Differential expression in “rogue” paramutation in peas (Pisum sativum L.)

Dissertação de Mestrado, Engenharia Biológica, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, 2014

Análise e caracterização da expressão e papel funcional dos potenciais genes da família 2 GPCRs no protostómio Caenorhabditis elegans

Dissertação de Mestrado, Biotecnologia, Faculdade de Engenharia de Recursos Naturais, Universidade do Algarve, 2009

Análise multivariada da sucessão dunar na península do Ancão e ilha da Barreta

O presente estudo tem a sua localização na Ria Formosa, mais concretamente na Península do Ancão e Ilha da Barreta. A barra do Ancão (ou de S. Luís) é a que tem influência directa sobre a área de estudo em causa. Ecossistema é todo o sistema (no sentido físico) incluindo não só a complexidade de organismos mas também a complexidade de factores físicos a que se chama de ambiente. Neste conceito de ecossistema, os componentes biológicos (bióticos) e físicos (abióticos) são um único sistema interactivo. Na Ria Formosa as dunas formam-se na praia, na zona que imediatamente se segue ao domínio das marés, dando origem a uma crista, mais ou menos contínua, relativamente baixa e sensivelmente paralela à linha de costa. A sucessão ecológica pode ser definida como o padrão contínuo não sazonal, direcional, de colonização e extinção num local por populações de espécies. Assim os sistemas dunares consistem num mosaico zonal, determinado pelas características ambientais definidas pela topografia. Os objectivos deste estudo foram caracetrizar a sucessão dunar da Ria Formosa em termos de associações que relacionam as espécies com elevada correlação e validá-las. Relacionar as correlações e associações com a idade dos locais e as outras variáveis ambientais (pH, condutividade, matéria orgânica e azoto), estabelecendo os tipos de composição florística e a sua sequência espacial e comparar os tipos composição florística obtidos com a idade e os propostos na bibliografia. Pela utilização do método de transecto em banda foram amostrados sete transectos, com um espaçamento de 3 m entre estações de 1 m2. Adaptou-se a escala de abundância-dominância proposta por Braun Blanquet (1979). Analizaram-se os resultados recorrendo à análise multivariada com metodologia Monte Carlo. Utilizou-se a análise de componentes principais, análise de agrupamento, análise discriminante e regressão múltipla para analisar os dados obtidos. Verificou-se então que a análise dos factores bióticos leva a concluir que a zonação do sistema dunar está dependente quer da idade do mesmo, quer das características que o próprio habitat apresenta (gradiente de recursos e gradiente directo). A zonação completa do sistema dunar necessita de pelo menos mais de 60 anos para ocorrer; idade com a qual as dunas apresentam uma série de relações inter-específicas que tendem a ser estabilizadas. As espécies ditas pioneiras, à medida que o tempo evolui, restringem a sua ocupação à vertente oceânica da duna, uma vez que sofrem uma pressão competitiva de outras espécies que se lhes sucedem com o tempo.

Study of influence of regulatory polymorphisms of expression in development of breast cancer

The human genome has millions of genetics variants that can affect gene expression. These variants are known as cis-regulatory variants and are responsible for intra-species phenotypic differences and individual susceptibility to disease. One of the diseases affected by cis-regulatory variants is breast cancer. Breast cancer is one of the most common cancers, with approximately 4500 new cases each year in Portugal. Breast cancer has many genes mutated and TP53 has been shown to be relevant for this disease. TP53 is one of the most commonly mutated genes in human cancer and it is involved in cell cycle regulation and apoptosis. Previous work by Maia et al has shown that TP53 has differential allelic expression (DAE), which suggests that this gene may be under the influence of cis-regulatory variants. Also, its DAE pattern is totally altered in breast tumours with normal copy number. We hypothesized that cis-regulatory variants affecting TP53 may have a role in breast cancer development and treatment. The present work aims to identify the cis-regulatory variants playing a role in TP53 expression, using in silico, in vitro and in vivo approaches. By bioinformatic tools we have identified candidate cis-regulatory variants and predicted the possible transcription factor binding sites that they affect. By EMSA we studied DNA-protein interactions in this region of TP53. The in silico analysis allowed us to identified three candidate cis-regulatory SNPs which may affect the binding of seven transcription factors. However, the EMSA experiments have not been conclusive and we have not yet confirmed whether any of the identified SNPs are associated with gene expression control of TP53. We will carry out further experiments to validate our findings.

Análise de uma unidade documental: biblioteca da Universidade do Algarve - Campus da Penha

Apresenta-se este relatório na sequência do curso de Mestrado em Ciências Documentais, ramo de Biblioteca e Documentação, cuja entidade promotora é a Universidade do Algarve – Faculdade de Ciências Humanas e Sociais. Sendo funcionário da Câmara Municipal de Tavira, a desempenhar funções na Biblioteca Pública Municipal Álvaro de Campos, pensei em fazer o meu estágio na Biblioteca da UALG uma vez que esta apresenta outras realidades e tipologias documentais diferentes por forma a acrescentar outros conhecimentos e aprender algo de novo. A primeira fase do estágio foi conhecer todos os serviços e recursos existentes na Biblioteca da UALG – Campus da Penha, familiarizar-me e trabalhar tecnicamente os registos ao nível das monografias, recursos contínuos ou material não livro em termos de catalogação, indexação e classificação da documentação e, assim contribuir para o desenvolvimento de competências profissionais. O presente relatório está estruturado em seis capítulos da forma seguinte: O primeiro é a introdução, onde apresento uma breve clarificação do projecto de estágio proposto e seus objectivos. O segundo capítulo mostra a caracterização da análise bibliográfica em geral e particularmente do fundo local e fundo regional da Biblioteca Pública Municipal de Tavira, onde exerço a minha actividade profissional. O terceiro capítulo faz a caracterização da Biblioteca da UALG, mostrando qual a sua missão, os objectivos e outros aspectos que a caracterizam. O quarto capítulo refere o serviço de atendimento à comunidade académica e ao público em geral que se dirige à Biblioteca da UALG. O quinto capítulo identifica as tarefas desenvolvidas por mim, enquanto estagiário, análise do estudo bibliográfico do fundo local e regional da Biblioteca Municipal de Tavira e identificação das fases do tratamento documental elaborado na Biblioteca da UALG. O sexto e último capítulo diz respeito ao impacto das novas tecnologias nos sistemas de informação documentais, observando-se alguns temas que no primeiro capítulo deste trabalho (Introdução) será melhor especificado. E, a finalizar este trabalho faço algumas considerações finais sobre a minha experiência de estágio na UALG - Penha embora, por decisão própria, não queira constituir este tema como capítulo.

Molecular structure and functional analysis of runx3 in zebrafish

Tese de doutoramento, Ciências Biomédicas, Universidade do Algarve, Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, 2014

Epigenetics and alternative splicing

Dissertação de Mestrado, Oncobiologia: Mecanismos Moleculares do Cancro, Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, Universidade do Algarve, 2015

Contribuições para a análise de crianças e jovens em situação de risco: resiliência e desenvolvimento

Tese dout. em Psicologia Educacional, Faculdade de Ciências Humanas e Sociais, Univ. do Algarve, 2005