Molecular differentiation of Anopheles (Nyssorhynchus) benarrochi and An. (N.) oswaldoi from Southern Colombia

Anopheles (Nyssorhynchus) benarrochi, An. (N.) oswaldoi, and An. (N.) rangeli are the most common anthropophilic mosquitoes in the southern Colombian state of Putumayo. Adult females are most commonly collected in epidemiological studies, and this stage poses significant problems for correct identification, due to overlapping inter-specific morphological characters. Although An. rangeli is easy to identify, the morphological variant of An. benarrochi found in the region and An. oswaldoi are not always easy to separate. Herein we provide a rapid molecular method to distinguish these two species in Southern Colombia. Sequence data for the second internal transcribed spacer (ITS2) region of rDNA was generated for link-reared progeny of An. benarrochi and An. oswaldoi, that had been identified using all life stages. ITS2 sequences were 540 bp in length in An. benarrochi (n = 9) and 531 bp in An. oswaldoi (n = 7). Sequences showed no intra-specific variation and ungapped inter-specific sequence divergence was 6.4%. Species diagnostic banding patterns were recovered following digestion of the ITS2 amplicons with the enzyme Hae III as follows: An. benarrochi (365, 137, and 38 bp) and An. oswaldoi (493 and 38 bp). This polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assay provides rapid, accurate, and inexpensive species diagnosis of adult females. This will benefit future epidemiological studies and, as PCR amplification can be achieved using a single mosquito leg, the remaining specimen can be either retained as a morphological voucher or further used in vector incrimination studies. That An. benarrochi comprises a complex of at least two species across Latin America is discussed.

Incrimination of Anopheles (Nyssorhynchus) rangeli and An. (Nys.) oswaldoi as natural vectors of Plasmodium vivax in Southern Colombia

Malaria transmission in the Southern Colombian state of Putumayo continues despite the absence of traditional vector species, except for the presence of Anopheles darlingi near the southeastern border with the state of Amazonas. In order to facilitate malaria vector incrimination in Putumayo, 2445 morphologically identified Anopheles females were tested for natural infection of Plasmodium vivax by ELISA. Specimens tested included An. apicimacula (n = 2), An. benarrochi B (n = 1617), An. darlingi (n = 29), An. mattogrossensis (n = 7), An. neomaculipalpus (n = 7), An. oswaldoi (n = 362), An. peryassui (n = 1), An. punctimacula (n = 1), An. rangeli (n = 413), and An. triannulatus (n = 6). Despite being overwhelmingly the most anthropophilic species in the region and comprising 66.1% of the mosquitoes tested, An. benarrochi B was not shown to be a vector. Thirty-five An. rangeli and one An. oswaldoi were naturally infected with P. vivax VK210. Sequence data were generated for the nuclear second internal transcriber space region of 31 of these 36 vivax positive mosquitoes (86.1%) to confirm their morphological identification. An. oswaldoi is known to be a species complex in Latin America, but its internal taxonomy remains unresolved. Herein we show that the An. oswaldoi found in the state of Putumayo is genetically similar to specimens from the state of Amapá in Brazil and from the Ocama region in the state of Amazonas in Venezuela, and that this form harbors natural infections of P. vivax. That An. rangeli and this member of the An. oswaldoi complex are incriminated as malaria vectors in Putumayo, is a novel finding of significance for malaria control in Southern Colombia, and possibly in other areas of Latin America.

Throughfall and soil properties in shaded and unshaded coffee plantations and a secondary forest: a case study from Southern Colombia

In Colombia coffee production is facing risks due to an increase in the variability and amount of rainfall, which may alter hydrological cycles and negatively influence yield quality and quantity. Shade trees in coffee plantations, however, are known to produce ecological benefits, such as intercepting rainfall and lowering its velocity, resulting in a reduced net-rainfall and higher water infiltration. In this case study, we measured throughfall and soil hydrological properties in four land use systems in Cauca, Colombia, that differed in stand structural parameters: shaded coffee, unshaded coffee, secondary forest and pasture. We found that throughfall was rather influenced by stand structural characteristics than by rainfall intensity. Lower throughfall was recorded in the shaded coffee compared to the other systems when rain gauges were placed at a distance of 1.0 m to the shade tree. The variability of throughfall was high in the shaded coffee, which was due to different canopy characteristics and irregular arrangements of shade tree species. Shaded coffee and secondary forest resembled each other in soil structural parameters, with an increase in saturated hydraulic conductivity and microporosity, whereas bulk density and macroporosity decreased, compared to the unshaded coffee and pasture. In this context tree-covered systems indicate a stronger resilience towards changing rainfall patterns, especially in mountainous areas where coffee is cultivated.

Morphometric discrimination of females of five species of Anopheles of the subgenus Nyssorhynchus from Southern and Northwest Colombia

The most important vectors of human Plasmodium in the neotropics belong to the subgenus Nyssorhynchus. These species are generally sympatric in terms of their geographical distributions. Some are difficult to identify based solely on examination of adult females using the available morphological keys, in these cases examination of immature stages and male genitalia is required to make correct determinations. However, in epidemiological studies it is necessary to identify the species of adult females which are found near humans, i.e. in studies of malaria transmission or evaluation of control measures. The purpose of the present study was to evaluate the discrimination of adult females of different species of Nyssorhynchus isolated mainly from Southern Colombia (department of Putumayo), using morphometric analysis. Adult females were obtained after rearing larvae collected in natural breeding places and from the progeny of females collected on humans. The morphological characteristics of the immature stages allowed the identification of four species of the subgroup Oswaldoi from Southern Colombia: Anopheles rangeli Gabaldon, Cova Garcia & Lopez, An. oswaldoi (Peryassu), An. benarrochi Gabaldon, Cova Garcia & Lopez and An. triannulatus (Neiva & Pinto). The species An. nuneztovari (Gabaldon) from the Northwest of Colombia was included for comparison. Morphometric analysis allowed differentiation of the females of all species to a confidence level approaching 90% using principal components analysis of 10 wing and leg variables, followed by canonical variate analysis of the first four principal components. We conclude that morphometrics may represent a useful taxonomic tool for this group and that its use should be further studied.

Deep geometry of subduction below the Andean belt of Colombia as revealed by seismic tomography

In this study new tomographic models of Colombia were calculated. I used the seismicity recorded by the Colombian seismic network during the period 2006-2009. In this time period, the improvement of the seismic network yields more stable hypocentral results with respect to older data set and allows to compute new 3D Vp and Vp/Vs models. The final dataset consists of 10813 P- and 8614 S-arrival times associated to 1405 earthquakes. Tests with synthetic data and resolution analysis indicate that velocity models are well constrained in central, western and southwestern Colombia to a depth of 160 km; the resolution is poor in the northern Colombia and close to Venezuela due to a lack of seismic stations and seismicity. The tomographic models and the relocated seismicity indicate the existence of E-SE subducting Nazca lithosphere beneath central and southern Colombia. The North-South changes in Wadati-Benioff zone, Vp & Vp/Vs pattern and volcanism, show that the downgoing plate is segmented by slab tears E-W directed, suggesting the presence of three sectors. Earthquakes in the northernmost sector represent most of the Colombian seimicity and concentrated on 100-170 km depth interval, beneath the Eastern Cordillera. Here a massive dehydration is inferred, resulting from a delay in the eclogitization of a thickened oceanic crust in a flat-subduction geometry. In this sector a cluster of intermediate-depth seismicity (Bucaramanga Nest) is present beneath the elbow of the Eastern Cordillera, interpreted as the result of massive and highly localized dehydration phenomenon caused by a hyper-hydrous oceanic crust. The central and southern sectors, although different in Vp pattern show, conversely, a continuous, steep and more homogeneous Wadati-Benioff zone with overlying volcanic areas. Here a "normalthickened" oceanic crust is inferred, allowing for a gradual and continuous metamorphic reactions to take place with depth, enabling the fluid migration towards the mantle wedge.

Insight into Anopheles (Nyssorhynchus) (Diptera: Culicidae) Species from Brazil

Anopheles (Nyssorhynchus) benarrochi s.l., Anopheles (Nyssorhynchus) oswaldoi s.l., and Anopheles (Nyssorhynchus) konderi s.l. collected in Acrelandia, state of Acre, Brazil, were identified based on morphological characters of the male genitalia, fourth-instar larvae, and pupae. Morphological variation was observed in the male genitalia of these species in comparison with specimens from other localities in Brazil. DNA sequence from the nuclear ribosomal second internal transcribed spacer of individuals identified as An. benarrochi s.l. by using male genitalia characteristics showed that the various morphological forms are conspecific but are distinct from An. benarrochi B from Colombia. Anopheles konderi s.l. and An. oswaldoi s.l. both misidentified as An. oswaldoi s.s. (Peryassu) throughout Brazil, may actually comprise at least two undescribed species. Diagnostic morphological characteristics of the male genitalia are provided to distinguish Anopheles benarrochi s.l., Anopheles oswaldoi s.l., and Anopheles konderi s.l. from morphologically similar species. Incrimination of An. oswaldoi s.s. in malaria transmission in Brazil needs further investigation because other undescribed species from Acre may have been confounded with this taxon.

A revision of species diversity in the Neotropical genus Oreobates (Anura: Strabomantidae), with the description of three new species from the Amazonian slopes of the Andes

We revisit species diversity within Oreobates (Anura: Strabomantidae) by combining molecular phylogenetic analyses of the 16S rRNA amphibian barcode fragment with the study of the external morphology of living and preserved specimens. Molecular and morphological evidence support the existence of 23 species within Oreobates, and three additional candidate species (Oreobates sp. [Ca JF809995], Oreobates sp. [Ca EU368903], Oreobates cruralis [Ca EU192295]). We describe and name three new species from the Andean humid montane forests of Departamento Cusco, southern Peru: O. amarakaeri New Species from Rio Nusinuscato and Rio Mabe, at elevations ranging from 670 to 1000 m in the Andean foothills; O. machiguenga, new species, from Rio Kimbiri (1350 m), a small tributary of the Apurimac River, in the western versant of Cordillera Vilcabamba; and O. gemcare, new species, from the Kosnipata Valley at elevations ranging from 2400 to 2800 m. The three new species are readily distinguished from all other Oreobates by at least one qualitative morphological character. Three species are transferred to Oreobates from three genera of Strabomantidae: Hypodactylus lundbergi, Pristimantis crepitans, and Phrynopus ayacucho (for which the advertisement call, coloration in life, and male characteristics are described for first time). Oreobates simmonsi is transferred to the genus Lynchius. Hylodes verrucosus is considered a junior synonym of Hylodes philippi. In addition, H. philippi is removed from the synonymy of O. quixensis and considered a nomem dubium within Hypodactylus. The inclusion of Phrynopus ayacucho in Oreobates extends the ecological range of the genus to the cold Andean puna. Oreobates is thus distributed from the Amazonian lowlands in southern Colombia to northern Argentina, reaching the Brazilian Atlantic dry forests in eastern Brazil, across an altitudinal range from ca. 100 to 3850 m.

Karyotype variability in KP1(+) and KP1(-) strains of Trypanosoma rangeli isolated in Brazil and Colombia

In the present study, the molecular karyotypes of 12 KP1(+) and KP1(-) Trypanosoma rangeli strains were determined and 10 different molecular markers were hybridized to the chromosomes of the parasite, including seven obtained from T. rangeli [ubiquitin hydrolase (UH), a predicted serine/threonine protein kinase (STK), hexose transporter, hypothetical protein, three anonymous sequences] and three from Trypanosoma cruzi [ubiquitin-conjugating enzyme E2 (UBE2), ribosomal RNA methyltransferase (rRNAmtr), proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 (PSMD6)]. Despite intraspecific variation, analysis of the karyotype profiles permitted the division of the T rangeli strains into two groups coinciding with the KP1(+) and KP1(-) genotypes. Southern blot hybridization showed that, except for the hexose transporter probe, all other probes produced distinct patterns able to differentiate the KP1(+) and KP1(-) genotypes. The UH, STK and An-1A04 probes exclusively hybridized to the chromosomes of KP1(+) strains and can be used as markers of this group. In addition, the UBE2, rRNAmtr and PSMD6 markers, which are present in a conserved region in all trypanosomatid species sequenced so far, co-hybridized to the same T. rangeli chromosomal bands, suggesting the occurrence of gene synteny in these species. The finding of distinct molecular karyotypes in KP1(+) and KP1 (-) strains of T rangeli is noteworthy and might be used as a new approach to the study of genetic variability in this parasite. Together with the Southern blot hybridization results, these findings demonstrate that differences at the kDNA level might be associated with variations in nuclear DNA. (c) 2009 Elsevier BY. All rights reserved.

Perspectiva geopolítica del desplazamiento forzado en Colombia durante el período 2002-2010. Caso de estudio: franja fronteriza entre los Departamentos de Huila y Tolima

El presente escrito realiza una interpretación alternativa, espacialmente centrada, de la violencia y el desplazamiento forzado en Colombia, desde la teoría neomarxista y la escuela de la regulación, tomando como base la influencia que tienen los intereses y estrategias, eminentemente económicos y políticos, de los actores del conflicto sobre el desplazamiento forzado. Ello, centrándose temporalmente en el período 2002-2010 y tomando como caso de estudio la franja fronteriza entre los Departamentos del Huila y el Tolima, concretamente los Municipios de Planadas y Ataco, al sur del Tolima. La hipótesis planteada establece que el desplazamiento forzado en Colombia, en tanto que fenómeno espacial complejo, tiene variadas causas y diferentes a la violencia, dentro de las que se enlistan los intereses económicos y políticos, en la consolidación del bloque hegemónico territorial. Se inicia con una presentación de los conceptos y planteamientos teóricos de los que parte el análisis, para luego hablar de la mentalidad imperante a nivel global, en términos del modo de regulación y el régimen de acumulación, así como de la malla de actores que componen el bloque hegemónico nacional, sus intereses y estrategias; y finalmente centrarse en el estudio de caso seleccionado, caracterizando los municipios e ilustrando en qué consiste el juego de intereses de los actores del bloque hegemónico local y cuál es su impacto sobre el desplazamiento forzado.

Análisis de las estrategias de cooperación sur-sur para el desarrollo económico y social binacional. Estudio de caso: proyectos en materia agropecuaria en el marco del convenio de cooperación técnica y científica entre Brasil y Colombia, periodo 2007-2011

Las desigualdades económicas y sociales entre los Estados del Norte y del Sur son evidentes, ante esta premisa surge la Cooperación Sur-Sur como una herramienta eficaz para potencializar el desarrollo económico y social de las naciones del Sur bajos los principios de horizontalidad, consenso y equidad. En este sentido, se analizan las estrategias de Cooperación Sur-Sur entre Brasil y Colombia y su aplicación en uno de los sectores prioritarios de los Estados del Sur como es el sector agropecuario.

Los conceptos de salud financiera, riesgo y epidemiología en los estados financieros de las compañías del sector de extracción de petróleo crudo y gas natural en Colombia

El presente proyecto tiene como objeto identificar cuáles son los conceptos de salud, enfermedad, epidemiología y riesgo aplicables a las empresas del sector de extracción de petróleo y gas natural en Colombia. Dado, el bajo nivel de predicción de los análisis financieros tradicionales y su insuficiencia, en términos de inversión y toma de decisiones a largo plazo, además de no considerar variables como el riesgo y las expectativas de futuro, surge la necesidad de abordar diferentes perspectivas y modelos integradores. Esta apreciación es pertinente dentro del sector de extracción de petróleo y gas natural, debido a la creciente inversión extranjera que ha reportado, US$2.862 millones en el 2010, cifra mayor a diez veces su valor en el año 2003. Así pues, se podrían desarrollar modelos multi-dimensional, con base en los conceptos de salud financiera, epidemiológicos y estadísticos. El termino de salud y su adopción en el sector empresarial, resulta útil y mantiene una coherencia conceptual, evidenciando una presencia de diferentes subsistemas o factores interactuantes e interconectados. Es necesario mencionar también, que un modelo multidimensional (multi-stage) debe tener en cuenta el riesgo y el análisis epidemiológico ha demostrado ser útil al momento de determinarlo e integrarlo en el sistema junto a otros conceptos, como la razón de riesgo y riesgo relativo. Esto se analizará mediante un estudio teórico-conceptual, que complementa un estudio previo, para contribuir al proyecto de finanzas corporativas de la línea de investigación en Gerencia.

Análisis del arrendamiento como alternativa en la política de vivienda de interés social en Colombia. Lecciones y reflexiones aprendidas a partir de la experiencia de Sudáfrica

Los esfuerzos de la presente investigación se concentran en el cumplimiento del objetivo principal, el cual consiste en analizar el arrendamiento como un programa que puede ser incorporado en la política de vivienda en Colombia, para dar respuesta de forma transitoria y/o temporal de alojamiento a los hogares con ingresos iguales o inferiores a dos salarios mínimos, ya que actualmente la política sectorial no incorpora esta forma tenencia de la vivienda para ofertar soluciones habitacionales. El arrendamiento tiene rasgos interesantes e importantes de destacar, tales como que él mismo constituye una forma de tenencia de vivienda eminentemente urbana. Además, es un mercado al que acuden todos los estratos socioeconómicos, por lo cual no es un mercado segregado. Igualmente, al relacionar ésta tenencia con el territorio y por ende con la economía espacial, se puede decir que no existe segregación socio-espacial muy pronunciada frente a la distribución urbana de la tenencia de la vivienda en arrendamiento. En este sentido, la tenencia de la vivienda en forma de arrendamiento se presenta en todo el territorio urbano de Cali, Medellín y Bogotá.

La reintegración social y económica de los grupos armados ilegales en Colombia: reflexiones a partir de la trayectoria de nueve excombatientes

Esta investigación toma como marco general la Política de Reintegración Social y económica de personas y grupos alzados en armas en Colombia, en donde tras el estudio de las trayectorias en el conflicto de un grupo de 9 excombatientes, se aborda la relación existente entre los beneficios otorgados por dicha política y aquello que facilitó y motivó el ingreso, la permanencia y desmovilización de los grupos armados. Se presenta una caracterización e interpretación conceptual de las denominadas trayectorias en el conflicto, son establecidas relaciones y diferencias entre las organizaciones ilegales FARC y las AUC, se revisan las percepciones que frente a los beneficios del programa de reintegración tienen excombatientes y profesionales de la entidad que lidera dicho proceso y a partir de ello, es argumentada la incidencia que sobre el éxito de esta política tienen las características individuales y particulares, tanto de los excombatientes como de las organizaciones armadas ilegales.

Evaluación de una herramienta educativa en conocimiento de donación y trasplante de órganos y tejidos en Colombia

El trasplante de órganos es considerado uno de los avances más significativos de la medicina moderna y es un procedimiento cada vez más exitoso en términos de supervivencia de los pacientes, siendo actualmente la mejor opción de tratamiento para los pacientes con innumerables patologías. El proceso de donación es insuficiente para cubrir las necesidades de trasplante de la población, por lo tanto, se hace necesario el desarrollo de nuevas estrategias para fortalecer la experiencia y efectividad de los programas existentes. La falta de conocimiento de los profesionales de la salud, su percepción y actitud hacia temas relacionados con el proceso de donación, pueden convertirlos en facilitadores o barreras para la identificación de potenciales donantes. Por esta razón, los recursos disponibles, las actitudes hacia la donación, la legislación y conocimiento de los procesos involucrados en la donación de tejidos y órganos son críticos. Dada la influencia de los profesionales de salud se definen los objetivos de este proyecto de tesis: determinar cuál es el conocimiento y las habilidades de los profesionales de la salud encargados de los trasplantes de órganos y de tejidos en la regional 1, evaluados mediante una herramienta educativa para contribuir a mejorar un programa eficiente de Donación de Órganos y tejidos y así mismo, fijar recomendaciones en aras de aumentar las tasas de donación, con especial énfasis en la actividad hospitalaria en el país. METODOLOGIA Se realizó un estudio basado en el análisis de la evaluación de conocimientos del proceso donación- trasplante de órganos y tejidos en el personal de salud participante en la herramienta educativa llamada “Curso taller primer respondiente del potencial donante de órganos y tejidos”. Este curso incluía un formato evaluativo que fue diligenciado de manera anónima por los participantes antes y después de recibir el contenido del curso. El estudio se desarrolló en personal de la Salud de IPS pertenecientes a la Regional I, de la Red Nacional de donación y trasplantes de órganos y tejidos. Con el fin de evidenciar si existen diferencias en el conocimiento de los participantes del curso antes y después de asistir al mismo, se utilizó la prueba de McNemar (p< 0.05). RESULTADOS Entre julio del 2011 y junio del 2012, se realizó el “Curso taller primer respondiente del potencial donante de órganos y tejidos” y se obtuvieron 303 encuestados incluidos médicos, enfermeras y auxiliares de enfermería. Al inicio del curso las respuestas acertadas con relación a legislación, selección del donante, muerte encefálica y mantenimiento del donante estuvieron alrededor del 50%. No fue posible detectar la profesión que pudiese generar riesgo en la detección del donante y los procesos asociados. Posterior al curso, el 72% de las preguntas se respondieron de manera correcta, lo que representa un incremento estadísticamente significativo. Este cambio evidenció significancia estadística al usar la prueba de McNemar y arrojar un valor de p=0.00. .DISCUSIÓN El personal de salud participante en el curso taller proveniente de unidades involucradas como generadoras de donantes muestra un déficit de conocimientos del proceso donación trasplantes lo que puede convertirlos en limitantes para dicho proceso

Los grupos paramilitares en Colombia: el incierto tránsito de la guerra a la paz

Esta investigación aborda las condiciones bajo las que se llevó a cabo en Colombia, en el primer gobierno del presidente Álvaro Uribe Vélez (2002-2006), la negociación entre el Estado y los grupos paramilitares. Se establecen las características de ese proceso de paz, su correspondencia con modelos tradicionales de negociación y sus alcances sobre el proceso de Desmovilización, Desarme y Reinserción (DDR) de las organizaciones paramilitares.