Estudos de elementos repetitivos presentes no genoma da espécie Schizodon borelli (Characiformes: Anostomidae)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Chromosome mapping of repetitive sequences in Anostomidae species: Implications for genomic and sex chromosome evolution

Background: Members of the Anostomidae family provide an interesting model system for the study of the influence of repetitive elements on genome composition, mainly because they possess numerous heterochromatic segments and a peculiar system of female heterogamety that is restricted to a few species of the Leporinus genus. The aim of this study was to isolate and identify important new repetitive DNA elements in Anostomidae through restriction enzyme digestion, followed by cloning, characterisation and chromosome mapping of this fragment. To identify repetitive elements in other Leporinus species and expand on studies of repetitive elements in Anostomidae, hybridisation experiments were also performed using previously described probes of LeSpeI repetitive elements. Results: The 628-base pair (bp) LeSpeII fragment was hybridised to metaphase cells of L. elongatus individuals as well as those of L. macrocephalus, L. obtusidens, L. striatus, L. lacustris, L. friderici, Schizodon borellii and S. isognathus. In L. elongatus, both male and female cells contained small clusters of LeSpeII repetitive elements dispersed on all of the chromosomes, with enrichment near most of the terminal portions of the chromosomes. In the female sex chromosomes of L. elongatus (Z2,Z2/W1W 2), however, this repeated element was absent. In the remaining species, a dispersed pattern of hybridisation was observed on all chromosomes irrespective of whether or not they were sex chromosomes. The repetitive element LeSpeI produced positive hybridisations signals only in L. elongatus, L. macrocephalus and L. obtusidens, i.e., species with differentiated sex chromosomes. In the remaining species, the LeSpeI element did not produce hybridisation signals. Conclusions: Results are discussed in terms of the effects of repetitive sequences on the differentiation of the Anostomidae genome, especially with respect to sex chromosome evolution. LeSpeII showed hybridisation patterns typical of Long Interspersed Elements (LINEs). The differential distribution of this element may be linked to sex chromosome differentiation in L. elongatus species. The relationship between sex chromosome specificity and the LeSpeI element is confirmed in the species L. elongatus, L. macrocephalus and L. obtusidens. © 2012 da Silva et al.; licensee BioMed Central Ltd.

Structure and diversity of endoparasitic infracommunities and the trophic level of Pseudoplatystoma corruscans and Schizodon borelli (Osteichthyes) of the high Paraná river

One hundred and ten specimens of Pseudoplatystoma corruscans (Pimelodidae) and 582 specimens of Schizodon borelli (Anostomidae) collected in the high Paraná River were analyzed. On necropsy 74% of P. corruscans were found to be parasitized; proteocephalidean cestodes presented the greatest number. With regard to S. borelli, the percentage of parasitism reached 19.42% and the nematode Cucullanus pinnai was the most abundant. The absence of correlation between the endoparasitic diversity and the standard length of the two host species indicates that each one presents homogeneity in alimentary behaviour during all its life time, permiting the uniform recruitment of the same species of endoparasites during all its ontogenetic development. Independence of diversity values in relation to sex of P. corruscans and S. borelli evidences that the ecological relationships are similar between males and females in these species. Both host's infrapopulations presented a typical overdispersed pattern of distribution with isolationist characteristics.

First description of microchromosome in the Anostomidae fish Schizodon nasutus from Argentina

Thirty-six specimens of Schizodon nasutus (Anostomidae-Characiformes) from the middle Paraná River (Posadas, Argentina) were analyzed cytogenetically. The karyotype of this species was similar to those described for this species in the literature. C-banding technique showed a rich heterochromatic pattern relative to other Anostomidae species. The NORs were located on one chromosome pair in terminal position and showed a very marked size heteromorphism. A microchromosome was observed with a frequency of about 20% in the sample studied. This additional element was punctiform, negative C-band, and constant in all metaphase plates of the seven carriers. The present study is the first karyotypic approach to Schizodon nasutus from Argentina and the first description of microchromosome in Anostomidae

Catch and selectivity parameters of the anastomid fish Schizodon nasutus using gillnets in the Jurumirim reservoir (São Paulo, Brazil)

Catch and selectivity parameters using gillnets were calculated for Schizodon nasutus in the Jurumirim reservoir on the Parana-panema River in southern Brazil. The simple gillnets used were made of monofilament nylon of 30 to 140 mm mesh size an of different heights. The relative abundance of the S. nasutus caught was analysed monthly and a positive relationship was found between catches per unit effort in number and biomass. The relative catches were more abundant for the nets of 40 and 50 mm, mesh size. Catches were characterized by clear temporal variations and a predominance of medium size fish throughout the study period. The selectivity curve of gillnets for S. nasutus in this ecosystem was obtained. The catch obtained was compared with the available catch for each mesh size, and the available catch for a certain length of fish was calculated starting from the theoretical selectivity curve. The 50 mm mesh size gillnet showed the best fit between real and available captures and was considered the most suitable, because a smaller mesh size resulted in a catch of predominantly immature specimens. It is expected that these results will contribute to improving management strategies for conservation of resources. Parameters such as the minimum catch length advisable or the mesh size permitted for a given species are indispensable for such decision-making.

Biological aspects of Schizodon nasutus Kner, 1858 (Characiformes, Anostomidae) in the low Sorocaba river basin, São Paulo state, Brazil

Four biological aspects of Schizodon nasutus in the low Sorocaba river basin, São Paulo, Brazil were analysed. These were accomplished during the year seasons. The fish diet and the feeding activity were investigated by studying the repletion index, which showed no significant differences between seasons. The food items analysed by frequency of occurrence and dominance showed a predominance of vegetable items in the diet. The reproduction, analysed by using the gonadosomatic index, indicated that the reproductive period occurs during the summer period when temperatures are higher and rainfalls are more intense. The amount of accumulated fat and condition factor varied according to reproduction, especially for females.

Characterization and genome organization of a repetitive element associated with the nucleolus organizer region in leporinuselongatus (anostomidae: Characiformes)

Chromosome mapping and studies of the genomic organization of repetitive DNA sequences provide valuable insights that enhance our evolutionary and structural understanding of these sequences, as well as identifying chromosomal rearrangements and sex determination. This study investigated the occurrence and organization of repetitive DNA sequences in Leporinus elongatus using restriction enzyme digestion and the mapping of sequences by chromosomal fluorescence in situ hybridization (FISH). A 378-bp fragment with a 54.2% GC content was isolated after digestion with the SmaI restriction enzyme. BLASTN search found no similarity with previously described sequences, so this repetitive sequence was named LeSmaI. FISH experiments were conducted using L. elongatus and other Anostomidae species, i.e. L. macrocephalus,L. obtusidens, L. striatus, L. lacustris, L. friderici, Schizodon borellii, S. isognathus, and Abramites hypselonotus which detected signals that were unique to male and female L. elongatus individuals. Double-FISH using LeSmaI and 18S rDNA showed that LeSmaI was located in a nucleolus organizer region (NOR) in the male and female metaphases of L. elongatus. This report also discusses the role of repetitive DNA associated with NORs in the diversification of Anostomidae species karyotypes. Copyright © 2012 S. Karger AG, Basel.

Estudo da organização estrutural de elementos repetitivos isolados do genoma de Leporinus elongatus em diferentes espécies da família Anostomidae (Teleostei, Characiformes)

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Variação geográfica em Schizodon dissimilis (Garman, 1890) e diversidade genética e filogeográfica do grupo Schizodon fasciatus sensu lato (Characiformes: Anostomidae)

Através da análise dos espécimes de Schizodon dissimilis depositados em coleções científicas registramos a ocorrência desta espécie nas bacias dos rios Pindaré-Mearim, Itapecuru, Turiaçu e Tocantins (trecho baixo), ampliando a área de distribuição da espécie que, até o momento, estava restrita à bacia do Rio Parnaíba. As análises realizadas demonstram uma tendência a separação das populações dessas bacias, onde as populações do rio Tocantins podem ser separadas das demais populações, assim como, as populações dos rios Turiaçu e Pindaré-Mearim, podem ser consideradas próximas. Provavelmente essas caracterizações são definidas por eventos geológicos ocorridos nessas áreas ou apenas por pressão seletiva. Porém, tais resultados não podem evidenciar uma separação definitiva entre essas populações em espécies distintas.

Uma nova abordagem do ciclo reprodutivo dos machos e fêmeas, e da origem e desenvolvimento dos oócitos do Ostariophysi, e Perciformes neotropicais aplicada ao Anostomidae, Schizodon nasutus e ao Sciaenidae, Plagioscion squamosissimus

Nos peixes, durante a vida reprodutiva o desenvolvimento gonadal é cíclico e anual. As gônadas passam por alterações de forma, de tamanho, de cor e de textura que são utilizadas como parâmetros para a sua classificação macroscópica. Porém, o desenvolvimento das células germinativas, nem sempre é consoante com essa classificação e, machos e fêmeas nem sempre parecem concatenados. Novas propostas de classificação vêm surgindo na tentativa de compatibilizar as informações macroscópicas e histológicas, considerando a atividade do epitélio germinativo de machos e fêmeas. Ocorre, no entanto, que essas propostas vêm sendo desenvolvidas em estudos com Perciformes marinhos. Aqui, tomando-se como modelo o Characiformes, Schizodon nasutus e o Perciformes, Plagioscion squamosissimus analisou-se comparativamente o ciclo reprodutivo de ambas as espécies, frente às classificações tradicionais e às novas propostas de classificação adicionadas das características histológicas das gônadas, e pode-se perceber que a análise macroscópica das gônadas, muitas vezes, não corresponde a sua verdadeira fase do ciclo reprodutivo, analisado microscopicamente. Isso se dá porque muitas das características cruciais para distinção das fases não são visíveis a olho nu, como folículos atrésicos, maturação do oócito ou anastomose de túbulos ou lóbulos testiculares. Assim, para determinação das fases reprodutivas, deve-se sempre contar com a análise microscópica e, no presente estudo, foi considerado que a melhor classificação para tal é a proposta de Brown-Peterson e colaboradores (2009), que divide o ciclo reprodutivo em seis fases reprodutivas, bastante detalhadas. A partir da descrição do ciclo reprodutivo feminino e masculino em S. nasutus e P. squamosissimus, os dados foram correlacionados com o índice gonadossomático, determinando, assim, que o período... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Inventario taxonômico e redescriçâo das espécies de Anostomideos (Characiformes, Anostomidae) do Baixo Rio Tocantins, PA, Brasil

RESUMOComo parte dos estudos ambientais que foram desenvolvidos pelo INPA, de 1980 a 1986, em convênio com a ELETRONORTE, na área de influência da UHE Tucuruí. são redescritas e ilustradas 20 espécies da damília Anostomidae do baixo rio Tocantins, entre Cametá e Itupiranga, PA: Leporinus affins, L. tigrinus, L. desmotes, L. sp. 4, L. trifasciatus, L. friderici, L. sp. 1, L. sp. 2, L. sp. 3, L. granti, L. pachiycheilus, Laemolyta petiti, L. taeniata, Anostomoides laticeps, A. sp. 1, Anostomus ternetzi, Leporellus vittatus, Schizodon vittatus, Sartor tucuruiense e Abramites hypselenotus. Cinco espécies (Laemolyta petiti, Leporinus affinis, L. sp. 2, Anostomoides sp. 1 e Sartor tucuruiense) somente foram assiladas até agora para a bacia do Tocantins-Araguaia. Por outro lado, outras espécies anostomídeos, melhor representadas na bacia Amazônica, não foram encontrados no baixo Tocantins, fazendo supor que esta área, do ponto de vista ictiológico, está relativamente iosolado do restante da bacia Amazônica e possui um certo grau de endemismo. A maioria das espécies ocorre amplamente no baixo Tocantins, sendo que algumas apresentam acentuada preferência por determinados biótopos, como por exemplo Leporinus pachycheilus, L. desmotes, L. sp. 1 e Sartor tucuruiense, por corredeiras; Leporinus sp. 3, Anostomus ternetzi, por igarapés; Schizodon vittatus e Laemolyta taeniata,por zonas marginais, periodicametne alagáveis. A partir da análise dos caracteres merísticas e morfométricas, sobretudo o número, a forma e disposição dos dentes, posição da boca e número de escamas, a apresentada uma chave de identificação para as espécies estudadas.

IMPACTOS DA HIDRELÉTRICA SAMUEL SOBRE AS COMUNIDADES DE PEIXES DO RIO JAMARI (RONDÔNIA, BRASIL)

A Usina Hidrelétrica de Samuel está localizada no rio Jamari, primeiro afluente da margem direita do rio Madeira, cerca de 56 km abaixo de Porto Velho-RO. A hidrelétrica teve sua construção iniciada em abril/1982 e entrou em operação a partir de abril/89. O estudo comparativo da ictiofauna, na área de influência daquela hidrelétrica, nas fases de pré e pós-enchimento do reservatório, mostra que as comunidades de peixes sofreram profundas alterações pelo represamento: houve redução da diversidade no reservatório, bem como o aumento de pira-nha-preta (Serrasalmuts rhombeus),tucunaré (Cichla monoculus),aracu-comum (Schizodon fasciatus)e mapará (Hypophthalmus edentatus);imediatamente à jusante da represa houve um aumento de mandi (Pimelodus blochii)\além disso, houve redução dos peixes detritívoros e frugívoros e aumento dos piscivoros.As comunidades de peixes do canal principal do Jamari parecem ter sido mais influenciadas pelo represamento do rio do que aquelas dos lagos marginais. A atividade pesqueira, antes restrita à foz do Jamari, foi intensificada na área do reservatório e isso vem constituindo-se num sério obstáculo para o manejo da pesca. Estes aspectos são comentados e algumas ações são propostas para melhor gerenciamento da pesca c sustentabilidade dos recursos pesqueiros.

INVENTÁRIO TAXONÔMICO DOS ANOSTOMÍDEOS (PISCES, ANOSTOMIDAE) DA BACIA DO RIO UATUMÃ-AM, BRASIL, COM DESCRIÇÃO DE DUAS ESPÉCIES NOVAS.

O presente estudo trata do inventário, descrição e ilustração das espécies de anostomídeos da bacia do rio Uatumã. Ele foi desenvolvido com base na coleção de peixes do INPA, montada a partir de um intenso programa de coletas, na bacia do Uatumã, nas áreas de influência das usinas hidrelétricas de Balbina e Pitinga, ambas no estado do Amazonas. Para a maioria das espécies são feitos comentários sobre os caracteres diagnósticos, área de distribuição, biótopos preferenciais e principais variações do padrão de colorido entre adultos e jovens. As vinte e duas espécies identificadas pertencem a 8 gêneros, sendo Leporinusdominante, com 12 espécies, seguido de Laemolyta, Anostomuse Pseudanos,com duas e de Schizodon, Anostomoides, Synaptolaemuse Gnathodolus,com uma espécie cada. Dentre os peixes inventariados, duas espécies são consideradas novas e descritas (Leporinus uatumaensissp.n e Leporinus pitingaisp.n.) A partir deste estudo, as espécies tiveram sua área de ocorrência ampliada, já que algumas delas só haviam sido assinaladas para a localidade-tipo.

ESTABILIDADE QUÍMICA E MICROBIOLÓGICA DE "MINCED FISH" DE PEIXES AMAZÔNICOS DURANTE O CONGELAMENTO

Foi estudada a estabilidade química e microbiológica de "minced fish" produzidos, em condições industriais, com espécies de peixes da Amazônia: aracú-comum (Schizodon fasciatus), branquinha-comum (Potamorhina latior), branquinha-de-cabeça-lisa (P. altamazonica), curimatã (Prochilodus nigricans), jaraqui-de-escama-fina (Semaprochilodus taeniurus), jaraqui-de-escama-grossa (S. insignis), mapará (Hypophthalmus edentatus), pacú-comum (Metynnis hypsauchen), pacú-manteiga (Mylossoma duriventre) e pirapitinga (Piaractus brachypomum), durante 150 dias sob congelamento a -18±1°C e -36±1°C. Com base no pH, nitrogênio das bases voláteis totais (N-BVT), substâncias reagentes ao ácido tiobarbitúrico (TBARS) e contagens de aeróbios mesófilos a 35°C e psicrotróficos a 7°C, e de coliformes totais e fecais (NMP), os "minced fish" obtidos a partir das espécies de peixes estudadas e de misturas de espécies (aracú+curimatã+pirapitinga; jaraqui+branquinha) mantiveram-se em condições de consumo, durante o período experimental. Os resultados obtidos são altamente promissores sob o ponto de vista tecnológico.

Estudo dos restos de peixes dos sítios arqueológicos da área de influência da usina hidrelétrica Machadinho, RS, Brasil

Durante o resgate do material arqueológico dos sítios da região de Piratuba, SC, e de Aratiba, Machadinho e Maximiliano de Almeida, RS, área de influência da Usina Hidroelétrica de Machadinho, foram observadas grandes quantidades de ossos e escamas de peixes incorporando os restos alimentares encontrados nestes locais. Utilizando uma coleção osteológica de referência pudemos identificar restos de Salminus maxillosus Valenciennes, 1850, Brycon orbignyanus (Valenciennes, 1849), Pogonopoma obscurum Quevedo & Reis, 2002, Hemiancistrus fuliginosus Cardoso & Malabarba, 1999, Prochilodus lineatus (Valenciennes, 1836), Schizodon sp., Leporinus sp., Hoplias sp., Hypostomus sp. e Crenicichla sp. Com base em medições realizadas em exemplares de coleções, foram obtidas regressões a partir das dimensões do osso pré-maxilar em Crenicichla spp. e do esporão peitoral em Hemiancistrus fuliginosus, Pogonopoma obscurum e Hypostomus spp. correlacionadas com o comprimento padrão e peso dos espécimes. A partir das estimativas de comprimento padrão e peso das peças ósseas encontradas foi possível formular hipóteses sobre a tecnologia de pesca utilizada pelos habitantes destes sítios.