Comparison of inverse planning systems based on biological or physical factors: Pinnacle®, Corvus® and Monaco®

Radiotherapy (RT) is one of the most important approaches in the treatment of cancer and its performance can be improved in three different ways: through the optimization of the dose distribution, by the use of different irradiation techniques or through the study of radiobiological initiatives. The first is purely physical because is related to the physical dose distributiuon. The others are purely radiobiological because they increase the differential effect between the tumour and the health tissues. The Treatment Planning Systems (TPS) are used in RT to create dose distributions with the purpose to maximize the tumoral control and minimize the complications in the healthy tissues. The inverse planning uses dose optimization techniques that satisfy the criteria specified by the user, regarding the target and the organs at risk (OAR’s). The dose optimization is possible through the analysis of dose-volume histograms (DVH) and with the use of computed tomography, magnetic resonance and other digital image techniques.

Aircraft accident report : crash of Pinnacle Airlines flight 3701, Bombardier CL-600-2B19, N8396A, Jefferson City, Missouri, October 14, 2004 /

On October 14, 2004, about 2215:06 central daylight time, Pinnacle Airlines flight 3701 (doing business as Northwest Airlink), a Bombardier CL-600-2B19, N8396A, crashed into a residential area about 2.5 miles south of Jefferson City Memorial Airport, Jefferson City, Missouri. The airplane was on a repositioning flight from Little Rock National Airport, Little Rock, Arkansas, to Minneapolis-St. Paul International Airport, Minneapolis, Minnesota. During the flight, both engines flamed out after a pilot-induced aerodynamic stall and were unable to be restarted. The captain and the first officer were killed, and the airplane was destroyed. No one on the ground was injured. The flight was operating under the provisions of 14 Code of Federal Regulations Part 91 on an instrument flight rules flight plan. Visual meteorological conditions prevailed at the time of the accident. The National Transportation Safety Board determines that the probable causes of this accident were (1) the pilots' unprofessional behavior, deviation from standard operating procedures, and poor airmanship, which resulted in an in-flight emergency from which they were unable to recover, in part because of the pilots' inadequate training; (2) the pilots' failure to prepare for an emergency landing in a timely manner, including communicating with air traffic controllers immediately after the emergency about the loss of both engines and the availability of landing sites; and (3) the pilots' improper management of the double engine failure checklist, which allowed the engine cores to stop rotating and resulted in the core lock engine condition. Contributing to this accident were (1) the core lock engine condition, which prevented at least one engine from being restarted, and (2) the airplane flight manuals that did not communicate to pilots the importance of maintaining a minimum airspeed to keep the engine cores rotating.

Holt, Johnson and the 1966 Federal Election. A Question of Causality

US President Lyndon Johnson's state visit to Australia in October 1966, came at the pinnacle of support for Australia's military involvement in the Vietnam War. Johnson's visit also occurred just weeks before an election for the House of Representatives at which the ruling Liberal-Country Party Coalition won its eighth successive, and largest victory, The proximity of these events has led many to argue that a causal relationship exists between the two. Advocates of this thesis, however, have failed to support their position with any evidence other than the anecdotal. Contrary to the assertions made by numerous political historians and observers of the period, this paper finds no evidence to support a thesis of causality. This paper argues that the Coalition's landslide victory in 1966 was both a rejection of the tired and lacklustre leadership of Labor's Arthur Calwell and a measure of the electorate's overwhelming support for Holt and his Government's policies of conscription and military involvement in Vietnam.

Towards an uncertain future? The strengthening of Japan's autonomy in Asia-Pacific

Recently, Japan has been increasing tensions with China regarding the Pinnacle Senkaku/Diaoyu islands. Due to the Chinese military development, Japan has been working on its political and military strengthening in Asia. This essay presents two possible scenarios for Japan.

Sociogenetics of fire ants

RÉSUMÉ GRAND PUBLIC La complexité des sociétés d'insectes (telles que les abeilles, les termites ou les fourmis) a depuis longtemps fasciné l'Homme. Depuis le débfit du XIXème siècle, de nombreux travaux observationnels, comportementaux et théoriques leur on été consacrés afin de mieux les décrire et comprendre. L'avènement de la biologie moléculaire à la fin du XXèrne siècle a offert de nouveaux outils scientifiques pour identifier et étudier les gènes et molécules impliqués dans le développement et le comportement des êtres vivants. Alors que la majorité de ces études s'est focalisée sur des organismes de laboratoire tel que la mouche ou les nématodes, l'utilisation de ces outils est restée marginale jusqu'à présent dans l'étude des sociétés d'insectes. Lors de ma thèse, j'ai développé des outils moléculaires permettant de déterminer le niveau d'activité de zo,ooo gènes chez la fourmi de feu, Solenopsis invicta, ainsi qu'une base de données et un portail en ligne regroupant les informations relatives à l'étude génétique des fourmis: Fourmidable. J'ai ensuite utilisé ces outils dans le cadre d'une étude comportementale chez la fourmis S. invicta. Dans les sociétés d'insectes, une hiérarchie peut déterminer le statut reproducteur des individus. Suite à la mort d'un dominant, les subordonnés entrent en compétition en vue d'améliorer leur statut. Un tel phénomène se produit au sein des colonies de S. invicta contenant une unique reine mère, des milliers d'ouvrières et des centaines de reines vierges ailées. A la mort de la reine mère, un grand nombre de reines vierges tentent de la remplacer en arrachant leurs ailes et en activant leurs organes reproducteurs plutôt que de partir en vol nuptial. Ces tentatives sont le plus souvent arrêtées par les ouvrières qui exécutent la plupart de ces reines sur la base de signaux olfactifs produits lors de l'activation des organes reproducteurs. Afin de mieux comprendre les mécanismes moléculaires impliqués, j'ai étudié l'activité de gènes au sein des reines au début de ce processus. J'ai ainsi déterminé que des gènes impliqués dans communication olfactive, le développement des organes reproducteurs et la métabolisation de l'hormone juvénile sont activês à ce moment là. La vitesse à laquelle les reines perdent leurs ailes ainsi que les niveaux d'expression de gènes sont ensuite liés à leur probabilité de survie. ABSTRACT : Honeybees, termites and ants occupy the "pinnacle of social evolution" with societies of a complexity that rivals our own. Humans have long been fascinated by social insects, but studying them has been mostly limited to observational and behavioral experiments. The advent of molecular biology first made it possible to investigate the molecular-genetic basis of development in model systems such as the fruit fly Drosophila melarcogaster or the roundworm Caenorhabditis elegans and subsequently their behavior. Molecular and genomic tools are now becoming available for the study of social insects as well. To permit genomic research on the fire ant, Solenopsis invicta, we developed a cDNA microarray that can simultaneously determine the expression levels of approximately 1oooo genes. These genes were assembled and bioinformatically annotated using custom pipelines. The obtained data formed the cornerstones for Fourmidable, a web portal centralizing sequence, gene annotation and gene expression data as well as laboratory protocols for research on ants. In many animals living in groups the reproductive status of individuals is determined by their social status. In species with social hierarchies, the death of dominant individuals typically upheaves the social hierarchy and provides an opportunity for subordinate individuals to improve their social status. Such a phenomenon occurs in the monogyne form of S. invicta, where colonies typically contain a single wingless reproductive queen, thousands of workers and hundreds of winged non-reproductive virgin queens. Upon the death of the mother queen, many virgin queens shed their wings and initiate reproductive development instead of departing on a mating flight. Workers progressively execute almost all of them over the following weeks. The workers base their collective decision on pheromonal cues associated with the onset of reproductive development of the virgin queens which occurs after orphaning. We used the aforementioned tools to determine that genes putatively involved in processes including olfactory signaling, reproductive development and Juvenile Hormone metabolism are differentially expressed at the onset of competition. Additionally, we found that queens that initiate reproductive development faster and, to a certain extent, shed their wings faster after orphaning are more likely to become replacement queens. These results provide candidate genes that are putatively linked to competition outcome. To determine the extent to which specific genes affect different aspects of life in ant colonies, functional tests such as gene activation and silencing will still be required. We conclude by discussing some of the challenges and opportunities for molecular-genetic research on ants. RÉSUMÉ Les sociétés d'abeilles, de termites et de fourmis sont d'une complexité proche de celle de la nôtre et ont depuis longtemps fasciné l'Homme. Cependant, leur étude était jusqu'à présent limitée aux observations et expériences comportementales. L'avènement de la biologie moléculaire a d'abord rendu possible l'étude moléculaire et génétique du développement d'organismes modèles tels que la mouche Drosophila melanogaster ou le nématode Caenorhabditis elegans, puis dans un second temps de leur comportement. De telles études deviennent désormais possibles pour les insectes sociaux. Nous avons développé une puce à ADN permettant de déterminer simultanément les niveaux d'expression de 1oooo gènes de la fourmi de feu, Solenopsís invicta. Ces gènes ont été séquencés puis assemblés et annotés à l'aide de pipelines que nous avons développés. En se basant sur les informations obtenues, nous avons créé un portail web, Fourmidable. Ce portail vise à centraliser toutes les informations de séquence, d'annotation et d'expression de gènes, ainsi que les protocoles de laboratoire utilisés pour la recherche sur les fourmis. Par la suite, nous avons utilisé les outils développés pour étudier un aspect particulier de S. invicta. Chez les animaux grégaires, une hiérarchie sociale peut déterminer le statut reproducteur des individus. Suite à la mort d'un individu dominant, les individus subordonnés peuvent entrer en compétition en vue d'améliorer leur statut. Un tel phénomène se produit au sein des colonies monogynes de S. invicta, qui contiennent habituellement une unique reine mère, des milliers d'ouvrières et des centaines de reines vierges ailées. Suite à la mort de la reine mère, dominante, un grand nombre de reines vierges, subordonnées, perdent leurs ailes et activent leurs organes reproducteurs au lieu de partir en vol nuptial. Au cours des semaines suivantes, les ouvrières exécutent la plupart de ces reines sur la base de signaux olfactifs produits lors de l'activation des organes reproducteurs. Afin de mieux comprendre les mécanismes moléculaires impliqués, nous avons étudié l'expression de gènes au début de cette compétition. Nous avons identifié 297 gènes différemment exprimés, dont l'annotation indique qu'ils seraient impliqués dans des processus biologiques dont la communication olfactive, le développement des organes reproducteurs et la métabolisation de l'hormone juvénile. Par la suite, nous avons déterminé que la vitesse à laquelle les reines perdent leurs ailes en début de compétition ainsi que les niveaux d'expression de gènes sont corrélés à la probabilité de survie des reines. Nous concluons en discutant des opportunités offertes par la recherche génétique sur les fourmis ainsi que les défis qu'elle devra surmonter.

Earliest known use of marine resources by neanderthals

Numerous studies along the northern Mediterranean borderland have documented the use of shellfish by Neanderthals but none of these finds are prior to Marine Isotopic Stage 3 (MIS 3). In this paper we present evidence that gathering and consumption of mollusks can now be traced back to the lowest level of the archaeological sequence at Bajondillo Cave (Málaga, Spain), dated during the MIS 6. The paper describes the taxonomical and taphonomical features of the mollusk assemblages from this level Bj19 and briefly touches upon those retrieved in levels Bj18 (MIS 5) and Bj17 (MIS 4), evidencing a continuity of the shellfishing activity that reaches to MIS 3. This evidence is substantiated on 29 datings through radiocarbon, thermoluminescence and U series methods. Obtained dates and paleoenvironmental records from the cave include isotopic, pollen, lithostratigraphic and sedimentological analyses and they are fully coherent with paleoclimate conditions expected for the different stages. We conclude that described use of shellfish resources by Neanderthals (H. neanderthalensis) in Southern Spain started ~150 ka and were almost contemporaneous to Pinnacle Point (South Africa), when shellfishing is first documented in archaic modern humans.

La politique allemande de la France telle que perçue par la presse française (1919-1926)

La France est souvent perçue comme la principale garante du traité de Versailles. Le révisionnisme français envers l’ordre établi par le traité, contrairement au même courant chez les responsables allemands, est un sujet peu étudié. Il a été abordé par quelques auteurs, tels George-Henri Soutou et Stanislas Jeannesson, mais la question mérite davantage d’élaboration. Grâce à l’analyse de la presse française, ce mémoire vérifie l’existence d’une volonté de rendre le traité de paix plus favorable à la France. Une Machtpolitik ainsi qu’un révisionnisme français sont apparents de 1919 à 1923 avec, comme zénith, l’occupation de la Ruhr. Les années suivantes virent la situation de la France se détériorer sur les plans politique, économique et diplomatique. La dégradation de sa posture inclina la France à se tourner vers une conciliation qui émanait de l’esprit du traité de Versailles. La couverture de l’actualité internationale de trois journaux français (Le Temps, L’Action française et L’Humanité) avant et après l’invasion de la Ruhr est analysée. On constate l’existence d’un révisionnisme français qui mène, après son échec en 1924, à un recentrage de la politique allemande de la France. En liant la perception des différents journaux à leur idéologie, nous avons aussi expliqué les variations dans leurs analyses des mêmes événements. L’étude de la presse, conjuguée aux sources secondaires, révèle un discours teinté d’une volonté révisionniste. Elle porte à croire, aussi, que le traité de Versailles ne fut réellement défendu en France qu’après l’échec de la politique de puissance et du révisionnisme français.

Le choix du tout-à-l'automobile à Montréal (1953-1967) : un contexte propice à l’aménagement de l'échangeur Turcot

En l’espace d’une décennie, Montréal s’est durablement transformée. Du milieu des années 1950, où elle représente une ville développée certes, mais dépourvue d'autoroutes, à 1967, année de l’Exposition universelle, la métropole du Québec confirme son choix du tout-à-l’automobile. Le développement autoroutier qu’elle réalise à cette époque doit alors être en mesure de répondre aux besoins de la société à court comme à long terme. Ce réseau perdure toujours de nos jours. Nous souhaitons décomposer la trame de cette période mouvementée afin de comprendre comment Montréal a pu adopter cette orientation aussi rapidement. Il est question d’aborder les éléments ayant permis de centraliser le thème de la circulation à Montréal. La réponse des autorités et la volonté de planifier la ville à long terme nous conduisent ensuite à une réalisation accélérée d’un réseau autoroutier métropolitain d’envergure dont l’échangeur Turcot représente l’aboutissement en 1967. Cette étude permet de mieux examiner l’histoire de ce projet autoroutier majeur qui a constitué un des symboles forts de la modernisation de Montréal et du Québec. L’échangeur Turcot construit dans les années 1960 est le fruit d’une conjoncture particulière, correspondant à des besoins et des attentes tout autre que ceux qui prévalent actuellement. Nous concluons ainsi en nous questionnant sur la construction actuelle du nouvel échangeur Turcot, et en affirmant qu’elle ne correspond peut-être pas aux besoins d’une métropole du XXIe siècle.

Edición de vídeo digital : materiales para la formación a distancia del profesorado.

Resumen basado en la publicación

Welcome DVD. 'Bienvenido DVD' : aprendizaje de inglés mediante gestión de contenidos web.

No publicado. No adjunta DVD

Crystal structure of the complementary quadruplex formed by d(GCATGCT) at atomic resolution

Here we report the crystal structure of the DNA heptanucleotide sequence d(GCATGCT) determined to a resolution of 1.1 Angstrom. The sequence folds into a complementary loop structure generating several unusual base pairings and is stabilised through cobalt hexammine and highly defined water sites. The single stranded loop is bound together through the G(N2)-C(O2) intra-strand H-bonds for the available G/C residues, which form further Watson-Crick pairings to a complementary sequence, through 2-fold symmetry, generating a pair of non-planar quadruplexes at the heart of the structure. Further, four adenine residues stack in pairs at one end, H-bonding through their N7-N6 positions, and are additionally stabilised through two highly conserved water positions at the structural terminus. This conformation is achieved through the rotation of the central thymine base at the pinnacle of the loop structure, where it stacks with an adjacent thymine residue within the lattice. The crystal packing yields two halved biological units, each related across a 2-fold symmetry axis spanning a cobalt hexammine residue between them, which stabilises the quadruplex structure through H-bonds to the phosphate oxygens and localised hydration.

Towards an uncertain future? The strengthening of Japan's autonomy in Asia-Pacific

Recently, Japan has been increasing tensions with China regarding the Pinnacle Senkaku/Diaoyu islands. Due to the Chinese military development, Japan has been working on its political and military strengthening in Asia. This essay presents two possible scenarios for Japan.

The effect of shoulder variation on IMRT and SmartArc for Head and Neck Cancer

Purpose: First, to determine an average and maximum displacement of the shoulder relative to isocenter over the course of treatment. Second, to establish the dosimetric effect of shoulder displacements relative to correct isocenter alignment on the dose delivered to the target and the surrounding structures for head and neck cancer patients. Method and Materials: The frequency of shoulder shifts of various magnitudes relative to isocenter was assessed for 4 patients using image registration software. The location of the center of the right and left humeral head relative to isocenter (usually C2) was found daily from CT on rails scans, and was compared to the location of the humeral heads relative to isocenter on the initial simulation CT. Three Baseline head and neck IMRT and SmartArc plans were generated in Pinnacle based on simulation CTs. The CT datasets (external contour and boney structures) were then modified to represent shifts of the shoulder (relative to isocenter) between 3 mm and 15 mm in the SI, AP, and LR directions. The initial plans were recalculated on the image sets with shifted shoulders. Results: On average, shoulder variation was 2-5 mm in each direction, although displacements of over 1 cm in the inferior and posterior directions occurred. Shoulder shifts induced perturbations in the dose distribution, although generally only for large shifts. Most substantially, large, superior shifts resulted in coverage loss by the 95% isodose line for targets in the lower neck. Inferior shifts elevated the dose to the brachial plexus by 0.6-4.1 Gy. SmartArc plans showed similar loss of target coverage as IMRT plans. Conclusions: The position of the shoulder can have an impact on target coverage and critical structure dose. Shoulder position may need to be considered for setup of head and neck patients depending on target location.