999 resultados para Spectroscopie [état condense]
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The second round of the community-wide initiative Critical Assessment of automated Structure Determination of Proteins by NMR (CASD-NMR-2013) comprised ten blind target datasets, consisting of unprocessed spectral data, assigned chemical shift lists and unassigned NOESY peak and RDC lists, that were made available in both curated (i.e. manually refined) or un-curated (i.e. automatically generated) form. Ten structure calculation programs, using fully automated protocols only, generated a total of 164 three-dimensional structures (entries) for the ten targets, sometimes using both curated and un-curated lists to generate multiple entries for a single target. The accuracy of the entries could be established by comparing them to the corresponding manually solved structure of each target, which was not available at the time the data were provided. Across the entire data set, 71 % of all entries submitted achieved an accuracy relative to the reference NMR structure better than 1.5 . Methods based on NOESY peak lists achieved even better results with up to 100 % of the entries within the 1.5 threshold for some programs. However, some methods did not converge for some targets using un-curated NOESY peak lists. Over 90 % of the entries achieved an accuracy better than the more relaxed threshold of 2.5 that was used in the previous CASD-NMR-2010 round. Comparisons between entries generated with un-curated versus curated peaks show only marginal improvements for the latter in those cases where both calculations converged.
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Whereas the resolving power of an ordinary optical microscope is determined by the classical Rayleigh distance, significant super-resolution, i.e. resolution improvement beyond that Rayleigh limit, has been achieved by confocal scanning light microscopy. Furthermore is has been shown that the resolution of a confocal scanning microscope can still be significantly enhanced by measuring, for each scanning position, the full diffraction image by means of an array of detectors and by inverting these data to recover the value of the object at the focus. We discuss the associated inverse problem and show how to generalize the data inversion procedure by allowing, for reconstructing the object at a given point, to make use also of the diffraction images recorded at other scanning positions. This leads us to a whole family of generalized inversion formulae, which contains as special cases some previously known formulae. We also show how these exact inversion formulae can be implemented in practice.
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The equilibrium structure of the hydrogen bonded complex H2O HF has been calculated ab initio using the CCSD(T) method with basis sets up to sextuple- quality with diffuse functions and taking into account the basis set superposition error correction. The calculations carried out confirm the importance of diffuse functions and of counterpoise correction to obtain an accurate geometry. The most important point is that the basis set convergence is extremely slow and, for this reason an accurate ab initio structure requires a very large basis set. Nevertheless, the ab initio structure is significantly different from the experimental r0 and rm structures. Analysis of the basis set convergence and of the approximations used for the determination of the experimental structures indicates that the ab initio structure is expected to be more reliable.
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SCOPUS: ed.j
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An 18 module Ceienkov detector with a total sensitive area of 2.3 m2 having silica aerogel as radiator is being tested in a particle beam at CERN PS. The modules having a sensitive area of 23 X 55 cm2 give typically a Cerenkov signal for (3= 1 particles of 12 photoelectrons for silica aerogel of refractive index 1.03 and a thickness of 15 cm. 1981 IOP Publishing Ltd.
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New simpler formulae are derived for the shear of a pair of material elements within the context of infinitesimal strain and finite strain. Also, new formulae are derived for shear stress based on the (symmetric) Cauchy stress and for the rate of shear of a pair of material elements within the rate of strain theory. These formulae are exploited to obtain results and to derive new simpler proofs of familiar classical results. In particular, a very simple short derivation is presented of the classical result of Coulomb and Hopkins on the maximum orthogonal shear stress. 1992.
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The application of stochastic methods to the problem of particle and energy transport in turbulent plasmas is briefly reviewed. The "classical" Corrsin approximation is shown to be valid only in the limit of weak turbulence. The recently developed method of decorrelation trajectories is applicable over the whole range of turbulence intensities and yields the correct asymptotic behavior in the limit of very strong turbulence (subdiffusion). 2004 Wiley Periodicals, Inc.
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Dans la premire partie, nous prsentons les rsultats de l'tude du supraconducteur sans inversion de symtrie LaRhSi3 par spectroscopie muonique. En champ nul, nous n'avons pas dtect de champ interne. Ceci indique que la fonction d'onde de l'tat supraconducteur n'est pas domine par l'tat triplet. Les mesures en champ transverse de 35G prsentent une transition en accord avec la transition de phase attendue sous le champ critique Hc1. Nous avons rpt ces mesures pour un champ entre Hc1 et Hc2, 150G. Le spectre obtenu pour ces mesures conserve l'asymtrie et relaxe rapidement basse temprature tel que prdit pour un supraconducteur dans la phase d'Abrikosov. Nanmoins, les relaxations produites par ce balayage en temprature prsentent une transition prs de 2 fois la temprature critique attendue. Dans la deuxime partie de ce mmoire, nous donnons l'interprtation des rsultats de la diffraction neutronique inlastique par l'tude des champs lectriques cristallins. Ces mesures ont t effectues sur des aimants frustrs SrHo2O4 et SrDy2O4 sous la forme de poudre. L'tude des niveaux produits par les champs cristallins par la mthode des oprateurs de Stevens indique une perte du moment cintique dans les deux matriaux. Pour le SrDy2O4, l'tat fondamental serait constitu de quatre tats dgnrs quasi accidentellement qui portent un moment magntique total non-nul. Toute fois, nos mesures de susceptibilit magntique ne montrent aucun ordre au-dessus de 50mK. Pour le SrHo2O4, le fondamental est form d'une paire accidentelle. Nous obtenons un moment magntique de 6.94(8)$\mu_B$ ce qui s'accorde avec les donnes exprimentales.
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Mmoire numris par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Universit de Montral
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Les toxines formeuses de pore (PFTs) sont des protines exognes responsables d’un grand nombre de maladies infectieuses qui permabilisent les membranes cellulaires de leur hte. La formation des pores ou l’introduction d’une enzyme dans le cytoplasme peut entrainer l’apparition de symptmes de maladies connues (l’anthrax, le botulisme) et, dans le pire des cas, la mort. Les mcanismes d’infection et de destruction des cellules infectes sont bien caractriss. Toutefois, l’aspect dynamique des changements de conformation durant le processus de permabilisation reste dcouvrir pour la majorit des toxines formeuses de pore. Le but de cette thse est d’tudier les mcanismes d’oligomrisation des PFTs, ainsi que la formation des pores la membrane lipidique grce la spectroscopie de fluorescence. Nous avons choisi la toxine Cry1Aa, un bio pesticide produit par le bacille de Thuringe et qui a t rigoureusement caractris, en tant que modle d’tude. La topologie de la Cry1Aa l’tat actif et inactif a pu tre rsolue grce l’utilisation d’une technique de spectroscopie de fluorescence, le FRET ou transfert d’nergie par rsonance entre un fluorophore greff au domaine formeur de pore (D1) et un accepteur non fluorescent (le DPA ou dipicrylamine) localis dans la membrane et qui bouge selon le potentiel membranaire. Le courant lectrique, ainsi que la fluorescence provenant de la bicouche lipidique membranaire horizontale ont t enregistrs simultanment. De cette manire, nous avons pu localiser toutes les boucles reliant les hlices de D1 avant et aprs la formation des pores. Dans la forme inactive de la toxine, toutes ces boucles se trouvent du ct interne de la bicouche lipidique, mais dans sa forme active l’pingle α3-α4 traverse du ct externe, alors que toutes les autres hlices demeurent du ct interne. Ces rsultats suggrent que α3-α4 forment le pore. Nous avons dcouvert que la toxine change significativement de conformation une fois qu’elle se trouve dans la bicouche lipidique, et que la Cry1Aa attaque la membrane lipidique de l’extrieur, mais en formant le pore de l’intrieur. Dans le but de caractriser la distribution de toxines chaque extrmit de la bicouche, nous avons utilis une technique de double FRET avec deux accepteurs ayant des vitesses de translocation diffrentes (le DPA et l’oxonol) dans la membrane lipidique. De cette manire, nous avons dtermin que la toxine tait prsente des deux cts de la bicouche lipidique durant le processus de permabilisation. La dynamique d’oligomrisation de la toxine dans une bicouche lipidique sans rcepteurs a t tudie avec une technique permettant le compte des sauts de fluorescence aprs le photoblanchiment des fluorophore lis aux sous units composant un oligomre prsent dans la bicouche lipidique supporte. Nous avons confirm de cette manire que la protine formait ultimement des ttramres, et que cet tat rsultait de la diffusion des monomres de toxine dans la bicouche et de leur assemblage subsquent. Enfin nous avons voulu tudier le « gating » de la colicine Ia, provenant de la bactrie E.Coli, dans le but d’observer les mouvements que font deux positions supposes traverser la bicouche lipidique selon le voltage impos aux bornes de la bicouche. Nos rsultats prliminaires nous permettent d’observer un mouvement partiel (et non total) de ces positions, tel que le suggrent les tudes de conductances du canal.
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Les polymres semi-conducteurs semicristallins sont utiliss au sein de diodes lectroluminescentes, transistors ou dispositifs photovoltaques organiques. Ces matriaux peuvent tre traits partir de solutions ou directement partir de leur tat solide et forment des agrgats molculaires dont la morphologie dicte en grande partie leurs proprits optolectroniques. Le poly(3-hexylthiophne) est un des polymres semi-conducteurs les plus tudis. Lorsque le poids molculaire (Mw) des chanes est infrieur 50 kg/mol, la microstructure est polycristalline et compose de chanes formant des empilements-π. Lorsque Mw>50 kg/mol, la morphologie est semicristalline et compose de domaines cristallins imbriques dans une matrice de chanes amorphes. partir de techniques de spectroscopie en continu et ultrarapide et appuy de modles thoriques, nous dmontrons que la cohrence spatiale des excitons dans ce matriau est lgrement anisotrope et dpend de Mw. Ceci nous permet d’approfondir la comprhension de la relation intime entre le couplage inter et intramolculaire sur la forme spectrale en absorption et photoluminescence. De plus, nous dmontrons que les excitations photognres directement aux interfaces entre les domaines cristallins et les rgions amorphes gnrent des paires de polarons lis qui se recombinent par effet tunnel sur des chelles de temps suprieures 10ns. Le taux de photoluminescence long temps de vie provenant de ces paires de charges dpend aussi de Mw et varie entre ∼10% et ∼40% pour les faibles et hauts poids molculaires respectivement. Nous fournissons un modle permettant d’expliquer le processus de photognration des paires de polarons et nous lucidons le rle de la microstructure sur la dynamique de sparation et recombinaison de ces espces.
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Nous avons tudi la cohrence excitonique dans le poly[N- 9’-heptadecanyl-2,7-carbazole-alt-5,5-(4,7-di-2-thienyl-2’,1’,3’-benzothiadiazole] (PCDTBT). l’aide d’un modulateur spatial de lumire, nous avons forg des impulsions lasers ultracourtes permettant de sonder les cohrences du systme. Nous nous sommes concentrs sur les proprits cohrentes des tats excitoniques, soit le singulet et l’tat transfert de charge. Nous avons observ que 35 fs aprs l’excitation, le singulet et l’tat transfert de charge sont toujours cohrents. Cette cohrence se mesure l’aide de la visibilit qui est de respectivement environ 10% et 30%. De plus, nous avons dmontr que les mcanismes permettant de gnrer du photocourant dans de tels dispositifs photovoltaques ne sont dj plus cohrents aprs 35 fs. Ces mesures rvlent une visibilit infrieure 3%, ce qui est en de de la prcision de nos instruments. Nous concluons donc que les tats transfert de charge ne sont pas les tats prcurseurs la gnration de photocourant, car ceux-ci se comportent trs diffremment dans les mesures de cohrences.
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Les htrojonctions formes de deux matriaux, un donneur et un accepteur (D/A), sont la base de la majorit des mlanges photovoltaques organiques. Les mcanismes de sparation des charges dans ces systmes reprsentent aujourd'hui l'un des sujets les plus chauds et les plus dbattus dans ce domaine. Nous entrons au coeur de ce dbat en choisissant un systme D/A base de phtalocyanine de cuivre (CuPc) et de fullerne (C60). Pour sonder les tats excits de nos molcules et obtenir de l'information sur les phnomnes l'interface D/A, nous ralisons une exprience pompe-sonde, appele absorption photoinduite (PIA). Nous y mesurons le changement fractionnaire de transmission au travers de l'chantillon. Les mesures de PIA sont ralises l'tat de quasi quilibre, T=10K. Nous observons une modulation prononce dans la rgion du photoblanchiment de l'tat fondamental qui nous indique que la pompe induit un dcalage du spectre d'absorption de l'tat fondamental. Ce dcalage peut tre expliqu par deux processus : soit l'chantillon est chauff par la pompe (effet thermique) ou bien des charges sont cres l'interface entre les deux matriaux (effet Stark). La dpendance en temprature du spectre d'absorption entre 10K et 290K montre une signature thermique pour un changement de temprature de 80K. Grce au ratio des raies Raman anti-Stokes et Stokes, nous dmontrons que la pompe chauffe l'chantillon de 34 K, temprature insuffisante pour attribuer notre signal un effet thermique. Nous vaporons ensuite la bicouche CuPc/C60 sur de l'ITO et du saphir, substrats qui possdent des conductivits thermiques diffrentes et nous observons le mme signal de PIA, excluant par le fait mme l'hypothse de l'effet thermique. Puisque notre tude est comparable la spectroscopie effet Stark, nous procdons une analyse similaire en comparant notre signal de PIA au spectre de la transmittance et ses drivs premire et seconde. Nous observons alors que notre signal reproduit presque parfaitement la drive seconde de la transmittance. Ces rsultats sont conformes une signature optique d'effet Stark due la cration de charges l'interface D/A.
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The trans-activator of transcription (TAT) peptide is regarded as the “gold standard” for cell-penetrating peptides, capable of traversing a mammalian membrane passively into the cytosolic space. This characteristic has been exploited through conjugation of TAT for applications such as drug delivery. However, the process by which TAT achieves membrane penetration remains ambiguous and unresolved. Mechanistic details of TAT peptide action are revealed herein by using three complementary methods: quartz crystal microbalance with dissipation (QCM-D), scanning electrochemical microscopy (SECM) and atomic force microscopy (AFM). When combined, these three scales of measurement define that the membrane uptake of the TAT peptide is by trans-membrane insertion using a “worm-hole” pore that leads to ion permeability across the membrane layer. AFM data provided nanometre-scale visualisation of TAT punctuation using a mammalian-mimetic membrane bilayer. The TAT peptide does not show the same specificity towards a bacterial mimetic membrane and QCM-D and SECM showed that the TAT peptide demonstrates a disruptive action towards these membranes. This investigation supports the energy-independent uptake of the cationic TAT peptide and provides empirical data that clarify the mechanism by which the TAT peptide achieves its membrane activity. The novel use of these three biophysical techniques provides valuable insight into the mechanism for TAT peptide translocation, which is essential for improvements in the cellular delivery of TAT-conjugated cargoes including therapeutic agents required to target specific intracellular locations.
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Evolution of catch and catch by unit effort of the sardine fishing boats (purse seiners) has been examined from 1966 to 1975. The effort data has been calculated with a new computer programme: Crosardi (Soisson et Barbe, 1974). The analysis has been done on the whole stock and in more detail on the east and west stocks of Cte d'Ivoire. The Sardinella eba stock has been analysed separately. Those analyses were done using the general production model (Prodfit; Fox, 1974). The stock of the eastern area of the Cte d'Ivoire seems to be exploited at its maximum level. Nevertheless, the western area stock could be able to support a progressive increase of fishing effort.
