Caracterização morfológica-sedimentar do vale inciso Apodi-Mossoró e plataforma continental adjacente - Bacia Potiguar Offshore

Systems of incised valleys have been studied in different continental shelves, including the Brazilian continental margin. The interest to characterize this feature is given by the information that it can provide variations on sea level, as well as the ability to host economically significant quantities of hydrocarbons in reservoirs located in deposits filling of the incised valleys. This thesis has the overall objective to characterize the morphology and sedimentary cover of the incised valley Apodi-Mossoró, located in the Northern Continental shelf of Rio Grande do Norte state, adjacent to Areia Branca city. The methodology included the integration of satellite imagery, bathymetric data, sedimentological data, shallow seismic, and the identification of foraminifera. The results indicate that the ApodiMossró incised valley is currently formed by two channels, shallow channel and deep channel, which have distinct morphological and sedimentological characteristics. The deep channel has connection with one of the heads of the Apodi Canyon, located in the slope area. The acquisition, processing and interpretation of shallow seismic data allowed the recognition of the depositional surface, erosional surface, discordance, and sismofaceis. The erosional surface mapped from shallow seismic sections is possibly a indicative of an ancient surface of valley incision, where it would probably be associated with the limit Pleistocene/Holocene. Different sismofaceis were identified and reflect the rise in sea level with standards sometimes agradacional, sometimes progradational. The thickness of sediments on this surface was estimated at a maximum of 22m thick in the central portion of the incised valley. Statistically, there are differences between the adjacent continental shelf and channels, and between these channels, for the content of calcium carbonate, organic matter, sand and mud perceptual, except for the gravel grain size. The analysis of living and dead foraminifera showed the presence of fifty species distributed in regards to morphology, depth and type of sediment. Four type of seismic echocharacteres were identified and mapped, as well as their bedforms, indicating different sedimentary processes along the incised valley. The integration of results suggests an activation of the Apodi-Mossoró incised valley in the Late Pleistocene.

Metais em águas e sedimentos da plataforma dos Açores

A presente tese tem por objetivo principal contribuir para o conhecimento da geoquímica sedimentar da zona oceânica da crista da Terceira e montanhas submarinas a sul (região entre 29-39ºN e 27-32ºW), integrando também a caraterização dos metais e nutrientes na coluna de água e propondo concentrações para servirem de referência nesta região do Atlântico Central. Para o efeito foram realizadas amostragens na coluna de água em sete locais e de sedimento em cinco locais, durante a campanha oceanográfica designada por EMEPC/AÇORES/G3/2007 a bordo do navio SV Kommandor Jack, no âmbito do projeto da Estrutura de Missão para a Extensão da Plataforma Continental (EMEPC). Os perfis de CTD da coluna de água na região estudada revelam a presença de massas de água distintas: a Western North Atlantic Central Water (WNACW), a Eastern North Atlantic Central Water tropical (ENACWt), a Eastern North Atlantic Central Water polar (ENACWp), a Mediterranean Overflow Water (MOW), a Deep Mediterranean Water (DMW) e a North Eastern Atlantic Deep Water (NEADW). Observou-se nos perfis de temperatura e salinidade, referentes aos primeiros 200 m da coluna de água, um gradiente meridional negativo entre as estações localizadas na crista da Terceira e as estações localizadas mais a sul. Observou-se nas águas superficiais valores de oxigénio dissolvido de 93% e de pH de 8,1, assim como que as concentrações dos nutrientes NOx, PO4 e SiO2 variam de acordo com a atividade biológica, tendo-se registado concentrações medianas mais baixas, respetivamente de 6,5, 0,23 e 1,3 mol L-1, que aumentam com a profundidade devido à ausência de produção primária (respetivamente 31, 1,4 e 22 mol L-1). As concentrações de NH4 e de SO4 não variam significativamente nas massas de água, sendo os valores medianos mínimos e máximos de 0,69 a 0,79 mol L-1 para o NH4 e de 30 a 32 mol L-1 para o SO4. São propostas concentrações de referência para as massas de água, para os elementos cobre, cádmio, chumbo e arsénio. Os perfis de sedimento analisados permitem distinguir os sedimentos na crista da Terceira (core A) dos restantes (cores B a E). A grande variabilidade textural encontrada no core A, que contrasta com os outros cores analisados, deve-se a importantes contribuições terrígenas, originadas pela erosão sub-aérea e pela atividade vulcânica das ilhas próximas. iv resumo (continuação) A análise mineralógica, efetuada à fração areia e à fração fina (< 63 μm), confirma que os sedimentos do core A derivam de rochas vulcânicas formadas maioritariamente por piroxenas, olivinas, anfíbolas, biotite, alterites e ainda calcite, plagióclase e magnetite, tendo-se identificado ao microscópio a glauconite e o vidro vulcânico. De acordo com a composição química destes minerais o core A apresenta valores mais elevados de Al, Fe, K, P, Mg, Si, Na, Zn, V, Cr e Mn relativamente aos cores B a E. Os cores B a E apresentam grandes quantidades de calcite (>80%) formada maioritariamente por foraminíferos e nanoplâncton calcário (cocolitóforos). A fração areia confirma a composição maioritariamente carbonatada com grande abundância de material biogénico formado por oozes de foraminíferos (planctónicos e bentónicos) com raras espículas de espongiários e restos de conchas. Os cores B a E apresentam valores muito mais elevados que o core A para os elementos Ca e Sr. Os resultados para o Al, Fe, K, P, Si, Na, As, Cu, Ni, Zn, V, Cr, Li, Pb, Cd e Co presentes nos locais B, C, D e E sugerem que estes cores são comparáveis aos sedimentos de fundo carbonatados. Propõe-se concentrações de referência para a região do Atlântico compreendida entre 29-39ºN e 27-32ºW considerando a primeira camada colhida em cada core. Para o core A as concentrações são normalizadas a 5% de Al e CaCO3, enquanto que para os cores B a E são normalizadas a 2% de Al e CaCO3. Assim as concentrações de referência para o core A são: As – 18 mg kg-1, Cr – 91 mg kg-1, Cu – 127 mg kg-1, Ni – 84 mg kg-1, Pb – 41 mg kg-1, Hg – 41 ng g-1 e Zn – 482 mg kg-1. Para os cores B a E as concentrações de referência são: As – 3 mg kg-1, Cr – 10 mg kg-1, Cu – 36 mg kg-1 Ni – 12 mg kg -1, Hg – 3 ng g-1 e Zn – 20 mg kg-1. Para os restantes metais as concentrações de referência para o core A são: Al – 9%, Si – 25%, Fe – 6%, Ca – 13%, K – 2%, Mg – 2%, Na – 3%, P – 0,4%, Sr – 900 mg kg-1, Li – 10 mg kg-1, Mn – 1200 mg kg-1, Ba – 700 mg kg-1 e V – 140 mg kg-1. Para os cores B a E as concentrações de referência são: Al – 0,9%, Si – 2%, Fe – 0,2%, Ca – 95%, K – 0,3%, Mg – 0,4%, Na – 0,3%, P – 0,04%, Sr – 2600 mg kg-1, Li – 5 mg kg-1, Mn – 240 mg kg-1, Ba – 345 mg kg-1, Co – 2 mg kg-1 e V – 6 mg kg-1. Os resultados da presente tese constituem um contributo para a caraterização geoquímica da região e podem servir de referência à monitorização futura do mar dos Açores e montes submarinos a sul.

Analise microbiológica da flora intestinal do mosquito Aedes Aegypti através do sequenciamento do gene 16S rRNA na plataforma Illumina MiSeq

Dengue é uma arbovirose que afeta cerca de 100 milhões de pessoas anualmente, em mais de 100 países situados nas regiões tropicais e subtropicais. Foi considerada a doença viral que mais cresceu no ultimo ano, repercutindo em impactos sociais e econômicos nas regiões endêmicas devido às altas taxas de morbidade e mortalidade desencadeadas pela infecção. O principal vetor da dengue é o mosquito Aedes aegypti, presente em toda a faixa tropical e subtropical. Por apresentar hematofagia antropofílica, rápido desenvolvimento e características comportamentais especificas, é um excelente transmissor do vírus dengue. Medidas de controle da disseminação da dengue são restritas à eliminação do mosquito vetor, e um tratamento específico ainda não foi desenvolvido, bem como a criação de uma vacina que previna simultaneamente a infecção pelos quatro sorotipos do arbovírus. Uma característica que determina a disseminação de doenças é a alta competência vetorial de seus mosquitos transmissores, que tem sido associada à composição da microbiota intestinal do inseto. As bactérias presente no intestino do mosquito exercem funções relacionadas a sua nutrição, desenvolvimento e reprodução, e são também um importante fator na eliminação de patógenos, por interferirem diretamente na atividade viral, ou indiretamente a partir da ativação das vias antivirais pelos micro-organismos. Dessa forma, este trabalho visa estudar a diversidade microbiana intestinal do mosquito Aedes aegypti em diferentes estágios de vida, através de sequenciamento de última geração com a plataforma MiSeq Illumina

Desenvolvimento de uma plataforma modelo para a busca de ligantes com potencial leishmanicida baseado na inibição seletiva da enzima diidroorotato desidrogenase

As doenças tropicais negligenciadas (DTNs) causam um imenso sofrimento para a pessoa acometida e em muitos casos podem levar o indivíduo a morte. Elas representam um obstáculo devastador para a saúde e continuam a ser um sério impedimento para a redução da pobreza e desenvolvimento socioeconômico. Das 17 doenças desse grupo, a leishmaniose, incluindo a leishmaniose cutânea, tem grande destaque devido sua alta incidência, os gastos para o tratamento e as complicações geradas em processos de coinfecção. Ainda mais agravante, os investimentos direcionados ao controle, combate e principalmente a inovação em novos produtos é ainda muito limitado. Atualmente, a academia tem um importante papel na luta contra essas doenças através da busca de novos alvos terapêuticos e também de novas moléculas com potencial terapêutico. É nesse contexto que esse projeto teve como meta a implantação de uma plataforma para a identificação de moléculas com atividade leishmanicida. Como alvo terapêutico, optamos pela utilização da enzima diidroorotato desidrogenase de Leishmania Viannia braziliensis (LbDHODH), enzima de extrema importância na síntese de novo de nucleotídeos de pirimidina, cuja principal função é converter o diidroorotato em orotato. Esta enzima foi clonada, expressa e purificada com sucesso em nosso laboratório. Os estudos permitiram que a enzima fosse caracterizada cineticamente e estruturalmente via cristalografia de raios- X. Os primeiros ensaios inibitórios foram realizados com o orotato, produto da catálise e inibidor natural da enzima. O potencial inibitório do orotato foi mensurado através da estimativa do IC50 e a interação proteína-ligante foi caracterizada através de estudos cristalográficos. Estratégias in silico e in vitro foram utilizadas na busca de ligantes, através das quais foram identificados inibidores para a enzima LbDHODH. Ensaios de validação cruzada, utilizando a enzima homóloga humana, permitiram identificar os ligantes com maior índice de seletividade que tiveram seu potencial leishmanicida avaliado in vitro contra as formas promastigota e amastigota de Leishmania braziliensis. A realização do presente projeto permitiu a identificação de uma classe de ligantes que apresentam atividade seletiva contra LbDHODH e que será utilizada no planejamento de futuras gerações de moléculas com atividade terapêutica para o tratamento da leishmaniose. Além disso, a plataforma de ensaios otimizada permitirá a avaliação de novos grupos de moléculas como uma importante estratégia na busca por novos tratamentos contra a leishmaniose

Análise de sedimentos associados à atividade de perfuração na plataforma continental externa, Bacia Potiguar - Brasil

This study was developed in an area located on the outer shelf in the Potiguar Basin, Brazilian equatorial margin; this tropical shelf represents a modern, highly dynamic mixed carbonate-siliciclastic system. Field sampling was carried out during 3 cruises surrounding a shallow-water exploratory well to compare sediment properties of the seafloor, including grainsize, texture, mineral composition, carbonate content, and organic matter. Cruise 1 (C1) was carried prior to drilling, while Cruise 2(C2) and 3 (C3) respectivelly 3 and 12 months after drilling. The sample grid used had 16 stations located along 4 radials from 50 m the well up to a distance of 500 m. Sediments were analyzed in the first 0-2 cm, and 0-10 cm layers. The results show that sedimentary cover around the well is poor to very poorly sorted, with the particle size predominantly in the medium to coarse sand fraction, followed by gravel and mud. The content of calcium carbonate is greater than 96%, associated to bioclastic sediments, and the content of organic matter is less than 12%. Only minor sedimentological variations occured in the area affected by drilling operations. Mainly observed during the second cruise, in terms of a change in grain size distribution associated to an increase in siliciclastic content, This impact occurred in the most surficial sediment (0-2 cm), in the radial closest to the well (50 m), and could suggest the effects of drilling. However, in the third cruise, one year after drilling, the sediments return to show the same characteristics as in the first cruise. These results show no significant sedimentological variations due to drilling activity, and indicate that ocean dynamics in this area was high enough to recover the environment original characteristics.

Análise de sedimentos associados à atividade de perfuração na plataforma continental externa, Bacia Potiguar - Brasil

This study was developed in an area located on the outer shelf in the Potiguar Basin, Brazilian equatorial margin; this tropical shelf represents a modern, highly dynamic mixed carbonate-siliciclastic system. Field sampling was carried out during 3 cruises surrounding a shallow-water exploratory well to compare sediment properties of the seafloor, including grainsize, texture, mineral composition, carbonate content, and organic matter. Cruise 1 (C1) was carried prior to drilling, while Cruise 2(C2) and 3 (C3) respectivelly 3 and 12 months after drilling. The sample grid used had 16 stations located along 4 radials from 50 m the well up to a distance of 500 m. Sediments were analyzed in the first 0-2 cm, and 0-10 cm layers. The results show that sedimentary cover around the well is poor to very poorly sorted, with the particle size predominantly in the medium to coarse sand fraction, followed by gravel and mud. The content of calcium carbonate is greater than 96%, associated to bioclastic sediments, and the content of organic matter is less than 12%. Only minor sedimentological variations occured in the area affected by drilling operations. Mainly observed during the second cruise, in terms of a change in grain size distribution associated to an increase in siliciclastic content, This impact occurred in the most surficial sediment (0-2 cm), in the radial closest to the well (50 m), and could suggest the effects of drilling. However, in the third cruise, one year after drilling, the sediments return to show the same characteristics as in the first cruise. These results show no significant sedimentological variations due to drilling activity, and indicate that ocean dynamics in this area was high enough to recover the environment original characteristics.

O potencial energético do gradiente térmico na plataforma continental do sul do brasil

O crescimento da demanda energética, prevista para a metade do século XXI, com números embasados no crescimento demográfico e de consumo dos países em desenvol- vimento, sugere a busca por fontes energéticas renováveis e de menor impacto ao meio ambiente, conforme os tratados da política internacional. Portanto, o fornecimento de energia suplementar se torna vital nas sociedades modernas e sua extensão até o mar tem se constituído uma recente preocupação do ponto de vista enérgico e ecológico. Várias formas de conversão de energia foram desenvolvidas no decorrer dos anos, com destaque para a energia dos gradientes térmicos. A Plataforma Continental Sul do Bra- sil (PSCB) possui alta variabilidade espacial e temporal nos campos de temperatura, de forma que existe a necessidade de uma análise das regiões de maior potencial energético com respeito ao gradiente vertical de temperatura. Neste estudo, foram utilizados dados do modelo OCCAM com uma grade de resolu- ção horizontal de 0, 25o e resolução vertical de 66 níveis, distribuídos ao longo de um sistema de coordenadas vertical. Foram utilizadas imagens de temperatura superfícial do mar (TSM) obtidas a partir do sensor AVHRR (Advanced Very High Resolution Ra- diometer) de forma a realizar a validação dos dados do modelo OCCAM. A análise da média dos dados do modelo indicou um sítio energético de maior viabilidade devido oC ao padrão médio do gradiente térmico de aproximadamente 0, 17 ao longo da coluna vertical (545 m de profundidade) no oceano. Neste local, foram coletados os dados, e aplicados a um módulo de conversão de energia térmica dos oceanos que vem sendo desenvolvido na Universidade Federal do Rio Grande - FURG. A região de estudo de- monstrou possuir um local com ótimo potencial energético, onde a produção máxima de energia pode alcançar 111, 9MW , associada com um padrão variabilidade tempo- ral dominante de 12 meses. Este sítio energético demonstra maior eficiência durante o período de verão e outono ao longo dos anos e sua média para todo o período é de 94, 3MW . Neste estudo, duas correntes: Corrente do Brasil (CB) e a Contra Corrente Costeira (CCC), com águas de origem tropical e subantártica com aportes continentais, respecti- vamente, tem alta correlação com os valores dos gradientes térmicos e com os significa- tivos eventos de conversão energética. O sítio energético demonstrou alta estabilidade à sazonalidade e à gama de eventos meteorológicos e oceanográficos, de forma que pode ser qualificado como uma fonte suplementar a matriz energética do país para um futuro próximo.

Alinhamento da produção científica do Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical da Universidade Federal de Pernambuco às necessidades sociais de saúde tropical em Pernambuco

Avalia a contribuição da produção científica do Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical da Universidade Federal de Pernambuco (2004 a 2012) às necessidades sociais em Saúde Tropical do estado de Pernambuco. Para isto, utiliza como referência o Plano Estadual de Saúde (2012-2015) desenvolvido pelo Governo Estadual de Pernambuco. Sobre o aspecto metodológico, este estudo se caracteriza como descritivo, e utilizou-se dos fundamentos da Cientometria para medir se as publicações dos pesquisadores permanentes do Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical da UFPE estavam alinhadas às problemáticas descritas no Plano Estadual de Saúde. As etapas metodológicas foram: a) levantamento de dados da formação e da produção científica dos pesquisadores na Plataforma Lattes do CNPq; b) identificação temática da produção científica realizada pelos pesquisadores envolvidos e mapeamento das doenças tropicais citadas no Plano Estadual de Saúde; e c) construção e aplicação de entrevistas realizadas junto aos pesquisadores por meio de questionário. Como principais resultados, percebe-se que as motivações de pesquisa são: a) adequação da produção às linhas de pesquisa estabelecidas pelo Programa, e b) a oportunidade de proporcionar benefícios para a sociedade, constatando assim, que as motivações para a realização das pesquisas são sociais, tendo pouca influência do segmento privado. Sobre o alinhamento dos temas produzidos com as necessidades sociais em Saúde Tropical do estado de Pernambuco, verifica-se que o programa vem ampliando o escopo do conceito de doença tropical para doenças infecciosas, e por isto, o HIV aparece no topo dos temas mais representativos.

Sexual selection in a tropical fruit fly : role of a plant derived chemical in mate choice

The specific mechanisms by which selective pressures affect individuals are often difficult to resolve. In tephritid fruit flies, males respond strongly and positively to certain plant derived chemicals. Sexual selection by female choice has been hypothesized as the mechanism driving this behaviour in certain species, as females preferentially mate with males that have fed on these chemicals. This hypothesis is, to date, based on studies of only very few species and its generality is largely untested. We tested the hypothesis on different spatial scales (small cage and seminatural field-cage) using the monophagous fruit fly, Bactrocera cacuminata. This species is known to respond to methyl eugenol (ME), a chemical found in many plant species and one upon which previous studies have focused. Contrary to expectation, no obvious female choice was apparent in selecting ME-fed males over unfed males as measured by the number of matings achieved over time, copulation duration, or time of copulation initiation. However, the number of matings achieved by ME-fed males was significantly greater than unfed males 16 and 32 days after exposure to ME in small cages (but not in a field-cage). This delayed advantage suggests that ME may not influence the pheromone system of B. cacuminata but may have other consequences, acting on some other fitness consequence (e.g., enhancement of physiology or survival) of male exposure to these chemicals. We discuss the ecological and evolutionary implications of our findings to explore alternate hypotheses to explain the patterns of response of dacine fruit flies to specific plant-derived chemicals.

New particle formation and growth at a remote, sub-tropical coastal location

A month-long intensive measurement campaign was conducted in March/April 2007 at Agnes Water, a remote coastal site just south of the Great Barrier Reef on the east coast of Australia. Particle and ion size distributions were continuously measured during the campaign. Coastal nucleation events were observed in clean, marine air masses coming from the south-east on 65% of the days. The events usually began at ~10:00 local time and lasted for 1-4 hrs. They were characterised by the appearance of a nucleation mode with a peak diameter of ~10 nm. The freshly nucleated particles grew within 1-4 hrs up to sizes of 20-50 nm. The events occurred when solar intensity was high (~1000 W m-2) and RH was low (~60%). Interestingly, the events were not related to tide height. The volatile and hygroscopic properties of freshly nucleated particles (17-22.5 nm), simultaneously measured with a volatility-hygroscopicity-tandem differential mobility analyser (VH-TDMA), were used to infer chemical composition. The majority of the volume of these particles was attributed to internally mixed sulphate and organic components. After ruling out coagulation as a source of significant particle growth, we conclude that the condensation of sulphate and/or organic vapours was most likely responsible for driving particle growth during the nucleation events. We cannot make any direct conclusions regarding the chemical species that participated in the initial particle nucleation. However, we suggest that nucleation may have resulted from the photo-oxidation products of unknown sulphur or organic vapours emitted from the waters of Hervey Bay, or from the formation of DMS-derived sulphate clusters over the open ocean that were activated to observable particles by condensable vapours emitted from the nutrient rich waters around Fraser Island or Hervey Bay. Furthermore, a unique and particularly strong nucleation event was observed during northerly wind. The event began early one morning (08:00) and lasted almost the entire day resulting in the production of a large number of ~80 nm particles (average modal concentration during the event was 3200 cm-3). The Great Barrier Reef was the most likely source of precursor vapours responsible for this event.

Greenhouse Gas Fluxes in Tropical and Temperae Agriculture: The Need for a Full-Cost Accounting of Global Warming Potentials

Agriculture's contribution to radiative forcing is principally through its historical release of carbon in soil and vegetation to the atmosphere and through its contemporary release of nitrous oxide (N2O) and methane (CHM4). The sequestration of soil carbon in soils now depleted in soil organic matter is a well-known strategy for mitigating the buildup of CO2 in the atmosphere. Less well-recognized are other mitigation potentials. A full-cost accounting of the effects of agriculture on greenhouse gas emissions is necessary to quantify the relative importance of all mitigation options. Such an analysis shows nitrogen fertilizer, agricultural liming, fuel use, N2O emissions, and CH4 fluxes to have additional significant potential for mitigation. By evaluating all sources in terms of their global warming potential it becomes possible to directly evaluate greenhouse policy options for agriculture. A comparison of temperate and tropical systems illustrates some of these options.