Análise preliminar de um processo para identificação e alinhamento de seqüências homólogas para proteínas com estrutura resolvida.

O objetivo deste trabalho é apresentar e fazer uma avaliação preliminar de um processo alternativo, denominado Sequences Homologue to the Query (Structure-having) Sequence-SH2Q, para elaboração de alinhamentos múltiplos semelhantes à aqueles relatados no HSSP. O processo aqui apresentado baseia-se em programas de domínio público para busca em bases de dados de sequências -Blast (Altschul et al., 1990, 1997) e para alinhamento múltiplo de sequências -ClustalW (Thompson et al., 1994) O critério para avaliação do mesmo é o grau de similaridade entre as medidas de Entropia Relativa, quando comparadas com os mesmos valores relatados pelo HSSP.

Processo de depuração depois do teste: definição e análise.

O objetivo da realização deste trabalho foi analisar em detalhes o processo de depuração que ocorre depois da atividade de teste. Por tanto, vários processos de depuração de software foram analisados. Baseado nessa análise foi definido um processo de Depuração depois do teste (DDT) que enfativa os seguintes aspectos: identificação, avaliação e refinamento sucessivo de sintomas internos até a localização do defeito; e tipo de informação de teste utilizada. Várias técnicas de depuração foram então avaliadas em termos de mecanismos de apoio ao processo DDT e quanto a sua escabilidade para programas reais. Dessa avaliação, observou-se que os resultados do teste sistemático de software, quando utilizado na depuração, resultam em técnicas de baixo custo e com maiores perspectivas de escabilidade para programas reais. Infelizmente, esses resultados têm sido utilizados apenas para apoiar um dos aspectos do processo DDT- identificação de sintomas internos. Essa observação motiva a definição de estratégias de depuração que utilizem, de maneira eficaz e eficiente, as informações de teste na avaliação e no refinamento de sintomas internos.