Desempenho e qualidade da carne de bovinos cruzados alimentados com diferentes dietas em confinamento.

Com a alta demanda mundial de carne de qualidade, a utilização de cruzamento entre raças e de dieta com teores elevados de energia são estratégias que podem ser utilizadas visando à melhorias na eficiência do sistema de produção de carne bovina e na qualidade do produto final. Assim, o objetivo neste trabalho foi avaliar o desempenho (pesos, ganhos em peso, consumo de matéria seca, eficiência alimentar e dias em confinamento), características de carcaça (peso e rendimento de carcaça fria, pesos dos cortes primários, espessura de gordura, mármore, área de olho de lombo e rendimento de cortes cárneos) e de qualidade da carne (cor, pH, capacidade de retenção de água, perda por cozimento, força de cisalhamento, % de lipídios, perfil de ácidos graxos e análises sensoriais descritivas e de aceitação) durante diferentes tempos de maturação (0, 14 e 28 dias) no longissimus thoracis de 169 novilhos e novilhas jovens provenientes do cruzamento de touros das raças Charolesa (CH) ou Hereford (HF) com vacas ½ Angus + ½ Nelore (TA) ou ½ Simental + ½ Nelore (TS). Após a desmama aos 7,5 meses, os animais foram tratados individualmente (ad libitum) por 119 dias, em média, em confinamento com duas dietas diferentes: dieta controle (DC) ou dieta energética (DE) (dieta controle acrescida de glúten de milho e gordura protegida). Os animais foram abatidos aos 13 meses de idade, em média, em frigorífico comercial, quando atingiram 5 mm de espessura de gordura subcutânea medida por ultrassonografia e por avaliação visual. Os dados foram analisados usando o procedimento MIXED do SAS, cujo modelo estatístico incluiu os efeitos fixos de ano, gênero, raça do touro (RT), grupo genético da vaca (GGV), dieta, tempo de maturação (TM) como medida repetida e suas interações (exceto com ano), dependendo da característica. Apesar de algumas interações significativas, o gênero foi o principal efeito fixo que influenciou os atributos estudados, seguido por RT, GGV e TM. Os machos, em geral, apresentaram superioridade quanto às características de desempenho e de carcaça, rendimento dos cortes cárneos e na relação ácidos graxos poliinsaturados/ácidos graxos saturados (PUFA/SFA), enquanto as fêmeas apresentaram maior espessura de gordura (EG), mármore (MAR), gordura perirrenal, % de lipídios e relação n-6/n-3. Os filhos dos touros charoleses apresentaram maiores pesos (inicial e final), melhores características de carcaça, rendimentos dos cortes (RCC) do traseiro e melhor aceitação quanto à textura, enquanto os filhos dos touros Hereford apresentaram maior EG, MAR, % de lipídios e RCC do dianteiro e menor força de cisalhamento. Os filhos das vacas TS apresentaram maiores médias de peso inicial e de área de olho de lombo, enquanto os filhos das vacas TA apresentaram maiores valores de MAR e permaneceram por mais dias no confinamento. A maciez da carne melhorou com o tempo de maturação. A dieta, em geral, não influenciou as características estudadas, mas apenas o perfil de ácidos graxos, em que a dieta DC foi a que influenciou positivamente, e a aceitação da carne, mas com a presença de interação com TM. Machos e filhos de touros da raça Charolesa melhoraram as características de desempenho e de carcaça e os rendimentos dos cortes cárneos. Para carcaças bem acabadas, maior espessura de gordura e mais gordura intramuscular (mármore e % v lipídios), recomenda-se a utilização de fêmeas, de filhos de touros da raça Hereford ou de vacas ½ Angus + ½ Nelore. Para carne mais macia, recomenda-se o uso de touros Hereford. Dietas energéticas melhoram a aceitação da carne, mas não melhoram o perfil de ácidos graxos. A maturação é recomendada, pois aumenta a maciez e a aceitação da carne.

Genome-wide copy number variation (CNV) detection in Nelore cattle reveals highly frequent variants in genome regions harboring QTLs affecting production traits.

Background: Copy number variations (CNVs) have been shown to account for substantial portions of observed genomic variation and have been associated with qualitative and quantitative traits and the onset of disease in a number of species. Information from high-resolution studies to detect, characterize and estimate population-specific variant frequencies will facilitate the incorporation of CNVs in genomic studies to identify genes affecting traits of importance. Results: Genome-wide CNVs were detected in high-density single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping data from 1,717 Nelore (Bos indicus) cattle, and in NGS data from eight key ancestral bulls. A total of 68,007 and 12,786 distinct CNVs were observed, respectively. Cross-comparisons of results obtained for the eight resequenced animals revealed that 92 % of the CNVs were observed in both datasets, while 62 % of all detected CNVs were observed to overlap with previously validated cattle copy number variant regions (CNVRs). Observed CNVs were used for obtaining breed-specific CNV frequencies and identification of CNVRs, which were subsequently used for gene annotation. A total of 688 of the detected CNVRs were observed to overlap with 286 non-redundant QTLs associated with important production traits in cattle. All of 34 CNVs previously reported to be associated with milk production traits in Holsteins were also observed in Nelore cattle. Comparisons of estimated frequencies of these CNVs in the two breeds revealed 14, 13, 6 and 14 regions in high (>20 %), low (<20 %) and divergent (NEL > HOL, NEL < HOL) frequencies, respectively. Conclusions: Obtained results significantly enriched the bovine CNV map and enabled the identification of variants that are potentially associated with traits under selection in Nelore cattle, particularly in genome regions harboring QTLs affecting production traits.

Uso de suplementos para acasalamento de bezerras Angus aos 14 meses de idade.

RESUMO: O experimento foi conduzido com o objetivo de avaliar o desenvolvimento de novilhas de corte em três sistemas alimentares: exclusivamente em pastagem de azevém (Lolium multiflorum Lam.) ou em pastagem de azevém e recebendo 0,93% do peso corporal de grão de milho inteiro ou grão de aveia branca como suplemento. O delineamento experimental foi o inteiramente ao acaso, com medidas repetidas no tempo. A utilização da pastagem de azevém, com ou sem uso de grão de milho ou aveia como suplemento, possibilita desenvolvimento reprodutivo para que as bezerras sejam acasaladas aos 14 meses de idade. O peso corporal ao início da utilização da pastagem é determinante para que as bezerras atinjam adequado desenvolvimento reprodutivo no início da estação de acasalamento. ABSTRACT: The experiment was carried out to evaluate the development of beef heifers in three feeding systems: exclusively on ryegrass pasture (Lolium multiflorum Lam.) or in ryegrass pasture and receiving 0.93% of body weight of corn whole grain or oats grain as a supplement. The experimental design was completely randomized with repeated measures in time. The utilization of ryegrass pasture, with or without the use of corn or oats grain as a supplement, provides reproductive development of heifers in order for them to be mated at 14 months of age. The body weight at the beginning of pasture utilization is crucial for heifers to reach adequate reproductive development at the beginning of the mating season.

Genomic structure and marker-derived gene networks for growth and meat quality traits of brazilian nelore beef cattle.

Nelore is the major beef cattle breed in Brazil with more than 130 million heads. Genome-wide association studies (GWAS) are often used to associate markers and genomic regions to growth and meat quality traits that can be used to assist selection programs. An alternative methodology to traditional GWAS that involves the construction of gene network interactions, derived from results of several GWAS is the AWM (Association Weight Matrices)/PCIT (Partial Correlation and Information Theory). With the aim of evaluating the genetic architecture of Brazilian Nelore cattle, we used high-density SNP genotyping data (~770,000 SNP) from 780 Nelore animals comprising 34 half-sibling families derived from highly disseminated and unrelated sires from across Brazil. The AWM/PCIT methodology was employed to evaluate the genes that participate in a series of eight phenotypes related to growth and meat quality obtained from this Nelore sample.

A single nucleotide polymorphism in NEUROD1 is associated with production traits in nelore beef cattle.

Feed efficiency and carcass characteristics are late-measured traits. The detection of molecular markers associated with them can help breeding programs to select animals early in life, and to predict breeding values with high accuracy. The objective of this study was to identify polymorphisms in the functional and positional candidate gene NEUROD1 (neurogenic differentiation 1), and investigate their associations with production traits in reference families of Nelore cattle. A total of 585 steers were used, from 34 sires chosen to represent the variability of this breed. By sequencing 14 animals with extreme residual feed intake (RFI) values, seven single nucleotide polymorphisms (SNPs) in NEUROD1 were identified. The investigation of marker effects on the target traits RFI, backfat thickness (BFT), ribeye area (REA), average body weight (ABW), and metabolic body weight (MBW) was performed with a mixed model using the restricted maximum likelihood method. SNP1062, which changes cytosine for guanine, had no significant association with RFI or REA. However, we found an additive effect on ABW (P ≤ 0.05) and MBW (P ≤ 0.05), with an estimated allele substitution effect of -1.59 and -0.93 kg0.75, respectively. A dominant effect of this SNP for BFT was also found (P ≤ 0.010). Our results are the first that identify NEUROD1 as a candidate that affects BFT, ABW, and MBW. Once confirmed, the inclusion of this SNP in dense panels may improve the accuracy of genomic selection for these traits in Nelore beef cattle as this SNP is not currently represented on SNP chips.

Genes diferencialmente expressos no músculo Longissimus dorsi de novilhos nelore divergentes para eficiência bruta.

2016

Análises de dados longitudinais em bovinos nelore mocho por meio de modelos não lineares.

2016

Efeito da endogamia sobre pesos pré-desmame em bovinos da raça Nelore mocho criados a pasto no bioma Cerrado.

2016

Diagnóstico da infecção por Babesia bovis por meio da técnica qPCR em bovinos da raça angus.

2016

Genome-wide detection of CNVs and their association with meat tenderness in Nelore cattle.

Brazil is one of the largest beef producers and exporters in the world with the Nelore breed representing the vast majority of Brazilian cattle (Bos taurus indicus). Despite the great adaptability of the Nelore breed to tropical climate, meat tenderness (MT) remains to be improved. Several factors including genetic composition can influence MT. In this article, we report a genome-wide analysis of copy number variation (CNV) inferred from Illumina1 High Density SNP-chip data for a Nelore population of 723 males. We detected >2,600 CNV regions (CNVRs) representing 6.5% of the genome. Comparing our results with previous studies revealed an overlap in 1400 CNVRs (>50%). A total of 1,155 CNVRs (43.6%) overlapped 2,750 genes. They were enriched for processes involving guanosine triphosphate (GTP), previously reported to influence skeletal muscle physiology and morphology. Nelore CNVRs also overlapped QTLs for MT reported in other breeds (8.9%, 236 CNVRs) and from a previous study with this population (4.1%, 109 CNVRs). Two CNVRs were also proximal to glutathione metabolism genes that were previously associated with MT. Genome-wide association study of CN state with estimated breeding values derived from meat shear force identified 6 regions, including a region on BTA3 that contains genes of the cAMP and cGMP pathway. Ten CNVRs that overlapped regions associated with MT were successfully validated by qPCR. Our results represent the first comprehensive CNV study in Bos taurus indicus cattle and identify regions in which copy number changes are potentially of importance for the MT phenotype.

Variation in myogenic differentiation 1 mRNA abundance is associated with beef tenderness in Nelore cattle.

The myogenic differentiation 1 gene (MYOD1) has a key role in skeletal muscle differentiation and composition through its regulation of the expression of several muscle-specific genes. We first used a general linear mixed model approach to evaluate the association of MYOD1 expression levels on individual beef tenderness phenotypes. MYOD1 mRNA levels measured by quantitative polymerase chain reactions in 136 Nelore steers were significantly associated (P ? 0.01) with Warner?Bratzler shear force, measured on the longissimus dorsi muscle after 7 and 14 days of beef aging. Transcript abundance for the muscle regulatory gene MYOD1 was lower in animals with more tender beef. We also performed a coexpression network analysis using whole transcriptome sequence data generated from 30 samples of longissimus muscle tissue to identify genes that are potentially regulated by MYOD1. The effect of MYOD1 gene expression on beef tenderness may emerge from its function as an activator of muscle-specific gene transcription such as for the serum response factor (C-fos serum response element-binding transcription factor) gene (SRF), which determines muscle tissue development, composition, growth and maturation.

Resumos...

Ação antibacteriana in vitro de extratos vegetais de plantas do Bioma Pampa; Adubação nitrogenada na produção de Tifton 85; Análise funcional da congruência de marcadores SNPs entre estudos de associação genômica ampla para a característica de resistência de bovinos ao carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus; Avaliação de capim-sudão BRS Estribo quando manejado por altura e pastejado por vacas em lactação; Avaliação de carcaças de animais da raça Charolês e de suas cruzas: dados parciais; Avaliação de genótipos de azevém na região da Campanha gaúcha; Avaliação de genótipos de Dactylis glomerata na região da Campanha gaúcha; Avaliação de Panicum maximum em Bagé - RS; Avaliação do crescimento e desenvolvimento de capim-sudão BRS Estribo sob diferentes disponibilidades hídricas; Avaliação do emprego da termografia em estimativas de carga parasitária de Rhipicephalus (Boophilus) microplus em bovinos; Avaliação in vivo da atividade anti-helmíntica de Senecio brasiliensis e de Acacia mearnsii em ovinos experimentalmente infectados; Comparação da resposta humoral de bovinos da raça Braford resistentes e sensíveis ao Rhipicephalus (Boophilus) microplus submetidos a infestações artificiais; Comportamento ingestivo de bovinos de corte em pastagem natural com diferentes níveis de intensificação; Descrição e evolução da infestação do capim-annoni utilizando o método de interceptação na linha; Desempenho de terneiros(as) das raças Angus e Braford em diferentes propriedades de pecuaristas familiares do Rio Grande do Sul; Dessecação na linha: implicações na produção de sorgo forrageiro no Método Integrado para Recuperação de Pastagens - Mirapasto; Dessecação na linha: implicações no estabelecimento de plantas forrageiras no Método Integrado para Recuperação de Pastagens - Mirapasto; Efeito do tempo de secagem e análise sequencial sobre a determinação de fdn e fda em forragens utilizando bolsas de filtro Efeito in vitro de extratos vegetais sobre a inibição da migração de larvas infectantes de Haemonchus contortus

Iron content affects lipogenic gene expression in the muscle of nelore beef cattle.

Iron (Fe) is an essential mineral for metabolism and plays a central role in a range of biochemical processes. Therefore, this study aimed to identify differentially expressed (DE) genes and metabolic pathways in Longissimus dorsi (LD) muscle from cattle with divergent iron content, as well as to investigate the likely role of these DE genes in biological processes underlying beef quality parameters. Samples for RNA extraction for sequencing and iron, copper, manganese, and zinc determination were collected from LD muscles at slaughter. Eight Nelore steers, with extreme genomic estimated breeding values for iron content (Fe-GEBV), were selected from a reference population of 373 animals. From the 49 annotated DE genes (FDR<0.05) found between the two groups, 18 were upregulated and 31 down-regulated for the animals in the low Fe-GEBV group. The functional enrichment analyses identified several biological processes, such as lipid transport and metabolism, and cell growth. Lipid metabolism was the main pathway observed in the analysis of metabolic and canonical signaling pathways for the genes identified as DE, including the genes FASN, FABP4, and THRSP, which are functional candidates for beef quality, suggesting reduced lipogenic activities with lower iron content. Our results indicate metabolic pathways that are partially influenced by iron, contributing to a better understanding of its participation in skeletal muscle physiology.

Genes diferencialmente expressos em músculo de novilhos Nelore divergentes para eficiência parcial de crescimento.

2016

Association analyses pointed the TIPARP as a potential candidate gene influencing residual feed intake variation in Nelore cattle.

2016