Resultados de pesquisa da Embrapa Soja - 2000: manejo do solo e plantas daninhas.

Manejo do solo e de espécies vegetais em sistemas de produção com a soja; Avaliação de doenças de soja e suas relações com as propriedades microbiológicas, físicas e químicas do solo, em diferentes sequências de culturas (04.2000.328-01); Avaliação de sistemas de preparo do solo e manejo do plantio direto envolvendo sucessão e rotação de culturas (04.2000.328-02); Sistema misto de rotação de lavoura e pasto em semeadura direta no Planalto Meridional do Paraná (04.2000.328-03); Rotação de culturas anuais no Planalto Meridional Paranaense (04.2000.328-04); Manejo dos resíduos da colheita condicionado por sistemas de preparo do solo (04.2000.328-05); Biologia e controle de plantas daninhas na cultura da soja; Impacto do uso de herbicidas sobre a comunidade infestante e a cultura da soja (04.2000.324-01); Biologia e manejo integrado de plantas daninhas na cultura da soja (04.2000.324-02); Dinâmica do estabelecimento de espécies de plantas daninhas (04.2000.324-03); Difusão de tecnologias para o manejo integrado de plantas daninhas na cultura da soja (04.2000.324-04).

Análise preliminar de um processo para identificação e alinhamento de seqüências homólogas para proteínas com estrutura resolvida.

O objetivo deste trabalho é apresentar e fazer uma avaliação preliminar de um processo alternativo, denominado Sequences Homologue to the Query (Structure-having) Sequence-SH2Q, para elaboração de alinhamentos múltiplos semelhantes à aqueles relatados no HSSP. O processo aqui apresentado baseia-se em programas de domínio público para busca em bases de dados de sequências -Blast (Altschul et al., 1990, 1997) e para alinhamento múltiplo de sequências -ClustalW (Thompson et al., 1994) O critério para avaliação do mesmo é o grau de similaridade entre as medidas de Entropia Relativa, quando comparadas com os mesmos valores relatados pelo HSSP.

Entendendo e interpretando os parâmetros utilizados por BLAST.

O método BLAST para determinação de similaridades entre sequências biológicas. Score e matrizes de substituição. Determinação de matrizes de substituição BLOSUM. Determinação de matrizes de substituição PAM. Resultados da teoria Estatística de comparação local de sequências. O Algoritmo usado por BLAST. NCBI-BLAST. Exemplo de busca.