intelectual da Universidade de São Paulo (BDPI/USP)


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Neste trabalho são descritas as técnicas de análise estatística utilizadas e a acessibilidade estatística em uma amostra dos artigos originais publicados no período 1996-2006 em duas revistas de pesquisa na área de fruticultura: a Revista Brasileira de Fruticultura (RBF) e a revista francesa Fruits. No total foram classificados 986 artigos em 16 categorias de análise estatística, ordenadas em grau ascendente de complexidade. No período analisado, foi constatado um aumento no uso de análises mais sofisticadas ao longo do tempo em ambos as revistas. Os trabalhos publicados pela RBF aplicaram com maior freqüência técnicas estatísticas mais complexas, com maior utilização de delineamentos em blocos aleatorizados, arranjos fatoriais, parcelas subdivididas e modelos hierárquicos, e do teste de Tukey para comparações múltiplas de médias. Nos trabalhos publicados pela revista Fruits, predominou o uso de outros testes paramétricos e do teste de Duncan. O pacote estatístico SAS foi o mais utilizado nos artigos publicados em ambas as revistas. Os leitores da revista RBF precisaram de um nível de conhecimento estatístico mais elevado para ter acesso à maior parte dos artigos publicados no período, em comparação com os leitores da revista francesa.

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Background: To determine the prevalence of diabetes mellitus (DM) and impaired glucose tolerance (IGT) in a rural community (Bengo) of Angola. Methods: A random sample of 421 subjects aged 30 to 69 years (30% men and 70% women) was selected from three villages of Bengo province. This cross-sectional home survey was conducted using a sampling design of stage conglomerates. First, clinical and anthropometric data were obtained and fasting capillary glucose level was determined. Subjects who screened positive (fasting capillary glucose >= 100 mg/dl and < 200 mg/dl) and each sixth consecutive subject who screened negative (fasting capillary glucose < 100 mg/dl) were submitted to the second phase of survey, consisting of the 75 g oral glucose tolerance test. Data was analyzed by the use of SAS statistical software. Results: The prevalence rates of diabetes mellitus and IGT were 2.8% and 8.1%, respectively. The age group with the highest prevalence of diabetes was 60 to 69 years (42%). Impaired glucose tolerance prevalence was 38% in the 40 to 49 year age group and it increased with age, considering that the 50 to 59 and 60 to 69 year age groups as a whole represent 50% of all subjects with impaired glucose tolerance. The prevalence of diabetes mellitus did not differ significantly between men (3.2%) and women (2.7%) (p = 0.47). On the other hand, the prevalence of impaired glucose tolerance among women showed almost twice that found in men (9.1% vs. 5.6%, respectively). Overweight was present in 66.7% of the individuals with diabetes mellitus and 26.5% of individuals with impaired glucose tolerance showed overweight or obesity. Conclusions: Although the prevalence of diabetes mellitus was low, the prevalence of impaired glucose tolerance is considered to be within an intermediary range, suggesting a future increase in the frequency of diabetes in this population.

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OBJECTIVE To evaluate the frequency and clinical features of endemic and other opportunistic infections in liver or kidney transplant recipients in four transplant centres in different geographical areas of Brazil. METHODS Retrospective analysis of medical and laboratory records of four transplant centres on endemic and other opportunistic infections in liver or kidney transplant recipients. Analyses were performed with spss statistical software. RESULTS From 2001 to 2006, 1046 kidney and 708 liver transplants were registered in all centres. The average age was 42 years. Among 82 (4.7%) cases with infections, the most frequent was tuberculosis (2.0%), followed by systemic protozoal infections (0.7%), toxoplasmosis (0.4%) and visceral leishmaniasis (0.3%). Systemic fungal infections occurred in 0.6%, of which 0.4% were cryptococcosis and 0.2% were histoplasmosis. Dengue was the only systemic viral infection and was registered in two cases (0.1%), of which one was classified as the classic form and the other as dengue haemorrhagic fever. Nocardiosis was described in one case (0.05%). The infectious agents most frequently associated with diarrhoea were Blastocystis sp., Schistosoma mansoni and Strongyloides stercoralis. CONCLUSIONS Opportunistic Infections in transplant patients have a wide spectrum and may vary from asymptomatic to severe infections with high mortality. A better understanding of the epidemiology of endemic pathogens and clinical manifestations can contribute to the establishment of an early diagnosis as well as correct treatment aimed at decreasing morbidity and mortality.

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Background: In Brazil hospital malnutrition is highly prevalent. physician awareness of malnutrition is low, and nutrition therapy is underprescribed. One alternative to approach this problem is to educate health care providers in clinical nutrition. The present study aims to evaluate the effect of an intensive education course given to health care professionals and students on the diagnosis ability concerning to hospital malnutrition. Materials and methods: An intervention study based on a clinical nutrition educational program, offered to medical and nursing students and professionals, was held in a hospital of the Amazon region. Participants were evaluated through improvement of diagnostic ability, according to agreement of malnutrition diagnosis using Subjective Global Assessment before and after the workshop, as compared to independent evaluations (Kappa Index, k). To evaluate the impact of the educational intervention on the hospital malnutrition diagnosis, medical records were reviewed for documentation of parameters associated with nutritional status of in-patients. The SPSS statistical software package was used for data analysis. Results: A total of 165 participants concluded the program. The majority (76.4%) were medical and nursing students. Malnutrition diagnosis improved after the course (before k = 0.5; after k = 0.64; p < 0.05). A reduction of false negatives from 50% to 33.3% was observed. During the course, concern of nutritional diagnosis was increased W = 17.57; p < 0.001) and even after the course, improvement on the height measurement was detected chi(2) 12.87;p < 0.001). Conclusions: Clinical nutrition education improved the ability of diagnosing malnutrition; however the primary impact was on medical and nursing students. To sustain diagnostic capacity a clinical nutrition program should be part of health professional curricula and be coupled with continuing education for health care providers.

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We consider the issue of performing accurate small-sample likelihood-based inference in beta regression models, which are useful for modelling continuous proportions that are affected by independent variables. We derive small-sample adjustments to the likelihood ratio statistic in this class of models. The adjusted statistics can be easily implemented from standard statistical software. We present Monte Carlo simulations showing that inference based on the adjusted statistics we propose is much more reliable than that based on the usual likelihood ratio statistic. A real data example is presented.

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Likelihood ratio tests can be substantially size distorted in small- and moderate-sized samples. In this paper, we apply Skovgaard`s [Skovgaard, I.M., 2001. Likelihood asymptotics. Scandinavian journal of Statistics 28, 3-321] adjusted likelihood ratio statistic to exponential family nonlinear models. We show that the adjustment term has a simple compact form that can be easily implemented from standard statistical software. The adjusted statistic is approximately distributed as X(2) with high degree of accuracy. It is applicable in wide generality since it allows both the parameter of interest and the nuisance parameter to be vector-valued. Unlike the modified profile likelihood ratio statistic obtained from Cox and Reid [Cox, D.R., Reid, N., 1987. Parameter orthogonality and approximate conditional inference. journal of the Royal Statistical Society B49, 1-39], the adjusted statistic proposed here does not require an orthogonal parameterization. Numerical comparison of likelihood-based tests of varying dispersion favors the test we propose and a Bartlett-corrected version of the modified profile likelihood ratio test recently obtained by Cysneiros and Ferrari [Cysneiros, A.H.M.A., Ferrari, S.L.P., 2006. An improved likelihood ratio test for varying dispersion in exponential family nonlinear models. Statistics and Probability Letters 76 (3), 255-265]. (C) 2008 Elsevier B.V. All rights reserved.

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The main purpose of this work is to study the behaviour of Skovgaard`s [Skovgaard, I.M., 2001. Likelihood asymptotics. Scandinavian journal of Statistics 28, 3-32] adjusted likelihood ratio statistic in testing simple hypothesis in a new class of regression models proposed here. The proposed class of regression models considers Dirichlet distributed observations, and the parameters that index the Dirichlet distributions are related to covariates and unknown regression coefficients. This class is useful for modelling data consisting of multivariate positive observations summing to one and generalizes the beta regression model described in Vasconcellos and Cribari-Neto [Vasconcellos, K.L.P., Cribari-Neto, F., 2005. Improved maximum likelihood estimation in a new class of beta regression models. Brazilian journal of Probability and Statistics 19,13-31]. We show that, for our model, Skovgaard`s adjusted likelihood ratio statistics have a simple compact form that can be easily implemented in standard statistical software. The adjusted statistic is approximately chi-squared distributed with a high degree of accuracy. Some numerical simulations show that the modified test is more reliable in finite samples than the usual likelihood ratio procedure. An empirical application is also presented and discussed. (C) 2009 Elsevier B.V. All rights reserved.

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Functional brain imaging techniques such as functional MRI (fMRI) that allow the in vivo investigation of the human brain have been exponentially employed to address the neurophysiological substrates of emotional processing. Despite the growing number of fMRI studies in the field, when taken separately these individual imaging studies demonstrate contrasting findings and variable pictures, and are unable to definitively characterize the neural networks underlying each specific emotional condition. Different imaging packages, as well as the statistical approaches for image processing and analysis, probably have a detrimental role by increasing the heterogeneity of findings. In particular, it is unclear to what extent the observed neurofunctional response of the brain cortex during emotional processing depends on the fMRI package used in the analysis. In this pilot study, we performed a double analysis of an fMRI dataset using emotional faces. The Statistical Parametric Mapping (SPM) version 2.6 (Wellcome Department of Cognitive Neurology, London, UK) and the XBAM 3.4 (Brain Imaging Analysis Unit, Institute of Psychiatry, Kings College London, UK) programs, which use parametric and non-parametric analysis, respectively, were used to assess our results. Both packages revealed that processing of emotional faces was associated with an increased activation in the brain`s visual areas (occipital, fusiform and lingual gyri), in the cerebellum, in the parietal cortex, in the cingulate cortex (anterior and posterior cingulate), and in the dorsolateral and ventrolateral prefrontal cortex. However, blood oxygenation level-dependent (BOLD) response in the temporal regions, insula and putamen was evident in the XBAM analysis but not in the SPM analysis. Overall, SPM and XBAM analyses revealed comparable whole-group brain responses. Further Studies are needed to explore the between-group compatibility of the different imaging packages in other cognitive and emotional processing domains. (C) 2009 Elsevier Ltd. All rights reserved.

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INTRODUÇÃO: o exame de tomografia computadorizada de feixe cônico (TCFC) oferece excelente representação dos tecidos duros da articulação temporomandibular (ATM). OBJETIVO: investigar as alterações morfológicas do côndilo mandibular, da infância à idade adulta, utilizando a TCFC. MÉTODOS: um estudo transversal foi conduzido envolvendo 36 côndilos de 18 indivíduos com idades variando entre 3 e 20 anos. As imagens dos côndilos foram obtidas por meio do sistema i-CAT e medidas com uma ferramenta do programa específica para ATM, que permite cortes perpendiculares à cabeça do côndilo, com correção individual em função das diferenças angulares de cada um. As maiores distâncias nas vistas lateral e frontal foram consideradas tanto para os côndilos do lado direto como para os do lado esquerdo. RESULTADOS: a dimensão lateral do côndilo mandibular parece ser estabelecida de maneira precoce, sofrendo poucas alterações com o passar dos anos, enquanto a dimensão frontal tende a aumentar. Assimetrias entre o côndilo esquerdo e o direito foram comumente observadas; no entanto, tais diferenças não apresentaram significância estatística para as vistas lateral (P=0,815) e frontal (P=0,374). CONCLUSÕES: os côndilos apresentaram simetria com relação ao tamanho, sendo observado crescimento apenas na dimensão frontal Os resultados sugerem que a TCFC constitui-se numa ferramenta útil na mensuração e avaliação das dimensões condilares.

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The objective of this work was to evaluate biaxial-flexural-strength (σf), Vickers hardness (HV), fracture toughness (K Ic), Young's modulus (E), Poisson's ratio (ν) and porosity (P) of two commercial glass-ceramics, Empress (E1) and Empress 2 (E2), as a function of the hot-pressing temperature. Ten disks were hot-pressed at 1065, 1070, 1075 and 1080 °C for E1; and at 910, 915, 920 and 925 °C for E2. The porosity was measured by an image analyzer software and s f was determined using the piston-on-three-balls method. K Ic and HV were determined by an indentation method. Elastic constants were determined by the pulse-echo method. For E1 samples treated at different temperatures, there were no statistical differences among the values of all evaluated properties. For E2 samples treated at different temperatures, there were no statistical differences among the values of σf, E, and ν, however HV and K Ic were significantly higher for 910 and 915 °C, respectively. Regarding P, the mean value obtained for E2 for 925 °C was significantly higher compared to other temperatures.

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OBJETIVOS: avaliar e mensurar a sutura palatina mediana por meio de radiografias oclusais totais de maxila digitalizadas, antes e depois da sua disjunção. MÉTODOS: a amostra constou de 17 pacientes, com idades entre 7 e 22 anos. Radiografias oclusais totais da maxila foram executadas antes e depois da abertura da sutura palatina mediana, e digitalizadas em scanner HP Scanjet 6110 C com adaptador de transparências HPC 6261 6100 C, utilizando-se o programa Deskscan II. Para a avaliação e medição, foi utilizado o programa Radioimp® (Radiomemory, MG/Brasil). Na análise estatística, foram utilizados a média, o desvio-padrão, o coeficiente de variação e os testes "t" e ANOVA. CONCLUSÕES: após os resultados, foi possível concluir que (1) na região dos incisivos, houve uma abertura palatina mediana estatisticamente significativa; (2) houve abertura de diastema entre os incisivos centrais superiores em torno de 69,37% dos casos; (3) houve uma maior abertura da sutura palatina mediana na região a 10mm a partir da crista para posterior, em comparação com a região a 3mm para posterior do parafuso expansor; (4) na região a 3mm para posterior do parafuso expansor houve uma abertura de 35,97%, e na região a 10mm para posterior da crista uma abertura de 69,37%.

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OBJETIVO: avaliar a existência de correlação entre a proporção da altura do ramo mandibular (AR) com a altura dentoalveolar posterior total (ADAPT) e a inclinação do plano mandibular (PM). MÉTODOS: dois examinadores avaliaram 81 telerradiografias laterais de pacientes, com idades a partir de 18 anos, do arquivo do curso de especialização em Ortodontia e Ortopedia Facial da Faculdade de Odontologia da UFBA. As radiografias foram digitalizadas, os pontos marcados e as medidas obtidas através do programa Radiocef 1.0. Mediu-se a inclinação do plano mandibular para caracterizar o padrão vertical da face e dividir as radiografias em três grupos: grupo de face normal (GN), de 22º a 28º, de face curta (GC), menor que 22º, e de face longa (GL), maior que 28º. A inclinação do plano palatino serviu como critério de exclusão, sendo que valores abaixo de -2,5° ou acima de 3,5º foram excluídos. Desta forma, 46 telerradiografias laterais totalizaram a amostra. RESULTADOS: a AR diferiu entre GC e GL, porém não houve diferença estatisticamente significante para as alturas dentoalveolares posteriores. Houve baixa correlação entre a AR e a ADAPT nos grupos, no entanto, a correlação da proporção entre essas alturas com a inclinação do PM mostrou-se estatisticamente significante e negativa. CONCLUSÃO: este é um fator a ser levado em consideração na avaliação do PM, quando do diagnóstico e tratamento das displasias verticais dentofaciais.

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O objetivo deste trabalho foi estudar as características da carcaça de suínos de diferentes linhagens genéticas, em diferentes idades ao abate. Foram utilizados 88 suínos por linhagem, fêmeas e machos castrados, com idade e peso médio iniciais de 74 dias e 30kg, respectivamente, pertencentes a três linhagens genéticas distintas, designadas de AgroceresPic, Dalland e Seghers. A etapa experimental foi dividida em quatro fases (Crescimento I, Crescimento II, Terminação I e Terminação II). Ao final de cada etapa, foram abatidos 60 animais (10 por linhagem/sexo), para as caracterizações: Peso (PCQ) e Rendimento de Carcaça Quente (RCQ), Área de Olho de Lombo (AOL) e Espessura de Toucinho (ET). Na análise dos resultados foi utilizado um delineamento inteiramente casualizado com desdobramento dos graus de liberdade em esquema fatorial 4 x 3 x 2, sendo quatro idades ao abate (90, 119, 150 e 186 dias), três linhagens (AgroceresPic, Dalland e Seghers) e dois sexos (fêmea e macho castrado), com 10 repetições por tratamento, sendo utilizado o pacote PROC MIXED do Softwear SAS. Os valores médios de peso vivo apresentaram diferença entre as linhagens e interação entre fase e linhagem (P<0,05). Os valores médios das demais variáveis estudadas apresentaram diferença e a interação (P<0,05) entre fase, linhagem e sexo, sendo que de maneira geral as principais diferenças ocorreram a partir da fase de Terminação I, em que as fêmeas das linhagens AgroceresPic e Dalland apresentaram melhores resultados (P<0,05) de RCQ (80,4 e 80,7%, respectivamente) em comparação com os machos (78,8 e 78,7%, respectivamente) e além disso as fêmeas Dalland apresentaram valores superiores (P<0,01) de AOL e ET (45,7cm² e 11,4mm x 38,3cm² e 18,3mm). Conclui-se que as linhagens genéticas avaliadas apresentaram características de carcaça muito interessantes para o mercado atual e que as fêmeas suínas podem ser utilizadas em programas que visem o abate de animais mais pesados.

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A avaliação do coeficiente de variação (CV) como medida da precisão dos experimentos tem sido feita com diversas culturas, espécies animais e forrageiras por meio de trabalhos sugerindo faixas de classificação dos valores, considerando-se a média, o desvio padrão e a distribuição dos valores de CV das diversas variáveis respostas envolvidas nos experimentos. Neste trabalho, objetivouse estudar a distribuição dos valores de CV de experimentos com a cultura do feijão, propondo faixas que orientem os pesquisadores na avaliação de seus estudos com cada variável. Os dados utilizados foram obtidos de revisão em revistas que publicam artigos científicos com a cultura do feijão. Foram consideradas as variáveis: rendimento, número de vagens por planta, número de grãos por vagem, peso de 100 grãos, estande final, altura de plantas e índice de colheita. Foram obtidas faixas de valores de CV para cada variável tomando como base a distribuição normal, utilizando-se também a distribuição dos quantis amostrais e a mediana e o pseudo-sigma, classificando-os como baixo, médio, alto e muito alto. Os cálculos estatísticos para verificação da normalidade dos dados foram implementados por meio de uma função no software estatístico livre R. Os resultados obtidos indicaram que faixas de valores de CV diferiram entre as diversas variáveis apresentando ampla variação justificando a necessidade de utilizar faixa de avaliação específica para cada variável.

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PURPOSE: The main goal of this study was to develop and compare two different techniques for classification of specific types of corneal shapes when Zernike coefficients are used as inputs. A feed-forward artificial Neural Network (NN) and discriminant analysis (DA) techniques were used. METHODS: The inputs both for the NN and DA were the first 15 standard Zernike coefficients for 80 previously classified corneal elevation data files from an Eyesys System 2000 Videokeratograph (VK), installed at the Departamento de Oftalmologia of the Escola Paulista de Medicina, São Paulo. The NN had 5 output neurons which were associated with 5 typical corneal shapes: keratoconus, with-the-rule astigmatism, against-the-rule astigmatism, "regular" or "normal" shape and post-PRK. RESULTS: The NN and DA responses were statistically analyzed in terms of precision ([true positive+true negative]/total number of cases). Mean overall results for all cases for the NN and DA techniques were, respectively, 94% and 84.8%. CONCLUSION: Although we used a relatively small database, results obtained in the present study indicate that Zernike polynomials as descriptors of corneal shape may be a reliable parameter as input data for diagnostic automation of VK maps, using either NN or DA.