Caracterização molecular dos genes PSO2 e PSO4 de Saccharomyces cerevisiae envolvidos na reparação do DNA : análise funcional e identificação de interações proteína-proteína

O alelo mutante termo-condicionalmente letal pso4-1 do gene PRP19, que codifica uma proteína associada ao spliceossoma, permitiu investigar a influência deste gene no processamento de pré-mRNA, reparação do DNA e esporulação. Fenótipos relacionados a genes portadores de introns foram correlacionados à temperatura. Sistemas repórteres para processamento de pré-mRNA e RT-PCR mostraram que eficiência de processamento de mRNA no mutante pso4-1 é inversamente correlacionada com a temperatura de crescimento. Uma mutação pontual, substituindo uma leucina por uma serina foi identificada dentro da região codificadora N-terminal do alelo Pso4-1 e afeta as propriedades bioquímicas de Pso4-1p. Entre 24 clones isolados utilizando o sistema doishíbridos, 7 foram identificados como partes dos genes RAD2, RLF2 e DBR1. RAD2 codifica uma endonuclease indispensável para a via reparação por excisão de nucleotídeos (NER), RLF2 codifica a subunidade maior do fator de montagem da cromatina I, cuja deleção resulta em sinsibilidade à radiação UVC, enquanto que DBR1 codifica uma enzima que atua sobre substratos de RNA na forma lariat, degradando estruturas lariat em introns durante o processamento de mRNA. A caracterização dos fenótipos após tratamentos com mutágenos em linhagens mutantes simples e duplos de rad2∆, rlf2∆ e pso4-1 mostraram sensibilidade aumentada para para mutantes rad2∆/pso4-1 e rlf2∆/pso4-1, sugerindo uma interferência funcional destas proteínas no processo dereparação do DNA em Saccharomyces cerevisiae. O mecanismo exato de reparação de pontes inter-cadeia (ICL) em S. cerevisiae não é ainda totalmente conhecido. Identificando novos fenótipos e isolando proteínas potencialmente capazes de interagir com Pso2p através da técnica do sistema dois-híbridos, foi possível extender a caracterização deste gene específica para reparação de pontes intercadeia. Tratamentos com acetaldeído (ACA), um metabólito natural da via glicolítica, foi mais tóxico a linhagem mutante pso2 em comparação com a linhagem selvagem e também capaz de induzir a expressão da fusão contendo o promotor de PSO2 à lacZ (PSO2-lacZ) por um fator comparável à tratamentos com outros agentes indutores de ICLs, indicando que o metabólito natural ACA pode causar danos do tipo ICL em S. cerevisiae. A utilização do sistema dois-híbridos permitiu isolar partes de proteínas codificadas por nove diferentes genes, entre eles a proteína quinase Pak1p, um supressor de mutações termosensíveis da DNA Polimerase alfa. Pak1p interage com a extremidade C-terminal conservada de Pso2p, uma região da proteína recentemente nomeada β-CASP entre v ortólogos conhecidos do gene PSO2. A integridade do domínio β-CASP é essencial para a reparaçãode DNA proficiente como demonstrado em ensaios de complementação com mutantes pso2 ∆. Comparação da sobrevivência após tratamento com agentes mutagênicos de simples mutantes pso2 ∆ e pak1 ∆ assim com o dulpo mutante pso2 ∆/pak1 ∆ revelaram que o gene PAK1 é necessário para reparação do DNA proficiente como na linhagem selvagem. A interação epistática dos dois alelos mutantes na linhagem duplo mutante sugere que Pak1p atua na mesma via de reparação a qual PSO2 pertence e que PAK1 constitui um novo locus envolvido na reparação do DNA em S. cerevisiae.

Identificação de genes em Chromobacterium violaceum relacionados à resposta ao estresse

The sequencing of the genome of Chromobacterium violaceum identified one single circular chromosome of 4.8 Mb, in which approximately 40% of the founded ORFs are classified as hypothetical conserved or hypothetical. Some genic regions of biotechnological and biological interest had been characterized, e. g., environmental detoxification and DNA repair genes, respectively. Given this fact, the aim of this work was to identify genes of C. violaceum related to stress response, as the ones involved with mechanisms of DNA repair and/or genomic integrity maintenance. For this, a genomic library of C. violaceum was built in Escherichia coli strain DH10B (RecA-), in which clones were tested to UVC resistance, resulting in five candidates clones. In the PLH6A clone were identified four ORFs (CV_3721 to 3724). Two ORFs, CV_3722 and CV_3724, were subcloned and a synergic complementation activity was observed. The occurrence of an operon was confirmed using cDNA from C. violaceum in a RT-PCR assay. Further, it was observed the induction of the operon after the treatment with UVC. Thus, this operon was related to the stress response in C. violaceum. The mutagenesis assay with rifampicin after the treatment with UVC light showed high frequency of mutagenicity for the ORF CV_3722 (Pol III δ subunit). In this way, we propose that the C. violaceum δ subunit can act in DH10B in the translesion synthesis using Pol IV in a RecA independent-manner pathway. In growth curve assays other four clones (PLE1G, PLE7B, PLE10B and PLE12H) were able to complement the function at the dose 5 J/m2 and in mutagenicity assays PLE7B, PLE10B and PLE12H showed frequencies of mutation with significant differences upon the control (DH10B), demonstrating that in some way they are involved with the stress response in C. violaceum. These clones appear to be interrelated, probably regulated by a messenger molecule (eg., nucleotide c-di-GMP) and/or global regulatory molecule (eg., σS subunit of RNA polymerase).The results obtained contribute for a better genetic knowledge of this specie and its response mechanisms to environmental stress.

Analytical Methods in Photoelectrochemical Treatment of Phenol

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Photocatalytic Degradation of Phenol by Thermal Titanium Dioxide Thin Layer Electrodes

Electrochemical processes in industrial effluents have been studied as a means to obtain higher efficiency in wastewater treatment. Heterogeneous photocatalysis appears as a low-cost alternative through the use of lower wattage lamps and thermal TiO2 films. Photocatalysis became a clean process for water treatment due to hydroxyl radicals generated on semiconductor surface. Such radicals are able to degrade several organic compounds. This study used different electrodes and analytical methods for degradation of phenol molecules to reduce treatment costs, improve efficiency, and identify compounds formed during the decomposition of phenolic molecules. Thermal growth of TiO2 film was observed on the titanium electrode in rutile form. Application of an electrical potential on the Ti/TiO2 working electrode increases efficiency in reducing concentration of phenol after photocatalytic treatment. Still, high energy radiation (UVC) showed best degradation rates in photolytic process. Different compounds formed during the degradation of phenol were also identified in the UVC-PE treatment.

Desenvolvimento de métodos analíticos para estudos de estabilidade para fluconazol cápsulas

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Atividade antioxidante, compostos fenólicos totais e cor em abacate ‘hass’ submetido a diferentes tratamentos físicos

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Avaliação de Reparo de DNA e Atividade Antioxidante do Extrato Etanólico e Substâncias Isoladas de Casearia sylvestris

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Utilização de luz ultravioleta contínua (UV-C) e luz pulsada para conservação de mangas CV. Tommy Atkins minimamente processadas

Pós-graduação em Agronomia (Produção Vegetal) - FCAV

Desenvolvimento e validação do método de difusão em ágar para quantificação de fluconazol cápsulas e aplicação em estudos de estabilidade

O fluconazol é um antifúngico de amplo espectro indicado para o tratamento de infecções fúngicas sistêmicas e superficiais. A determinação da potência dos antimicrobianos é importante no controle e na garantia da qualidade das preparações farmacêuticas e faz-se necessário o desenvolvimento de procedimentos práticos e econômicos que possam ser validados e aplicados no doseamento desses fármacos. Dentre os ensaios microbiológicos, os mais comumente empregados são o de difusão em ágar e o turbidimétrico. O objetivo deste trabalho foi desenvolver e validar métodos microbiológicos para determinação da potência do fluconazol cápsulas. O método de difusão em ágar foi desenvolvido empregando ágar Sabouraud e Candida albicans ATCC 64548 como micro-organismo teste. Foi utilizado o delineamento 3 x 3, segundo preconiza a Farmacopeia Brasileira (2010). A validação do método demonstrou linearidade entre o diâmetro dos halos de inibição e o logaritmo da concentração numa faixa de 25,0 a 100,0 µg/mL. Os resultados foram precisos, com desvio padrão relativo igual a 6,15%, e exatos, com intervalo de tolerância de 97,30%, dentro dos limites permitidos. O método foi aplicado ainda em estudos de estabilidade, nas condições de estresse calor úmido, em câmara climática a 40 ºC e 75% de umidade relativa por 90 dias; calor seco, em estufa a 60 ºC por 66 dias e fotodegradação, em câmara espelhada com luz UVC por 66 e 180 dias. Os valores de teor médio calculados foram de 30,27% para calor úmido; 27,72% para calor seco; 33,29% para fotodegradação durante 66 dias e 25,00% para fotodegradação durante 180 dias

Tetraethylortossilicate plasma thin film with hydrophilic and hydrophobic characteristics: Use on passive mixers

This work aims to obtain plasma thin film composites with hydrophobic/hydrophilic alternated regions, which are useful for the production of miniaturized mixers. These regions were acquired by two different strategies: either the codeposition of TEOS and HFE plasma thin films or the exposition of TEOS plasma films to ultraviolet radiation (UVA and UVC). These films were characterized by several chemical and physical techniques. The refractive indexes vary from 1.4 to 1.7; infrared and photoelectron spectroscopy detect Si-O-Si and CHn species. Silicone-like structures with high or low number of amorphous carbon microparticles and with fluorinated organic clusters were produced. Cluster dimensions were in the 1-5 mm range and they are made of graphite or COF (carbon/oxygen/fluorine) compounds. Scanning electron and optical microscopy showed rough surfaces. Water contact angles were 90º; however, for TEOS films that value changed after 6 hr of UVC exposure. Moreover, after UV exposure, organic polar compounds could be adsorbed in those films and water was not. The passive mixer performance was simulated using the FemLab 3.2® program and was tested with 20 nm thick films on a silicon wafer, showing the capacity of these films to be used in such devices.

Estudo das células mononucleares e polimorfonucleares no intestino de cães naturalmente infectados por leishmania infantum

Pós-graduação em Ciência e Tecnologia Animal - FEIS

Stability study of fluconazole applying validated bioassay and stability-indicating LC methods

Chemical degradation of drugs may result in altered therapeutic efficacy and even toxic effects. Therefore, understanding the factors that change the stability of pharmaceuticals and identifying ways to guarantee their stability are important. In this work stability-indicating Liquid Chromatographic (LC) and bioassay methods were validated and employed in the fluconazole stability studies. The correlation of sample results from both methods was evaluated. Fluconazole raw material stability was investigated in aqueous, acid (0.1 M HCl), alkaline (0.1 M NaOH) and oxidative (3% v/v H2O2) reflux for 6 hours, by LC method. Fluconazole capsules were exposed to UVC (254 nm, 66 and 180 days), climatic chamber (40°C, 75% RH, 90 days) and oven (60°C, 60 days), these samples were analyzed by LC and bioassay methods It was found that the drug is degraded (10% decrease) with arising of a possible degradation product in an oxidative medium and UVC exposure, in all the others conditions fluconazole remained chemically stable (higher than 98%) when analyzed by LC. However when the capsules stressed samples were evaluated through bioassay very low antifungal activity was found (about 30%). Fluconazole showed to be an unstable drug and it indicates that special care must be taken during the handling, storage and quality control using appropriated methods to analyze this therapeutic agent. This work suggests monitoring the fluconazole stability by bioassay and the stability-indicating LC methods.

Development and validation of a stability-indicative agar diffusion assay to determine the potency of flucloxacillin sodium in capsules

Flucloxacillin sodium (FLU) is a semi-synthetic penicillin active against many gram-positive bacteria such as streptococci and penicilinase-producing staphylococci, including methicillin-susceptible S. aureus. This study describes the development and validation of a microbiological assay, applying the diffusion agar method for the determination of FLU, as well as the evaluation of the ability of the method in determining the stability of FLU in capsules against acidic and basic hydrolysis, photolytic and oxidative degradations, using S. aureus ATCC 25923 as micro-organism test and 3 x 3 parallel line assay design (three doses of the standard and three doses of the sample in each plate), with six plates for each assay, according to the Brazilian Pharmacopoeia. The validation method showed good results including linearity, precision, accuracy, robustness and selectivity. The assay is based on the inhibitory effect of FLU using Staphylococcus aureus ATCC 25923. The results of the assay were treated by analysis of variance (ANOVA) and were found to be linear (r = 0.9997) in the range from 1.5 to 6.0 μg/mL, precise (repeatability: R.S.D. = 1.63 and intermediate precision: R.S.D. = 1.64) and accurate (98.96%). FLU solution (from the capsules) exposed to direct UVC light (254 nm), alkaline and acid hydrolysis and hydrogen peroxide causing oxidation were used to evaluate the specificity of the bioassay. Comparison of bioassay and liquid chromatography by ANOVA showed no difference between methodologies. The results demonstrated the validity of the proposed bioassay, which is a simple and useful alternative methodology for FLU determination in routine quality control.

Qualidade do tomate 'Pitenza' com utilização da radiação ultravioleta (UV-C)

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Qualidade do tomate ‘pitenza’ com utilização da radiação ultravioleta (UV-C)

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)