Extensive admixture and selective pressure across the Sahel Belt

Genome-wide studies of African populations have the potential to reveal powerful insights into the evolution of our species, as these diverse populations have been exposed to intense selective pressures imposed by infectious diseases, diet, and environmental factors. Within Africa, the Sahel Belt extensively overlaps the geographical center of several endemic infections such as malaria, trypanosomiasis, meningitis, and hemorrhagic fevers. We screened 2.5 million single nucleotide polymorphisms in 161 individuals from 13 Sahelian populations, which together with published data cover Western, Central, and Eastern Sahel, and include both nomadic and sedentary groups. We confirmed the role of this Belt as a main corridor for human migrations across the continent. Strong admixture was observed in both Central and Eastern Sahelian populations, with North Africans and Near Eastern/Arabians, respectively, but it was inexistent in Western Sahelian populations. Genome-wide local ancestry inference in admixed Sahelian populations revealed several candidate regions that were significantly enriched for non-autochthonous haplotypes, and many showed to be under positive selection. The DARC gene region in Arabs and Nubians was enriched for African ancestry, whereas the RAB3GAP1/LCT/MCM6 region in Oromo, the TAS2R gene family in Fulani, and the ALMS1/NAT8 in Turkana and Samburu were enriched for non-African ancestry. Signals of positive selection varied in terms of geographic amplitude. Some genomic regions were selected across the Belt, the most striking example being the malaria-related DARC gene. Others were Western-specific (oxytocin, calcium, and heart pathways), Eastern-specific (lipid pathways), or even population-restricted (TAS2R genes in Fulani, which may reflect sexual selection).

Interaction paradigms versus age-related user profiles: an evaluation on content selection

Novel input modalities such as touch, tangibles or gestures try to exploit human's innate skills rather than imposing new learning processes. However, despite the recent boom of different natural interaction paradigms, it hasn't been systematically evaluated how these interfaces influence a user's performance or whether each interface could be more or less appropriate when it comes to: 1) different age groups; and 2) different basic operations, as data selection, insertion or manipulation. This work presents the first step of an exploratory evaluation about whether or not the users' performance is indeed influenced by the different interfaces. The key point is to understand how different interaction paradigms affect specific target-audiences (children, adults and older adults) when dealing with a selection task. 60 participants took part in this study to assess how different interfaces may influence the interaction of specific groups of users with regard to their age. Four input modalities were used to perform a selection task and the methodology was based on usability testing (speed, accuracy and user preference). The study suggests a statistically significant difference between mean selection times for each group of users, and also raises new issues regarding the “old” mouse input versus the “new” input modalities.

A violência sexual e de género nos campos de população refugiada: análise e enquadramento legal

Dissertação de mestrado em Direitos Humanos

The relationship between sexual and emotional promiscuity and infidelity

Dissertação de mestrado integrado em Psicologia

Analysis and selection of indicators for a sustainability assessment method for school buildings based on SBTool ‐ PT

Nowadays, the sustainability of buildings has an extreme importance. This concept goes towards the European aims of the Program Horizon 2020, which concerns about the reduction of the environmental impacts through such aspects as the energy efficiency and renewable technologies, among others. Sustainability is an extremely broad concept but, in this work, it is intended to include the concept of sustainability in buildings. Within the concept that aims the integration of environmental, social and economic levels towards the preservation of the planet and the integrity of the users, there are, currently, several types of tools of environmental certification that are applicable to the construction industry (LEED, BREEAM, DGNB, SBTool, among others). Within this context, it is highlighted the tool SBTool (Sustainable Building Tool) that is employed in several countries and can be subject to review in institutions of basic education, which are the base for the formation of the critical masses and for the development of a country. The main aim of this research is to select indicators that can be used in a methodology for sustainability assessment (SBTool) of school buildings in Portugal and in Brazil. In order to achieve it, it will also be analyzed other methodologies that already incorporate parameters directly related with the schools environment, such as BREEAM or LEED.

Desenvolvimento de competências no âmbito da educação sexual: uma investigação-ação com professores e alunos

De acordo com a lei portuguesa, a Educação Sexual (ES) é obrigatória desde o 1.º Ciclo do Ensino Básico (CEB) até ao Ensino Secundário. No entanto, muitos projetos de ES em meio escolar não consideram as necessidades do seu público-alvo, o que limita a sua eficácia. Assim, esta investigação-ação procurou averiguar necessidades e conceções de professores e alunos sobre ES em meio escolar e, a partir destas, desenvolver as competências dos professores para abordar a ES de modo a promover a vivência de uma sexualidade saudável por parte dos alunos. A investigação desenrolou-se em três fases: diagnóstico, intervenção e avaliação. Para a fase de diagnóstico construímos um questionário, validado por meio de um estudo piloto, que aplicámos a professores de 1.º, 2.º e 3.º CEB de escolas do concelho do Porto. O questionário foi preenchido on-line e os dados obtidos foram tratados com o programa SPSS. A mesma metodologia foi utilizada para analisar as conceções de alunos de 2.º e 3.º CEB de uma escola do Porto. Na fase de intervenção começamos por um focus group com professores para clarificar as suas opiniões e registar reações à imposição legal da ES. Seguiram-se sessões de formação para professores e a implementação de um conjunto de ações estruturadas com os alunos. A avaliação efetuou-se com novo focus group com os professores intervenientes e através de um questionário aplicado aos alunos das turmas alvo de intervenção. Os resultados revelaram que, depois da intervenção, os professores se sentiam mais confiantes, com mais conhecimentos e mais estratégias para implementar projetos de ES. Os alunos ampliaram o seu conceito de sexualidade, demonstraram uma atitude mais favorável face ao papel da ES no seu desenvolvimento, aumentaram a sua confiança na escola como agente educativo nesta temática, aumentaram os seus conhecimentos sobre sexualidade e atenuaram-se algumas diferenças de género.

Conceções de alunos do 1.º ciclo do ensino básico sobre sexualidade e educação sexual

Nesta investigação procuramos averiguar as conceções e necessidades de alunos do 1.ºCEB sobre sexualidade e educação sexual (ES), como ponto de partida para delinear intervenções adequadas. Construímos e validámos um questionário, que aplicámos a alunos de 3.º e 4.º anos de escolaridade de um agrupamento de escolas do concelho do Porto. Responderam 96 alunos (45 raparigas e 51 rapazes), cuja média de idades foi de 8.95 anos. Destes, 52 frequentavam o 3.º ano e 44 o 4.º ano. Os dados obtidos foram tratados e analisados com o programa SPSS. Sobre o papel que a ES pode desempenhar no desenvolvimento das crianças, a maioria dos alunos considerou que: “conhecer o corpo é importante para crescer saudável”; “conhecermo-nos a nós e aos outros ajuda a sermos mais amigos”; “nem sempre os meus amigos sabem o que é melhor para mim”; “conhecer o corpo torna-nos mais responsáveis”. As raparigas concordaram mais com esta afirmação. Verificámos que os alunos atribuem importância ao papel da escola na ES, pois, na sua maioria, consideraram que: “a escola é um local onde posso fazer perguntas sobre o corpo e o nascimento dos bebés à vontade”, “os professores sabem responder às minhas perguntas sobre o corpo e o nascimento dos bebés” e “gostava de participar em mais atividades sobre o corpo e o nascimento de bebés na escola”. Foram os alunos de 3.º ano que mais concordaram com estas afirmações. A maioria dos alunos (81%) referiu que gostaria que fossem os professores a falar sobre o corpo e o nascimento dos bebés, em detrimento dos amigos, pai e psicólogo escolar. Os alunos do 3.º ano concordaram mais com os professores como responsáveis pela ES e as raparigas concordaram menos com o pai. Estes resultados devem ser considerados na elaboração de projetos de ES, para conseguirmos intervenções eficazes junto do público-alvo.

Trabalhar relacionamentos interpessoais e emoções como dimensões da educação sexual com crianças de 1.º CEB

Emoções e relacionamentos são tópicos incluídos nos Standards para a Educação Sexual na Europa (WHO, 2010) que estipulam uma abordagem adequada a cada faixa etária e ao longo de todo o sistema educativo. Em Portugal, a recente legislação sobre educação sexual (Lei n.º 60/2009) inclui esta temática no currículo escolar, obrigatoriamente, a partir do 1.ºCEB, privilegiando uma educação integral do indivíduo, considerando o seu desenvolvimento nos níveis cognitivo, físico, psicoafetivo, emocional e social. A necessidade de realização deste trabalho surgiu da observação de relações conflituosas e de competição, assim como de limitações na expressão de emoções, entre crianças, em contexto de estágio. O objetivo principal foi aprofundar o conhecimento sobre o desenvolvimento da inteligência emocional (IE) nas crianças e a sua relação com a educação sexual (ES), tentando compreender o impacto de algumas práticas de ES no desenvolvimento de competências inerentes à IE. Seguiu-se uma metodologia qualitativa, tendo-se realizado uma investigação-ação com uma turma de 20 alunos (12 de sexo feminino; 8 de sexo masculino) de 2.º ano de escolaridade, com idades compreendidas entre os 7 e os 8 anos. Implementou-se um conjunto de atividades com base nas orientações curriculares para a ES no 1.ºCEB, tentando estimular as competências emocionais e de relacionamento interpessoal das crianças. Também se aplicou um questionário na fase de diagnóstico e na fase de avaliação, para verificar a eficácia da intervenção. A análise e reflexão das práticas implementadas revelou o desenvolvimento da empatia e que os alunos foram demonstrando novas atitudes de resolução de conflitos. A comparação dos resultados obtidos nos dois momentos de aplicação do questionário revelou uma evolução ao nível da identificação de emoções em expressões faciais e de novas emoções, da distinção entre emoções positivas e emoções negativas e da identificação de situações que desencadeiem emoções de amor ou amizade.

Educação sexual no 1.º Ciclo do Ensino Básico: O saber e o sentir das crianças

A sexualidade humana deve ser entendida no conjunto das suas múltiplas dimensões e as conceções prévias das crianças e jovens não podem ser negligenciadas na promoção da Educação Sexual. Perante estas necessidades, os objetivos da investigação realizada centraram-se: i) na sistematização das conceções de sexualidade mais frequentes nos alunos do 1.º Ciclo do Ensino Básico (CEB), tendo em consideração as influências de fatores individuais e socioculturais; ii) na aferição dos assuntos que as crianças desejam ver esclarecidos. A metodologia de investigação foi qualitativa - estudo de caso - e optou-se pela técnica de focus groups para a recolha de dados. Realizaram-se quatro grupos de discussão, constituídos em função dos fatores sexo, idade e ano de escolaridade. A amostra incluiu vinte e duas crianças. As discussões foram orientadas por um roteiro de questões, audiogravadas e posteriormente transcritas. Foi feita uma análise de conteúdo com recurso ao programa NVivo (versão 9.0), tendo-se selecionado nove termos pivô (adultos, família, namorar, sexy, sexo, engravidar, bebé, separar e falar) e duas categorias emergentes (rapazes&raparigas; amor&paixão). Os resultados permitiram-nos verificar: existência de estereótipos de género; recurso a linguagem vulgar na denominação de partes do corpo; valorização dos relacionamentos interpessoais; existência de brincadeiras com cariz sexual; diferenças de género na verbalização dos temas amor e paixão; a interpretação do divórcio como consequência da falta de amor e respeito; diferenças na aceitação dos modelos de família não tradicionais; noções temporais sobre os processos de maturação sexual e gestação; parca comunicação sobre sexualidade. Esta investigação permitiu-nos ainda concluir que os assuntos mobilizadores de mais interesse e dúvidas relacionam-se com: relações interpessoais; papéis sociais/papéis de género; diferentes expressões da sexualidade; maturação sexual e reprodução humana.

Human and murine clonal CD8+ T cell expansions arise during tuberculosis because of TCR selection

The immune system can recognize virtually any antigen, yet T cell responses against several pathogens, including Mycobacterium tuberculosis, are restricted to a limited number of immunodominant epitopes. The host factors that affect immunodominance are incompletely understood. Whether immunodominant epitopes elicit protective CD8+ T cell responses or instead act as decoys to subvert immunity and allow pathogens to establish chronic infection is unknown. Here we show that anatomically distinct human granulomas contain clonally expanded CD8+ T cells with overlapping T cell receptor (TCR) repertoires. Similarly, the murine CD8+ T cell response against M. tuberculosis is dominated by TB10.44-11-specific T cells with extreme TCRß bias. Using a retro genic model of TB10.44-11-specific CD8+ Tcells, we show that TCR dominance can arise because of competition between clonotypes driven by differences in affinity. Finally, we demonstrate that TB10.4-specific CD8+ T cells mediate protection against tuberculosis, which requires interferon-? production and TAP1-dependent antigen presentation in vivo. Our study of how immunodominance, biased TCR repertoires, and protection are inter-related, provides a new way to measure the quality of T cell immunity, which if applied to vaccine evaluation, could enhance our understanding of how to elicit protective T cell immunity.

Fine time scaling of purifying selection on human nonsynonymous mtDNA mutations based on the worldwide population tree and mother-child pairs

A high-resolution mtDNA phylogenetic tree allowed us to look backward in time to investigate purifying selection. Purifying selection was very strong in the last 2,500 years, continuously eliminating pathogenic mutations back until the end of the Younger Dryas (∼11,000 years ago), when a large population expansion likely relaxed selection pressure. This was preceded by a phase of stable selection until another relaxation occurred in the out-of-Africa migration. Demography and selection are closely related: expansions led to relaxation of selection and higher pathogenicity mutations significantly decreased the growth of descendants. The only detectible positive selection was the recurrence of highly pathogenic nonsynonymous mutations (m.3394T>C-m.3397A>G-m.3398T>C) at interior branches of the tree, preventing the formation of a dinucleotide STR (TATATA) in the MT-ND1 gene. At the most recent time scale in 124 mother-children transmissions, purifying selection was detectable through the loss of mtDNA variants with high predicted pathogenicity. A few haplogroup-defining sites were also heteroplasmic, agreeing with a significant propensity in 349 positions in the phylogenetic tree to revert back to the ancestral variant. This nonrandom mutation property explains the observation of heteroplasmic mutations at some haplogroup-defining sites in sequencing datasets, which may not indicate poor quality as has been claimed.

Predicting SO2 pollution incidents by means of additive models with optimum variable selection

The aim of this paper is to predict time series of SO2 concentrations emitted by coal-fired power stations in order to estimate in advance emission episodes and analyze the influence of some meteorological variables in the prediction. An emission episode is said to occur when the series of bi-hourly means of SO2 is greater than a specific level. For coal-fired power stations it is essential to predict emission epi- sodes sufficiently in advance so appropriate preventive measures can be taken. We proposed a meth- odology to predict SO2 emission episodes based on using an additive model and an algorithm for variable selection. The methodology was applied to the estimation of SO2 emissions registered in sampling lo- cations near a coal-fired power station located in Northern Spain. The results obtained indicate a good performance of the model considering only two terms of the time series and that the inclusion of the meteorological variables in the model is not significant.

Spawning habitat selection by Octopus vulgaris: new insights for a more effective management of this resource

The selection of spawning habitat of a population of Octopus vulgaris that is subject to a small-scale exploitation was studied in the Cíes Islands within the National Park of the Atlantic Islands of Galicia (NW Spain). The technique used was visual censuses by scuba diving. We conducted 93 visual censuses from April 2012 to April 2014. The total swept area was 123.69 ha. Habitat features (season, depth, zone, bottom temperature, swept area, bottom substrate type, and creels fishing impact) were evaluated as predictors of the presence/absence of spawning dens using GAM models. O. vulgaris has a noteworthy preference for spawning in areas with hard bottom substrate and moderate depth (approximately 20 m). The higher density of spawning dens (1.08ha−1) was found in a surveyed area of 50.14ha located in the northeastern part of the northern Cíes Island. We propose to protect the area comprised from Punta Escodelo to Punta Ferreiro between 5 and 30 m depth. This area has a surface of 158 ha equivalent to 5.98% of the total marine area of the Cíes islands. The strengths and weaknesses of a management strategy based on the protection of the species’ spawning habitat are discussed.

Relatório de atividade profissional

Relatório de atividade profissional de mestrado em Ciências – Formação Contínua de Professores (área de especialização em Biologia e Geologia)