Indicadores de sustentabilidade: avaliação de plantios florestais.

O impacto ambiental de plantios florestais em Marabá (PA) foi avaliado por quatro grupos de atores sociais pertencentes à cadeia produtiva de madeira para produção de carvão (agricultores, industrias, gestores e pesquisadores) com o uso do sistema Eco-cert.Rural. O referido sistema consiste em um conjunto de 24 indicadores de desempenho ambiental da atividade produtiva de uma propriedade rural ou território, composto por 125 componentes, agrupados em sete aspectos e duas dimensões (Desempenho Ecológico e Socioambiental). A avaliação geral, considerando todos os entrevistados, detectou índices negativos para os indicadores Uso de Insumos e Recursos, e Qualidade Ambiental, além de destacar critérios positivos relacionados ao indicador Renda. Na avaliação por grupos, observou-se o aparecimento de outros critérios com índices negativos, como os critérios Qualidade do Produto e Qualidade do Trabalho, para o grupo Agricultores, e o critério Qualidade do Produto no grupo representado Pesquisa.

Avaliação de impacto socioambiental de estabelecimento agroflorestal com potencial para plantios florestais energéticos na região de Marabá/PA.

2009

Lipid profile and glycemic response of rats fed on a semi-purified diet supplemented with Agaricus brasiliensis mushroom.

A busca por hábitos alimentares saudáveis tem incentivado o estudo de novas fontes alimentares. Destacam-se os cogumelos comestíveis, como os do gênero Agaricus. Este trabalho avaliou a influência da ração semi-purificada, suplementada com o cogumelo Agaricus brasiliensis no perfil de lipídios, em ratos. Foi realizado experimento com 28 ratos machos Wistar, em 32 dias. Os animais foram separados em quatro grupos de sete dos quais o primeiro recebeu dieta AIN-93 (CAS), o segundo recebeu dieta AIN-93 adicionada de 1% de colesterol (CAS + COL) e o terceiro e o quarto grupos foram alimentados com dieta AIN-93 suplementada com cogumelos sem (COG) e com (COG + COL) adição de colesterol a 1%, respectivamente. No 32.º dia, amostras foram coletadas para análises de colesterol, triglicerídeos, colesterol hepático da gordura hepática. O estudo mostrou que Agaricus brasiliensis influenciou o perfil lipídico, diminuindo o colesterol total (-16%) e os triglicérides (- 26,9%), além de aumentar o HDL (+ 60,2%). É possível afirmar que nutrientes contidos em Agaricus brasiliensis são moduladores do perfil lipídico de ratos, diminuindo a deposição de lipídios hepáticos e aumentando a sua eliminação fecal. A curva glicêmica mostrou declínio significativo entre quinze e sessenta minutos em ratos alimentados com dieta contendo o cogumelo.

Periodicidade do crescimento de espécies arbóreas da Floresta Estacional Semidecidual no Sul do Brasil.

Embora a sazonalidade climática seja menos evidente nas regiões tropicais que nas temperadas, muitas espécies tropicais apresentam crescimento rítmico. A avaliação do crescimento em circunferência do tronco (CCT) permitirá obter informações sobre o desenvolvimento dos indivíduos de espécies arbóreas desta região. Esse estudo teve como objetivo avaliar o CCT de 11 espécies arbóreas de uma floresta estacional semidecidual no sul do Brasil, visando testar duas hipóteses: (i) existe sazonalidade no CCT das árvores e este crescimento está relacionado às variações climáticas da região de estudo; (ii) as características dos indivíduos (posição sociológica, altura da árvore, grau de ocupação por lianas, deciduidade e diâmetro à altura do peito) influenciam no incremento acumulado em circunferência. Para detectar a periodicidade do CCT foram implantadas faixas dendrométricas permanentes no tronco (altura do DAP) de 156 indivíduos. O acompanhamento do crescimento foi realizado mensalmente por um período de 18 meses. Foram feitas correlações do CCT mensal com a precipitação, temperatura e fotoperíodo para verificar a influencia dos fatores ambientais e análise de covariância para averiguar se as características dos indivíduos também interferiram no incremento acumulado em circunferência do tronco. As espécies apresentaram um padrão sazonal de CCT, com as maiores taxas de crescimento de outubro a dezembro, sendo que os parâmetros ambientais avaliados atuaram em conjunto - principalmente o fotoperíodo e a temperatura - promovendo essa sazonalidade e confirmando a primeira hipótese. Considerando as características dos indivíduos, somente o diâmetro do tronco correlacionou-se negativamente com o incremento acumulado em circunferência (b = -0,32; p = 0,02), aceitando parcialmente a segunda hipótese.

Modelos para estimativa de volume de árvores individuais pela morfometria da copa obtida com LiDAR.

A estimativa volumétrica, a partir do escaneamento digital de florestas por meio do uso do LIDAR, potencializa o emprego de técnicas de manejo de precisão no planejamento da exploração nas florestas tropicais. A utilização dessa tecnologia de sensoriamento remoto permite a incorporação de variáveis da morfometria de copa, ainda pouco empregadas e menos conhecidas em decorrência da dificuldade de coleta em campo. O objeto deste estudo foi construir equações capazes de estimar o volume do fuste de árvores individuais dominantes e codominantes, a partir da morfometria da copa obtida por meio do LIDAR aerotransportado, considerando duas situações de inventário florestal: a) com a coleta do DAP, conjuntamente com as variáveis morfométrica da copa obtidas pelo LIDAR e b) apenas com os dados de morfometria de copa. Para seleção dos modelos foram considerados: a matriz de correlação das variáveis preditoras e a combinação das variáveis que geraram os melhores resultados estatísticos pelos critérios Syx, Syx(%) e Pressp, e que foram homocedásticos e com disposição dos resíduos normais e independentes. Para as melhores equações foram realizadas análise de influência. Os resultados estatísticos do ajuste dos modelos para as duas situações permitiram selecionar equações com e sem DAP, com resultados R2 aj.(%) de a) 92,92 e b) 79,44; Syx (%) de a) 16,73 e b) 27,47; e, critério de Pressp de a) 201,15 m6 e b) 537,47 m6, respectivamente. Por meio das variáveis morfométricas, foi possível desenvolver equações capazes de estimar com precisão o volume do fuste de árvores dominantes e codominantes em florestas tropicais.

Variação genética para caracteres silviculturais em três espécies arbóreas da região do bolsão sul-mato-grossense.

O objetivo do presente estudo foi avaliar a variação genética e a seleção das melhores progênies de Myracrodruon urundeuva, Astronium fraxinifolium e Terminalia argentea, quanto aos caracteres de crescimento, em Selvíria, Mato Grosso do Sul. O teste de progênie foi instalado utilizando o delineamento de blocos ao acaso com 28 tratamentos, quatro repetições e dez plantas por parcela em linhas simples, no espaçamento 1,5 x 3,0 m. Aos 14 anos de idade, as progênies foram avaliadas quantos aos caracteres: altura (ALT); diâmetro a altura do peito (DAP); diâmetro médio da copa (DMC); forma do tronco (FT, escala de notas, variando de 1 a 5) e sobrevivência (SOB). Foram encontradas altas herdabilidades entre médias de progênies para os caracteres DAP (0,67), DMC (0,57) e forma do tronco (0,83), respectivamente. O ganho predito para DAP indica que a seleção baseada em informações, tanto de progênies, quanto de indivíduos dentro de progênies foram substanciais, o que denota uma boa perspectiva de exploração da variabilidade genética ao longo de um programa de melhoramento genético para as espécies estudadas, assim como o estabelecimento de estratégias para futura formação de um pomar de sementes.

Genome selection in fruit breeding: application to table grapes.

Genomic selection (GS) has recently been proposed as a new selection strategy which represents an innovative paradigm in crop improvement, now widely adopted in animal breeding. Genomic selection relies on phenotyping and high-density genotyping of a sufficiently large and representative sample of the target breeding population, so that the majority of loci that regulate a quantitative trait are in linkage disequilibrium with one or more molecular markers and can thus be captured by selection. In this study we address genomic selection in a practical fruit breeding context applying it to a breeding population of table grape obtained from a cross between the hybrid genotype D8909-15 (Vitis rupestris × Vitis arizonica/girdiana), which is resistant to dagger nematode and Pierce?s disease (PD), and ?B90-116?, a susceptible Vitis vinifera cultivar with desirable fruit characteristics. Our aim was to enhance the knowledge on the genomic variation of agronomical traits in table grape populations for future use in marker-assisted selection (MAS) and GS, by discovering a set of molecular markers associated with genomic regions involved in this variation. A number of Quantitative Trait Loci (QTL) were discovered but this method is inaccurate and the genetic architecture of the studied population was better captured by the BLasso method of genomic selection, which allowed for efficient inference about the genetic contribution of the various marker loci. The technology of genomic selection afforded greater efficiency than QTL analysis and can be very useful in speeding up the selection procedures for agronomic traits in table grapes.

Factor analysis applied to genome prediction for high-dimensional phenotypes in pigs.

The aim of the present study was to propose and evaluate the use of factor analysis (FA) in obtaining latent variables (factors) that represent a set of pig traits simultaneously, for use in genome-wide selection (GWS) studies. We used crosses between outbred F2 populations of Brazilian Piau X commercial pigs. Data were obtained on 345 F2 pigs, genotyped for 237 SNPs, with 41 traits. FA allowed us to obtain four biologically interpretable factors: ?weight?, ?fat?, ?loin?, and ?performance?. These factors were used as dependent variables in multiple regression models of genomic selection (Bayes A, Bayes B, RR-BLUP, and Bayesian LASSO). The use of FA is presented as an interesting alternative to select individuals for multiple variables simultaneously in GWS studies; accuracy measurements of the factors were similar to those obtained when the original traits were considered individually. The similarities between the top 10% of individuals selected by the factor, and those selected by the individual traits, were also satisfactory. Moreover, the estimated markers effects for the traits were similar to those found for the relevant factor.

Selection between and within full-sib sugarcane families using the modified BLUPIS method (BLUPISM).

2016

Juvenile-mature genetic correlations in Pinus taeda clones propagated via somatic embryogenesis.

Objetivou-se com o presente trabalho, estimar a correlação genética entre idades de seleção (juvenil-adulta) e eficiência da seleção precoce para as características altura, diâmetro e volume de indivíduos de famílias de Pinus taeda propagados via embriogênese somática. O estudo foi realizado por meio de análise genético-estatística pelo procedimento de estimação de componentes de variância (Reml) e de predição de valores genéticos (Blup), usando-se o software Selegen-Reml/Blup. As correlações genéticas entre idades juvenis e idade de rotação foram realizadas aplicando o modelo linear desenvolvido por Lambeth (1980). Segundo os resultados do modelo estabelecido, a seleção precoce pode ser realizada em clones de Pinus taeda com alta eficiência de seleção. As idades de 4 a 6 anos são suficientes para selecionar clones de Pinus taeda propagados via embriogênese somática para colheita aos 8 e 12 anos e, as idades de 6 a 10 anos são suficientes para selecionar para colheita aos 20 anos. De acordo com as estimativas de correlação genotípicaa partir dos ambientes, a seleção de clones de Pinus taeda propagados via embriogênese somática deve ser praticada de forma específica para cada ambiente. Pode-se realizar a seleção de clones considerando o diâmetro, visto a alta correlação observada entre volume e diâmetro.

Drimys brasiliensis essential oil as a source of drimenol.

Drimys brasiliensis Miers é uma espécie nativa da Mata Atlântica, conhecida popularmente por cataia, utilizada como estimulante, antidiarreica, antifebril, dentre outras propriedades. Folhas frescas e secas de cataia foram coletadas no outono/2012, submetidas à hidrodestilação em aparelho graduado tipo Clevenger durante um período de 4 horas após ebulição, retirando-se em seguida o óleo. No óleo de folhas frescas foram identificados 49 compostos, sendo 65,0% sesquiterpenos, 12,0% monoterpenos e 23,0% de outras substâncias. Já no óleo de folhas secas identificou-se 40 compostos, sendo 76,1% sesquiterpenos, 2,0% monoterpenos e 21,9% de outros compostos. Os principais constituintes para as folhas frescas foram germacreno D (8,9%), biciclogermacreno (5,3%), epi-alfa-cadinol (5,1%), alfa-cadinol (6,0%) e drimenol (9,3%). Já para as folhas secas, os principais constituintes foram germacreno D (6,3%), (E)-nerodidol (5,4%), espatulenol (9,5%), epi-alfa-cadinol (5,5%), alfa-cadinol (6,7%) e drimenol (11,6%). Devido a sua composição, a espécie possivelmente pode possuir algumas atividades como antifúngicas, antibacterianas, além de insetífuga, moluscocida e com propriedades farmacológicas que a espécie pode possuir.

Next-generation transcriptome assembly of an Amazon palm (Euterpe precatoria).

2016

Transcriptome analysis of Euterpe edulis and identification of microsatellite markers.

2016

Daily foraging activity of Acromyrmex (Hymenoptera: Formicidae) leaf-cutting ants.

Leaf-cutting ants are well-known insects due to their remarkable activity as herbivores and the considerable economic damage they cause to many crops. The identification of season and time of day when leaf-cutting ants are most active is an important tool, not just to understand the foraging ecology of these ants, but also to optimize their control in plantation areas where they are pests. Thus, the aims of this study are to evaluate the daily foraging activity of leafcutting ant species of the genus Acromyrmex, which occur in forest plantations in Southern Brazil. Foraging activity of Acromyrmex crassispinus (Forel) and Acromyrmex subterraneus subterraneus (Forel) were correlated with weather conditions, and it was more intense during spring and summer. Workers that forage at night are significantly heavier than workers that forage during the day. This study showed that A. crassispinus and A. subterraneus subterraneus did not forage at temperatures below 10-11°C. Then, the use of granulated baits to control these leaf-cutting ants species where they are pests should be done just under favorable conditions of temperature for Acromyrmex foraging activity (over 12°C), to ensure maximum collection of baits by ants and the least left-over baits.

Predictive ability of Genomic Estimated Family Values (GEFV).

Genomic selection (GS) has been used to compute genomic estimated breeding values (GEBV) of individuals; however, it has only been applied to animal and major plant crops due to high costs. Besides, breeding and selection is performed at the family level in some crops. We aimed to study the implementation of genome-wide family selection (GWFS) in two loblolly pine (Pinus taeda L.) populations: i) the breeding population CCLONES composed of 63 families (5-20 individuals per family), phenotyped for four traits (stem diameter, stem rust susceptibility, tree stiffness and lignin content) and genotyped using an Illumina Infinium assay with 4740 polymorphic SNPs, and ii) a simulated population that reproduced the same pedigree as CCLONES, 5000 polymorphic loci and two traits (oligogenic and polygenic). In both populations, phenotypic and genotypic data was pooled at the family level in silico. Phenotypes were averaged across replicates for all the individuals and allele frequency was computed for each SNP. Marker effects were estimated at the individual (GEBV) and family (GEFV) levels with Bayes-B using the package BGLR in R and models were validated using 10-fold cross validations. Predicted ability, computed by correlating phenotypes with GEBV and GEFV, was always higher for GEFV in both populations, even after standardizing GEFV predictions to be comparable to GEBV. Results revealed great potential for using GWFS in breeding programs that select families, such as most outbreeding forage species. A significant drop in genotyping costs as one sample per family is needed would allow the application of GWFS in minor crops.