Estudo in vitro do efeito da interferência por RNA (RNAi) na replicação do vírus da hepatite C

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Clonagem de construto de RNA interferente para produção de Maruba-Kaido resistente a vírus de macieira.

2012

Identificação de genes alvo para controle de Helicoverpa armigera em milho via RNA interferente (RNAi).

2016

Avaliação da tecnologia do RNA interferente (RNAi) para controle de Rhopalosiphum maidis e Schizaphis graminum em milho.

2016

Inibição do vírus da hepatite C utilizando siRNAs direcionados para o genoma viral e proteínas celulares Hsps

Pós-graduação em Microbiologia - IBILCE

siRNAs sintéticos direcionados à no sintase neuronal : efeitos sobre a expressão gênica e viabilidade celular do glioma

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Saúde Animal, 2011.

Silenciamento da expressão da enzima óxido nítrico sintase neuronal (nNOS) em linhagem de neuroblastoma via siRNAs sintéticos em dupla fita

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Saúde Animal, 2011.

Redes neurais artificiais na previsão da inflação: aplicação como ferramenta de apoio à análise de decisões financeiras em organizações de pequeno porte

As estimações das taxas de inflação são de fundamental importância para os gestores, pois as decisões de investimento estão intimamente ligadas a elas. Contudo, o comportamento inflacionário tende a ser não linear e até mesmo caótico, tornando difícil a sua correta estimação. Essa característica do fenômeno pode tornar imprecisos os modelos mais simples de previsão, acessíveis às pequenas organizações, uma vez que muitos deles necessitam de grandes manipulações de dados e/ou softwares especializados. O presente artigo tem por objetivo avaliar, por meio de análise formal estatística, a eficácia das redes neurais artificiais (RNA) na previsão da inflação, dentro da realidade de organizações de pequeno porte. As RNA são ferramentas adequadas para mensurar os fenômenos inflacionários, por se tratar de aproximações de funções polinomiais, capazes de lidar com fenômenos não lineares. Para esse processo, foram selecionados três modelos básicos de redes neurais artificiais Multi Layer Perceptron, passíveis de implementação a partir de planilhas eletrônicas de código aberto. Os três modelos foram testados a partir de um conjunto de variáveis independentes sugeridas por Bresser-Pereira e Nakano (1984), com defasagem de um, seis e doze meses. Para tal, foram utilizados testes de Wilcoxon, coeficiente de determinação R² e o percentual de erro médio dos modelos. O conjunto de dados foi dividido em dois, sendo um grupo usado para treinamento das redes neurais artificiais, enquanto outro grupo era utilizado para verificar a capacidade de predição dos modelos e sua capacidade de generalização. Com isso, o trabalho concluiu que determinados modelos de redes neurais artificiais têm uma razoável capacidade de predição da inflação no curto prazo e se constituem em uma alternativa razoável para esse tipo de mensuração.

Lineage replacement accompanying duplication and rapid fixation of an RNA element in the nsP3 gene in a species of alphavirus

A sequence of thirty-six nucleotides in the nsP3 gene of Ross River virus (RRV), coding for the amino acid sequence HADTVSLDSTVS, was duplicated some time between 1969 and 1979 coinciding with the appearance of a new lineage of this virus and with a major outbreak of Epidemic Polyarthritis among residents of the Pacific Islands. This lineage of RRV continues to circulate throughout Australia and both earlier lineages, which lacked the duplicated element, now are extinct. Multiple copies of several other elements also were observed in this region of the nsP3 gene in all lineages of RRV. Multiple copies of one of these, coding for the amino acid sequence P*P*PR, were detected in the C-terminal region of the nsP3 protein of all alphaviruses except those of African origin. The fixation of duplications and insertions in 3' region of nsP3 genes from all lineages of alphaviruses, suggests they provide some fitness advantage

Physical and functional interaction of the archaeal single-stranded DNA-binding protein SSB with RNA polymerase

Archaeal transcription utilizes a complex multisubunit RNA polymerase and the basal transcription factors TBP and TF(II)B, closely resembling its eukaryal counterpart. We have uncovered a tight physical and functional interaction between RNA polymerase and the single-stranded DNA-binding protein SSB in Sulfolobus solfataricus. SSB stimulates transcription from promoters in vitro under TBP-limiting conditions and supports transcription in the absence of TBP. SSB also rescues transcription from repression by reconstituted chromatin. We demonstrate the potential for promoter melting by SSB, suggesting a plausible basis for the stimulation of transcription. This stimulation requires both the single-stranded DNA-binding domain and the acidic C-terminal tail of the SSB. The tail forms a stable interaction with RNA polymerase. These data reveal an unexpected role for single-stranded DNA-binding proteins in transcription in archaea.

Identification of a cryptic Prokaryotic promoter within the cDNA encoding the 5′ End of Dengue Virus RNA Genome

Infectious cDNA clones of RNA viruses are important research tools, but flavivirus cDNA clones have proven difficult to assemble and propagate in bacteria. This has been attributed to genetic instability and/or host cell toxicity, however the mechanism leading to these difficulties has not been fully elucidated. Here we identify and characterize an efficient cryptic bacterial promoter in the cDNA encoding the dengue virus (DENV) 5′ UTR. Following cryptic transcription in E. coli, protein expression initiated at a conserved in-frame AUG that is downstream from the authentic DENV initiation codon, yielding a DENV polyprotein fragment that was truncated at the N-terminus. A more complete understanding of constitutive viral protein expression in E. coli might help explain the cloning and propagation difficulties generally observed with flavivirus cDNA.

Subtropical towers typology design : RNA showground case study

The QUT Team developed an idea for a new residential housing typology that is appropriate for sites where the best views are in the opposing direction to the preferable climatic orientation. The interlocking configuration creates a double height external living space in every apartment, creating further opportunities for cross ventilation and natural daylight. Unlike conventional double loaded housing typologies, the interlocking configuration only requires a continuous public circulation corridor every second level. The cores that service this corridor are separated to either end of the tower and open areas. The configuration of the interlocking apartments creates an interesting composition of solid and void when viewed externally. This undulating facade petternation assists in articulating the large building mass. The project was evaluated by independent consultants and found to be cost effective, and at the same time delivering energy efficient high density liveability. The project was presented to a meeting of the Australian Council on Tall Buildings seminar on 15 September 2010.