Factor analysis applied to genome prediction for high-dimensional phenotypes in pigs.

The aim of the present study was to propose and evaluate the use of factor analysis (FA) in obtaining latent variables (factors) that represent a set of pig traits simultaneously, for use in genome-wide selection (GWS) studies. We used crosses between outbred F2 populations of Brazilian Piau X commercial pigs. Data were obtained on 345 F2 pigs, genotyped for 237 SNPs, with 41 traits. FA allowed us to obtain four biologically interpretable factors: ?weight?, ?fat?, ?loin?, and ?performance?. These factors were used as dependent variables in multiple regression models of genomic selection (Bayes A, Bayes B, RR-BLUP, and Bayesian LASSO). The use of FA is presented as an interesting alternative to select individuals for multiple variables simultaneously in GWS studies; accuracy measurements of the factors were similar to those obtained when the original traits were considered individually. The similarities between the top 10% of individuals selected by the factor, and those selected by the individual traits, were also satisfactory. Moreover, the estimated markers effects for the traits were similar to those found for the relevant factor.

Absorção de glifosate por soja não transgênica a partir de exsudatos de raiz de soja RR cultivadas em sistema hidropônico.

O ácido chiquímico é um indicador da intoxicação das plantas por glifosate. Apesar de inativado no solo, há indícios de que esse herbicida pode ser liberado pelas raízes das plantas tratadas sendo, posteriormente, absorvido por outras plantas. O objetivo desse trabalho foi verificar a exsudação do glifosate a partir de plantas de soja RR e sua posterior absorção por soja convencional, ambas cultivadas em sistema hidropônico. Os resultados mostraram que houve exsudação do glifosate e de seu metabolito ácido aminometilfosfônico (AMPA) pela soja RR na solução nutritiva e posterior absorção do herbicida, indicada pelo acúmulo do ácido chiquímico nas plantas de soja convencional. Comprova-se a exsudação e posterior absorção do glifosate, entretanto, relacionar estes fatos com os efeitos negativos sobre o crescimento e o aumento da suscetibilidade das plantas às doenças é prematuro, principalmente devido à forte adsorção do produto. Há necessidade de estudos posteriores que relacionem fatores climáticos, balanço de massas além de microorganismos endofíticos e micorrizas.

Efeito do glifosate sobre a nodulação da soja cv. BRS-Valiosa RR.

A soja resistente ao glifosate (RR) é uma tecnologia que vem acrescentar mais uma ferramenta ao manejo de plantas daninhas para essa cultura, que possui a maior área plantada no país. Estudos buscando informações para o uso correto da soja transgênica na região de Campinas/SP são importantes devido ao uso cada vez mais freqüente desta prática agrícola em todo o Estado e no Brasil. O objetivo deste trabalho foi avaliar esta tecnologia na nodulação da soja cv. Valiosa RR em condições de casa de vegetação. Os tratamentos utilizados foram aplicações isoladas de Roundup Ready a 1,5, 2,0 e 3,0 L.ha-1; aplicações seqüenciais de Roundup Ready a 1,5/1,5; 2,0/1,5 e 2,0/1,5/1,5 L.ha-1, além de uma testemunha absoluta. O número e as biomassas fresca e seca dos nódulos foram determinados nos estádios R3 e R5. Apesar de terem sido observadas reduções em alguns dos parâmetros avaliados, estas foram não significativas.

Polinização por Apis mellifera em soja em soja transgênica [Glycine max (L.) Merrill] Merrill] Roundup ReadyTM cv. BRS 245 RR e convencional cv. BRS 133.

RESUMO: O objetivo deste estudo foi verificar a influência de Apis mellifera na produção de grãos e qualidade de sementes da soja transgênica Glycine max (L.) Merrill Roundup ReadyTM e convencional. A soja transgênica foi plantada intercalada com a convencional, em 18 parcelas, em três tratamentos: gaiolas com abelhas A. mellifera, gaiolas sem abelhas e áreas descobertas, com livre visitação de insetos. Na soja transgênica, em três parcelas de cada tratamento, foi aplicado glifosato, 30 dias após a emergência. Os parâmetros analisados foram: produção de grãos; número de vagens por planta; peso de 100 sementes e porcentagem de germinação das sementes. Não houve diferença entre as cultivares, entretanto a produção de 2.757,40 kg ha-1 obtida na área coberta por gaiola com abelhas, e 2.828,47 kg ha-1 na área livre para visitação de insetos foram superiores a 2.000,53 kg ha-1 da área coberta por gaiola sem abelhas. O número de vagens por planta foi maior na área coberta por gaiola com abelhas (38,28) e área livre (32,65), quando comparado com o da área coberta por gaiola sem abelhas (21,19). O peso médio de 100 sementes e a germinação das sementes não foram diferentes entre as cultivares e nem entre os tratamentos. Conclui-se que, para as cultivares estudadas, houve benefício na produção de grãos de 37,84%, quando foi permitida a visita de abelhas. ABSTRACT. Pollination by Apis mellifera in transgenic soy (Glycine max (L.) Merrill) Roundup Ready? cv. BRS 245 RR and conventional cv. BRS 133. This research was carried out to evaluate the influence of Africanized honeybees in grain production and seed quality of Glycine max (L.) Merrill Roundup Ready? transgenic soy, as well as of conventional soy. Transgenic soy was interposed with conventional soybean, in 18 plots and three treatments: covered area with Africanized honeybees, covered area without honeybees, and uncovered area with free insect visitation. The herbicide Glyphosate was applied on three plots of each treatment of transgenic soy, 30 days after emergence. Grain production, number of pods/plant, weight per 100 seeds, and seed germination percentage were evaluated. There was no difference among cultivars; however, the production in the covered area with honeybees (2757.4 kg ha-1) and in the uncovered area (2828.47 kg ha-1) were higher than in the covered area without honeybees (2000.53 kg ha-1). The number of pods/plant was greater than in the covered area with honeybees (38.28) and in the uncovered area (32.65) as compared to the covered area without honeybees (21.19). The weight per 100 seeds seed germination did not differ among cultivars or treatments. It can be concluded that, for these cultivars, there was a rise in grain production of 37.84% when honeybee visits were allowed.

Efeito de glifosate sobre a nodulação da soja cv. BRS-Valiosa RR.

2009

Nodulação da cultivar de soja BRS 246 RR tratada com diferentes inoculantes comerciais em terras baixas.

2015

Estimates of genetic parameters using RELM/BLUP for intrapopulational genetic breeding of Platonia insignis Mart.

The aim of this study was to estimate genetic parameters to support the selection of bacuri progenies for a first cycle of recurrent selection, using the REML/BLUP (restricted maximum likelihood/best linear unbiased prediction) procedure to estimate the variance components and genotypic values. Were evaluated twelve variables in a total of 210 fruits from 39 different seed trees, from a field trial with an experimental design of incomplete blocks with clonal replies among subplots. The three variables related with the fruit development (weight, diameter, length) showed strong correlation, and where fruit length showed higher heritability and potential to be used for indirect selection. Among the 39 progenies evaluated in this study, five present potential to compose the next cycle of recurrent selection, due they hold good selection differential either to agrotechnological variables as to development of bacuri fruit.

Glyphosate-resistant hairy fleabane competition in RR® soybean.

2014