Análise preliminar de um processo para identificação e alinhamento de seqüências homólogas para proteínas com estrutura resolvida.


Autoria(s): HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G.
Contribuinte(s)

Embrapa Informática Agropecuária.

Data(s)

09/04/2011

09/04/2011

2003

27/02/2004

Resumo

O objetivo deste trabalho é apresentar e fazer uma avaliação preliminar de um processo alternativo, denominado Sequences Homologue to the Query (Structure-having) Sequence-SH2Q, para elaboração de alinhamentos múltiplos semelhantes à aqueles relatados no HSSP. O processo aqui apresentado baseia-se em programas de domínio público para busca em bases de dados de sequências -Blast (Altschul et al., 1990, 1997) e para alinhamento múltiplo de sequências -ClustalW (Thompson et al., 1994) O critério para avaliação do mesmo é o grau de similaridade entre as medidas de Entropia Relativa, quando comparadas com os mesmos valores relatados pelo HSSP.

2003

Acesso em: 30 maio 2008.

Formato

7 p.

Identificador

10041

http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/5069

Idioma(s)

pt_BR

Publicador

Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2003.

Relação

Embrapa Informática Agropecuária - Comunicado Técnico (INFOTECA-E)

(Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado Técnico, 48).

Palavras-Chave #Processo para construção de alinhamento múltiplo
Tipo

Comunicado Técnico (INFOTECA-E)